KEGG   Prochlorococcus marinus subsp. pastoris CCMP1986: PMM1105
Entry
PMM1105           CDS       T00142                                 
Symbol
recC
Name
(GenBank) possible exodeoxyribonuclease V subunit C 125 kD polypeptide
  KO
K03583  exodeoxyribonuclease V gamma subunit [EC:3.1.11.5]
Organism
pmm  Prochlorococcus marinus subsp. pastoris CCMP1986
Pathway
pmm03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pmm00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03440 Homologous recombination
    PMM1105 (recC)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:pmm03400]
    PMM1105 (recC)
Enzymes [BR:pmm01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.11  Exodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
    3.1.11.5  exodeoxyribonuclease V
     PMM1105 (recC)
DNA repair and recombination proteins [BR:pmm03400]
 Prokaryotic type
  DSBR (double strand breaks repair)
   HR (homologous recombination)
    RecBC pathway proteins
     PMM1105 (recC)
SSDB
Motif
Pfam: Exonuc_V_gamma RecC_C DGKD_4H
Other DBs
NCBI-ProteinID: CAE19564
UniProt: Q7V0Y9
LinkDB
Position
complement(1052805..1055978)
AA seq 1057 aa
MLNIYKSNKIEVITELLAKELIISPPFITEKLDVAVPNYFLGKWLWDQITISNQISALYE
FKTISSYTEAILTKIFPAIDMGVWNFDSIKWGIIDSFEELNSYEESLPLSNWINKYLNNK
KIIDGDIHNLIKKIANNFIEYLIFRPEMIANWHRYELSSRNLFNNLNSNEYWQPILYKLL
EKKMTEKPSCLFMIDIINNIKKIHNEENLLPRQIYIISDNNLSRLHVSFYSKLAEFTKVN
LYLLSAGDNLWNRINSLEGEVDFSSIESKFNLNSSNIEKIFGKFGANYQKLIEETSNIEN
IKINNNSIYIDPTFSFTSEKDIPLINQIQKRLIDNSQDDFMINEKDESIIFREHFNQLSQ
LEYVRNKVIEILEACDNVKYSDIAIVSPQTSLIKPYLKYIFNNELINGQKLPHLFLEDNF
EDSSNVYNFLLDIIELANEKITLEKIEYFLSKKVNQNIFDFDIDEKNEIILILNEVGFHW
GLDTNERLGEEKNTLEWCINRITLGLVYDEQFSLNNSNLKSFTPKNSSLDLNKWVKILVQ
LKQYINLLRGSFNYSDWVKKIKFILKKIRNFNDNFNLDIYEINRILDNYLISSTSDKVIV
LNVFREILITCINKLNYRNQSYINKILVSDIEKVRLIPRKIIFLINMNSIYYPRLSSNEN
INLLTKKYLLGDPSSFDREKYFFLELLISCRKQLIVSWVNNDKDNKILDISFPIKELINY
LESFLSVKQRKSIIKYFDYEKEEVDNPNNSNFLKSQYSLLNKIDWEEKIYKCKDFKLSEL
IYWFKAPQLYWLNKKNISPKVIFNHHPDEEYVSNLQKFKLVTKVIQKLDIDNYDIIDELK
NLNINEQFLENGIIAPRNSIFTKGKEIQNLLGSLVENLSNDKNIKRVYVKSNSNKEEYLI
SDNVVIELIHSKLSLKSLSEAWIKLLFISSLEKRITKTKVIFRKENQYKSEILQTPGQLQ
SKKILEEYINIFKNYSDKCLPLPPESTYKYVEAKKLFKNEKKAFSDKWIGNKTFTKGERD
NSVIKCVLEIKKKETSFLEMINLMIYLSDYMAPYLRH
NT seq 3174 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
ttgcttaatatttataaatcaaacaaaattgaagttattactgagctattagcaaaagaa
ttaataattagccccccttttataacagaaaaactagatgtagcagttcctaattatttt
ttagggaagtggttatgggaccaaataacaataagtaatcaaataagtgctctttatgaa
tttaagactatatcaagttataccgaagcaatattgacaaaaattttcccggcaattgat
atgggagtatggaattttgattcaataaaatggggaattatagattcatttgaagaatta
aacagctatgaagaatcattaccgctaagtaattggattaataaatatttaaacaataaa
aagataattgatggggatattcacaacttaatcaaaaagattgcaaataattttattgag
tatttaattttcaggcctgagatgatagctaattggcatagatatgagttgagttcacga
aatctttttaataatttaaattcaaatgaatattggcaaccaattttatataaattactt
gagaaaaaaatgaccgagaaaccttcatgtttattcatgattgacataataaataatatt
aaaaaaatacataatgaagaaaatctattacctagacaaatatatattatttctgataac
aatttatcaagattacatgttagcttttattctaaattagcagaatttactaaggttaat
ttatacttactctctgctggagataatttgtggaatagaataaattctcttgagggagag
gttgattttagttctattgagagcaaatttaatttaaatagttcaaatatcgaaaaaata
tttggcaaatttggagctaattatcagaaattaattgaggaaacttctaatattgaaaat
ataaaaataaacaataattcaatatatattgatccaacgtttagttttacaagtgagaag
gatatacctttgattaatcaaattcagaaaagattaattgataatagtcaagatgatttt
atgataaatgaaaaggatgagtcaattatttttagggagcattttaatcaattaagtcaa
ttagagtatgtaagaaataaagtcatagaaatattagaagcttgcgataatgttaaatac
agtgatatcgctatagtatctcctcaaactagtttaataaaaccttatcttaagtatatt
tttaataatgaattaataaacggacaaaagctacctcatttatttcttgaagataatttt
gaggattcttcaaatgtatataatttcttacttgatattattgaattagcaaatgagaaa
attacgcttgaaaaaatagaatattttctttctaaaaaagttaatcagaatatttttgat
tttgatattgatgagaaaaatgagattattttaatactaaatgaagttggttttcattgg
ggattagatactaacgaaaggttgggtgaagaaaaaaatactttagagtggtgtataaat
agaattactttaggtctagtttatgatgaacaatttagtttaaataattctaaccttaaa
tcatttacccctaagaattcaagcttggacttgaataaatgggttaaaattttagttcaa
ttaaaacaatatattaatttactaagaggatcttttaattattcagattgggttaaaaag
attaaatttatacttaaaaaaattagaaattttaatgataattttaatttagatatatat
gaaataaatagaattcttgataattatttaatatcttcaacatctgataaagtaattgtg
ttgaatgtttttagagaaatattaattacatgtataaataaacttaactatagaaatcaa
tcttatataaataagatattagtaagtgatattgagaaggttaggctaattcctcgtaag
attatcttcttgataaatatgaatagtatttattatccaagattatcgagtaatgaaaat
ataaatttgctaactaaaaaataccttcttggggatccatcttcttttgatagagaaaaa
tactttttcctagagttattaatttcctgtagaaagcaacttatagtttcttgggttaat
aatgataaagataataaaatattagatatttccttccctattaaggaactaataaactat
ttagagagctttttatctgtaaaacaaagaaagtccataatcaaatactttgattatgag
aaagaagaagttgataatcctaataatagtaattttttaaaaagtcaatattctttatta
aataaaatagattgggaagaaaaaatttataaatgtaaagactttaaattatctgaattg
atttattggtttaaagctcctcagctttattggctcaataaaaagaatatttctcctaaa
gtaatatttaatcatcatccagatgaagagtatgtaagtaatttgcagaaatttaaacta
gttactaaagttattcagaaactagacattgataattatgacattattgatgaattaaaa
aatttaaatataaacgaacaatttcttgaaaatggaattattgcgccaagaaatagtatt
tttacaaaaggaaaagagatacaaaacctgttaggaagtttagttgaaaatttgagtaat
gataaaaatataaaaagagtttacgttaaatcaaattcaaataaagaagaatatttaatt
tctgataatgttgtgattgaattgattcattccaaacttagtttgaaaagtttgtcagaa
gcttggattaagttactctttatttcttctttagaaaagaggataacaaagacaaaagta
atttttagaaaagaaaatcaatataaatcagaaattcttcaaacaccaggccaactccaa
tcaaagaaaatattagaagaatatataaatatttttaagaattactctgataaatgttta
cccctccctccagaaagtacatataaatatgtagaagcaaaaaagctatttaaaaatgag
aaaaaagctttttctgataaatggatagggaataaaacatttaccaaaggagaaagagat
aatagtgtaattaaatgtgttttggaaataaaaaagaaggagacttcttttttggaaatg
ataaatttgatgatttatctttcagattatatggccccttatttgaggcattaa

DBGET integrated database retrieval system