KEGG   Prochlorococcus marinus MIT 9215: P9215_11841
Entry
P9215_11841       CDS       T00598                                 
Symbol
ddpA
Name
(GenBank) ABC transporter, substrate binding protein, possibly oligopeptides
  KO
K02035  peptide/nickel transport system substrate-binding protein
Organism
pmh  Prochlorococcus marinus MIT 9215
Pathway
pmh02024  Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pmh00001]
 09140 Cellular Processes
  09145 Cellular community - prokaryotes
   02024 Quorum sensing
    P9215_11841 (ddpA)
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:pmh02000]
    P9215_11841 (ddpA)
Transporters [BR:pmh02000]
 ABC transporters, prokaryotic type
  Peptide and nickel transporters
   Peptides/nickel transporter
    P9215_11841 (ddpA)
SSDB
Motif
Pfam: SBP_bac_5
Other DBs
NCBI-ProteinID: ABV50799
UniProt: A8G5B8
LinkDB
Position
complement(1001329..1002906)
AA seq 525 aa
MKYKKKVVLSIFIILISFLQNSCGSKRISRKFIVASSGKIESLDPARANTLKAIQLISSL
GDTLYELNSDGELIPELASGMPVISKDRLQITINLRKNVFFHDGTAFNSNAMKFTFDRFK
RIGTMNYILGNKIKSIETPSEYSFIINLNKPSSSLNGLLTSVNLTPISPTFYKKYSDKFL
NEKFVGTGKYVLTSFSNEVQSIDPYLNYWGEKPLNNGVNFVGYSNSSSLFGALKSKQIDV
LLSNSIDDSQRKNLNNLSKNKQFNEGNSPFTELSFISLKTSSYPLSNLNLRLALAKSLNR
KLISEKVSYGLRKPSRSIIPPILKKDNQELWPKYNYLEARRLLKKENYCKGNILKIPLTY
RSNVPADKLIALTWQAEIKNYLKDCIDIELNGVESTTVYKNLSLGIYTAVILDWTGAYSD
PEAYLTPLLSCNEIVDGICKKGESVYSGSFWGSNKVESLFIESEKISGITRLEKLVEIEK
IAASAIPYIPIWISSQKAWSQNKISKPVFNGAGIISLSDLKLINE
NT seq 1578 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaatataaaaaaaaagttgttttatcaatatttattattttaatttcttttttacag
aattcttgcggttcaaaaagaatatctagaaaattcatagtagcaagttctggaaaaatt
gaatctttagatccagctagagcaaatactcttaaagcaattcaattaatcagttctctt
ggagacacattatatgaattaaattctgatggagaattaatccctgaattggcctcgggg
atgccagttatttcaaaggatagacttcaaataactatcaatttaagaaagaatgttttt
tttcacgatggaactgcatttaactcaaatgctatgaagtttacctttgatagattcaaa
agaattggaacgatgaactatattttaggaaataagattaaatcaatagaaacgccgagt
gaatattcattcataataaatttgaataaaccatcaagttctttaaatggtttactcaca
tcagtaaatctaactccaatatctcctacattttacaaaaaatattctgataagtttcta
aatgaaaaattcgttggtactggcaagtatgtgctaaccagtttttctaatgaagtgcaa
tcaattgatccatatttgaattattggggtgaaaagcccttaaataacggcgttaatttt
gtgggatattcaaattcgtcctctctttttggggctttaaaaagtaaacaaattgacgta
cttttatcaaattcaattgatgatagtcagagaaaaaatttaaataatttaagcaaaaat
aaacagtttaatgaaggtaatagcccttttactgaattaagttttataagccttaaaact
agttcttatcccttaagtaatcttaatttaagactggctttggcaaaaagtcttaataga
aaattgattagtgagaaagtaagttatggattaaggaagccatctagatcaattattcct
ccgatattaaaaaaagataatcaagaactgtggcctaaatataattatttagaagcgaga
aggttattgaaaaaagaaaattattgcaaaggaaatattctaaaaataccccttacttat
agatcgaatgtcccagctgacaagcttattgctctgacatggcaggcggaaattaaaaat
tatttgaaagattgtattgatattgaactcaatggtgttgaatctacaacagtttataag
aatttaagtttaggaatttatacagcagttattctcgattggactggagcttattcagat
ccagaagcctatctcacccctcttttgagttgtaatgaaatagttgatggtatatgtaaa
aaaggggaatcagtttacagcggtagtttttggggatctaataaagtggaaagtttattt
attgagagtgaaaaaataagtggaattacaagattagaaaaacttgttgaaattgaaaaa
atagcagcaagtgcaataccttatattcctatttggatatcctcacaaaaagcatggtct
caaaataaaatatcaaaacctgtatttaatggtgcaggaataatttcattgagcgatctt
aaattaataaatgagtag

DBGET integrated database retrieval system