Prochlorococcus marinus MIT 9301: P9301_12121
Help
Entry
P9301_12121 CDS
T00488
Symbol
recC
Name
(GenBank) possible exodeoxyribonuclease V subunit C 125 kD polypeptide
KO
K03583
exodeoxyribonuclease V gamma subunit [EC:
3.1.11.5
]
Organism
pmg
Prochlorococcus marinus MIT 9301
Pathway
pmg03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pmg00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03440 Homologous recombination
P9301_12121 (recC)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
pmg03400
]
P9301_12121 (recC)
Enzymes [BR:
pmg01000
]
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.1.11 Exodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
3.1.11.5 exodeoxyribonuclease V
P9301_12121 (recC)
DNA repair and recombination proteins [BR:
pmg03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
RecBC pathway proteins
P9301_12121 (recC)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Exonuc_V_gamma
RecC_C
DnaA_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABO17835
UniProt:
A3PDL0
LinkDB
All DBs
Position
complement(1029227..1032409)
Genome browser
AA seq
1060 aa
AA seq
DB search
MLNLYKSNKIEVISELLAEELKICPPAINEKLEIVVPNYFFGNWLREQITIKNKISALYE
LKTISTYTESLLTNFFPAIDMSAWNFESIKWGIVDSLEELNSFKESFPLRNWINKYLDNK
KIIDGDIYSLTKKITNNFIDYLIFRPEMIAQWNRYEINSSSLFKNLNSDQFWQPILYKLL
EEKISEKPSCLYMIEVIKNLRKIKNLQFQVPNQIYIFSDNNLSKLHINFYSELSKFIKVN
LYLLSPGEDLWNRINCLEGELEFDDNESKLNLNNTNIEKIFGKFGANFQKLIDENIYTEG
INLKNNLIYLDPTTNFNNKKDIPLLNQIQKRLIDNSTVDFTVSERDDSILLCEHFNQNSQ
FEYLRKKIIEIINSCENIKYSDIAVLSPQTNLIKPYLRYIFNNELINGEKIPYFFIDDDN
NDSAGIYEFLIDITEIASEKITLEKIDYILSKKVTQNIFDFNITEKDEIIFLLTQAGFHW
GLDDKERLGEEKNTLDWCINRITLGLIYDKEVNLSNFNLKPFSYKNISLDLNKWVKILIH
LKKYINLIRGSFSYTNWVEKIKFILKSVADSNANFNLEISQINRILDNHAIPLIPDDLIL
LKVFREILISCINKVKYQNKSRVNKILVSDIENSRHIPHKVIFLIDMNSVNYPKLPKSET
INLLKNKYHLGDPSVFEREKYAFLELLIACRDKFIVTWVKNDKDNKKLDVSFPIKELISF
FDSFLNQSQRELIIKDSDLNKNEIIDLDKCQIIKSNYSLIEDINWNEKKSDIKNYKLSEL
IYWFKNPQKYWLNKNNISPNEIFIHHPDEEYVSNLQKSQLITKIIQQIEIDKHNIIDDLN
ELNINDQLAENGIIMPKNSIFTKEKEIKDLLSSLAASLSQHNKINKIYVKLNANKEEYLI
ADETVIELINAKLSLSSLTEAWIKLLFISSLKRNIKRSKVIFRTENNYKSQIIQSPGEAE
SNLILEDYINIFKNYSEKCLPLPPESTYKYVEAKIKSKNEKKAFTDKWIGNKNFSKGERD
NIVMKLCFGNEKEPDFFLRNNNFDQLSYRLYGPLIKALKK
NT seq
3183 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgctcaatctttataagtcaaataaaattgaagtaattagtgagctgttagcagaggaa
ttaaaaatatgtcctccggctataaatgagaaattagaaatagtagtccccaattacttt
tttgggaattggttacgtgaacaaataactataaaaaacaaaataagtgctctttatgaa
ttaaagacaatatcaacgtataccgaatctttattgacaaattttttccctgcaattgat
atgagcgcatggaattttgagtcaattaaatggggaattgttgattccttggaagaatta
aatagctttaaagaatcatttccgcttagaaattggattaataaatatttggataataaa
aagataattgatggagatatatatagtctgacaaaaaagatcacgaataattttattgat
tatctgatttttagacctgaaatgattgctcaatggaatagatatgaaattaattcatct
agtctatttaagaatttaaactcggatcaattttggcagcctattttatataaattatta
gaggaaaagatatctgaaaagccatcatgtttatacatgattgaagtaataaagaattta
agaaaaattaaaaaccttcaatttcaagtgccaaatcaaatttatattttttcagataat
aacttatctaaactacatattaatttttattcagaactttcaaaatttattaaggtaaat
ttgtatttattatctcctggagaagatttatggaataggataaattgtcttgaaggtgag
ttggaatttgatgataatgaaagtaaattgaatttaaataatacaaatatagagaaaata
tttggtaaatttggagcaaactttcagaaattaattgatgaaaatatttatacagaaggt
ataaatttaaaaaataatcttatttatctcgatccaacaactaattttaataataagaaa
gatattcctcttcttaatcaaattcaaaaaagactaattgataatagtaccgtcgatttt
acagtaagtgaaagggatgactcaatattactttgtgagcattttaatcagaatagtcaa
tttgaatatttaagaaaaaaaattatagagataataaattcttgcgagaatattaaatat
agtgatattgctgttttatctccacaaacaaatttaattaaaccttatctaaggtacatc
tttaataatgagttaattaatggagaaaagataccttatttttttattgatgatgataat
aatgactctgcaggcatttatgaatttctaattgatattactgaaatagcaagtgaaaaa
attacacttgaaaaaatagattatattctttcgaaaaaagtaactcagaacatttttgat
tttaatattactgagaaggatgaaataattttcttactaacccaagcagggtttcattgg
ggattagatgataaagaaagattaggtgaagagaaaaatactctagattggtgtataaat
agaattactttagggttaatttatgataaagaagtaaatttaagtaattttaatttaaaa
ccatttagttataaaaatattagtttggatttgaataaatgggttaaaatattaattcat
ttaaaaaaatatattaatttgataaggggatctttttcttacacgaattgggttgaaaag
ataaagtttatattaaaaagtgttgctgattctaatgcaaatttcaatttagaaataagt
caaataaatagaattcttgataatcacgcaatacctttaatacctgatgatcttatcttg
ttaaaagtttttagagaaatattaatttcttgcataaataaagttaaatatcaaaacaaa
tcacgagttaacaagatcctagtaagtgatattgagaattcaaggcatattccacataag
gttattttcctgatagacatgaatagtgttaattatccaaaattaccaaagagtgaaacc
attaatttattaaaaaacaaatatcatttgggtgatccatctgtttttgaaagagagaaa
tatgcatttctggagttgttaattgcctgcagagataaatttatagttacctgggtaaaa
aatgataaagacaataaaaaattagatgtttcttttcctataaaagagttaatatctttt
tttgatagtttcttaaaccaaagccaaagagaactaataattaaagattctgatttaaat
aaaaatgaaataattgatcttgataaatgtcagattattaaaagtaattattctttaata
gaagatataaattggaatgaaaaaaaatctgatattaaaaattacaagttatcagaattg
atttattggttcaagaatccacaaaaatattggcttaataaaaacaatatttctcccaat
gaaatatttattcatcatccagacgaggagtatgtaagcaatctgcaaaagtcgcaatta
attacaaaaataatccagcaaatagagattgataagcataatattattgatgatttaaat
gaattaaatattaatgatcaattggctgaaaatggtattattatgcccaaaaatagtatt
tttacaaaagaaaaagaaatcaaagacttattaagcagcctagctgcaagtttgagtcaa
cataataaaattaataaaatctatgtcaagttaaatgcgaataaagaagaatatttaatc
gctgatgaaaccgtaattgaattaattaatgcgaagttaagtttaagtagtttgactgag
gcttggataaaattactctttatttcttctttaaagaggaatataaaaaggagtaaagta
atttttagaacagaaaataattacaaatcgcaaattattcaatcacccggagaagctgaa
tcaaatctaattttggaggattacataaatatttttaaaaattattctgaaaaatgttta
cctcttcctccagaaagtacttataaatatgtagaagcaaaaataaaatcaaaaaatgaa
aaaaaagcttttacagataaatggattggtaataaaaatttttctaaaggagaaagagat
aatatcgtaatgaaattgtgttttggtaatgaaaaagaaccagatttctttcttagaaat
aataattttgatcaattatcatacagattatatggtcctctaattaaagcattaaagaaa
taa
DBGET
integrated database retrieval system
