Candidatus Phytoplasma mali: ATP_00422
Help
Entry
ATP_00422 CDS
T00729
Symbol
polC2
Name
(GenBank) DNA polymerase III, alpha subunit
KO
K03763
DNA polymerase III subunit alpha, Gram-positive type [EC:
2.7.7.7
]
Organism
pml
Candidatus Phytoplasma mali
Pathway
pml03030
DNA replication
pml03430
Mismatch repair
pml03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pml00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
ATP_00422 (polC2)
03430 Mismatch repair
ATP_00422 (polC2)
03440 Homologous recombination
ATP_00422 (polC2)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
pml03032
]
ATP_00422 (polC2)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
pml03400
]
ATP_00422 (polC2)
Enzymes [BR:
pml01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
ATP_00422 (polC2)
DNA replication proteins [BR:
pml03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
ATP_00422 (polC2)
DNA repair and recombination proteins [BR:
pml03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
ATP_00422 (polC2)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
RNase_T
DNA_pol3_finger
PHP
HHH_6
RNase_H_2
zf-C3HC4
zf-RING_UBOX
DEDDh_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAP18609
UniProt:
B3R0M5
LinkDB
All DBs
Position
500395..504744
Genome browser
AA seq
1449 aa
AA seq
DB search
MSKIIKQIIKNHELFYENNQLIKIFHRDFILEITKKEFILIIKNQTKFQNFKFQKTNFQL
KEINYQNLDYQKLIIKPNKINPHLIQNLKLDQKIIYKNNQIIKKIRTKIENNTKNYYFLD
SNLIYCQELDLTHQGYKNIYHYIYAQKNKGDLLLKIVNQTIPKLKPQYQTLYQTYQTIKP
QIKLQVDNFTIIPHSKVQYLALINQNYGFKNKTLTLKGYIQEIQFKPSYLDNEKLVLEFI
LAKKTFDLSSDDAILVKKFDFNIDEKQKWQNAEIQNDDYLEITGTIYQPKINDQVYLILK
TYQKIILPIKIDKQVGLKRIEFSAHTKMSEFNGLISPETYLTRLNQYQHSSIAFIDLDNV
IAFPKIEAVFKNTNIKPIYGLEIYFQSNQKLYLNNPKITQDYDLNLATYVIFDFETTGLS
KINDQIIEIAAIKIQNNQIIDEFQTLINPQQELTPFIENLTNISNQDLKNQPLIATILPK
FLKFCENSILIAHNISFDMGFLVNQTKKHLNLKLNLPFIDTLNLARYCLDSNLRYFNLKS
LAKYFKISFENHHRAMSDVLITKTIFQQLLNYLLTKNIQFYQQLKLTLPVKFIKPFRITL
LVKNQIGLTTLYQLLSKAQITNFNSTTKLTFMDLINHRSNLLIGNTINDGDLMEIALNEN
DFDLENAINFYDYITIQPITCYQHLMLNLGTNGSKIIQNAIKRIIKFAKKAKKLIIATGN
VFYLDHEQKKYYAIYTKTALIAKKLHPLVKCEFEDLPNNAFLTTTEMLKMFEFLNDSKLI
EEIVIINPNLLNTKIASINILPQKLLTLADNELATSPLKINSINQTLKQIILTKMITKYG
ENWSLELKQRFYQEFQIIINHQSPNYENITVMYLLAYLLVQKSLQDGYLVGSRGSIGSSF
IAYLIGITEVNPLKPHYYCQNCLQTWFNVSELESTIECPRCDLLLFKTGNNIPFEAFLGL
NGNKTPDIDLNFASKYQEKAQNYLQFILGIKQVFKVSTIQTISNKTAFSYVYNYLKTQQI
KARFHQINLISKQLIGTKRTIGTHSSGLIIVPKNNSIYQIAPFQNSIHNSKIWQTISFEY
HSFENNLSKLDILSHENPTLFKMFFDYIKQHPKKFPFKNYHEIPINDSKVFQLFTQTFKN
SQGITISTLGIPEFGTKFVRKMLVNIYQVENQPFNLEKLIKVSGLSHGTNVWLNNGLDII
NQTNEFQNLPVKITFKDIIACREDIYNYLIINQVPKIKAFEIMEFVRKGKQHQNLTEWQT
LIKPYQNLIPTWYWKSAFKIKYLFPKAHASAYTLMAIKIAYFKVYYPILFYYGYFSQKIT
QFNYQLIIGSIKNLEQEIKTLNQIKQRKLTNLENESLITYELVLEFKQQNFKLQPINWNY
SAINEFLIINETTLLIPLTALNSLGIEKANLIIQQRQQKLFTDKTDFIKRTKISKTLISQ
LETLNGFIF
NT seq
4350 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaaaaattattaaacaaattattaagaatcatgaacttttttacgaaaacaatcaa
ttaattaaaatctttcatcgtgattttattcttgaaattacaaaaaaagaattcatttta
attattaaaaatcaaactaaatttcaaaattttaaatttcaaaaaactaatttccaatta
aaagaaattaattatcaaaatttggattatcaaaaattaattattaaaccaaataaaatt
aatccacatttaatccaaaatctaaaattagatcaaaaaattatttataaaaacaatcaa
attattaaaaaaattcgaactaaaatcgaaaataatacaaaaaattattattttttagat
tcaaatttaatttattgtcaagaattagatttaactcaccaaggttataaaaatatttat
cattatatttacgctcaaaaaaataaaggtgatttattactcaaaatagttaatcaaact
attccaaaattaaaaccacaataccaaactttatatcaaacttatcaaactattaaacca
caaattaaattacaagttgataattttacgattattccacattctaaagttcaatattta
gctttaattaaccaaaattatggttttaaaaataaaactttaacattaaaaggttatatt
caagaaattcaatttaaaccaagttatttagataatgaaaaattggttttagaatttatt
ttagctaaaaaaactttcgatttaagtagtgatgatgcaattttggttaaaaaattcgat
tttaatattgatgaaaaacaaaaatggcaaaatgctgaaattcaaaatgatgattattta
gaaattactggaacaatttatcaaccaaaaatcaacgatcaagtttatttaattttaaaa
acttatcaaaaaattattttaccaattaaaattgacaaacaagttggtttaaaacgaatt
gaattttcagctcatacaaaaatgtcagaatttaatggtttaattagtcctgaaacttat
ttaacacgtttaaatcaatatcaacattcaagtattgcttttattgatttagataatgtt
attgcatttccaaaaattgaagcagtttttaaaaatacaaatattaaaccaatttatgga
ttagaaatttattttcaatcaaatcaaaaactttatcttaataatccaaaaattactcaa
gattatgatttaaatttagctacatatgtaatttttgattttgaaactactggattatca
aaaattaacgatcaaattattgaaattgctgcaattaaaattcaaaataatcaaattatt
gatgaatttcaaactttaatcaatcctcaacaagaattaactccttttattgaaaattta
accaatatttctaatcaagatttaaaaaatcaaccattaattgctacaattttaccaaaa
tttttaaaattttgtgaaaatagtattttaatagcacataatattagtttcgatatggga
tttttagttaatcaaactaaaaaacatttaaatttgaaattaaatttaccttttattgat
acattaaatttagctcgttattgtttggattcaaatttacgttattttaatttaaaaagt
ttagctaaatattttaaaatttcttttgaaaatcatcatcgtgctatgagtgatgtttta
attactaaaaccatttttcaacaacttttaaattatttattaaccaaaaacattcaattt
tatcaacaattaaaattaactttaccagttaaatttattaaaccttttcgtattacacta
ttagttaaaaatcaaattggtttaactactttatatcaattattaagtaaagcacaaata
actaattttaattcaaccactaaattaacatttatggatttaattaatcatcgttctaat
ttattaattggtaatactattaatgatggtgatttaatggaaattgctttaaatgaaaat
gattttgatttagaaaatgctattaatttttatgattatattacaattcaaccaattact
tgttatcaacatttaatgttaaatttaggtactaatggttcaaaaattattcaaaatgct
attaaaagaattattaaatttgctaaaaaagctaaaaaattaattattgctacaggaaat
gttttttatttagatcacgaacaaaaaaaatattatgctatttataccaaaactgcttta
atagctaagaaattacatccattagttaaatgtgaattcgaggatttacctaataatgct
tttttaacaaccactgaaatgttaaaaatgtttgaatttttaaatgattcaaaattaatt
gaggaaattgtgattattaatcctaatttattaaataccaaaattgcttcaattaatatt
ttgccacaaaaattattaactttagctgataatgaattagctacttcacctttaaaaatt
aatagtattaatcaaactttaaaacaaatcattttaactaaaatgataactaaatatggt
gaaaattggtctttagaattaaaacaacgtttttatcaagaatttcaaattattattaat
catcaaagtcctaattatgaaaatattactgtaatgtatttattagcttatttattagtt
caaaaatcacttcaagatggttatttagttggttctcgaggttcaattggttcatcattt
attgcttatttaattggaattacggaagttaatccattaaaaccacattattattgtcaa
aattgtttacaaacttggtttaatgtatcagaattagaatcaacaattgaatgtcctcgt
tgtgatttattattattcaaaactggtaataatattccatttgaagcttttttaggttta
aatggtaataaaacccctgatattgatttaaattttgcttctaaatatcaagaaaaagct
caaaattatttacagtttattttaggcattaaacaagtttttaaagttagtacaattcaa
actatttcgaataaaactgcttttagttatgtttataattatttaaaaactcaacaaatt
aaagcacgatttcatcaaattaatttaattagcaaacaattaattggtaccaaaagaact
attggcactcatagctcaggtctaataattgttccaaaaaataattcaatttatcaaatt
gccccttttcaaaattcaattcataactcaaaaatttggcaaacaattagttttgaatat
cacagttttgaaaataatttatcaaaattagatattttaagtcatgaaaatcctacttta
tttaaaatgttttttgattatattaaacaacatccaaaaaaatttccttttaaaaattat
catgaaattccaattaatgattccaaagtatttcaattatttactcaaacttttaaaaat
agtcaaggaattacaattagtactttaggtattccagaatttggtactaaatttgtccgt
aaaatgttagttaatatttatcaagttgaaaatcaaccctttaatttagaaaaattaatt
aaagtgtcaggattatctcatggtactaatgtttggttaaataatggtttagatattatt
aatcaaacaaatgaatttcaaaatttaccagttaaaattactttcaaagatattattgca
tgtcgtgaagatatttataattatttaatcattaatcaagtaccaaaaattaaagctttc
gaaatcatggaatttgttcgaaaaggtaaacaacatcaaaacctcactgaatggcaaact
ttaattaaaccttatcaaaatttaattccaacatggtattggaaatcagcttttaaaatt
aagtatttatttccaaaagctcatgcttcagcttatactttaatggcaattaaaattgct
tattttaaagtttattatccaattttattttattatggatatttttcacaaaaaataact
caatttaattaccaattaatcattggttcaattaaaaatttagaacaagaaattaaaact
ttaaatcaaattaaacaacgaaaattaaccaatttagaaaatgaatccttaataacttat
gaattagttttagaatttaaacaacaaaattttaaattacaaccaattaattggaattat
tcagcaattaatgaatttttaattattaacgaaactactttattaatacctttaactgct
ttaaattcattaggaattgaaaaagcaaatttaattattcagcaacgtcaacaaaaatta
tttactgataaaactgattttattaaacgaactaaaattagtaaaactttaatctcccaa
ttagaaacattaaatggttttattttttag
DBGET
integrated database retrieval system
