Candidatus Phytoplasma mali: ATP_00164
Help
Entry
ATP_00164 CDS
T00729
Symbol
thdF
Name
(GenBank) tRNA modification GTPase
KO
K03650
tRNA modification GTPase [EC:3.6.-.-]
Organism
pml
Candidatus Phytoplasma mali
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pml00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
pml03016
]
ATP_00164 (thdF)
Transfer RNA biogenesis [BR:
pml03016
]
Eukaryotic type
tRNA modification factors
Other tRNA modification factors
ATP_00164 (thdF)
Prokaryotic type
Methyltransferases
ATP_00164 (thdF)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
MnmE_helical
TrmE_N
MMR_HSR1
FeoB_N
Ras
Dynamin_N
Roc
GTP_EFTU
MMR_HSR1_Xtn
AAA_29
RsgA_GTPase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAP18351
UniProt:
B3R0I7
LinkDB
All DBs
Position
210069..211427
Genome browser
AA seq
452 aa
AA seq
DB search
MIFDTIAAIITPFGTGGVSIIRISGTKTIEEIRKIFKGKNLNKMNSHTITHGFILNKDNI
ILDEVLISLFKNPKSFTGEDVIEIHTHGGILITQMVLERILELNIRMSLPGEFSQRAYLN
RKIDLIQAESIMDLIYAKNENAIKIANLGLQKKTSQLVIQLREKILNLISQIEVNIDYPE
YEDTTVMSKENILPQTKLLIKEIKNVLKYSYKTRYLKEGVETLIIGRPNVGKSSLLNFFL
EEERSIVSDIPGTTRDFVDVYFNLQGITLHLIDTAGVREAEDKIEKIGVLKTKQLLKKAE
LVLLVLDQNNCLQSEDKELLNLTKDYPRILIGNKSDLKTKIEKQQLTEEIIFISTIEKKG
LELLKNNILKILKLDVIKEKDFNYFSNTRHIQQIKKALCFLEDASNSLQNNIPVDICVDD
FKKSYEFLGLILGECQTDDLIKNLFSKFCLGK
NT seq
1359 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattttcgatactatagcagcgattataaccccttttggaacgggtggggttagtatt
attagaattagtggaacaaaaaccatagaagaaataagaaaaatttttaaaggtaaaaat
ttaaataaaatgaattctcacaccatcacacatggttttattttaaataaagataatatt
attttagatgaagttttgatttctttatttaaaaatcctaaatcttttactggagaagat
gtaattgaaattcatactcatggaggaattttaattacacaaatggttttagaaagaata
ttagaattaaatattagaatgtctttgccaggagaatttagtcaaagagcttatttaaac
cgtaaaattgatttaatacaagcagaatcaattatggatttaatttatgctaaaaatgaa
aatgctattaaaatagctaacttaggtttacaaaaaaaaacctctcaattagttattcaa
ttaagagaaaaaattttaaatttaatatcacaaattgaagttaatattgattatccagaa
tacgaagatacaactgtaatgtctaaagaaaatattttgccccaaactaaattattaatt
aaagaaataaaaaatgttttaaaatattcttataaaacacgttatttaaaagaaggggtg
gaaactttaattattggtcgtcctaatgtaggtaaatctagtttattaaattttttttta
gaagaagaaagatctattgtttctgatataccaggaactacaagagattttgtagatgtt
tatttcaatttacaaggaattacattacatttaattgacacagctggtgttagagaagca
gaagataaaatagaaaaaataggtgttttaaaaactaaacaacttttaaaaaaagcagaa
ttagttttattagttttagatcaaaacaattgtttacaatcagaagataaagaattattg
aatttaacaaaagattaccctcgaattttaataggcaataaatcagatttaaaaactaaa
attgaaaaacaacaattaacagaagaaattatttttatatccactattgaaaaaaaagga
ttagaattacttaaaaataatattttaaaaattttaaaactagatgttattaaagaaaaa
gattttaattatttttcaaacacaagacatattcaacaaataaaaaaagctttatgtttt
ttagaagatgcttcaaattcattacaaaataatatacccgtagatatttgtgtagatgat
tttaaaaaatcttatgaatttttaggtttaattttaggcgaatgtcaaactgatgattta
ataaaaaatttattttctaaattttgtttaggtaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
