Prochlorococcus marinus MIT 9313: PMT_0096
Help
Entry
PMT_0096 CDS
T00143
Name
(GenBank) capsular polysaccharide biosynthesis protein
Organism
pmt
Prochlorococcus marinus MIT 9313
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DegT_DnrJ_EryC1
Aminotran_1_2
Aminotran_5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAE20271
CyanoBase:
PMT0096
UniProt:
Q7V962
LinkDB
All DBs
Position
110264..111430
Genome browser
AA seq
388 aa
AA seq
DB search
MSNLDPLPYGKQSITPDDVAAVTEVLQSPFLTQGPVLPVFEQALSNYTKSQYSIAVNSAT
SALHIACLALGVEPGDRIWTSPITFVASANCGRYCGAKVEFVDIDPRTALLDTDLLKKKL
IAADRDGALPKVIIPVHLTGTSCDMALIGELADLFGVHIIEDASHAIGAYYMDMPVGNCR
FSSISVFSFHPVKIITTAEGGLATTNDPILAERMYLLRSHGIERNPEKFELQSPGPWYYE
QHGLGFNYRLTELQAALGLSQLKRLDLIVDERNRLLDNYKCLLKDLPITFLEIPSSCRSS
VHLAVILLETINPLNHRRVFEGLRSASIGVQLHYSPVHLQPYYRSLGWKMDDFPFAESYA
SRAISLPLFPGLTEDDQQRVADALRTLL
NT seq
1167 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtaatcttgacccacttccttacggtaagcaatcaataacgcctgatgatgttgca
gcagttacagaagttcttcaaagcccttttttaacgcaaggaccagttcttcctgtcttc
gagcaggcattatctaattacacaaaatcgcaatattctatagctgttaattcagcaaca
agtgcacttcacattgcctgtctagctcttggtgtggagcctggtgatcgtatctggacc
tctccaattacatttgtcgcttcagccaattgtggtcgatattgtggagcaaaagttgaa
tttgtagatatcgatcctcgtactgctcttctcgatactgatctattaaagaagaaatta
atagctgctgatcgagatggagcactcccaaaagttattattccggtacatctcactgga
actagttgtgatatggctttgatcggtgaattagctgatttatttggcgttcatattatt
gaagatgctagtcatgctattggtgcttattatatggatatgccagttggaaattgtcgt
tttagttccatttctgtatttagctttcatcctgtgaaaataattactacggctgaagga
ggtctggctacaacgaatgatcctatattggctgaacgaatgtatcttttacgcagtcat
ggtattgagcgaaatcctgaaaagttcgagctgcaaagtcctggtccttggtattatgag
cagcatggtcttggttttaattatcgtttaacggaattgcaggcagcgcttggattaagt
caattaaagcgtcttgatttaattgttgatgaacgcaatcgtctgctcgataactataaa
tgtctcttaaaagaccttcccataacgtttttagaaataccttcttcttgtaggtcaagt
gtacatttggctgtgattcttcttgaaaccataaatccccttaatcacagacgtgttttt
gagggactccgttctgcaagtataggtgttcagcttcattatagcccagttcatttgcag
ccttattatagaagtcttggctggaaaatggacgacttcccttttgctgagagttatgca
tctagagctattagccttcctttgttcccaggtctcacagaggatgatcagcaaagagtt
gctgatgccttgagaactttgttatga
DBGET
integrated database retrieval system
