Pedobacter mucosus: LOK61_20265
Help
Entry
LOK61_20265 CDS
T08291
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
pmuo
Pedobacter mucosus
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pmuo00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pmuo02000
]
LOK61_20265
Transporters [BR:
pmuo02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
LOK61_20265
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CarbopepD_reg_2
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
CarboxypepD_reg
CooC_C
Big_1
SpaA
TTR_TEN1-4
EF-hand_5
MetallophosN
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UKT64088
LinkDB
All DBs
Position
4825900..4828866
Genome browser
AA seq
988 aa
AA seq
DB search
MKVFYLLKQGLLMLLIFSALIVKAQTGSISGKVLDETGQPLPGASVVIKGTTRVTSTDGN
GNFKLTGLTNGSITLSASFIGYQTLDKAANVTANATLNFQLVPDAQKLNEVVVIGYGTAE
KKNLTGSITTVNSKDFQKGTITTPEQLIQGKVAGVNVISNSGQPGVGSTIRIRGGASLNA
SNDPLIVIDGVPFSGNTIDNAPSPLSLINPNDIETFTVLKDANATAIYGSRASNGVILIT
TKKGSSGAPVINFSTNNSIATVIKKVDVLSADQVRAYVNANGTPSQKASLGTANTDWQDE
IYQRAFTSDNNLSISGSFKSVPYRISAGYLDQDGLLITDKLKRGTGSITLSPRLFKDHLK
IDLNVKGSLTDSHFANGGAIANAIQFDPTQPVNVQNSYGNYFEWTQGTGANMVPNPNAPR
NPVGLIRLQDNNGNAARSIGNAKFDYSFHFLPELHANLNLGYDVSKGYGSINVPSFAAQS
ASTFGSATRGLRTGNDKFSEFYLNYAHTVESIKSRFDATAGYGYYDNSTTLNNFTSYTGT
GVALVTPVFPFSVERNKLLSYYGRFVYTLADKYILSGTMRADASSKFAENNRWGYFPSAG
FTWRIIGENFLKDSKVISDLKLRLSYGETGNKDGIGNYDYLSKYYANSNTGQYQIGNTFY
NYYAPAGYDPDLRWESTTTYNAGLDYGFLQGRLYGSLDVYYKKTKDLLSTVTIPVGTNFS
NVLTTNVGNMDVRGAEASLNFVAIKSDNITWDLGINAAYNKRKVTNLTLNPNSGFKIDAG
DITGGTGVHLKYNAVNQIPGSFFVYKQVYDGSGKPLEGIYADLNGDGTITPDDQYFYKSA
DPNFTFGFNTSFTYKKWSVSTVLRANIGNYVYDNVASNYGIKSNILTSVGVLNNASTDLL
STGFTATQYLSDYYIRNASFLKMDNLGLTYNIGKLSQNGNTTMRISANCQNVFVVSEYKG
LDPELSSGIDYNLYPRPRTFTLGLNVGF
NT seq
2967 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaagtattttacctgttaaaacaggggcttttgatgctgttaattttttcagcattg
atcgtaaaagcacaaaccggatctatatctggtaaagtgcttgatgaaaccggccaacct
ttacctggtgcttccgtagttattaaaggaacaaccagggttacctccacagatggaaac
ggtaattttaaacttaccggattaacaaatgggtctataactttatctgctagttttatc
ggttaccaaactttagataaagctgcaaatgttacggcaaatgctacattaaatttccaa
ttggtacctgatgcacaaaagcttaatgaggttgtagtaattggttacggtacagcagaa
aagaaaaacctaaccggatctatcaccacagtaaactcaaaagattttcaaaaagggaca
atcactaccccagaacaattaattcagggtaaagttgcgggtgtaaatgtaatttctaac
agtggtcagccaggtgttgggagtacaattcgtattcgcggtggtgcttcgctaaatgca
agtaacgatccattgattgttattgatggagttccttttagtggaaacactattgataat
gcgccaagtccattatcattaattaatcctaatgatattgaaacttttactgtgttaaag
gatgcaaacgcgaccgcaatttatggttcaagagcatcgaacggcgtaattttaattaca
accaaaaaaggtagttctggtgcaccagttattaacttcagcaccaataattcaattgca
acggtaattaagaaagttgatgtattgtcagctgatcaagttcgtgcttatgttaacgcg
aatggtactccttctcaaaaagcatcattaggaacagcaaatacagattggcaagatgaa
atttatcaaagagcttttactagtgataataatttaagtatttcgggatcattcaaaagt
gttccttaccgcatttcagctggttatttagatcaagatggtttattaattactgataaa
ttgaaacgcggaacaggatcgattacgctatctccacgattatttaaagatcatttgaaa
attgatttaaatgttaagggatcattaacagattctcatttcgcaaacggtggagcaatt
gccaacgccattcagttcgatccaactcaacctgtaaatgttcaaaatagttacggcaat
tatttcgaatggacacaaggtaccggcgctaatatggttccaaatccaaatgcgcctcgt
aacccagttggtttaattaggctgcaagacaataatggaaatgcagcaagaagtattggt
aatgctaaatttgattattctttccattttttaccagagctgcatgctaacttaaactta
ggttatgatgtttctaaaggttacggctcaattaacgttccttcttttgcggcgcaaagt
gcctcaacatttggttcggcaacccgcggacttagaactggtaatgataaattttctgag
ttttacttaaactatgcacatactgttgaaagtattaaaagtaggtttgatgcaactgca
ggatatggttactacgataattctacaacgctaaataattttacaagttatacaggtaca
ggcgtagcattagttactccggtttttcctttctctgttgagcgtaacaaattgctttct
tactacggaagatttgtttacacgttagctgataaatatattttatctggtacgatgcgt
gctgatgcttcctcgaaatttgctgaaaataatcgttggggatattttccatcagctggt
tttacatggagaattattggcgaaaacttcttaaaggatagcaaagtaatttcagactta
aaattaaggttgagttatggcgaaactggtaataaagatggtattggcaattacgattat
ttatctaaatattacgcaaactctaatactggtcaataccaaattggaaacactttttac
aattattatgcgccagcaggttacgatccagatttaagatgggaatctacaaccacgtat
aatgcaggtttagattacggctttctacaaggtagattatatggtagtttagatgtttat
tacaaaaaaactaaagatttattaagtacagttaccattccagttggaacaaactttagc
aacgtattaacaacaaacgttggtaatatggatgtgagaggtgctgaagctagcttaaat
ttcgtagcaattaaatctgataacattacctgggatttaggaattaatgcagcatacaac
aaaaggaaggttactaatttaacattaaatcctaattctggttttaaaattgatgctgga
gatattacgggtggaacaggtgttcacttaaaatacaatgcggttaatcaaattccagga
tcgtttttcgtttacaaacaagtttatgacggctctggtaaacctttagaaggtatttat
gcagatttaaatggtgatggtacaattacaccagatgatcaatatttttataaatctgct
gatccaaactttactttcggttttaatacatcattcacttataaaaagtggtcggttagc
acggttttaagagctaacattggtaactatgtttatgataacgtagcttctaactatggt
attaaatcaaacattctaacatccgttggtgtattaaacaacgcaagtactgatttatta
agtacaggtttcaccgccacacaatacttaagtgattattacatcagaaatgcgtcgttc
ttaaaaatggataacctgggcttaacttataatattggtaagttatctcaaaatggaaat
acaaccatgcgtatttcggcaaactgtcaaaatgtttttgtcgtatctgaatataaaggt
ttagatcctgaattgtcttcaggtatcgattacaatctttaccctagaccaagaacattt
actttaggcttaaacgttggtttttaa
DBGET
integrated database retrieval system