Prochlorococcus marinus MIT 9313: PMT_0256
Help
Entry
PMT_0256 CDS
T00143
Name
(GenBank) Hemolysin-type calcium-binding region:RTX N-terminal domain
Organism
pmt
Prochlorococcus marinus MIT 9313
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HemolysinCabind
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAE20431
UniProt:
Q7V8S5
LinkDB
All DBs
Position
complement(288922..294219)
Genome browser
AA seq
1765 aa
AA seq
DB search
MASITNFTANASDRWGWWRWNRWSPRGTTATAIENQSLRIDSDELRISATANSGWRTARA
TGLLNSEVEYTGKAVSINTYAQGREAYSIGIDGSRLSLVGNDNKLVDINATSRVFGYDPA
WGLRHSSLSTQGGDDIISIKADAGILGGRFVNAAILATGLESSSVNTGAGNDFVSLQSIA
SGRTTATAYGSTDSSIDLGSGNDSLFINASASGSGGWWGGGKVAAYGALNSDIQTGSGDD
FIVINASASNRGGWWRGGGYAEAVGLGNGSSINTGDGNDAIHITARADGRTTNAWAMRDS
NINTGSGDDSVTLNAFTNSRFIDPAYGASNSSINLGSGNDSLLINASANGRTWGSIAAYG
ALNTKINTSGQELQGLPPLDGFDVGSEQSPLIIGIGEDPVIANDNDSISINAFATNWGGY
AEAIGLGNNSSIKTGAGDDSIDITARAVGRNTNAWAMRDSEIHTGSGDDSVILNAFTQSR
IWDPAYGASNSSIELGIGSDQLTINANARGNGREIKAYGLEDSFVESGEGNDDIKINVSA
EGGNSRINKHSWEHIYSYESSGDRNYNNQRVYSYTNEYDYNSGRKYSNSYEYASSGSYDY
SHASQRSGSRDYQSTYKNSYSYGNSWYNNSRDYERSHLNSYDYDYSNSSSSSSNHSNSYS
RSYNYDNTRSSSHSSDYLNSYSNSHQSSYDNNRFNQSSYDYDHSRIHSYGEATGADGSNI
STGSGSDSVNLQINAGSSAIGLNDSILSTSDGNDDITIDITAIGENSFYNKSSSSRSSFD
DSTGSNSSDYSRIDSRSSSYSNDYTNSYSNSYERSDASSSSFNRDSTNSRSGINQSTYKN
SYSYGNSWYNNSSDYERSHLNSYDYDYSNSSSSSSNHSNSYSRSYNYDNTRSYSNSSDYL
NSYSNSHQSSYDNNRFNQSSYDYDHSRIHSYGEATGADGSNISTGSGSDSVNLQINAGSS
AIGLNDSILSTSDGNDDITIDVNAFGENSFYNKSSSSRSSFDDSTGSNSSDYSSIYSRSS
SYSNDYTNSYSNSYDHSSSGSYDYSHASQGSGSSINQSTYKNSYNYRSSWYNNSRDYERS
HLNSYDYDYNNSYSRSGNYDHSSSGSYNYDYNRSYNYGYDYNNNYNGSHQSNYDNNRFNQ
SSYDYDHSRIETLGVAIGAEDSTISTGSGNDSVNLQINAGSSAIGLKNSVLETGEGQDQV
NISVNALGHSFYHGKSTEKGDAKTLLNSTISTGGGDDQIFVNAIGSHSGAALTNSTIKTG
TGDDSVLLSGDLVNSSIHGGDGDDQILHSGGGNAEIYGDDGNDTIIGGSGADKISGGKGD
DDIFAGDGGDTIDAGDGKDNITITGGKGISVTTGFGSDTIVFTADYYRSLLEGASSGTNI
FADDINNISSPLMIKDFTVEISEKKAIFNHNVAIRGDSAYTIVEGPTWEEAEANAQKLGG
NLVTINDAEENKEMGISFGDNLELSLEDDLVIAIGGDPEPALEDDLVIAIGGDPEPALED
DLVIAIGGDPEPALEDDLVIAIGDDPEPALEDDLVIAIGGDPEPALEDDLVIAIGGDPEP
AFEQDSIIAFGEDSEPLLEETPIAQPSSNHDMMNFDDLLNNVAINYDGSNAFATGHINLS
QDGDDTLVSFDADGIAGDKNIGIVIATLQNVNTSDLSTGNIDSDYSLEGGLDPITGAAET
QIEEDLTTITAETTDAIINPSNDSLVKSTTSEETDSMAISEAINALTTSEDVASATSLTS
TTSEATSSTDIVTAAITAAVDQSTI
NT seq
5298 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcttcaatcaccaacttcacagcaaatgcatctgatcgatggggttggtggagatgg
aaccggtggtcgcctcggggaacaactgccacagcgattgaaaatcaaagcctgcgtatc
gatagcgacgaactgcgcatctcagccacagccaactctggctggcgtacagcacgtgca
acgggtctgctgaatagcgaagttgaatacaccggcaaagctgtaagcatcaacacctac
gcgcaagggagagaggcctactccattggtatcgatggctcccggctttctcttgttggt
aatgacaacaagctggttgatatcaacgccacttcaagggtctttggatatgacccagcc
tggggccttcgtcattcctcgctaagcacccagggtggtgatgacatcatcagcatcaaa
gctgatgctggaatccttggtggcagattcgtcaacgctgcgatcttggcaacaggcctt
gaaagcagctcggtcaatactggcgcgggcaatgatttcgttagccttcaatcaatcgca
agcggtagaacaactgccactgcctacggctctacagacagttcgattgatctcggttca
ggtaacgattccctattcatcaatgcttcagctagcggttcaggcggatggtggggtggc
ggcaaagttgcagcctatggagctcttaacagcgatattcaaactggaagcggagatgat
ttcattgtcatcaatgcctctgctagcaaccgtggtggttggtggcgaggtggtggttat
gcagaggctgtaggtcttggcaatggctcatcaatcaatacaggtgatggcaatgatgcc
attcacatcaccgctcgagctgatggacgcacaaccaatgcttgggcgatgcgcgacagc
aacatcaatacaggctcaggcgatgattccgtcactctcaatgcatttaccaattccagg
tttattgatccggcctacggcgcaagcaacagctcaatcaaccttggatctggcaacgac
tcgctgctgattaatgcctctgcaaatgggcgaacgtggggttcgattgctgcctatgga
gcattaaataccaagatcaatacaagtggccaagagcttcagggattacctccattagat
ggttttgatgttggtagtgaacaatcacctctcatcatcggcattggcgaagaccccgtc
attgctaatgacaacgactccattagcatcaatgcctttgcaaccaattggggtggttat
gcagaagcgatcggactaggaaataactcttccatcaaaacaggagctggtgatgattcg
attgacatcacagcaagagctgtaggtcgcaataccaatgcctgggcgatgcgtgatagc
gaaatccatacgggctctggtgatgattccgtcattctcaacgccttcactcaatctaga
atttgggatccggcctacggcgcaagcaacagctccatcgaactcggcattggcagtgat
cagctaacaatcaatgccaatgcacgtggcaatggcagagaaatcaaagcttatggccta
gaggatagttttgtagaaagtggagagggcaatgacgacattaaaatcaatgtttcagca
gaaggtggcaatagcagaatcaacaaacactcttgggagcatatatattcatacgagtcc
tcaggcgatagaaattataacaatcaaagagtttattcatatacaaatgaatacgattat
aactctggcagaaaatatagtaacagctatgaatacgcgtcttccggctcctacgattac
agccacgcttcacaaagaagcggtagtcgagactatcaatcgacttacaaaaattcctat
agctacggcaacagctggtacaacaacagccgtgactacgaacgctcacacctcaacagc
tacgactacgactacagcaacagttcaagtagttccagcaaccacagcaattcctactcg
cgctcttacaactacgacaacacccgcagcagcagccattccagcgattacctcaacagc
tacagcaactcccatcaatcctcctacgacaacaaccgcttcaatcaatcctcctacgac
tacgaccactcacgcattcactcctacggagaagccactggtgctgatgggtccaacatc
tctacaggctctggcagtgattccgtcaacctacaaatcaacgccggctcttctgccata
ggccttaacgattcaattctctccaccagcgatggtaatgatgacatcaccattgatatc
accgctataggtgaaaacagcttctacaacaaatcatcgagctcacgctcctccttcgat
gattccactggcagcaacagcagcgactacagcagaatcgattctcgctcttccagttac
agcaacgactacaccaacagctacagcaactcctacgaacgctctgacgccagctccagc
tctttcaaccgcgactcaacaaatagccgcagcggcatcaatcaatcgacttacaaaaat
tcctatagctacggcaacagctggtacaacaacagtagtgactacgaacgctcacacctc
aacagctacgactacgactacagcaacagttcaagtagttccagcaaccacagcaattcc
tactcgcgctcttacaactacgacaacacccgcagttacagcaattccagcgattacctc
aacagctacagcaactcccatcaatcctcctacgacaacaaccgcttcaatcaatcctct
tacgactacgaccactcacgcattcactcctacggagaagccactggtgctgatgggtcc
aacatctctacaggctctggcagtgattccgtcaacctacaaatcaacgccggctcttct
gccataggccttaacgattcaattctctccaccagcgatggtaatgatgacatcaccatt
gatgtcaacgcttttggcgaaaacagcttctacaacaaatcatcgagctcacgctcctcc
ttcgatgattccactggcagcaacagcagcgactacagcagcatctattctcgctcttcc
agttacagcaacgactacaccaacagctacagcaactcctacgatcacagctcttccggc
tcctacgattacagccacgcttcacaaggcagcggtagcagcatcaatcaatcgacttac
aaaaattcctacaattacagaagcagctggtacaacaacagccgtgactacgaacgctca
cacctcaacagctacgactacgactacaacaacagctacagcagatctggaaactacgat
cactcctcctcaggctcttataactacgactacaacaggagttataattatggctacgac
tataataacaactacaacggctctcatcaatctaattacgacaacaaccgcttcaatcaa
tcctcctacgactacgaccactcacgcattgagacccttggtgttgctattggggcggag
gattccaccatctccacaggctctggcaatgattccgtcaacttgcaaatcaatgctggt
tcctctgccataggccttaagaattctgttctcgaaactggcgagggacaagatcaagtc
aacatcagtgttaatgccctagggcattccttctaccacggcaaatcaacggagaaaggt
gatgccaaaactctgttgaattccactatctcaacaggaggtggagacgaccagatcttt
gtgaacgccatcggcagccattctggagcggcactcaccaacagcacaatcaaaacagga
acaggtgatgactctgtcttgttgagtggtgacctagtcaacagcagcatccacggcgga
gatggtgacgaccagatcctgcattcaggcggaggcaacgccgagatctacggtgatgat
ggtaatgacacaattatcggtggatcaggagcagataaaatcagtggtgggaagggtgat
gatgacatctttgctggcgatggaggtgacacaattgatgctggagatggcaaggacaac
atcaccattaccggcggtaaaggtataagtgttacgacgggtttcggctcagacacaatc
gttttcactgccgattactacagaagtttgctagaaggagcaagttccggaacaaacatc
ttcgcagacgacataaataacatatcttcacctctgatgatcaaggatttcactgttgaa
atatccgagaaaaaagcaatcttcaatcataatgtagcaataagaggtgacagtgcttac
acaatcgtcgaagggcctacctgggaagaagcagaggccaatgctcagaagctaggcgga
aacttagtaacaattaacgatgcagaagagaataaagaaatggggatttctttcggcgat
aatctagagctttcactagaagatgatcttgtaattgctattggcggtgatccagagcct
gctctagaggatgatcttgtaattgctattggcggtgatccagagcctgctctagaggat
gatcttgtaattgctattggcggtgatccagagcctgctctagaggatgatcttgtaatt
gctattggcgatgatccagaacctgctctagaggatgatcttgtaattgctattggcggt
gatccagagcctgctctagaggatgatcttgtaattgctattggcggtgatccagagcct
gccttcgagcaagattcgatcattgcgtttggcgaagattccgagcccctcctagaggaa
actccaattgctcagccatcaagcaatcatgacatgatgaactttgatgacctccttaat
aatgttgcaatcaactacgacggatccaacgccttcgctacaggccacatcaacttgtca
caagatggagacgatacattggtcagctttgacgcagatggtattgctggagacaaaaat
attggtattgtcatagcaacactccaaaacgtgaatacttcagacttgagtacgggcaat
attgattcggattattcactagagggaggattggatccaatcacaggagccgcagaaaca
caaatcgaagaagatttaacaacaatcactgctgaaacaactgatgcaatcatcaatcca
agcaatgactcacttgtaaaatcaacaacatcagaggagactgattctatggcaatttca
gaagccatcaacgccctaacaacatcagaggatgtcgcctctgcgacatcccttacatca
acaacatcagaagcaacaagttcaaccgatatcgtcacagcagcgataaccgctgctgtt
gatcaaagcaccatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
