Candidatus Phytoplasma mali: ATP_00097
Help
Entry
ATP_00097 CDS
T00729
Symbol
dnaE
Name
(GenBank) DNA polymerase III, alpha subunit
KO
K02337
DNA polymerase III subunit alpha [EC:
2.7.7.7
]
Organism
pml
Candidatus Phytoplasma mali
Pathway
pml03030
DNA replication
pml03430
Mismatch repair
pml03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pml00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
ATP_00097 (dnaE)
03430 Mismatch repair
ATP_00097 (dnaE)
03440 Homologous recombination
ATP_00097 (dnaE)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
pml03032
]
ATP_00097 (dnaE)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
pml03400
]
ATP_00097 (dnaE)
Enzymes [BR:
pml01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
ATP_00097 (dnaE)
DNA replication proteins [BR:
pml03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
ATP_00097 (dnaE)
DNA repair and recombination proteins [BR:
pml03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
ATP_00097 (dnaE)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
DNA_pol3_finger
PHP
HHH_6
KIX
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAP18284
UniProt:
B3R0C0
LinkDB
All DBs
Position
127224..129986
Genome browser
AA seq
920 aa
AA seq
DB search
MRGYFYCQSYYNLLKSLNSLEDIVKTAIKNNYDFVSLSDDENLYGMIEFLELCYKYKIKP
VIGIKIKLNLNKKNEFSKNNKKIEILVYAKNDIGINNLIKLSNIIKAENKEVYLQDLQEL
QEGIFVIISILDKFFFEKVNNYFLSPTDANKEIIETILLNFKEKIKNFYIGISLQANINV
DMIEYGINDLSIISPDLEQIEDNITYFADKLKIKILPTHKTKYLEQKDNIVYEQLIKLNT
DNKNEKNNQKLNFSFLTKEEFILKYDKFPKLMLNLQELVSKINYSNNIFDDKFHLPKINK
DVLLDSSKILKKKTWENFKKKINTKENKIYSEYVKRLKHELKIISQMKYEDYFLIVADII
SYAKKNNILVGPGRGSSVGSLVCFCLDITEIDPLKYDLIFERFLNPQRTKMPDIDLDFPD
NQRENVINYVKNKYKNNNVANLITFLHFPMNFLIDKIANNLYGYTNTDNLKKKISKKTLD
KTDYKGKEIERIANIIIKIPRTTGTHISGIILSQENLLKTLPLQLNNNNKQTNYQTQFED
KNLQKIGLFKIDFLGIKALTLMNKILKKIKNLEIKNIPLDDIKTYNLLKEQKTISIFQLE
STTAKNVLKKIQPCKFSDLIDVLGFNRPGTINFINEYIRNKNTNIKKVFLHPLIHEILKP
THGVIIYQEQIMQIIIKFANYNLIEADNFRNAISKKDQYFLINEKNTFIKKSMENGNSIE
DTNKIYDHIYNFANYGFNKSHSVAYALITYRMSYLKTNYQKEFNLVLLNQFAKNNDWEAT
NNFIKEIKTEMKFIKPNIFNSSNQYNVLSEKKLIIPLISIKGVDNNFYQNLIKEKEQKKF
ENYENFKQRLKISLNLNKNENLLDNLIFSGALDIFGLNRRTLYEYKNINSERPKEYEEFS
KIKLINEEKKAFKFDLSLIK
NT seq
2763 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagggggtatttttattgtcaaagttattataatttattaaaaagtcttaattcatta
gaagatattgttaaaacagcaataaaaaataattatgattttgtatcactaagcgatgat
gaaaatttatacggtatgatagaatttttagaattatgttataaatataaaattaaacct
gttataggtattaaaataaaattaaatttaaacaaaaaaaatgaattttcaaaaaataat
aaaaaaatagaaattttagtttacgctaaaaatgatataggaattaataatttaattaaa
ttatctaacataattaaagcagaaaacaaagaggtatatttgcaagatttacaagaatta
caggaaggaatttttgtaattatttccattctagataaatttttttttgaaaaagttaat
aattattttttatctccaacagatgcaaataaagaaataattgaaacaatattgctaaat
tttaaagaaaaaataaaaaatttttatatcggtatttctttacaagctaatattaatgtt
gacatgattgaatatggaataaatgatttatcaattatatcgcccgatttagaacaaatc
gaagataatataacatactttgcagataaattaaaaataaaaattttacctactcataaa
acaaaatatttagaacaaaaagataatattgtatatgaacaattaattaaattgaatact
gataataaaaatgaaaaaaataatcaaaaattaaactttagttttttgacaaaagaagaa
tttattttaaaatatgataaattcccaaaattaatgttaaatttacaagaattagttagc
aaaattaattattctaataatatattcgatgataaatttcatttaccaaaaattaataaa
gatgttttattagattcttcaaaaattttaaaaaaaaaaacttgggaaaattttaaaaaa
aaaataaatacaaaagaaaataaaatttattctgaatatgtaaaaagattaaaacatgaa
ttaaaaattatttctcaaatgaaatatgaagattattttttaattgtggctgatattata
tcttatgctaaaaaaaataatattttagttggacccggacgaggttcttcagttggttct
ttagtatgtttttgtttagatattactgaaatcgatcctttaaaatatgacttaattttt
gaaagatttttaaatcctcaacgaacaaaaatgccagatattgatttagattttcctgat
aatcaaagagaaaatgttataaattatgtaaaaaacaaatacaaaaataataatgttgca
aatttaattacttttttacattttcctatgaattttttaatagataaaatagcaaataat
ttatatggttatacaaatacagataacctaaaaaaaaaaatttcaaaaaaaacattagat
aaaacagattataaaggtaaagaaattgaacgcatagcaaatataataataaaaatacca
agaactacaggtactcatatttctggcattattttaagtcaagaaaatttattaaaaact
cttccacttcaattaaacaataacaataaacaaacaaattatcaaacacaatttgaagat
aaaaatttacaaaaaattggtctattcaaaatagactttttaggaataaaagctttaact
ttaatgaacaaaattttaaaaaaaattaaaaatttagaaataaaaaacattccattagat
gatataaaaacatataatttattaaaagaacaaaaaactataagtatttttcaattagaa
tcaacaacagctaaaaatgttttaaaaaaaattcaaccatgcaaattctcagatttaata
gatgttttagggtttaatagacctggaacaataaattttattaatgaatatataagaaat
aaaaacacaaatattaaaaaagtttttttacatcctttaattcatgaaattttaaaacct
actcatggagttattatttatcaagaacaaataatgcaaataattattaaatttgcaaac
tataacttgatagaagcagataactttagaaatgccataagtaaaaaagatcaatatttc
ttaattaatgaaaaaaatacttttataaaaaaaagtatggaaaatggaaattcaatcgaa
gatacgaataaaatttatgatcatatttacaattttgctaattatggtttcaataaaagt
catagcgttgcctatgctttaataacttatcgtatgtcttatttaaaaactaattaccaa
aaagaatttaatttagtattattaaaccaatttgcaaaaaataatgactgggaagcaacc
aataatttcataaaagaaataaaaacagaaatgaaatttataaaacctaatattttcaac
agttcaaatcaatataatgttttatctgaaaaaaaactaattattcctttaatctcaatt
aaaggggttgataataatttttatcaaaacttaataaaagaaaaagaacaaaaaaaattt
gaaaattatgaaaattttaaacaaagattaaaaataagtttaaatttaaataaaaacgaa
aatttattagataatttaattttttctggagctttagatatttttggtttaaatcgtaga
actttatatgaatataaaaacataaatagtgaacgacctaaagaatatgaagaattttca
aaaataaagttaattaatgaagaaaaaaaagcatttaaatttgatttatctttaattaaa
taa
DBGET
integrated database retrieval system
