Parabacteroides merdae: INE87_02589
Help
Entry
INE87_02589 CDS
T07751
Name
(GenBank) YDG domain protein
Organism
pmer
Parabacteroides merdae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
YDG
Big_2
Big-like
DUF6383
MBG_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QUT50098
LinkDB
All DBs
Position
complement(3087116..3093547)
Genome browser
AA seq
2143 aa
AA seq
DB search
MKTRLLMLLSVFMAITSVGWMQAQSITYYKTGSGSGGTGTEQDPIVKISLDEILGDANAK
TESDSIVVSLSNGDYTAASGTFPITKSGISIIGTDSNKVVIKSPFDITLSEKGNISFSSL
QIAATTATGRGLVDIKSSNTTVSFLDVKLNIEGAGTADGGSTTCFGIVSQLEVDNNTVNF
VASHMYMSKGFQRGLCFRDGAGHTLNMENSKIDGPAGASGYSYVIGIGSWPRMTLVKDPV
TYNIKNSVVDVNYYALFTNNQKASAVPVVINIEGSDITAWSALYLRGDQVQDAFPHTVKI
SDTRLNGRSYFNGPSDGFGTIVLDNCQKMDLTMDSKCRITATNKKIQSSVNTYMVVADIR
NNTKGTWKIVPVDADTCLIQSNNDIYTPTLFTLASTAALTINGIENVKFQSEGGKPCITV
YKQDGSLRNAASDITTLLTKISISDGDKVVFPEGSFTFPQKFVLDKSLTIEGAGKDKTIL
TGTVQVTATYGTKVNFNNLHLSASSTDVHAIEVGTDKGNEAPDITITDCMIDNANNGVRL
MGAGAKLTLKNTDITARYYGVSVRNEKQTVSIDGGTIKGWAAIMTSAGGLTTGDGTLAST
GTSIDIKNATLKSATISNEGYGVIVLQEKYNGVTLAIDGSTLEATDENIGTNEAGVRALS
ALDIRSYGNKVTVKGSHLSSLYGENYYKLEGKTLHAAIINLGWHGSGDKSVLADNTIEIT
NSQLNGKIGENPVYSYRDKEEKAHDKLTINGKTYDPASGLICYGEQDLQSKLDHAIAGET
ILLPVGTYELSKQLTIKEAVILQGTITDKDSTILIAADDWSGSDGSSKHLVSIQANDVAL
KNLVIDGSKSLTEGSGSGINVYISTGVTLDNVISRNNKAAGLIVNGSTVSATNFCTSGNE
WYGVNVDKGQEVTESPAFIIGSGCCFAEKVAIKSDAVDAPASYVVGNGWFKTKVTEGDKT
FSVWVNGATGGLDFAITSVPASVIYGQPTLPLLTNVDSAYYKAGKVKITVDNEAVVKIEK
DSLQILKPGKVNLTLAVGDTAVTQSLDVLKKTLTITGITATTRPYNGSKEVGLVTTDMKV
DGLVGDHTSGNVITVPTTGEALSADAGVQPVTVTAALKDSYGDYYELAEITGVMDTIKKV
KLIYKTATSDAIDFGKVSTKTFTAALADGTAFVNGEDASVLGGTLQFDCPVTDVSLAGKY
PIMPYGYTSNNYEIYYKADSLQVNAVAPKAEITAVTVNGVGDQASISVVGRILSNGGTPT
DQLKATVIPKTGGSGPGTTVNVAKDGTFKTENIKLTAAMYTVELTVVANETLVSDAVTSG
EVNLAAKLQNVNFTSVPARMTYGSTAGIAVASTEADAKLVYTIIGEAIKFNSDSTEVEAV
KAGEATVTITATKAEYVTAIAKQTIKVEPKLVTVKAVAKDKVYDGKLDAEVSFTAEGILE
KDASLVTLNTTSVTGTFTDKNAGESAKTVILKGECSLNNNTGNYVLAQPANPTAKISKAK
ITSIFASNVKRSYKTTSLSYKLDAEGLVNGELITTPGLYTGTISVKEVSGKYSIDMTGVT
FRNYDYAGVQPIGGDVTIIKGIPTIVTYNTEGNAGAAGMVVDNGGWENLGTPEIADATET
GKVFARLTYPDGTVTGNTIIKEKQAPAVTISLENVASASYYSRKSPMTKAVGSQLGYSEE
KVLNITVSGTYTVESTTPSVITVYKKNDDKYYIKGTGVGTGAILVKVGDAVASKTIDVVP
ATLNVTVSGQNKEYDGTTTANIALLLDAAEGASLDLEGVSFNYTSKDAGNKSILPSKDIV
LKGNNADNYELKAISLSGEISKRTLIVTSQISKYYDGTNTIDLTDYSATGLLTEETVPTV
TATFTGDANVGLDKDIKLALKDNNSNYVLATEGNTAKGNISKSTLEATLPEKATDATNLK
NNITYVVRESGETVKANAGVNQYVTVTGSNPFSVKATDNDNCVIIVNNTAVTKSDPVTPP
SGGDGDENVTISLDATTKALPRLEKFVLEATVSPSGKTVTWSSSDPTIASVTADGNKVTV
KGLKVGTATITAKIGDVTATCEVTVDFATGLEEALANTEVFGRKGNIYVNPIQSLQVIVV
NMIGKIVYNARINSYARIPVTKGIYIVKLTNVGNTKIIKVNVY
NT seq
6432 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaacaagattacttatgttgttatcagtctttatggcgataacgagtgtgggatgg
atgcaagctcaatctattacttattacaagactgggagtggatcaggaggtacaggaacc
gaacaagatcctattgtgaaaatatcgttggacgaaattctgggggatgctaatgctaaa
actgaatcagacagtattgtggttagtctatcgaatggagactatactgctgcatccgga
actttcccgattacaaaatccgggattagtattattgggactgattctaataaagttgtc
ataaagtctccgttcgatataactctttccgaaaagggaaatatttcttttagttctttg
caaattgcagcaacaacggcgacgggaagaggcttagtcgatattaaatcatccaataca
acggtttcctttcttgacgttaaattgaatattgaaggggctggtactgccgatggtggc
tctacgacttgttttggtatcgtttcccaacttgaagttgataataatacggtgaatttt
gtcgcttcccatatgtatatgtcaaaaggttttcagagaggattatgttttagggatgga
gccggacatacacttaatatggagaatagcaaaattgacggaccagcaggtgcttctggt
tattcgtatgtgatcggtatcggttcttggccgagaatgactttggtcaaagatccggtt
acatataatataaaaaactcagtagttgatgtaaactattatgccctgtttactaataat
caaaaggcttctgctgtaccggttgttatcaatattgaagggagtgatattacagcttgg
tctgctttgtacttgcgtggcgatcaagttcaggatgctttccctcatactgtgaaaata
agtgatacccgattgaacggacgttcttattttaatggaccgtccgatggttttggaaca
attgtattggataattgccaaaaaatggatttgacaatggattcgaagtgtcgtatcacg
gcaaccaataagaaaatccaatcgagtgtcaatacctatatggttgtagccgatatccgt
aacaacactaaaggaacttggaaaattgtccctgtggatgctgatacttgtcttattcag
tctaataatgatatatatacaccgactttatttactttggcatcaacggcagcattaact
ataaatggcatcgaaaatgtaaaattccagtcggagggaggtaaaccctgtattaccgtt
tataagcaagacggctctttacgaaatgccgccagtgatataacaacattgctgacaaaa
atttcgatttcggatggtgataaagttgttttcccggaaggttcttttacttttcctcag
aaatttgtcttggataaatctcttacgatagagggggccggcaaagacaaaacaatcctt
accggaacagtccaagtgacagcaacatatggtacaaaagtaaatttcaataatttgcat
ttgtctgcctcttcgactgatgtacatgcaattgaagtaggaacggataaaggtaatgaa
gctccagatattactataactgattgcatgattgataatgcaaataatggtgtgcgattg
atgggtgccggggctaaactgacattgaagaatacggatatcacagctcgctattatggg
gtaagtgttcgcaatgaaaaacagacagtatcgattgatggtggtacgattaaagggtgg
gctgcaataatgacaagtgccggcggtttgacgaccggtgatgggacattggcaagtaca
ggtacgtctatagatataaagaatgccacactgaaatcagctactatttcaaatgaggga
tatggagtcattgtattacaagaaaaatataatggtgtgacgctcgccattgacggttct
actttggaggctactgatgagaatataggtactaacgaggcgggtgtacgtgccttgtct
gcgttggatatccgctcttatgggaataaggttactgttaagggtagccatctttcgtct
ctttatggtgaaaattattataagctggaaggaaaaactttacatgccgctattattaat
ttaggctggcatggctctggtgataaatctgtattggcagacaatacgattgaaatcact
aattctcaattgaacggaaaaatcggtgaaaatccagtttattcatatcgggataaggaa
gagaaagcgcatgataagttgactataaatggaaaaacttatgatccggcttccggactt
atttgttatggtgaacaggatttgcaaagcaagctcgatcatgcaattgcgggtgagact
atactgcttcctgttggaacgtatgagttaagcaagcagttgacaatcaaagaagctgtg
atcttgcagggtacgattaccgataaagattccacaattcttattgcagccgatgattgg
tccggttcagatggaagcagtaagcatcttgttagtattcaggcaaacgatgtagctttg
aaaaacttggtaatagatgggtctaaatctctaacagaaggttcaggtagtggtattaat
gtctacatatcaactggcgttacattggataatgtaatctcaagaaacaataaagcagcc
ggtctgatcgtaaacggctcaactgtttctgcaaccaatttctgtacttccggtaacgaa
tggtacggtgtaaatgtggataaaggacaagaagttacagaatctcctgcatttataatc
ggttcgggatgttgctttgcagaaaaagttgccattaaatctgatgctgtggatgcaccc
gcaagttatgtcgttggtaacggatggttcaaaacaaaggtaacagaaggagacaaaact
ttttctgtttgggttaacggtgctaccggcggtttggactttgcgattacttctgttccg
gcatccgttatctacggacagcctactttgccgttgctgacaaatgttgacagtgcttat
tataaagctggaaaagttaagattactgtcgataacgaggcggtagtgaaaatagaaaaa
gactctttgcagatattgaaaccgggtaaggttaatctaactttggctgtgggtgatact
gctgttacacagtctttggatgttctgaaaaagacattgactatcacgggtattacggct
acgacaagaccctataatggtagcaaagaggttggtttggttacaaccgatatgaaagtg
gacggtcttgtgggggatcatacctctggaaatgttattactgttccgactacaggtgaa
gctctttctgctgacgctggcgtacagccggtgaccgtaacggctgctttgaaagatagt
tatggtgactattacgaactggcagaaataaccggtgtgatggatacgatcaagaaagtg
aaactgatttataaaactgccacttcggatgcaatagactttggtaaggttagtaccaaa
actttcacagcagctttggctgatggaactgcatttgtaaatggcgaagatgcgagtgtt
ttaggtggtacactccaatttgattgcccggtaaccgatgtatctttagcaggtaagtat
cctataatgccttatggctatacttccaataattacgaaatctattataaagctgattca
cttcaagtgaatgctgttgcaccgaaagctgaaatcacggctgtaacagtaaatggagta
ggcgatcaggcttctatatctgttgttggccgtatcttgtccaatggtggtacaccgact
gatcagttgaaggcgacagttataccgaaaacaggtggctctggtcctggaacaactgtc
aatgttgcaaaggacggtactttcaaaactgaaaatataaaacttacagccgcaatgtat
acagtagaacttacagttgtagcaaacgaaactcttgtttctgatgcagtaacttccgga
gaagttaatttggctgcaaaattgcaaaatgtaaacttcacatcggttcctgcccgtatg
acttacggaagtacagccggtatagctgttgcaagtacggaagctgatgccaagcttgtt
tatactattataggtgaagccataaagttcaattctgattcgacagaagtagaagctgta
aaagcaggagaggctactgtaacgataacagctactaaagcggagtacgtaacagctatc
gctaaacaaacgattaaggttgaacctaaattggtaacggtcaaagctgttgcaaaggat
aaggtttatgatggtaaacttgatgccgaagtttcttttacggctgaaggtattttggaa
aaagatgcatcattggttactctcaatactacaagtgtaacaggcacttttacagataag
aacgccggtgaaagtgcgaagactgtgattcttaaaggcgaatgttctttgaataacaat
actggtaactatgtcttggctcaaccggctaatccgacagccaaaatatcaaaagccaag
atcacttccattttcgcatctaacgtgaagcgcagttacaaaacaacttcattgtcttat
aaattggatgctgaaggtcttgtaaatggtgaactgattactacaccgggcttatacacc
ggaacaatcagtgtgaaagaggtatcaggcaaatattctatagatatgactggtgttacg
ttccgtaattacgattacgcaggtgttcaaccgatcggaggtgatgttaccattataaag
ggaattccgactatcgtaacttataatacggaaggaaatgctggtgctgcaggcatggtt
gtcgataacggtggctgggaaaatctcggcacaccggaaattgctgatgcaacagaaaca
gggaaagtatttgcaaggttgacatatcctgatggaaccgtaaccggtaatactatcatt
aaagaaaagcaagcacctgctgtaacgatcagcttggaaaatgtcgcttctgcttcttac
tattcccgtaaatctccgatgacaaaggctgtcggtagccagcttggctatagtgaagaa
aaagtcttgaacataactgtcagtggaacctatacggtggaatcgacaaccccttccgta
attactgtatataagaagaacgatgataagtattatattaagggaacaggtgtaggaaca
ggtgctatcctggttaaagtaggtgacgctgttgcttctaagactattgatgtggttcct
gctacattgaatgtgactgtgtccggccaaaataaagagtatgacggtacaacaacagcc
aatatcgcattgctgttggatgcagccgaaggtgcttctcttgatttggaaggcgtatcg
ttcaactatacaagcaaagatgcaggtaataaaagtattcttccgtcaaaagatattgtc
ctgaaaggaaataatgcagataactatgagttgaaagccatatccttgagtggtgaaatc
tctaaacgtacactgattgtgaccagccagataagtaaatattatgatggaaccaataca
attgatttgacggattattctgcaacgggattattgacagaagagaccgtaccgacagtt
acggcaacatttaccggcgatgccaatgtcggtttggataaggatatcaagctagcattg
aaggataataatagtaactatgttttagctaccgaaggcaatacggctaaaggtaatatt
tctaaatctacgttggaggcaactttgccggaaaaggcaacagatgcgactaatttaaag
aataatattacatatgtagttcgtgaatcaggtgaaacggttaaagctaatgctggtgtt
aaccaatatgtaactgttacaggttctaatccattctctgtaaaagcaacagataatgac
aattgcgttatcattgtgaataatacggctgtaaccaagtccgaccctgttactcctcct
tctggtggtgatggagacgaaaacgttacgatctctttggatgcaacgacaaaagctctt
ccacgtctcgaaaaattcgttttggaagcaactgtttctccttccggtaaaacagtgaca
tggagcagtagcgatccgacgatcgccagtgtgacagccgatggcaacaaggtaaccgta
aaggggcttaaagtcggaacagctacgatcacagctaagatcggtgacgtgaccgctact
tgtgaagtgacggttgactttgcaaccggccttgaagaagcccttgccaatacggaagtg
tttggaagaaagggaaatatttatgtgaatccgattcagtcgctacaagtgatcgttgtg
aacatgatcggtaagatcgtctacaatgcacgtatcaatagctatgcgcgaataccggta
acaaaaggcatttacattgtgaaattaaccaatgtcggcaatacgaaaattattaaggta
aatgtatactaa
DBGET
integrated database retrieval system
