Prochlorococcus marinus MIT 9215: P9215_00691
Help
Entry
P9215_00691 CDS
T00598
Symbol
smc
Name
(GenBank) putative chromosome segregation protein, SMC ATPase superfamily
KO
K03529
chromosome segregation protein
Organism
pmh
Prochlorococcus marinus MIT 9215
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pmh00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
pmh03036
]
P9215_00691 (smc)
Chromosome and associated proteins [BR:
pmh03036
]
Prokaryotic type
Chromosome partitioning proteins
Condensin-like complex
P9215_00691 (smc)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SMC_N
SMC_hinge
AAA_23
AAA_21
AAA_29
AAA_15
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABV49688
CyanoBase:
P9215_00691
UniProt:
A8G257
LinkDB
All DBs
Position
66808..70398
Genome browser
AA seq
1196 aa
AA seq
DB search
MRLVHINQVEFENFKSFGGNVKIPLEEGFTVVTGPNGSGKSNILDGILFCLGLANSRGMR
AERLPDLINNSKVKEGKSSETSVSVKFNIQDWSPREDLPPLELEEEEIALNKGQKEWVVS
RKLRLMPGGSYASTYTSDGKQCTLQQIQRILRDISVDPEGSNVVMQGDVTRIVSMNNKER
RNLIDELAGVALFDTRIEQTNAKLNDVFERQERCEILENELQSSKNKLEKECEKAKLYKK
LKATLLQITELEKVLIFDKQVKHVESIEKKESEIEKNKILFNNQKESISKEISVLEDALK
ILVDELKEKGEDKLIKVNSDIGSINSSLRELDRISSLNREEGIKLQKQRDEIAISKRNIE
SEKNRQENFDENFLNQLNLQIDDLTLKHKLSRQKLSDAAGESGEFSKQSIKLNAELESIK
NQINPLEIKKRKIEEETIQNNIQKDEILSQIDSLDLEKQKLFEGNQRIKEISDTKNKNLA
SNSTEINSLKNAIDLLIKTKSRLNNEQLRLEKDLSRFESRKEALNESRGSYALRILLEAG
LEGIHGYVAQLGEVSEKNRYALEIAAGNRLGQIVVDNDHIAAKAIEILKKKKAGRLTFLP
LNRIKSQKKNYAISRFENNRENGFIDKAINLITFDEVYSDVFRYVFGDTLVFSDLSSARL
STQKKRLVTLSGELLEASGAITGGSKLNKDLAYRFGINNDIDDSSPIKERLLVIEEALKE
SNNDLIIKNNRLSKLNSNRSLIIEDCASFNKEIEVNQDSLKAVSHRIEDCKSRLNKLDTA
NNLLVNELDHLKNELKPYHDRFDELQTIQKTNYEKNQKSSLIAFNNDFNNLDKKLELLIK
ERDTLIDKKNQFALNKERINNSLKINLLQEKNLQESIKNLAIAHSEWIEKRDKFKKELLA
LDNKKNSLEKDLGLLRRKRDELNASISNKRQEYNNYLLKLEYLERDTHSLKEEMRSEKIK
LENYKKDLPNPSPEFGEYEGKSLESLQSEISIINAKLQSLEPVNMLALDELEELVERLNG
LREKLEILSNERSELLLRIETVSTMRQEAFMQAFTEVDKHFKEIFANLSDGDGFLQLENP
NSPLEGGLTLVAHPKGKNVRRLASMSGGEKSLTALSFLFALQKYQPSPFYALDEVDSFLD
GINVERLSKLISNQSSNAQFIVVSHRRPMISASERTIGVAQARGANTQVLGLPNAA
NT seq
3591 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgagattggtacatatcaatcaggtcgagtttgaaaattttaaatcttttgggggaaat
gtgaaaattcctctagaagagggttttactgtggttacgggtcctaacggttctggaaaa
agtaatattttagatggaattttgttctgtttaggtctagctaatagtagagggatgagg
gctgaaagattaccagatctaataaataactccaaagttaaagagggtaagtcatcagaa
acatctgtatcggtaaaatttaatattcaagattggtctcccagagaggaccttccgcct
ttggaactagaagaagaagaaattgcccttaataaaggtcaaaaagaatgggtagtttct
agaaaattaaggcttatgccaggtggctcttatgcttctacttatacttctgatggaaaa
caatgtacattgcaacaaatacagagaatattaagagatattagtgttgatcctgagggc
agcaatgttgttatgcaaggtgatgtaacaagaatagtatcaatgaataataaggaaaga
agaaatcttattgatgaattagcaggagtcgcactttttgatacaagaatagaacaaact
aatgcaaaattaaatgacgttttcgaaagacaagaaagatgtgagattttagaaaacgaa
ttgcaatctagtaagaataagcttgaaaaagaatgtgaaaaagcaaagctatataaaaag
ttaaaggcaacactattgcaaataacggaattagagaaagttcttatttttgataaacaa
gttaagcatgttgaatctatagaaaaaaaagaaagtgaaattgaaaaaaataaaatatta
tttaataaccaaaaagaatctattagcaaagaaatatcagtcttagaagatgctttgaaa
atactggttgatgagcttaaggagaaaggagaggataaattgataaaagtcaattctgat
attggaagtattaattctagcttgagagaacttgataggatatcaagtcttaatagagaa
gaaggtattaaattacaaaagcagagagatgaaattgcaatttctaagaggaatatcgaa
tcagaaaagaatagacaagaaaatttcgatgaaaattttttaaatcaattgaacttgcaa
attgatgatctcactttaaaacacaaattatccagacaaaaactttctgatgcggctgga
gaatctggagaattctcaaaacaaagtatcaaattaaatgcagagcttgaaagtataaaa
aatcaaattaatcctttagaaataaaaaaaaggaaaattgaagaagaaactatccaaaat
aatattcaaaaagatgagatattatctcagattgactccttagacttagaaaagcagaaa
ctttttgagggaaatcaaagaataaaagagatatccgacacaaagaataaaaacttggca
agtaatagcacagaaattaattctttaaaaaatgcaattgatttattaattaaaactaaa
tcaaggctaaataacgagcaattaaggcttgaaaaggatttatctagattcgaaagcagg
aaggaagctttaaatgaatctagaggttcatatgctctcagaattcttttagaagcaggg
ttagagggaatacatggttatgtagctcaacttggagaggttagtgagaaaaatagatat
gcattagaaattgctgctggaaatagattaggacaaattgttgttgataatgatcatatt
gctgctaaagcaattgaaatccttaaaaagaagaaagcgggaagattaactttcttacct
ttaaatagaattaaaagtcaaaaaaagaattatgcaatttcaagatttgaaaataacagg
gagaatggatttattgataaagctattaatctaatcacttttgatgaagtctattcagat
gtttttcgatatgtttttggagatacgttggttttttcagatttatcctcagctaggtta
tctacacaaaaaaaaaggttggttaccttaagtggtgaattattagaagcaagtggtgct
attacagggggcagtaagttaaataaagatttggcttataggtttggaattaacaatgat
attgatgattccagtcctataaaagaaagattattagttatcgaagaagctttaaaagag
tcaaataatgatttgataataaaaaataatagactcagtaaattaaattctaaccgcagt
ctaataattgaggattgtgcctcatttaataaagaaattgaagtaaatcaagattctctt
aaggctgtctcgcatagaattgaggattgtaaatcaagactaaataaacttgatactgct
aataatttattagttaacgaattagatcatttaaaaaatgaattgaagccttatcatgat
aggtttgatgaattacaaaccattcaaaagactaattatgaaaaaaatcaaaaatcgtca
ttaatagcttttaataacgattttaataatcttgataaaaaacttgaattacttattaaa
gagagagatacattaatagataaaaagaatcaatttgctttaaataaagagcgtatcaat
aattcattaaaaattaatttattacaagaaaaaaacttgcaggaatctattaaaaatctc
gcaattgctcatagtgaatggatagaaaaaagagataaatttaagaaagagcttttagct
ctcgataataaaaaaaattctctagagaaggatttagggttattgagaaggaaaagagat
gaattaaacgcttcaatttcaaataaaaggcaagaatataataactatctgttgaagctt
gaatatcttgaaagggatacgcattctcttaaagaagagatgaggagcgagaaaattaaa
ttagaaaattataaaaaagatctacctaatccttcccctgagtttggagaatatgaaggg
aagagtcttgaatctttgcaatcagaaatttcaatcataaatgcaaaactacaaagctta
gaacctgttaatatgttggctcttgatgaactagaagaattagttgagagattaaatggt
ttgcgagaaaaattagaaattctatccaatgaaagatctgaattattgctgagaatagaa
actgtatctacgatgcgtcaggaggcttttatgcaagcattcacagaagtggataaacat
tttaaagaaatatttgcaaatttatctgatggagatggatttcttcaacttgaaaatcct
aattctcctttagaaggaggattaactttagtggctcatcctaaggggaaaaatgtcaga
agattagcctctatgtcaggtggtgaaaaatcgttaactgctttaagttttttatttgct
ttgcaaaagtatcaaccttcacctttttatgcattagatgaggttgatagtttcttagat
ggtataaatgttgaaagattgtcaaaattaatatctaatcagtcatcaaatgctcaattt
atagttgtaagtcatagaaggcctatgattagtgcatctgaacgaacaattggggttgcg
caagcaagaggtgctaatactcaagttcttgggttaccaaatgctgcataa
DBGET
integrated database retrieval system
