Entry |
|
Symbol |
cobN
|
Name |
(GenBank) cobalamin biosynthetic protein CobN
|
KO |
|
Organism |
pme Prochlorococcus marinus NATL1A
|
Pathway |
|
Brite |
KEGG Orthology (KO) [BR:pme00001]
09100 Metabolism
09108 Metabolism of cofactors and vitamins
00860 Porphyrin metabolism
NATL1_10041 (cobN)
Enzymes [BR:pme01000]
6. Ligases
6.6 Forming nitrogen-metal bonds
6.6.1 Forming coordination complexes
6.6.1.2 cobaltochelatase
NATL1_10041 (cobN)
|
SSDB |
|
Motif |
|
Other DBs |
|
LinkDB |
|
Position |
complement(924796..928584)
|
AA seq |
1262 aa
MHRIASLPGNDPQEEITFIEQPNAPVIFLTSATSDITCLSSVLKQPKNKKWRNKIRALPI
AYLSSNASIDHYISNTCNTAEIVVVRFLGSRSYWSYGFEQLSLWQLEKPNRQLIVVSGIE
STANDLKDISSIKKVQVDFIQLLLNEGGLKNYTYLLKVLDNLKSLEEIKVERDLIEYHDD
LVKWKWIDNDYPKIAIFLYKSLLQSGNTELADSIVKISKRHQINAKIVWITSFKSKDIQK
EIINLLDNEKIEAIITTTSFSSVEYKNDNIKNSIWDTLDVPVYQLLISSSTVNEWKKSTV
GLNPIDLSIQVVLPEVDGRICTVPIAFKNLSYTDNELSISVYKTEPYDKHIEWCINYIKN
LIYLRKTSNFNKKIAVVIANYPVKDSRIANGVGLDTPESLLYVLRWLKDEGYYLGDNPLP
RSSKELINKLITYRTNSEETISNEPQSYLSLFDYLYHWNKIESNAKEKLIKRWGEPNFSK
QLEESGFPINGFTLGNITVLVQANRGFESDNLSDLHSPDLPPTHKYIAQYFWLTHSFKAN
AIIHLGKHGSVEWLPGKGVGLSSNCFPFIICPPVPNIYPFIVNDPGEGSQAKRRTHAIII
DHLTPPLSNAGSYNELLEIENLIDEYYESKLINDDRNQLLEKKIIELLINNSWPSIDPNI
IKDDIKKCNIQEIIDSAESYLCELKQSQIRTGLHILGVNLSMDKLIELTLAISNVPTGNI
SGLSQCLAEDLGFTIDPWRDEENLDLTQSDINLFKEYTSINARKVGQLIDWFNEIGMYII
EFHCIHILNLETSAKNKIELDSKLLKYLDIENPNIFINHLITDILPRLLKSSKNEKTNLL
KALEGKRIASGPSGAPTRGKLEVLPTGKNFFSVDIRAIPTETAWDLGKRSAEKLVDLYLQ
ENGEHLLHLAISIWGTSTMRNGGEDICQLFALMGLMPIWDGTLRRVVDVEVIPMSVLNRP
RVDVTLRISGLFRDAFPQIIELIRRGQNLIGNLNEPKAINPLAESYRNGNTDSRIYGSAP
GSYGAGLQEIINNGSWEHQSELANAFIEWSKWRYEGSNNIVKDKKGLEYNLSKVKVVLHS
QDNREHDILDSDDYYQFQGGLISAVKKTSGNNPQAYFADNSRYQRPRIHKLSKEIDKVVR
SRLLNPKWLEGMKQHGYKGAFEMSASLDYLFSFDATTNLVPNWCYESIASNWLEDEKTRK
FIIDNNPWALRDIAERLLEASNRKLWTNATNEEIASIKSVLSDIDSKIEKFNSSRRNNKS
AS |
NT seq |
3789 nt +upstreamnt +downstreamnt
atgcatagaattgccagccttcctgggaatgatcctcaagaagaaattacatttattgaa
caaccaaatgcaccagttatcttcttaactagtgctacatccgacataacatgcttatcc
tctgtattaaagcaacctaaaaataaaaagtggagaaataaaatcagggctttaccaata
gcctatttatcatcaaatgcatcaattgaccattatatatccaatacatgtaatacagcg
gaaatcgttgttgttaggtttttaggatcaagatcatattggtcatatggatttgaacaa
ttaagtttatggcaattagagaaacctaatagacaattaatagtagtctctggcatagag
agtacagcaaatgatcttaaagatattagtagtataaaaaaagttcaagttgattttatt
caacttctattaaatgaaggcggtttaaaaaactatacttacctattaaaggttttagat
aacttaaaaagtttagaggaaattaaagtagaaagagatttaattgaatatcatgatgat
ttagtcaaatggaaatggatagataatgattaccctaagattgctatatttctctacaaa
tcattgttgcaatcaggcaatacagaattagcagactcaatagttaaaatttcaaaaaga
catcagataaatgccaaaatcgtatggattactagttttaagtcaaaagatattcagaaa
gagataataaatttattggataatgaaaaaattgaagcgatcattactactacttcattt
tcatcagttgaatataagaatgataatataaaaaatagcatatgggacacattagacgtt
cctgtctatcaactacttatatccagttcgacggttaatgaatggaaaaaatcaacagta
ggtttaaatccaattgacttatcaattcaagttgttctgccagaagtagatggtcgaatt
tgtacagttccaattgcatttaaaaatcttagctatacagataatgaattatctatatct
gtatataagacagaaccttatgacaaacatattgaatggtgtattaattacataaaaaat
cttatttatcttagaaaaacaagtaatttcaataaaaaaattgctgttgtaatagctaat
tatcctgttaaggattcaagaattgcaaatggagttggtttagatacaccagaaagcctt
ttgtacgtgttgagatggttaaaagatgaaggatattatttaggagataaccccttgcca
cgaagtagtaaagagctaattaataagttaattacttataggacaaattctgaagaaacc
atatctaacgaaccccaatcatatttaagcctttttgattatttataccattggaataaa
attgaatctaatgcgaaggaaaagttaattaaacgatggggagaaccaaatttttcaaaa
caattagaagaaagcgggttcccgatcaatggattcactctaggaaatataactgtatta
gttcaagcaaatagaggctttgaatcagataatttatcagatttgcattcaccagatcta
ccacctacacataaatatattgcgcaatatttttggttaacgcattcatttaaggcaaat
gcaattatacatctaggaaagcacggtagcgttgaatggttacctggtaaaggtgttggt
ttaagtagtaattgtttcccatttattatttgcccaccagtaccaaacatatacccattt
atagtaaatgaccctggagaaggctcacaagcaaaaagaaggacacatgcgataattatt
gatcatttaacaccaccactttctaacgctggtagttataatgagttattagaaattgag
aacttaattgatgaatattatgaatctaaacttattaatgatgatagaaatcagttatta
gaaaaaaagattatagagttattaattaacaattcatggccaagtattgacccaaatata
attaaagatgatataaaaaaatgtaatatacaagagataatagattctgcagaaagttat
ttatgtgaattaaaacaatcccaaataaggacaggacttcatatcttgggtgtgaatcta
agtatggataaactaattgaattaacgttggctatatcaaatgtacctacagggaacatc
tctggtttatcacaatgtttagctgaagatttaggtttcaccatagacccctggagagat
gaagaaaatttggacttaacgcaatcagatattaatttatttaaagaatatacctctatt
aatgcaagaaaagtagggcagctaattgactggtttaatgaaattggaatgtatataatt
gagtttcattgtatacacatacttaatctcgaaaccagtgccaaaaataaaattgaactt
gatagtaaactactaaaatatttagatattgaaaacccaaatatatttataaatcattta
ataactgatattttacctagattattaaaaagttccaaaaacgaaaagactaatttactt
aaagcgttggaagggaagagaattgcaagcggcccttctggtgctccaacaagaggaaaa
ttagaggtcttaccgacaggtaaaaatttcttttctgttgatattagagctattccaaca
gaaacagcatgggacctagggaaaagaagtgctgaaaaattagttgatctttacctacaa
gaaaatggagagcatctattacatctcgctatttcaatatggggaacttcaaccatgaga
aatggaggagaagatatttgtcaactatttgcacttatgggtctaatgcctatatgggat
ggaactttaagaagagttgttgacgttgaagtcattcccatgagtgttttaaataggccc
agagtcgacgtcacattaagaatatctggtttatttagggatgcattcccccaaatcatt
gaattaatacgaagaggacaaaatcttattgggaatttaaatgagcccaaagcaattaat
ccccttgcagagtcttatagaaatggaaacaccgactcaagaatatatggatcagcacct
ggatcatatggagcaggtttgcaagaaattatcaataatggctcatgggaacatcaatct
gaactggctaatgcatttatagaatggagtaaatggcgatatgaaggttcaaacaatatt
gttaaagacaaaaaagggttggaatataatttatcaaaagtaaaagtagtgctacatagt
caagataatagagagcacgacatactcgattcagatgattactatcaatttcagggtggc
ttaatctctgcagtaaagaaaactagtggtaacaatccacaagcttattttgcagataat
tctagatatcaacgaccaagaatacataaactttcaaaagaaatagataaggttgttagg
agtaggttattaaatccaaaatggcttgagggaatgaaacaacatggctataaaggagct
ttcgagatgtcagcaagccttgactatttattctcttttgatgcaacaactaaccttgtt
cctaattggtgttatgagtcaattgcaagtaattggttggaagatgaaaagacaagaaaa
tttattattgataacaatccatgggcattaagagatatcgctgaaagactactagaagca
tcaaatcgaaagctttggacaaatgcaactaatgaagaaatagcatctattaaatctgtt
ttatctgatatagacagtaaaattgaaaaatttaattccagtagaagaaataataaatca
gcgtcttaa |