Prochlorococcus marinus MIT 9312: PMT9312_0417
Help
Entry
PMT9312_0417 CDS
T00297
Name
(GenBank) putative ABC transporter, oligopeptides
KO
K02034
peptide/nickel transport system permease protein
Organism
pmi
Prochlorococcus marinus MIT 9312
Pathway
pmi02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pmi00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
PMT9312_0417
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pmi02000
]
PMT9312_0417
Transporters [BR:
pmi02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
Peptide and nickel transporters
Peptides/nickel transporter
PMT9312_0417
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
BPD_transp_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABB49478
UniProt:
Q31CB7
LinkDB
All DBs
Position
396030..396851
Genome browser
AA seq
273 aa
AA seq
DB search
MGTNIRKAGFLIVLFYLLVVLIMKFLEANNFFGYSFSMLSNDIFAPPSLNHFCGTDRLGR
DVCLRTLQGSSLAIEVVFLAILFSLSLGLPLGLLSGYFGGFFDKCLSLIMDTIFSIPVIL
LSVVVAFVLGKGILNAALALCIVYSPQYFRLIRNQTILVKSETYVEAAQVSGADVKTIIF
KYILPNVITPLPILLTLNAADAVLVLGSLGFLGLGVPADVPEWGSDLNLALAALPTGIWW
TALFPGLAMFFLVLGLSFIGEDLEEIFDSQNSE
NT seq
822 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgggcacaaatatcagaaaagctggatttctaattgtacttttttatctgcttgttgtt
ttaataatgaaatttttagaggccaataatttttttggttattcattttcaatgttaagc
aatgatatctttgcccctccttcgcttaatcatttttgtgggacagatagattaggaaga
gatgtttgcttaagaactttgcaaggatcatccttagcgatagaagttgtattcttagct
attcttttttcattaagtttgggtttgccattgggattattaagtggatattttggtggt
ttttttgataaatgcttatcactaataatggatactattttttcaatacctgtaattttg
ctttcagttgttgtggcttttgtattgggtaagggtatccttaacgcagctttggcattg
tgtattgtttactctcctcaatattttagattaatcagaaatcagacaatattggttaaa
tccgaaacttatgtggaggcagctcaagtttcaggagctgatgttaaaacaattattttt
aaatatattcttccaaatgtaataacacctttgcctatcctgcttaccctaaatgctgcg
gatgctgttttggtattgggaagtttaggatttttaggccttggtgttcctgcagatgtt
cctgaatggggcagtgatttaaatcttgctcttgcagctttacctacaggtatatggtgg
acggctttgttcccaggtttggcaatgttttttttagttttaggcctttcttttataggg
gaggatcttgaagagatttttgatagtcaaaattccgaataa
DBGET
integrated database retrieval system
