Pedobacter mucosus: LOK61_03735
Help
Entry
LOK61_03735 CDS
T08291
Name
(GenBank) PAS domain S-box protein
Organism
pmuo
Pedobacter mucosus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PAS_9
HATPase_c
PAS
PAS_4
HisKA
PAS_8
PAS_3
PAS_7
HATPase_c_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UKT64887
LinkDB
All DBs
Position
835385..836938
Genome browser
AA seq
517 aa
AA seq
DB search
MNTFQKGKFELSGFSMSENFELLTKALDASISGIIITDNNQPDNPIIYCNSAFEVISGYS
RKEIIGHNCRFLQAEDRNQKEREILAQSVKEGLDCAVVIRNYRKNGDLFWNELYMSPVKN
SNGDVTHFIGVQNDVTERKKVEHDLRQQKVLMQQKVDERTVALRDSEAFLTSIIETVREG
LLVLDPKFRVISANYHFLRTFKVSAEETVGKQLYELGNNQWDILKLRELLITILPTNNPV
VDFEVEHDFPHIGKKLMLLNAYRIELEGQFKDQILLAIEDITERKEIERRKDDFLSIASH
ELKTPLTTIKGYMQILERNVPKEASDKFSVTLAKVSQYVERLNNLIAELLDVSRIQTGNI
ELHEESFDFDRMMSEVVEGIQASAQHHRIILTGKVDATVTADETHIMQVLNNLLSNAVKY
GPESENIEVNVTNISEYVKVSVRDYGVGMSIDDKKRVFERFFRGSDIQKRFPGMGIGLYV
CDQIIKNHNGTLWVESEKGKGSTFSFTIPKGGKKSNE
NT seq
1554 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgaacacattccaaaaagggaagtttgagctttccggattttccatgagtgaaaacttt
gagcttttaacgaaagcgcttgatgcatcaatttcaggaattataattacagacaataac
cagcctgacaacccaattatatattgcaattctgcttttgaggtaattagcggttatagc
cgcaaagaaattattggccataattgtagatttcttcaagcagaagacaggaatcagaag
gaaagagaaatattagcccagtctgtgaaagagggtttggattgtgctgttgtaattaga
aattatagaaaaaatggagatttgttttggaacgaactctatatgtcgccagtcaaaaat
tcgaatggtgacgttactcactttatcggggttcaaaatgatgtaaccgagcgaaaaaag
gtggagcatgatcttcgtcagcagaaagttttaatgcaacaaaaagttgatgagcggacg
gttgccttacgcgatagcgaagcttttttaaccagtattattgaaacggttagggaagga
ttgcttgtgctcgatccaaagtttagggtaataagtgccaattatcattttctacgaacc
tttaaagtatctgccgaggaaactgtaggcaagcaattgtatgaattaggaaataaccaa
tgggatatattaaaacttcgcgaacttctaatcacgattctgcccactaataatccggtg
gtagattttgaagtagaacatgatttcccgcatattggtaaaaaattaatgctgttaaat
gcctatcggattgaacttgaagggcaatttaaggaccagattttattagccatagaagat
attaccgagcgtaaagaaatagaacgaagaaaagatgatttcctttctattgccagtcat
gagttaaaaacacccttaactacgattaagggatatatgcagattcttgaaaggaacgtt
ccaaaagaagcatcagataaatttagcgttactttagccaaagtttctcagtatgtagaa
aggctaaataatttgatagcagaattattggatgtatcacgaatccaaaccggcaatatt
gagttgcatgaggaaagttttgacttcgatagaatgatgagtgaggttgttgaaggtata
caagcatcagctcagcaccatcgaattatacttactggtaaagttgacgccacggtaaca
gctgatgaaacccatattatgcaggttttaaataaccttttatcaaatgcggtaaaatat
ggaccagaatctgaaaatattgaagttaacgttacaaatatcagtgaatatgttaaagtt
tctgttcgggattatggtgttggaatgagcattgatgataagaagcgtgtatttgaacgg
ttttttagaggcagtgatattcaaaagcgcttcccggggatgggcattggattgtacgtt
tgcgaccagattattaaaaatcacaatggtacgctttgggtggagagtgaaaagggcaaa
ggttcaacatttagttttacaataccaaaagggggaaaaaaatcgaatgagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
