Pseudomonas mucidolens: NCTC8068_00677
Help
Entry
NCTC8068_00677 CDS
T08935
Name
(GenBank) glycoprotein
Organism
pmud
Pseudomonas mucidolens
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_6
BapA_N
PUA_3
CarboxypepD_reg
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
SQH31744
LinkDB
All DBs
Position
1:774480..779516
Genome browser
AA seq
1678 aa
AA seq
DB search
MENITIVDKATGTTTEHAFGNASLNGTGIVKLPFGPESVQSFQQSGQNLVVTLKTGETIT
IQNFFVVGADGATSQLVMTNPDGTLLLGNYSSPYSGFTFSEVSSLDDLVGAGVLAESSTP
SWVLWGLGLLGVGIAAAALDGGSGGGGGGGGATPSLGKATDLSVSADGLNVIGKGLPGTT
VIVRDAAGNVIGSGTVGADGNFQVGLDTPRTNGETLEVVLKDSAGNESPPSTVVAGDTTA
PEAPADLVISEDGATVSGKGEPGTTVTIKDAAGNVIGSGTVGADGNFQITLDPPQVNGET
LEVTLSDPAGNESQPGSVVAGDTTAPDAPTGLLVGEDGTTVSGKGEPGTTVTIKDAAGNV
IGTGQVDADGNFQVTLDPPQVNGETLEVTLSDPAGNESQPGSVVAGDTTAPDAPTGLLVG
EDGTTVNGKGEPGTTVTIKDAAGIVIGTGQVDADGNFQVTLDPPQVNGETLEVTLSDAAG
NESVPATVVAIDIDDTDADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADA
DADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADA
DADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADA
DADADADADADADADADGDADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADA
DADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADA
DADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADA
DADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADA
DADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADA
DADADADADADADADADADADADADADADADADADADADLEAFDDVATAELTVTPVTTQT
ELNEMRVFTLLGVGGIQLGVPSLSQQFTVDAESTGTLNLSFSQGDLLSVLGGGFTGVLEV
SDGAGGWVGIDQSSGGSGLLDLLGLFGSGTTAQIEGLAAGEYRFTLSLDPNLVAVGASAT
ASLSVDNASLTDFTVEPGADVEGNVITDPGFNGQPDSPGALGDATVQVEVDGVFVDADAA
VGTVLQGQYGQLTIFANGDYSYTPNGDAASIGQVDSFAYQLVTAAGGVASANLYIRIDSN
DTTIVWSPTDPSAPGVVEVVATDDIGAAQVDIDNLVDTQGLAEISYAPPVLIGTGTGTGA
SFVVAADTTAELEVSRDFTGIGVLPTTTINLQKLIDGVWTTQQTTTTATHTFTGLDAGEY
RVTASTGALVSVGTVTIDQTLVTTHLTEFVTGAAVAATGNVLELSDLSPADSLGSTLTVL
SVLVNGLYVIPGQTGAEVQGLYGTLTLHADGAYSYTPTPGLALADIGQVDTFTYKLTTPS
GQEDTANLYIRIDSPDRDLVWDDANPGSPATEGAGIAAASFMVDQAASGDDSAGSEGSAD
TDFSHVEGVAGADGLLWEGGDAAINLSDLIGNVSGVESIDLNDVSAVELTLSLEDLVSIT
GPESDRLMIQGDDQDSVHLTGDWSTGATQVENGLEYVIYTSQEDETHQLWVQSGISVV
NT seq
5037 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaaatataacaattgtcgataaggcaacgggaacgacaacggagcatgcatttggc
aatgccagcctcaatggaaccggtattgtaaagttgccgttcgggcctgaaagcgtgcag
tcgtttcagcaatccgggcaaaacctggtggtcactctaaaaactggagaaaccatcacc
atccagaatttttttgtagtgggggctgacggtgcgacgagccagttggtaatgacgaac
cctgacggaacgttattgctgggcaactattcttcgccgtactcgggctttacattcagt
gaggtttcctcgctcgacgatttggtcggtgcgggtgtgctggcagaaagctcgacaccg
agttgggtgctctggggcctgggcctgctcggcgttggcattgcagctgctgcacttgat
ggtggtagcggcggcggcggcggaggcggcggtgccaccccgtcactgggtaaagccacg
gacttatcggtcagtgccgatggcctgaacgtcatcgggaaagggctgcccggtaccacg
gtgattgtcagagatgccgccggaaatgtgatcggttccggcactgtcggcgctgacggt
aacttccaggtcggcctggatacaccgcgtaccaatggcgagactctcgaagttgtcctc
aaggactcggcgggcaacgagtcgccccccagcactgttgttgcaggcgataccaccgca
cctgaggcgccggctgatttggttatcagtgaggatggagccaccgtcagcggcaagggt
gagccaggcacgacggtgacaatcaaggatgccgctggcaacgtgatcggttccggcact
gtcggcgctgacggtaacttccagatcacactggatccgcctcaggtcaacggtgaaacg
ctggaagtgacgctgtcggatcccgcgggcaatgagtcgcaacccggcagcgttgtcgcg
ggtgacacaaccgcgcctgacgcaccaaccggtctgctcgtcggtgaggatggaactacc
gtcagcggcaagggtgaaccaggcacgacggtgacaatcaaggatgccgctggcaacgtg
atcggtactggtcaggtcgatgctgacggtaacttccaggtcacactggatccgcctcag
gtcaacggtgaaacgctggaagtgacgctgtcggatcccgcgggcaatgagtcgcaaccc
ggcagcgttgtcgcgggtgacacaaccgcgcctgacgcaccaaccggtctgctcgtcggt
gaggatggaactaccgtaaacggcaagggtgaaccaggcacgacggtgacaatcaaggat
gccgctggcatcgtgatcggtactggtcaggtcgatgctgacggtaacttccaggtcaca
ctggatccgcctcaggttaacggtgaaacgctggaagtgacgttgtcggatgcggcgggg
aacgagtctgttcctgccacagtggtcgctatcgatattgatgatactgacgccgacgcc
gacgctgacgctgacgctgacgctgacgctgacgccgacgccgacgccgacgctgacgct
gacgccgacgccgacgccgacgccgatgccgacgcggatgctgatgccgacgctgatgcc
gacgcggatgctgacgcggatgctgacgcggatgctgacgcggatgctgacgctgatgct
gatgctgatgccgatgccgatgccgatgccgatgccgatgccgatgccgacgcagatgcg
gatgccgatgctgatgctgatgctgatgctgatgctgatgctgatgctgatgctgatgct
gatgcggatgcggatgccgacgccgacgccgacgccgatgcggatgcggatgctgacgcc
gacgccgacgccgacgccgacgccgacgccgacgcggatgcggatgctgacgctgatgct
gacgccgacgccgacgccgacgctgatgctgatgctgacgccgatgccgatgccgatgcg
gatgcggatgcggatgccgacgcggatgcggatgctgatgccgacgcggatggggatgcc
gatgccgatgccgatgccgacgcggatgctgacgcggatgctgacgcggatgcggatgcc
gacgcggatgccgatgccgacgctgatgctgacgccgacgccgacgccgacgctgatgct
gatgctgacgccgatgccgatgccgatgccgatgctgacgcggatgctgatgctgatgct
gatgctgatgctgacgccgatgccgatgccgatgccgatgccgacgctgatgcggatgcg
gatgcggatgcggatgcggatgccgacgcggatgccgacgctgatgctgatgctgacgcc
gacgccgacgccgacgccgacgctgatgctgatgctgatgctgatgctgatgctgatgct
gacgcggatgctgatgctgatgctgatgctgatgccgatgccgatgccgatgccgacgcc
gacgccgacgcggatgctgacgccgatgccgatgccgatgccgatgccgatgcggatgcc
gacgctgatgccgatgccgatgccgatgcggatgcggatgccgacgctgatgctgatgct
gatgctgatgcggatgctgatgcggatgccgatgcggatgcggatgctgatgctgatgcg
gatgctgatgctgatgctgatgccgatgccgatgccgatgccgacgccgacgcggatgcg
gatgctgacgccgatgccgatgccgatgccgatgccgatgccgatgccgatgcggatgcc
gacgctgatgctgatgctgatgcggatgcggatgcggatgcggatgcggatgcggatgcg
gatgcggatgcggatgctgatgctgatgctgatgccgatgccgatgccgatgccgatgcc
gacgcggatgcggatgcggatgcggatgcggatgctgatgctgatgctgacgccgatgcc
gatgccgatgccgatgccgatgccgatgccgatgcggatgccgatgccgatgccgacctt
gaagcctttgacgacgtcgccactgcagagctcaccgtcactcctgtcacgacacagaca
gagctgaacgagatgcgcgtattcacgttgctgggagtcggtggtatccagctcggggtg
ccttcgctgagtcagcagttcaccgtggatgccgagagtaccgggacgctgaacctgtcc
ttcagccagggagacctgctgtcggtcttgggaggtggctttaccggcgtgctcgaagtc
agcgatggggctggcggctgggtcggtatcgatcagtccagtggtggttcgggcctgctc
gatctgctggggctgttcggttctgggacgaccgcgcaaatcgaaggtctggccgcaggt
gagtaccgcttcacgctcagcctcgatccgaacctggtagcggtgggtgcctctgcaacg
gctagcctgagcgtcgataacgcaagcctgacggacttcaccgtggaacccggcgctgat
gttgagggtaacgtcatcaccgatccaggcttcaacggacaaccggactccccgggggct
ctgggcgatgcgacggtgcaagtggaagtcgatggtgtatttgtcgatgcagatgccgcg
gttggaacggtcctgcaagggcagtacggtcaactgacgatctttgccaacggtgattac
agctacacgccaaacggcgatgcggcgagcattggccaggtcgacagcttcgcgtatcaa
ctggttacggcggctggcggtgtggcttcggccaacctttatatccgcatagacagcaac
gatacgacgattgtctggagccctaccgatccgtcggccccgggtgtcgtggaggtggtt
gccaccgacgacattggtgctgcgcaggtcgatatcgacaacctggtcgacacgcaaggc
ctggcggaaatcagctatgcgccgccagttcttatcggcaccggaaccgggaccggtgcg
tcctttgtggtggctgctgacacgacggctgagctggaggtcagtcgcgacttcacgggt
attggcgtgttgcctacgacgacgatcaacttgcagaaactgatcgatggcgtttggact
acgcagcagaccacgaccaccgccactcataccttcaccgggctggatgccggtgagtat
cgcgtgacggcgtcgactggcgcgcttgtatcggtcggcacggtgacgatcgaccagacg
ctggtgacgacccacctgacggagttcgttacgggggccgctgtcgccgcaacgggcaat
gtcctcgaactcagtgatctatcgccagcggacagcctcggctcgacgttgaccgtactg
agtgtgctggtcaatgggctctacgtcataccagggcaaaccggagcggaggtccagggt
ctttacggcacgctgacgttgcacgccgacggtgcttacagctacacgccgaccccgggg
ctggcgcttgcggacatcgggcaggtggataccttcacctacaaactcaccacgccaagc
ggtcaggaggatacggccaacctgtacatccgcatcgattcgccagaccgcgacctggtg
tgggacgacgccaaccctggctcgcctgccactgagggcgccggtatcgccgccgccagc
ttcatggtggatcaggcagcctcaggtgatgacagtgcgggctcggaaggcagcgcagac
actgacttcagtcatgtcgaaggtgtcgcgggggccgacggtttgctatgggagggtggt
gatgcagccatcaacctgagcgacctgatcggaaatgtcagcggtgtggagagcattgac
ctgaatgacgtcagcgcggttgaactgacgttgagcctggaggacctggtgtccatcacg
gggccggagtcggatcgcttgatgatccagggcgacgatcaggacagtgtgcatttgaca
ggcgactggtccaccggtgcgacccaggtagagaacggtctggagtacgtgatctacacc
agccaggaagatgaaacccatcagctgtgggtgcaaagcggcatcagcgtggtttaa
DBGET
integrated database retrieval system
