KEGG   Candidatus Phytoplasma mali: ATP_00470
Entry
ATP_00470         CDS       T00729                                 
Symbol
srmB
Name
(GenBank) Superfamily II DNA and RNA helicase
  KO
K18692  ATP-dependent RNA helicase CshB [EC:5.6.2.7]
Organism
pml  Candidatus Phytoplasma mali
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pml00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:pml03019]
    ATP_00470 (srmB)
   03009 Ribosome biogenesis [BR:pml03009]
    ATP_00470 (srmB)
Enzymes [BR:pml01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.7  DEAD-box RNA helicase
     ATP_00470 (srmB)
Messenger RNA biogenesis [BR:pml03019]
 Prokaryotic type
  Bacterial mRNA degradation factors
   RNA degradosome components
    Helicases
     ATP_00470 (srmB)
Ribosome biogenesis [BR:pml03009]
 Prokaryotic type
  rRNA helicases
   ATP_00470 (srmB)
SSDB
Motif
Pfam: DEAD Helicase_C ResIII NAT10_TcmA_helicase PhoH Lin0512_fam AAA_19 AAA_30
Other DBs
NCBI-ProteinID: CAP18657
UniProt: B3R051
LinkDB
Position
565220..566416
AA seq 398 aa
MKNYIKDKLQKLNFSYLTPIQEEVFKNFSQPQHLIGLAPTGTGKTHAYLLAILSQIDVNQ
AVVQAVIIAPTNELVLQIFKMLQAIPENAVKVRIFYGGMDKKRTSLKLQKQQPQIVIATP
EKLFEYAISLGQLKINRTLFFVLDEADMLLDRKFLSFLKPLMITKSKPKIMLFSATFKPF
LTNFIKQNFGPTLLIDLTKNYLKNIKYYLLKSHDKLKTLLTLTQKLKPYLALIFVSRKQD
QLPIFETLKKHQLNVFNFSSDLSVKQRKQSLKAIENLKYQYIITSDLAARGLDLDISLVI
HYDLPLHLEFFQHRSGRTGRMGKPGEVITIYNESEIKTINKLKSQHFNFQQMILTSKEIE
ILKPKPDRNHKPHLIKTPRKKNKIRSIQKYSQGKKKNA
NT seq 1197 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
ttgaaaaattatattaaagataaattacaaaaattaaatttttcttatttaactcctatt
caagaagaagtttttaaaaatttctctcaaccacaacatttaattggtttagcaccgacg
ggtactggtaaaactcatgcttatttattagcaattttaagtcaaattgacgttaaccaa
gctgtcgttcaagctgttattatcgcaccaacaaatgaattagttttacaaatttttaaa
atgttacaagcgattcctgaaaatgcagttaaagtacgaattttttatggtggtatggat
aaaaaaagaactagtttaaaattacaaaaacagcaacctcaaattgtgatcgctactcca
gaaaaattatttgaatatgctatttctttaggacaattaaaaattaaccgcacccttttt
tttgttttagatgaagctgatatgttgttagatcgaaaatttttatcttttttaaaacca
ttaatgattactaaatcaaaacctaaaataatgctattttctgctacttttaaaccattt
ttaactaattttattaaacaaaattttggtcctactttattaattgatttaactaaaaat
tatttaaaaaatattaaatattatttattaaaaagtcatgataaattaaaaactttatta
actttaacccaaaaattaaaaccttatttagctttaatttttgtttctcgtaagcaagat
caattaccgatatttgaaactttaaaaaaacatcagttaaatgtttttaatttttcatca
gatttatcagttaaacaaagaaaacaaagtttaaaagctattgaaaatttaaaatatcag
tatattattacgagtgatttagctgctcgtggtttagatttagatatttctttagtgatt
cattatgatttacctttacatttagaattttttcaacatcgctccggtcgtactggtcgc
atgggaaaaccaggtgaagtaattaccatttacaatgaatcagaaataaaaacaattaat
aaattaaaaagtcaacattttaattttcaacaaatgattttaacttctaaagaaattgaa
attttaaaacctaaaccggatcgcaaccacaaaccgcatttaattaaaactcctagaaaa
aaaaataaaattcgatcaattcaaaaatattcccaaggaaagaaaaaaaatgcttaa

DBGET integrated database retrieval system