Pedobacter mucosus: LOK61_07890
Help
Entry
LOK61_07890 CDS
T08291
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
pmuo
Pedobacter mucosus
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pmuo00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pmuo02000
]
LOK61_07890
Transporters [BR:
pmuo02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
LOK61_07890
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
NOMO1-like_2nd
fn3_3
Y_Y_Y
EMC7_beta-sandw
SpaA
SdrD_B
MetallophosN
PEGA
DUF4198
DUF2846
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UKT65701
LinkDB
All DBs
Position
1911374..1913782
Genome browser
AA seq
802 aa
AA seq
DB search
MTKKFTLFFNLLAIVLLLAGNVHAQSKNGSVSGSIKTSDGKPAANVSVGLKNTGKITQTD
DKGNFTIKNVTPGNYIIKVSAIGVSSEEKSITVTTNQTISTSFAIAQSSSQLKDVAINGY
RTPNNKPINLGKIAIAPKDLPQSVQIVNSQIITDQQALRLSDVLANVNGVAYSENRGGVS
GETFVARGYSLGGNNLLKNGARTSSGGSPEVSTLESVEVLKGSAALLYGGVTGGAIINMI
TKKPKFEYGGEVSMRVGSYDLYKPIVDFYGPISKKLAFRIIGTTENANSFRDNVKTNRIY
VNPSLLYKINENTDFLLQGDYLKSNNTPDFGIGTIANAVPNLDRGAYLNAPWAYNKTNTA
TTQLNFNHKFNEDWKMTVIGSFQSYNRNYYSAERPFALLANGIAARNVTRSKSKEFTYNQ
QINVNGKFNTGNITHTILVGVDADQARTTSLANWSYNGAAAFNYGNINLLDPSTYYGSGI
EPNAVSTSSTFAPIFRMGAFVQDLISITEQFKVLAGVRWTYQKTPSTVTTANATGIKTPS
ATADKIDKAYSPKFGLVYEPLKTTSIYVSYANNFTSNSGTDVFLAPMRPSIIDQYEAGVK
NDFLEGKLTANVTVYRIKNSNFAQTAALKADGTANADATIKEFTGKTASDGIEFDLSGTI
VNGLNFLAGYSYNNYRYLSTLPVTGLIEGERVVGTVKNKANATVFYTFQDGAIKGLKLGT
TLIYTGTRFGGRNQNKSGTSTGLIPLTPFTTVDFTAGYSWKKLSLLAKLANITNELNYYV
HENYSVNPIPPRQFVTTVSYKF
NT seq
2409 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgactaaaaaatttactctattttttaatttgcttgcaatagtactgctcctggcagga
aatgttcatgcccaatccaaaaacgggtccgtatctggatcgattaaaaccagcgatggt
aagcctgcagctaatgttagcgtgggattaaagaatacaggaaaaataacccaaactgat
gataaggggaatttcacaatcaaaaacgttacaccgggaaactatataattaaggtatca
gcaattggtgtttcttcagaagaaaaatcaataacggttactacaaatcaaaccatatcc
acaagttttgctattgctcaatcttcttcacaattaaaagatgtagcaattaatggttac
agaacacctaacaataagcctattaatttaggtaaaattgctattgctcctaaagattta
ccacaatcagttcagatagtaaacagtcaaatcattacagatcagcaagctttacgttta
agcgacgttttagctaatgtaaatggcgttgcttattcagaaaatcgtggcggtgtaagt
ggcgaaactttcgtagctagaggttacagtttaggtggtaacaatttacttaaaaatggt
gctcgtacctcatcaggaggttcgccagaagtaagtactttagaatctgttgaggtgcta
aaaggtagtgctgccttattgtatggtggtgttacaggtggtgcaattatcaacatgatt
acaaaaaaaccaaaatttgaatatggtggtgaagtttctatgcgtgtaggtagttacgat
ttatataaaccaattgtagatttctatggtccaatttctaaaaaacttgcttttcgtatt
ataggtactacagaaaatgcaaatagctttagagacaatgtaaaaacaaataggatttat
gtgaacccatcattactttataaaattaatgaaaataccgatttcttattacaaggtgat
tatctaaaaagtaataacacaccagattttggtattggaacaattgcaaatgctgttcct
aatttagacagaggcgcctatttaaatgctccatgggcgtataacaaaaccaatactgct
accacacaattaaattttaatcacaaatttaatgaagattggaaaatgacagtgatcggt
tcatttcaatcctataacagaaattattatagtgcagaacgcccttttgctttattagct
aatgggattgccgctcgtaatgttacacgttcgaaatctaaagagtttacttataatcaa
caaattaatgtaaatggaaaattcaatactggcaacatcacccacacaattttagttggt
gttgatgcagatcaggcaagaacaacttcattagcaaattggagctataatggtgcagct
gcatttaactatggtaatataaatcttttagacccatctacctattacggatcgggtata
gagccaaacgcagtctctacaagttcaacctttgctccaatttttagaatgggtgcattt
gttcaggatttaattagcattacagaacaattcaaagtgttggcaggcgtaaggtggact
taccaaaaaacaccttctaccgtaactacagctaatgcaacaggtatcaaaacacctagt
gctactgcagacaagattgataaagcatattctccaaagtttggtttggtttatgagcca
ttgaaaacaacttctatctacgtaagttatgcaaacaactttacgtcaaattcaggaact
gacgtctttcttgcgccaatgagaccatcaattattgatcaatatgaagcaggcgtaaaa
aatgattttcttgaaggaaagttaactgcaaatgtaactgtatatagaattaagaatagc
aattttgcacaaactgccgctttaaaagctgatggtactgcaaatgctgatgcaacaatt
aaagagtttacaggtaaaactgctagtgatggtatagagtttgatttaagcggaaccatc
gttaacggcttaaacttccttgctggttatagctataacaactatcgctatttaagtaca
cttccggttacaggtttaattgaaggtgaaagagttgttggaaccgtaaaaaacaaagca
aatgctaccgttttttacactttccaggatggagcgataaaaggccttaaattaggcaca
accctaatttacactggcactcgatttggaggcagaaaccagaataaaagtgggacttca
actggtttaattccattaacaccatttactactgttgattttacagctggttattcatgg
aaaaaattatcgcttttagctaaacttgcaaatattacaaatgagttaaactattatgtt
cacgagaattatagtgttaatccaattccacctcgtcaattcgtaactaccgtatcatac
aaattttaa
DBGET
integrated database retrieval system