Prunus mume (Japanese apricot): 103323915
Help
Entry
103323915 CDS
T03196
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
pmum
Prunus mume (Japanese apricot)
Pathway
pmum03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pmum00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
103323915
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
pmum03019
]
103323915
Messenger RNA biogenesis [BR:
pmum03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
103323915
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
S1CSD-TOTE-2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
103323915
NCBI-ProteinID:
XP_008224160
LinkDB
All DBs
Position
LG2:complement(39065072..39068937)
Genome browser
AA seq
467 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWETSEDKLKEYFSNYGDVLQTVVMRDKVTGRPRGFGFVVFVDPAVL
DRVLQDKHTIDGRTVEAKRALSREEQQTTGRVGNANPTRSGGNGGNIRTKKIFVGGLPPT
LSEEGFREYFETYGHVTDVVVMYDQSTGRPRGFGFISFDTEEAVDRVLHKTFHDLNGKQV
EVKRALPKDANPGGGGRSMGGGQGGGGAAGGGYQGYGASGGNPNAYDGRMDSNRYMQSQS
TGGGFPPYGSSGYSAPSYGYGPTSNGIGYGGYGSYGGTNTGYGGPAAAAYGNPNAPNAGY
ASGPPGAPRSSWSSQAPSGYGAMGYGNTAPWGVSGGSAGAGSGGPGSAPAGQSPSAAAGY
GAQGYGYGGYSGSDASYANPSGYGAVGGRSGSVPNNNVGGAGGEQGSGGGYVGSGYGDSN
GNTGYGNAGWRSDPSQASGNYGGQANGGQVGYGGGYGSAQARQSQQQ
NT seq
1404 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcagatcaaggcaagctttttattggtgggatttcatgggaaacctcggaggat
aagctgaaggagtacttcagcaactacggcgacgttttgcaaacagtggttatgagggac
aaagtcacgggacgccctagaggttttgggtttgtggtttttgtagatcctgctgttctt
gatagggttcttcaggataagcacaccatcgatggtagaacggttgaggctaagagggcc
ctatcgagagaggagcagcaaaccactggcagagttggaaatgctaaccctactagaagt
ggtggaaatggtggaaatattaggaccaagaagatatttgttggagggttgcctcccact
cttagcgaagaaggattccgtgagtattttgaaacttatggccatgtaactgatgtagta
gtaatgtatgaccaaagtaccggacgtcctcgtggatttggatttatttcatttgatact
gaagaagcagttgatagggttttgcacaaaacatttcatgatttaaatggtaagcaagtg
gaagttaagcgggcgcttcccaaagatgccaatcctggtgggggtggccgtagcatgggg
ggtggtcaaggtggcggtggtgcagctggtggcggttatcaaggatatggcgcatctggt
ggcaacccaaatgcatatgatggtagaatggactccaacaggtacatgcaatctcagagt
actggaggtggttttccaccttatggttcttctgggtatagtgcacccagttatggctat
ggtcctaccagtaatggaattggttatggcggttatggaagttacggtggtactaatacc
ggctatggaggtccagcagctgctgcctatggaaaccctaatgccccaaatgctggctat
gctagtggtccgccaggtgcccctagaagttcatggagttctcaagccccctctggatat
ggtgctatgggatacgggaatactgctccttggggtgtttcaggtggcagtgcaggtgca
ggcagtggcggccctggttctgcacctgctggtcaatcacctagtgcagcggctgggtat
ggagctcaaggttatggttatggtgggtacagtggaagtgatgcgtcctatgcaaatccg
tctggttatggtgctgttggagggcgttcagggagtgtcccaaacaacaatgttggtggc
gcaggtggggagcaaggtagtggtggtggctatgttgggagtggctatggcgattcaaat
ggaaatacaggttatggaaatgctggttggagatctgatccatcccaggcttcaggaaac
tatggtggtcaggcaaatggtggacaagttggttatggtggtgggtatggcagtgctcag
gcacgacaatcccaacagcagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
