Prunus mume (Japanese apricot): 103332869
Help
Entry
103332869 CDS
T03196
Name
(RefSeq) transcription initiation factor TFIID subunit 15b
KO
K13098
RNA-binding protein FUS
Organism
pmum
Prunus mume (Japanese apricot)
Pathway
pmum03015
mRNA surveillance pathway
pmum03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pmum00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
103332869
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
103332869
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
pmum03041
]
103332869
Spliceosome [BR:
pmum03041
]
Complex A
Other components
Complex A specific factors
103332869
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
Zn_ribbon_RanBP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
103332869
NCBI-ProteinID:
XP_008233891
LinkDB
All DBs
Position
LG1:complement(1242070..1246317)
Genome browser
AA seq
474 aa
AA seq
DB search
MAGMYGQEGGDGAPPPYGSSGSGGYGGSGGYGSGGGGYGGGGGGGGYGGGSGGGGYGGKG
GDGGGYGGGGRGGRGGGGYGGGGGRGGGYQGGDRGGRGADRGGGGRGGRGGSGRDGDWLC
PNPGCGNLNFARRVECNKCGTPSPAGGGGDRGGGSGGGGYNRGGSGGGYGGNRGGRGGNY
DGGRSSNYEGGKSSGYDGGRGGNFDGRGGGGSRGGSYGSNQGRDDGGYGQVPPHVPPSYG
AAGGSYPPSYNASYGTDAVPPPTSYTGGPTSYPPSYGGPAGGYGGDGPGDVRSGGRGGPP
AKYDGGYGAGGRGGYGGAAMEAPAKVKQCDQNCDETCDNARIYISNLPPDVTVDELQQLF
GGIGQVGRIKQKRGYKDQWPYNIKIYTDESGKNKGDACLAYEDPSAAHSAGGFYNDYELR
GYKINVAMAERSAPRAPPDQGGGRGGYGGGGRRDNYRDGGPDRHQHGGNRARPY
NT seq
1425 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctgggatgtacggtcaagagggtggcgatggcgcccctccgccatatggatctagc
ggcagtggtggctatggtggctctggaggctacggaagcggtggtggaggctatggaggt
ggtggtggaggcggaggatatggaggaggtagtggtggtggtggttatggaggtaagggc
ggcgatggaggtggttacggtggtggaggccgtggtggacgaggtggtggaggttatggc
ggcggtggtggtcgaggcggaggatatcaaggaggagatcgcggtggccgaggtgccgac
cgtggtggtggtggcagaggtggccgcggtggcagcggaagagatggtgattggctttgc
cctaacccaggctgtgggaatttgaactttgcaagaagagttgagtgtaacaagtgtggc
acgccctctcctgcgggtggcggtggtgatcgcggcggcggcagtggtggcggcggttat
aataggggaggaagtggtgggggctatggtggtaaccgtggtggtagaggtggtaattat
gatgggggtcgaagtagtaactatgaaggaggtaaaagtagcggttatgatggaggtaga
gggggtaattttgatggtagaggtggaggtggtagtagaggtggttcttatggcagtaac
caaggaagagatgatggtgggtacggtcaggttcctccacatgtgccgccgtcctatggt
gcagctggaggcagttacccaccatcttacaatgctagttatggaacagatgcagttcct
cctcctacaagctataccggtgggcctacatcatatcccccatcctatggtggtcctgcg
ggtggttatggtggtgatggtcctggtgatgtaaggagtggtggccgaggtggccctcct
gctaaatatgatggtgggtatggtgctggtggtcgaggtggatatggtggtgctgctatg
gaagccccagctaaggtgaagcaatgcgaccagaattgtgatgaaacttgtgacaatgct
agaatctacatatcaaacttgccaccagatgttactgttgatgaactgcagcagcttttt
ggaggcattggacaagtgggaagaatcaagcaaaaacgtggctataaggaccaatggcca
tacaatatcaaaatatacacagatgaatcgggaaaaaacaaaggcgatgcatgtttagca
tatgaagatccgtctgctgcacattcagctggtggattttacaatgattacgagttaagg
ggctataagatcaatgttgcgatggcagagaggtcggcacctagggctccgcctgaccag
ggtggtggtagaggtggatatgggggcggtgggcgcagggataattatagagatggtgga
cctgatagacatcaacatggcggaaaccgtgcacgtccttattga
DBGET
integrated database retrieval system
