Candidatus Phytoplasma mali: ATP_00196
Help
Entry
ATP_00196 CDS
T00729
Symbol
gyrA
Name
(GenBank) DNA gyrase, alpha subunit
KO
K02469
DNA gyrase subunit A [EC:
5.6.2.2
]
Organism
pml
Candidatus Phytoplasma mali
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pml00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
pml03032
]
ATP_00196 (gyrA)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
pml03400
]
ATP_00196 (gyrA)
Enzymes [BR:
pml01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.2 DNA topoisomerase (ATP-hydrolysing)
ATP_00196 (gyrA)
DNA replication proteins [BR:
pml03032
]
Prokaryotic type
DNA Topoisomerases
ATP_00196 (gyrA)
DNA repair and recombination proteins [BR:
pml03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
NHEJ (non-homologous end-joining)
SHIIR (short-homology-independent illegitimate recombination)
Facilitator
ATP_00196 (gyrA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_topoisoIV
DNA_gyraseA_C
DUF3683
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAP18383
UniProt:
B3R0L9
LinkDB
All DBs
Position
255208..257724
Genome browser
AA seq
838 aa
AA seq
DB search
MSKKNDLLKNEDSLVGKIKKININQEIKKSFLSYAMSVIVARALPDIKDGLKPVQRRILY
GMNELGVYSHSSYKKSARIVGDVMGKFHPHGDSSIYEAMIRMAQDFNYRYPLVDGHGNLG
SIDGDNAAAMRYTEVKMSKISMELLKEIDQETVDFVENYDGSEREPVFLPSSFPNLLVNG
STGIAVGMATNIPSHNLSEVIDALINYIDNKEIDTEGLMKFIKGPDFPTGGEILGISGLK
EAYETGRGRIFVRSKTEIIYSDKNKPIIIIKEIPYQIKKTSLIEKIAFLVKEKIIEGITD
LRDESNNSRGMRIIIELRKDVEPKIILNNLYKHTQLQTSFCFNMIALVNGVPKIVSLKNM
LEEFFLFRIDVINRQKKFELNKAKQKKHLITALAIILNDIEKVLKIIKNSNDVKEAQKNI
MINYNFDEIQSKAILEMSLQKITNLEIKKVIKEEEILKLKIYECENIINSQTKKEKILKK
ELLKIKNQFQDKRKSIISNEQYLTVENESLINKETILITVTNKGYIKRLNLDTYKKQNRG
GKGVSGLKMQENDFLEHILITSTHDHQLFFTNKGKIYQLKGYEIPLGSRYSKGIPLVNLL
PLEKNEFLTSLTSVKDFKEEKNYLVLVTKKGLIKRNSLKDFENVRRNGKIAAVLKNNDEV
LFVSRTTGQQDIILAASDGKAIRFNEFEIRQTGRKSSGVRGIKIKTEEEIIGMTVVDSEK
QNILVITEKGYGKITKANEYRNQIRGGKGTKTLKITSRNGKLVRLLTIYRNEELIIFSDH
GKVVRIDTKQIPLTKSKVTQGNILISLEESDKVSSVALIKKTLIKKEESNDETLIEIF
NT seq
2517 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaaaaaaaaatgatttattaaaaaatgaagattctttggttggaaaaattaaaaaa
attaatattaatcaagagattaaaaaatcttttttaagttatgctatgagtgttattgta
gctagagcattacctgatattaaagatgggttaaaacctgttcaaagaagaattttatat
ggaatgaatgaattgggtgtttattctcattctagttataaaaaatcagctagaattgtc
ggggatgtaatgggtaaatttcatccgcacggagattctagtatttatgaagctatgatt
agaatggctcaagattttaattatcgttatcctttggttgatggtcatggtaatttaggt
tctattgatggcgataatgctgcagctatgcgttatactgaagttaagatgtctaaaata
tctatggaattattaaaagaaattgatcaagaaacagttgattttgttgaaaattatgat
ggtagtgaaagagaaccggtttttttgccttctagttttcctaatttattggtaaatggg
tcaactggtattgctgttggaatggctactaatataccttctcataatttatctgaagta
atagacgctttaattaattatattgataataaagaaattgatactgaaggtttaatgaaa
tttattaaagggcctgattttcctactggaggagaaattttaggtatttctggtttaaaa
gaagcttatgaaactggaagaggaagaatatttgttcgctctaaaacagaaattatttat
tctgataaaaataaaccaattataataattaaagaaattccttatcaaataaaaaaaact
agtttaattgaaaaaattgcttttttagttaaagaaaaaattattgaaggtataactgat
ttaagagatgaatctaataattctagaggtatgagaattattattgaattgaggaaagat
gttgaacctaaaattattttaaataatttatataaacatactcaattacaaacttctttt
tgttttaatatgatagctttagttaatggtgttcctaaaatagtttctttaaaaaatatg
ttggaagaattttttctttttagaatagatgttattaatcgtcaaaaaaaatttgaatta
aataaagctaaacaaaaaaaacatttaattactgctttagcaattattcttaatgatata
gaaaaagttttaaaaattattaaaaattctaatgatgttaaagaagcacaaaaaaatatt
atgataaattataattttgatgaaattcaaagtaaagctattttggaaatgagtttgcaa
aaaattactaatttagaaataaaaaaagttataaaagaagaagaaattttgaaattaaaa
atttatgaatgtgaaaacattattaattcacaaactaaaaaagaaaaaattttaaaaaaa
gaattattaaaaattaaaaatcaatttcaagataaaagaaaatctattattagcaatgaa
caatatttaactgttgaaaatgaatctttaattaataaagaaacaattttaattacagtt
actaataaaggttatattaaacgtttaaatcttgatacttataaaaaacaaaatcgtggt
ggtaaaggtgtttcaggtttaaaaatgcaagaaaatgattttttagaacatattttaatt
acttctacacatgatcatcaattattttttactaataaaggtaaaatttatcagttaaaa
ggttatgaaattcctttaggttcacgttactccaaaggtattcctttggttaatttatta
cctttagaaaaaaatgaatttttaacttctttaacaagtgtaaaagattttaaagaagaa
aaaaattatttagttttagtaactaaaaaaggtttaattaaaagaaattctttaaaagat
tttgaaaatgttcgtagaaatggtaaaatagctgctgttttaaaaaataatgatgaagtt
ttatttgttagtagaactacaggtcaacaagacattattttagctgcctccgatgggaaa
gctattcgttttaatgagtttgaaattagacaaacaggacgtaaaagttctggtgttaga
ggtattaaaataaaaacagaagaagaaattattggtatgactgtggttgatagcgaaaaa
caaaatattttagttattactgaaaagggttatggaaaaataactaaagctaacgaatat
cgtaatcaaattcgtggtggaaaaggtactaaaacattaaaaataacttctagaaatggt
aaattagttagacttttaactatttatcgaaatgaagaattaattattttttctgatcat
ggaaaagtagttagaattgataccaaacaaatacctttaactaaatctaaagtaacacaa
ggaaatattttaatttcactagaagaaagtgataaagtatcttcagtagctttgattaaa
aaaactttgattaaaaaagaagaatcaaatgatgaaactttaattgaaattttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
