Prunus mume (Japanese apricot): 103330546
Help
Entry
103330546 CDS
T03196
Name
(RefSeq) putative disease resistance protein RGA1
Organism
pmum
Prunus mume (Japanese apricot)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
NB-ARC
Rx_N
LRR_8
LRR_4
NACHT
AAA_16
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
103330546
NCBI-ProteinID:
XP_016649630
LinkDB
All DBs
Position
LG5:complement(636543..640820)
Genome browser
AA seq
1157 aa
AA seq
DB search
MAEGVLFNVAEGIIGRLGSLVFQEIALLWGVKDDLQKLKDKVAQLQAVLLDAEQKQANYQ
VKVWLQSVEDAVYEADDVLDEFYTEAQWRQMVPGNNKVSKQVRIFFSSSNQLVFGLKIGH
KIKDLNKRLYEIASNRTFGQLQVNHEDARFVIRERVTHSFVREDNIIGRDEDKRAIIQLL
LHPISTENTENAENVSTISIVGFGGMGKTALAQLVFNDEEVQKHFEPKMWTCVSNSFQLD
ILVKKILKTDMFDMDQLQNELRKKIDGKRYLLVLDDVWNDNREKWLALKDLLMGGARGSK
ILITTRIDTVAKITNTAKPYKLKGLNEEQSWSLFKKMAFQDGKEPTSSTIKVIGEEIARK
CKGVPLAIRTIGRMLYTRDPETEWPTFNNNKLSTIRQEENDILPTLQLSYDVLPSHLKHC
FAYCSLFPPDYEIPIENLIKLWVAQGFVKSSNPNECLEDVGYEYCNELVWRSFFQEEEKD
EFGIIKSCKMHDLMNELAVKVAGEGSIIIGRNKTDFDAKLLLHVSFDFCVDLWKLKIPKS
LLESNKLRTFLFLRQVWWGKSFHKSFCVTIASNFKSLRTLSLNGLKIKKLPKCLWTMIHL
RYLDLSDNREMERLPNWIVKLQNLEVLDLSRCDSLVELPRDIKKLINLRHLILKRCYKLA
WIPHGLGELTRLCTLSRFVLSENKSMLRDCAGLSELGKLKNLRGELEIENLRYKKDMVSE
LNYDGAVLKEKRHLYSLTLHWMHIERENSDAVEEESDVIIKSMEALQPHSSLKELTLKYY
MGVGFASWFHSLTNIINLKLSDCDRCQHLPPLDHLPFLKSLKLFGLRNLEHISAEDTVKD
FASDEMMMMMSVASPLTTFFASLESLYLIDCPNLKGWWRNETASASASSFPCLSTLYIRN
CPNLTSMPLYPNLDKLWLEGSSWKVLPSSFVLSKLKSLNIRGVDDIEYLPEEWIGNLTLL
QELEFHHCPNLASLPEGIGNLTLLQDLIIKDCPNLASLPEGFRCLASLKSLIIDSCPILE
QRCQKETGEDWSKIAHIPEFIIDSLFIFFMIMNIKSWVYEDGVSTKKAYGLIVIVQQQAT
KNVRREEETDGVKKANSHHSNGPCRSTGKLQECRKSVVRSVLKSCGAFQQLRELHYPKCG
ILCCSVEQRSSVLNSCF
NT seq
3474 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcagaaggagtcctcttcaacgttgcagaagggatcattggaaggttaggctccctt
gttttccaagagattgccttgctttggggtgtcaaagatgacctccaaaagctgaaggac
aaagttgcccaactccaagctgttcttcttgatgctgagcaaaaacaagccaactatcaa
gtcaaagtgtggctccaaagcgtagaagatgcagtttatgaagctgatgacgtgctcgat
gagttttatactgaagctcagtggagacaaatggtgcctggaaataataaagtgtcaaag
caggtacgcatcttcttctctagctcaaaccagcttgtttttgggctaaaaatcggtcat
aagataaaagatcttaacaagagactttatgagattgcctcgaatagaacatttggtcaa
ttacaagtgaaccacgaagatgcacgatttgtaataagagagagggtcacccactcattt
gtccgcgaggataatataatagggagagatgaagataaaagagcaattattcaacttctg
ttgcatcccatctctacagagaatacagagaatgcagagaatgtgtccaccatttccatt
gtgggatttggaggaatgggaaaaactgcacttgcccaactcgtattcaacgatgaagag
gttcaaaagcattttgagccaaaaatgtggacatgtgtctctaattcatttcagttggat
atactcgttaagaaaatcctaaaaactgacatgttcgacatggatcagttgcaaaatgag
cttaggaagaagatcgatgggaagagatacctccttgtgttagacgatgtgtggaatgat
aatcgtgaaaaatggctagccttgaaagacttgttgatgggtggtgcaagaggtagtaaa
atactaataactactcgtattgatacagttgcaaagataacaaatacagctaaaccatat
aagttaaaggggttgaatgaagaacagtcttggtctttatttaagaaaatggcatttcaa
gatggaaaagagccaacaagttcaaccattaaggtgattggggaggagattgctagaaaa
tgtaaaggggttccgcttgctataaggaccataggacggatgttgtacactagagatcca
gaaactgagtggccgactttcaataataacaagctttcaacaataaggcaagaagaaaat
gatattttaccaacacttcagctgagttatgatgttctcccatcacatttgaaacattgt
tttgcttattgtagtttgttcccgcctgattatgagattcccatagagaatttaattaag
ctatgggtggcacaagggttcgttaagtcttcaaatcctaatgagtgcttggaagatgtt
ggttatgaatattgtaatgaactagtttggagatcttttttccaagaagaagaaaaagat
gagtttggtataataaaaagctgtaaaatgcatgatctcatgaatgaacttgctgttaaa
gtggcaggggagggaagcataataataggtcgcaataagactgattttgatgcaaaactt
cttcttcatgtatctttcgatttttgtgttgatttgtggaaattgaaaataccaaaatcg
ttgttggaatcaaataagctaaggacttttcttttcttaagacaagtgtggtggggaaag
tcattccataagtcattttgtgttacaattgcttcaaattttaagtcattgcgtacgttg
agtttgaacggattgaaaattaaaaaattgccaaaatgtctttggacaatgatacattta
agatatcttgatcttagtgataacagagaaatggagagacttcccaattggatagtcaaa
cttcaaaatttggaagtactagatctctcaagatgtgactctcttgtggaattgcctaga
gatatcaagaaattgatcaacttgagacatctcattttgaaaagatgttataaattggct
tggattcctcatggattgggtgaattgactcgtctttgtactttgagtagatttgttttg
agtgaaaacaaatccatgttgagggactgtgcagggctcagtgagttggggaagctgaag
aatttaagaggagagttggagatcgaaaatttgaggtacaagaaagatatggtgtcagaa
ttgaattatgatggtgcagttttgaaggagaaacgacatctctattcattgactttacat
tggatgcacatcgaaagagaaaatagtgatgcggttgaggaggagagtgatgtaattatt
aagtcaatggaagcgctgcagccccattcaagtctaaaagagttaaccctgaagtactat
atgggtgtggggtttgcgagttggtttcattctctcacaaatattattaatctcaaattg
tctgactgtgatagatgccaacatcttccaccgttggatcatttaccttttcttaaaagt
cttaaacttttcgggttaaggaatttggagcacatatcagcagaagacacggttaaagac
tttgccagtgatgagatgatgatgatgatgtcagttgcttctccattgacgaccttcttt
gcctccttagagagtctttatctaattgattgccctaatctcaagggatggtggaggaat
gaaacagcttcagcttcagcttcttcatttccttgtctttctactttatatatacggaat
tgtcctaacctaacttccatgccactgtacccaaatcttgataaactgtggttagaggga
agcagctggaaggtccttccctcctcctttgttctctccaaattaaaatctctaaacatt
agaggtgttgatgatatagaatatttgccagaagaatggattggcaacctcacattactc
caggagcttgaatttcatcattgccctaatttggcatcactaccagaagggatcggcaac
ctcacattactccaggacctcataattaaggattgtcctaatttggcatcactcccagaa
gggtttcgttgccttgcctcattaaaatcgttgataattgattcttgccccatcttagag
caaagatgccagaaagaaacaggtgaggactggtctaagattgctcacatcccagaattt
atcatagacagcttgttcattttcttcatgatcatgaatatcaagtcttgggtttatgag
gatggcgtcagcactaagaaagcttatggcttgattgtgattgtgcaacagcaggccacc
aagaatgtgcggagagaagaagaaacagatggagtgaagaaagccaatagccatcattca
aatggaccttgtaggagtactggaaaattgcaagagtgccggaagagtgtggttcgaagt
gtgctcaagtcttgtggggcatttcagcagttgagagagcttcactatcccaagtgtggt
atcttgtgctgcagtgttgagcaacgttcctccgttctgaattcgtgtttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
