Prochlorococcus marinus MIT 9312: PMT9312_0059
Help
Entry
PMT9312_0059 CDS
T00297
Name
(GenBank) condensin subunit Smc
KO
K03529
chromosome segregation protein
Organism
pmi
Prochlorococcus marinus MIT 9312
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pmi00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
pmi03036
]
PMT9312_0059
Chromosome and associated proteins [BR:
pmi03036
]
Prokaryotic type
Chromosome partitioning proteins
Condensin-like complex
PMT9312_0059
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SMC_N
SMC_hinge
AAA_23
AAA_21
AAA_29
Peptidase_M10_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABB49120
UniProt:
Q31DC5
LinkDB
All DBs
Position
61229..64819
Genome browser
AA seq
1196 aa
AA seq
DB search
MRLVHINQVEFENFKSFGGSVKIPLEEGFTVVTGPNGSGKSNILDGILFCLGLANSRGMR
AERLPDLINNSKVKEGKSSETFVSVKFNIQDWSPREDLPPLELEEEEIALKKGQKEWVVS
RKLRLMPGGSYASTYTSDGKQCTLQQIQRILRDISVDPEGSNVVMQGDVTRIVSMNNKER
RNLIDELAGVALFDTRIEQTNAKLNDVFERQERCEILENELQSSKNKLEKECEKAKRYKE
LKAKLLQITELEKVLIFDKQVKHVESIEKKETEIEKNKILFNEQKESINKEISVLEGALK
ILVAELKEKGEDTLIKVNSDIGSINSSLRELDRVSSLNKEEGIKLQKQRDEIAISKRNIE
SEKMRQENFDENFLNKLNLQIDDLTLKHKLSRKKLSDAAGESGEFSKQSIKLNAELESIK
NKINPLEIKKRKVEEETIQNNIQKDAISSQIDALALEKQKLLEGNQIKKETSEINKNNLA
SNSLEINSLKNEIDLLNKTKLRLNNEQLRLEKDLSRFESRKEALNESRGSYALRILLEAG
LEGIHGYVAQLGEVSEKNRYALEIAAGNRLGQIVVDNDHIAAKAIEILKKKKAGRLTFLP
LNRIKSQKKNYAISRFENNREHGFIDKAINLITFDEVYSDVFRYVFGDTLVFSDLASARL
SKQKNRLVTLSGELLEASGAITGGSKLNKDLAYRFGINNDLDDSSPIKERLLVIEEALRE
SNNDLIIKNNRLNKLNSNRSHIIEDCASFNKEIEVNKNSVEVVMKRIQDFKLSLNKLDSA
NNLLVEELDSLKNELKPHHDKFDQLQIILKENYEKNQKSSLIAFNNDFNNLDKKLELHIK
ERDTLLDKKNQFALNKERINNSLKITLLQEKNLQESIKELAIAHSEWIEKRDKFKKELLV
LNNQKNSLEKDLGFLRRKRDELNSSISNKRQEYNNYLLKLEYLERDMHSLKEEMRSEKIK
LENYKKDLPNPFPKLEEYEEKSLESVQSEISIINAKLQSLEPVNMLALDELEELIERLNG
LREKLAILSNERSELLLRIETVSTMRQEAFMQAFLEVDKHFREIFANLSDGDGFLQLENT
NSPLEGGLTLVAHPKGKNVRRLASMSGGEKSLTALSFLFALQKYKPSPFYALDEVDSFLD
GINVERLSKLISNQSSNAQFIVVSHRRPMISASERTIGVAQARGANTQVVGLPNAA
NT seq
3591 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgagattggtacatatcaatcaggtcgagtttgaaaattttaaatcttttgggggaagt
gtaaaaattcctcttgaagaaggttttacagtggttaccggccctaacggttctgggaaa
agtaatattttagatggcattttattctgtttaggtttagctaatagtagaggaatgagg
gcagaaagattacctgatctaataaataattccaaagttaaagaaggcaagtcatccgaa
acatttgtatcggtaaaatttaatattcaagattggtctcccagagaggaccttccgccc
ttggaattagaagaagaagaaattgctcttaagaaaggtcaaaaagaatgggtagtttct
agaaaattaaggcttatgccgggtggttcttatgcttcgacttatacttctgatggaaaa
caatgtaccttgcaacaaatacagagaatattaagggacattagtgttgatcctgaggga
agcaatgttgttatgcagggtgatgtaacaagaatagtatcaatgaataacaaggagagg
agaaatcttattgatgaattagcaggagtcgcactgtttgatacaagaatagaacaaact
aatgcaaaattaaatgatgttttcgaaagacaagaaaggtgtgaaattttagaaaatgaa
ttgcaatctagtaaaaataagcttgaaaaagaatgtgaaaaagcaaagcgatacaaagag
ttaaaggcaaaacttcttcaaataaccgaattagagaaagttcttatttttgataaacaa
gtgaagcatgttgaatctatagagaaaaaagaaactgaaattgaaaaaaacaaaatatta
tttaatgaacaaaaagaatctattaataaagaaatatcagttttagaaggtgctctgaaa
attctggttgctgagcttaaggagaaaggagaggataccttgataaaggtcaattctgat
attggaagtattaattctagcttgagagaacttgatagggtatcaagtttgaataaagaa
gagggtattaaattacaaaagcagagagatgaaattgcaatatctaagaggaatatcgag
tcagaaaagatgagacaagaaaattttgatgagaattttttaaataaattgaacttgcaa
attgatgatctgacattaaaacacaaattatccagaaaaaaactttctgatgcagcggga
gaatctggagaattctcaaaacaaagtatcaaattaaatgctgagcttgaaagtataaaa
aataaaattaatcctttggaaataaaaaaaaggaaagttgaagaagaaacgatccaaaat
aatattcaaaaagatgcaatatcttctcagatcgatgctttagctttagaaaagcagaaa
cttttagagggaaatcaaataaaaaaagagacatccgagataaataaaaataatttagca
agtaacagcttggaaattaattctttaaaaaatgaaattgatttattaaataaaactaaa
ctaaggctaaacaacgagcaattaaggcttgaaaaggatttatctagatttgaaagcaga
aaggaagctttaaatgaatctagaggttcatacgctctaagaattcttttagaagcagga
ttagagggtatacatggttatgtagctcaacttggagaggttagtgagaaaaatagatat
gcattagaaattgctgctggaaatagactaggacaaattgttgttgacaatgatcatatt
gcagctaaagctattgaaattcttaaaaagaagaaagcgggaagattaacttttttacct
ttaaatagaattaaaagtcaaaagaagaattatgcaatttcaagatttgaaaataataga
gagcatggattcattgataaagccattaatttaattacttttgatgaagtttattcagat
gtttttagatatgtttttggagatacattggttttctcagacttagcctcagctagatta
tctaaacaaaaaaataggttggttactttaagtggtgaactattagaagcaagtggagct
attacagggggcagtaagttaaataaagatttagcttatagatttggaattaataatgat
cttgatgactctagccctataaaagaaagattattggttattgaagaagccttaagggag
tcaaataatgatttaattataaaaaataatagactcaataaattaaattctaaccgcagt
catataattgaggattgtgcttcatttaacaaagaaattgaagtgaataaaaattctgtt
gaagttgtcatgaaaagaattcaggatttcaaattgagtttaaataaacttgatagtgct
aataatttattagttgaggagttagatagtttaaaaaatgaattgaagcctcatcatgat
aagtttgatcaattgcaaatcattcttaaggagaattatgaaaaaaatcaaaaatcatca
ttaatagcttttaataacgattttaataatcttgataaaaaacttgaattacatattaag
gagagagatacattactagataagaagaatcaatttgctttaaataaagagcgtatcaat
aattcattaaaaataactttattacaagaaaaaaacttgcaggaatctatcaaagaactt
gcaattgctcatagtgaatggatagaaaaaagagataaatttaaaaaagagcttttagtt
ctcaataatcaaaaaaattccctagagaaggatttaggttttttgagaagaaaaagagat
gaattaaactcttcaatttcaaataaaaggcaagaatataataactatctattgaagctt
gaatatcttgaaagggatatgcattctctgaaagaagagatgaggagcgagaaaataaaa
ttagaaaattataaaaaagatctacctaatcctttcccaaagcttgaagaatatgaagag
aagagtcttgaatctgttcaatcagaaatctcgattataaatgcaaaactacaaagctta
gaacctgttaatatgctggctcttgatgaactagaagaattaattgagcgattaaatggt
ttacgagaaaaattagcaatcctatctaatgaaagatctgaattattgctgagaatagaa
actgtatcgactatgcgtcaggaggcttttatgcaagcatttttagaagttgataaacac
tttagagaaattttcgcaaatttatctgatggagatggtttccttcaacttgaaaatact
aattctcctttggaaggaggattaactttagttgcacatcctaagggaaaaaatgtcaga
agattagcctctatgtcaggtggtgaaaaatcattaactgctttaagttttttatttgcg
ttgcaaaagtataaaccttcccctttttatgcattagatgaggttgatagttttttagat
ggtatcaatgttgaaaggttgtcaaaattaatatctaatcagtcatcaaatgcacaattt
atagtcgtaagtcatagaaggcctatgattagtgcgtctgaacgaacaattggtgttgcg
caggcacgaggtgctaatactcaagttgttgggttaccaaatgctgcataa
DBGET
integrated database retrieval system
