Protobothrops mucrosquamatus (Taiwan habu): 107283645
Help
Entry
107283645 CDS
T05763
Symbol
COL1A2
Name
(RefSeq) collagen alpha-2(I) chain isoform X1
KO
K06236
collagen type I alpha
Organism
pmur
Protobothrops mucrosquamatus (Taiwan habu)
Pathway
pmur04510
Focal adhesion
pmur04512
ECM-receptor interaction
pmur04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pmur00001
]
09130 Environmental Information Processing
09133 Signaling molecules and interaction
04512 ECM-receptor interaction
107283645 (COL1A2)
09140 Cellular Processes
09144 Cellular community - eukaryotes
04510 Focal adhesion
107283645 (COL1A2)
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
107283645 (COL1A2)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
pmur00536
]
107283645 (COL1A2)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
pmur00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
107283645 (COL1A2)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
COLFI
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107283645
NCBI-ProteinID:
XP_029139091
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1247 aa
AA seq
DB search
MSKSADMGHGPMGLMGPRGPPGTNGPPGSPGFQGPSGEPGEPGQAGPQGSRGPMGPPGKS
GEDGHPGKSGRSGERGVPGPQGTRGFPGTSGLPGFKGIRGHNGLDGRKGEPGATGNKGEP
GAAGENGTPGQAGARGLPGERGRVGAPGSVGARGSDGSVGPVGSAGPIGAAGPSGFPGAP
GAKGEIGSAGNVGPSGPSGPRGDIGLPGAAGPVGPAGNPGANGLSGAKGAAGLPGVAGAP
GLPGPRGIPGPTGASGAAGARGLAGEPGPPGSKGETGNKGEPGIAGPAGPAGSSGEEGKK
GPNGEAGSSGLPGSAGLRGVPGSRGLPGSDGRAGGLGMAGSRGATGPAGAKGPSGDTGRP
GEPGLMGARGLPGQSGSPGPAGKEGPSGSAGPDGRSGPTGPAGPRGEPGNIGFPGPKGPN
GEPGKPGDRGSVGLSGSQGPPGSDGNNGAQGPPGLAGNAGSKGETGPAGAPGFQGLPGPS
GPVGEAGKPGERGAHGDFGLPGPAGARGERGAPGESGALGPAGPLGSRGPSGPAGADGNK
GEPGAVGALGSAGPSGPSGVHGERGAAGGPGGKGEKGPSGFRGDAGATGRDGARGAPGAV
GAPGPAGASGERGEGGSAGPAGPAGPRGSSGERGEGGPAGPPGFAGPAGPVGQAGPSGAR
GDGGPPGPNGFPGNAGRSGPPGPAGITGPSGPPGPAGKEGIRGPRGDTGPMGRSGETGIS
GPPGFSGEKGPSGEAGAAGAPGSSGPQGILGAPGILGLPGSRGERGLPGLSGALGDHGPV
GISGPSGARGPSGPIGSSGVNGAPGESGRDGNPGNDGPPGRDGAPGYKGERGAPGNTGPA
GAVGAPGPHGSVGPVGKSGNRGERGPAGVTGPSGPAGSRGPAGSQGVRGEKGVGGDKGPR
GLPGFKGHNGLQGLPGIAGHHGEQGSAGITGPAGPRGPSGPSGPAGKDGRNGLPGPVGPA
GLRGSHGSQGPSGPPGSPGLPGPAGPNGGGYEIGYDMEYYRADQPSLRPKDYEVDATLKI
LNNQIETLLTPEGSKKNPARTCRDLKLSHPEWNNGFYWIDPNQGCTMDAIRAYCDFSTGE
SCISAKPGNFPAKNWYTGRKPDEKNLVWFGETINGGTQFEYNEEGVSTKDMATQLAFLRL
LANHASQNITYHCKNSIAYMNEETGNLKKAVVLQGSNDVEFRAEGNGRFTFTVIEDGCSR
KTNEWGKTVIEYRTNKPSRLPFLDIAPLDIGGADQEFRLDVGPACFK
NT seq
3744 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtccaaatcagctgatatgggccatggacctatgggattaatgggacctagaggccca
cctggaaccaatggacccccgggttctcctggcttccaaggtccttcaggtgaaccgggt
gaacctggacaagccggaccccaaggttctcgtggtccaatgggtcctcctggaaaatct
ggtgaagatggccatcctggaaaatctggaagatctggagagagaggtgttcctggacct
cagggtactcgtggctttcctggaacttctggtctgcctggattcaaaggaataagggga
cacaatggtttggatggtcgcaaaggagaacctggtgctaccggtaacaagggtgaacct
ggtgccgctggtgaaaatggtaccccaggacaagctggtgctcgtggtcttcctggtgaa
agaggaagagttggtgctcctggctcagttggtgctcgtggcagtgatggaagcgttggc
cctgttggttctgctggccctattggtgctgctggtccttctggattccccggtgctcct
ggagccaagggtgaaatcggttctgctggaaatgttggcccaagtggaccttctggtcct
cgtggtgatattggactccctggcgctgctggacctgttggccctgctggtaaccctggt
gccaatggcctttctggtgctaaaggtgctgctggtcttcctggtgtggctggtgctcct
ggcctgcctggtcctcgtggtatacctggtccaactggtgcttctggtgcagctggtgca
agaggacttgctggtgaaccaggtccacctggatccaagggagagactggtaacaagggt
gaacctggtattgctggtcccgctggtcctgctggttcatctggtgaggaaggcaaaaag
ggtcccaatggtgaagctggctcctctggtctaccaggatctgcaggtttaagaggtgta
cctggatctcgtggtctcccaggatctgatggcagagctggtggtttaggcatggctggc
agtcgtggtgctactggtcctgctggtgctaaaggtcccagcggtgacacaggtcgtcct
ggtgagcctggtctcatgggtgcaagaggtctcccaggacagtctggaagcccaggtccg
gctggaaaagaaggtccttctggttctgctggacctgatggtcgctctggcccaactggc
ccagctggtccacgaggtgaacctggaaatatcggattcccaggaccaaaaggtccaaat
ggtgaacctggcaaacctggtgacaggggcagtgtgggtctgtctggttcacagggtcct
cctggttctgatggaaacaatggagctcagggtccacctggtctcgccggcaatgcaggt
tcaaaaggtgaaactggtccagctggtgctcctggcttccaaggccttcctggtccctct
ggtccagttggtgaagctggcaaaccaggtgaaagaggtgctcatggtgattttggtctc
cctggtcctgctggcgcaagaggcgaacgtggtgcaccaggtgaaagcggtgctcttggt
cctgcaggccctctgggaagccgtggcccatcaggtccagcaggtgctgatggtaataag
ggtgaacctggagccgttggtgcacttggttctgcaggcccatctggtcctagtggagtc
catggtgagaggggtgctgctggtggcccaggtggcaaaggtgaaaagggtccatctggc
ttcagaggagatgctggagcaacaggaagagatggtgcacggggagcccctggtgctgtt
ggtgccccaggacctgctggtgcttctggtgaaagaggcgaaggtggttctgctggcccc
gctggccctgctggacctcgtggatcctctggtgaacgtggtgaaggcgggcctgctggt
cctcctggatttgctggtcctgctggtcctgttggtcaagcaggtccttctggagcccgt
ggtgatggtggtccacctggtcccaacggttttcctggtaatgctggcagatccggacct
cctggccctgctggtatcactggtccatctggcccccctggtcctgccggcaaagaggga
attagaggcccacgtggtgatactggcccaatgggtcgttctggtgaaactggcatttct
ggaccccctggtttcagtggagagaaaggcccatcaggagaagctggtgctgctggtgct
cctggctcctcaggtcctcaaggtatccttggagcacctggtatccttggtcttcctggc
tctagaggagaacgtggtcttccaggcttgtctggagcacttggtgatcatggacctgtt
ggcatttctggcccctcaggtgcccgtggcccatctggtcccatcggttcttctggtgta
aatggtgctcctggtgaaagtggacgtgatggaaatccaggtaacgatggtcctcctggc
cgtgatggtgctcctggttacaagggtgaacgtggtgctcctggcaacactggtcctgct
ggtgctgttggtgctcctggtcctcatggctctgttggccctgttggcaaatctggaaat
cgtggtgaacgtggtcctgctggagttactggccccagtggtcctgctggttcaagaggt
cctgctggctcacaaggtgtacgtggtgagaaaggtgttggtggtgacaagggtcccaga
ggtttgccaggtttcaagggacataatggacttcagggactgcctggtattgctggtcat
catggagaacaaggttctgctggtattactgggcccgccggaccaaggggtccttctggt
ccttctggccctgctggaaaagatggtcgcaatgggcttcctggacctgttggtccggct
ggtttgcgaggatctcatggtagccaaggaccctctggtccaccaggatcacctggtctt
cctggcccagctggtcccaatggtggtggctatgaaattggctacgatatggaatactat
cgtgcagatcagccatctcttagacccaaggattatgaagttgatgccactctgaaaatc
ctgaacaaccagattgagaccctccttaccccagaaggctccaagaagaatccagctcgc
acttgccgtgacttaaaactcagccaccctgaatggaataatggtttctactggattgat
cctaatcaaggctgcacaatggatgctattcgtgcatattgcgatttctccactggtgag
agttgtatctctgctaaacctggaaacttcccagccaagaactggtacactggcaggaaa
cctgatgagaagaatcttgtttggtttggagaaaccatcaatggtggtacccagtttgaa
tataatgaggaaggtgtgtctaccaaggacatggctacccaacttgctttcctgaggctg
ctggctaaccatgcttcccagaacattacttaccactgcaagaacagcattgcttacatg
aatgaggaaacaggcaaccttaaaaaggctgtggtgctgcagggatccaatgatgttgaa
ttccgagctgaaggcaacggccggtttactttcactgttattgaagatggctgctctaga
aagaccaatgaatggggcaaaacagtgattgaatacagaacaaacaagccttcccgtttg
cccttccttgacattgcacctttggacattggtggcgctgaccaagaattccgtttggac
gttggcccagcctgtttcaaatga
DBGET
integrated database retrieval system
