Pasteurella multocida subsp. multocida HN06: PMCN06_0510
Help
Entry
PMCN06_0510 CDS
T01776
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K15125
filamentous hemagglutinin
Organism
pmv
Pasteurella multocida subsp. multocida HN06
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pmv00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
pmv00536
]
PMCN06_0510
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
pmv00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Microbial pathogens
PMCN06_0510
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TPS
Fil_haemagg_2
PT-HINT
ESPR
GH-E
PT-VENN
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFF23765
LinkDB
All DBs
Position
545541..554501
Genome browser
AA seq
2986 aa
AA seq
DB search
MNKHCYRVIFSKTQQQFIVVSEIAKTAGQAKSEGKIRAEAESMKTLAKLTALFSPIPQSV
FKPLSFALLCAWGLVSIQSAYANPTNSPLIIQADPTAQANQRPQVMEAANGIPQVNIQTP
NQQGLSYNRYSQFDVDKKGAILNNSRKDTQTQLGGWVQANPYLAGGEAKVIVNEVNSNKP
SQLKGYVEVAGQKADVIIANPSGLHCEGCGVINADRVTLTTGKPQLKQGHLDHFVVEKSK
VTVSGKGLDNSQSNYTDIIAREAEINAGVWSKKAVNVTTGKNKVSKNNDAVQIIHSKSQN
NQKEENVTEYALDVSNLGGMYAEKIHLIGTEAGLGVRNAGHIGASAGDVVIDVNGKIVNQ
HRIQAQQHVILNAKGDKGTIDNMASAQVLANQGRINVQAEKTLNQSGVIGAKQQIAVQAE
AITQSKTGEIQGGEVRLTAQGQVVNRGLINSKVEDDTPAKTVIKADKIENVGTGRIYGDH
VALMADSLHNHDETTEITSSPIIAARKRLDLGVKQITNQNHQYSGNTTGATALYSDGTLH
VGAGLDAQDKVMGQAEVLNNHSALIESQGNMQLNVAKIHNTNDFFATELQVVLEKEVDWH
YIVPQGVAESELRFDTRLLHWRNQSRGRNGWVVNSKPKAIHKPHNGDVQSNYLPEVNQCM
NGTQGAGCEFLIDSYYFPHDPAWQYFAIKPSIRDNVASLLNEAKVPVAPIAPVEPVAPTN
PNANAQQEYEEKLAQYHQQKVVYDNAYQVYLQEKAHFDEKVKPAYLQWVKDNENHFTELS
HAIGQHNQRRASAAGRDYRSYWSHRVNRQVVKEDVVIQTQAGAILAGGDLKIDTQQFVND
KSRVLAGGQLQLQGDLLQRQADGLQFTESYGSKYYSYLRKRKSKTSSGRNKYQRRNERWY
SGLLSNTQKSITLPVANVFEQYEFDQDSLVIKSTGEHLALPNSSLYKLNPAAESHVLVET
DSAFTNRKKWLSSDYMFNMLRADHNLVHKRLGDGYYEQRLIRDQINQLTGRQFLGNHQDM
ETQYKALMDNGITFAKKFHLTPGISLSPEQVAQLTSDIVWFEQQTVTLPDGGTQQVLAPR
VYAVVQKGDVTSQGTLLSANHVDLHAHTIRNQGTIAGRKIAILENQQLTNLGTLTGDLVH
IQTDGDVINQGNIRAEHALSLDVGGDLIQQSTTQTSHVNAGHYRQSDTHLDRKALLHVTG
KEGTLQVSAKNIQLIGADILNEGLGDTTITAKNQLKLTALETVKEEKIGHGDHYRHERVQ
DVIVSHVKGAGDVKLQAYNIATEGAKFESAKKLTALAENDLVLNAAVKRLDYDEYHHTKS
GSFISKTKQTSYDAINASTHQGSQLMAQDIVLQAGNQLNSAGLVVKAKQAIQADAKTIEL
GTVTDQRHETHWSKRSKSGLAASAKGGVATVGYQRSNAGSHHNTFDETLKVSHLAAEGNI
RLNANDALTLNATQLQAEQDIYLVGKTVDINAVDETHRNHYSRYSKASGIGINMVYNPIA
VGRDKYQQREQQGATKGIVGQITGIKAITDTVEMTARGLMPYIKHQRSQANQFGEQTIAK
TAEIDSKGDLKIFATGGDITTQGSQISVGKKAEFNATGNVNFDVATDRYRQNADAASRAA
ELNGLNKYVAGIATSRQRGNQLLHEEKGTLISVGGDSQVIAQEGNITGKGLSLVSEGKNE
LKAKGNVILETARTEQNGAQGRKSHGIGELTTSETEHFFGYHRERYNQEGDTLTHQGSQI
ASLNSHVKIEAGQDYRQVSSSLLAKDTLDVTAQNLYFDATHNLQRHQQSQSDLKIGQFSR
IKSPIIDMIQTTERLVKNKAASDRLKVANAMGLAAQGYALYDNINKMANQRYSSAYLLRV
ESGVGVTHSRQKQEVEMRISQGNLLNATHIHLNAGRDKTASTSAEVGNIRLTHTTLASRD
DKGQRIAGSTLSLTGRQIDIQAGESRTKERSRGQNIGAEVGAFAQVGAQSGMGAYATLGG
GNQKVNGDSLSYHNSQLDSEHVTLRSRQDMHLVGAKVQGKRVDIEAGGNLHIESRQDESR
FDSRSTQAGVNAEVSFGNAWSANGNVSAERGKSNYKQVRELSGIMAEEGGYHVTAENVHL
KGSVIASTNPAQSELTTNRFSFEDIKNESSYSASSASISGGYSKGREYYRDADTHKVVSA
GSKNAEFIAGKKGANFNAGLPMHSEGSEESLTKATLTAGRITLNKDSQPIETTADALGIN
TDLSQAQREVSKPKDVTQLLAEQKEIAKAVGEIKSAVEIYTSNQQEEAELAVKRAKKALA
QAEQSNDTVEIARHKLAELEAKRELGKWHDGGSTKQAIDTVTILFTSVLAGKGEVATAVS
TLSPTMNKLIADNTNDKVSNALAHAVWGAIEAHAAGGSAIQGALISSGAELVAPKIAEIL
YGKTESELNADEKANIISLISLGGGVASGLLSSSGNSVEILSHSAIGSEIAKNTVTNNYL
SDWQKSLKQQELVECQGRLRCEIQTRLYWLAVDTGQDVSFGAGMVASIPEGVLDTFKGVI
DFAQSPVETLDALYQMVKDGQLVDNMKESYLQRINKLRTEFENAGAEGSFNAGREFGALL
QDTVGILIGGVGSAKATKQLMNITKHQVDNMLGDLHVAMKGNRHHFSTLSCSFRGDMEVK
TAQGYKAISQIKVGDNVFAKNALTGLITYQKVKAHYSNPYDYTVYVDVIDTEGRKSQTIV
SNKIHPFFVQVLEGNPPISSEGHDYAGEIAKGQWVDAQHLQKGYRLLSEDGKWQEVKQVV
IKPEQLIAYNLAVENDHTYFVKAPQGADGVWVHNDCWHALPDNAKSVGKIDGYKAFEIKD
KDGNDIIVLQKDINRFETVNHKKGVDPHFNRLSQLIDAETGRYLSTDNPVDGLYNRSYLR
SETLQKVYANYEKLDNGDYWDIVNRKIIEGPIDIGHVYGWEHRRLSLAAKELNWSQKQLN
DYVNARPENFKLENMHRNRSHVDEMPGKNDIDRIIRDMKKYEKGDN
NT seq
8961 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataagcattgttatcgtgtaatttttagtaaaacacagcaacagtttattgtagta
tcagaaatagcaaagacagcaggacaagcaaaaagtgaaggcaaaataagagcagaagct
gaaagcatgaaaacgttagcaaaactaaccgcacttttttcacccattcctcaatctgta
tttaaacctttatcttttgcattattgtgtgcttggggattggtgagtattcaatctgcc
tacgctaatccaacgaattcgcctttaattattcaagctgatccgacggcacaagcaaat
caacgtccacaagtcatggaagcggctaatggcatacctcaagtcaatattcaaacccca
aatcaacaaggcttatcttataaccgttattcacagtttgatgtagataaaaagggggcg
attttaaataacagccgtaaagatacccaaacgcaattaggcggttgggtacaagctaac
ccgtatttagccggtggcgaagcaaaagtcattgttaatgaagttaattcaaataagcca
agtcagttgaaaggctatgtggaagtggcgggacaaaaagcagatgtgattatcgctaac
ccaagtggtttacattgtgaagggtgtggtgtgattaatgcggacagagtaaccttaacg
acgggtaaacctcaactcaaacagggacaccttgatcattttgtggtggaaaagagtaag
gttactgtgagtggaaaaggtttagataacagtcaaagtaattatacagacattattgcc
agagaagccgagattaatgcaggtgtgtggtcgaaaaaagcggtcaatgttacgacaggg
aaaaataaagtcagtaagaataatgatgcggttcaaatcattcacagtaaatcccagaac
aatcaaaaagaagaaaatgtcacggaatacgccttagatgtatcaaatttaggcgggatg
tacgctgaaaaaatccacctcattggtaccgaagctggtttaggggtacgcaacgcagga
catattggtgcctctgcgggcgatgtggtgattgatgtgaatgggaagatcgtcaatcaa
catcgtattcaagcacaacagcatgtgatactcaatgcaaaaggcgataaaggcacaatt
gacaacatggcttctgctcaggtattggcgaatcaaggtcgtatcaatgtacaagcagaa
aaaaccttaaatcaatcgggagttataggggcaaaacagcaaattgccgtacaagcagaa
gcgattacccagagtaaaacaggtgaaatacagggtggtgaagtgcgtttaacggcgcaa
ggacaggtggttaatcgcgggttgattaatagcaaagtcgaagacgacacaccagccaaa
acggtcattaaagcagacaagattgagaatgtgggaacgggacgtatttatggtgatcat
gtggcgttgatggcagacagcttacataaccatgatgaaactacggaaattacttcaagt
ccgattatcgcggctagaaagcgtttagatttaggggtcaagcaaattacgaaccaaaat
caccaatattcaggcaatacaacaggggcaaccgcactttatagtgatggcacattacat
gtgggggcagggcttgatgcacaagataaggtgatggggcaggcagaggtattaaataat
catagtgcgttaattgaaagccaaggcaatatgcagcttaatgtcgcaaaaattcataat
acgaatgatttttttgctactgagttacaagtggtattagaaaaagaagtggattggcat
tatattgtgccacaaggtgtcgcagaatctgaactccgctttgatacccgtttattgcat
tggcggaaccaatcaagagggcgtaatggctgggtcgtgaatagcaagcctaaagcgatt
cataaaccacataatggtgatgtgcaatcaaactatctaccagaagtgaatcaatgtatg
aatggtacacaaggcgcgggttgcgagtttttgattgattcttattattttccacacgat
cccgcatggcaatatttcgcgattaagccaagtattcgtgataacgtggcgagcctgttg
aatgaggcaaaagtacctgtcgcaccgattgcacccgttgagccagttgcaccaaccaac
ccgaatgctaacgctcaacaagaatatgaggaaaagttggcgcaatatcatcaacaaaaa
gttgtttatgacaatgcatatcaagtttatttacaagaaaaagcacattttgatgaaaag
gtcaaacccgcttatttgcaatgggttaaagataatgaaaaccactttactgaattaagc
catgcgataggccagcataaccaacggcgtgcgagtgcagcgggtcgtgattatcgtagt
tattggagtcatcgtgtgaatcgccaagtagtaaaagaagacgtggtgattcaaacccaa
gcaggtgcaattttagctggtggtgatttaaagattgatactcaacagttcgtcaatgat
aaaagccgagtattggccggaggtcagttacagcttcaaggtgatttgcttcaacgccaa
gcagatggtctgcaatttaccgaaagttatggcagtaaatattatagttatctccgaaaa
cgtaaaagtaagacatcaagtgggcgtaataaataccaacgtcgtaatgagcgttggtat
tcaggattattaagtaatactcagaaaagtattaccttacctgtcgccaatgtttttgag
caatatgaatttgatcaagattctttagtcattaaatcaacgggtgagcatttagcatta
ccaaactccagcctatataagctcaatcctgccgcagagagtcatgttttagtagaaacg
gattcagcgtttaccaatcgtaaaaaatggttgagtagcgattatatgttcaatatgtta
cgcgctgatcataatctagtgcataaacgtttaggtgatggttattatgagcaacgtcta
attcgtgaccaaatcaaccaacttacggggcgacagttcttgggcaatcatcaggatatg
gaaacccagtacaaggcgttgatggataatggtattacttttgcgaaaaaatttcattta
acgccgggtatcagcttaagccctgaacaagtggcacagctgacctccgatattgtgtgg
tttgaacaacaaaccgtaaccttacctgatggcggtacacaacaagtattggcaccacga
gtttatgccgttgtacaaaaaggtgatgtgacatcccaaggcacattgctaagtgcaaat
catgtagatcttcatgcgcatactattcgtaaccaagggacgattgcagggcgtaaaatc
gccattttagagaatcagcaattaactaaccttggtacgctgactggcgatctcgttcat
atccaaacggatggtgatgtgattaatcagggcaatattcgcgcagaacacgcattatct
cttgatgtggggggcgatttaattcagcaaagtaccacacaaacaagtcatgttaatgcg
ggacattatcgccaaagtgacacgcaccttgaccgtaaagcattgttacatgtgacagga
aaagagggaaccttacaggtaagtgcaaaaaatattcaactcattggcgccgacattctt
aatgaaggactcggtgacaccaccatcaccgcaaaaaatcagttaaaactgaccgcactt
gagacggtaaaagaggaaaaaatagggcacggcgatcattatcgtcacgagcgtgtacaa
gacgtgattgtaagccatgtgaaaggggctggagatgtgaagcttcaagcttacaacatt
gcaactgaaggcgcaaaatttgaaagtgcgaaaaaactgaccgcacttgctgagaatgat
ttggtattaaacgcagcagtgaagcgcttagattatgatgaatatcatcatactaagagc
gggtcttttatcagtaaaacgaaacaaacaagttacgatgcgattaatgcaagtacacat
caaggtagccagcttatggcgcaagatattgtgttacaagcgggtaatcagttgaacagt
gccggattggtggtaaaagcgaaacaagctattcaagcggacgcaaaaacgattgagtta
ggtaccgtcacagatcaacgtcatgaaacccattggtcaaaacgaagtaaatcaggtctt
gctgccagtgcaaaaggtggcgtggcgacagtgggctatcagcgttcaaatgcaggcagt
catcacaatacatttgatgagacgttaaaagtgagtcacttagcggcggagggaaatatt
cgtctgaatgctaatgatgcattaacactcaatgcaacacaattacaagcagaacaagat
atttatttagtgggtaaaacggtcgatattaacgcggttgatgaaacccaccgtaatcat
tatagtcgatatagcaaagcttcaggcatcggtatcaatatggtgtataacccgattgct
gttggacgtgataaatatcaacaacgtgaacaacaaggcgcaaccaaaggcattgttggt
caaattacagggattaaagctattactgatacggttgagatgactgcgcgtggtttaatg
ccttatatcaagcatcaacgtagccaagcaaatcagtttggtgagcaaactatcgcaaaa
acagctgagattgacagtaaaggcgatttgaagatctttgccacgggcggagatattaca
acgcaaggaagtcaaatttcagtcggcaaaaaggctgagtttaatgcaacgggcaatgtg
aactttgatgtggcaacagaccgttatcgtcaaaatgcagacgccgcctcacgcgctgcc
gaattaaatggtttaaataaatatgtagctggtattgccacgagtcgtcaaagagggaat
caattattacatgaagaaaaaggcacattgatttcggttggtggcgatagccaagtgatt
gcacaagagggcaatattacgggcaaagggctgagtttagtgagtgaaggtaaaaatgaa
ctcaaggcaaaaggcaatgttattcttgaaacggcacggactgagcaaaatggcgcgcaa
ggacgtaaaagtcatggaattggtgaactgactacatcagaaacggagcatttctttggt
tatcatcgcgaacgctataatcaagagggcgatactttaacgcatcaaggtagccaaatc
gcaagcttgaacagtcatgtgaagattgaggcgggacaagattatcgtcaagtcagcagt
agcttgcttgctaaagatacacttgatgtcactgctcaaaatctgtatttcgatgcgacc
cataatctacagcgacatcaacagagccaaagtgatttaaaaattgggcagtttagccga
ataaaatcacctatcattgatatgattcaaacgacagagcgcttagtgaaaaataaggcg
gcatcagaccgattaaaagtagcgaatgcgatggggttagcggcacagggttacgcctta
tatgacaacatcaataaaatggcgaatcagcgctattcctcagcatatttattgcgtgta
gagtctggcgtgggggtgacacatagccgtcaaaaacaagaagttgaaatgcgtattagc
caaggaaacttattaaatgcgacgcatattcacttaaatgcagggcgtgataagaccgca
tcaacgtcggcggaggtggggaatattcgtttaacacatactacgttggcaagtcgtgat
gataaaggacaacgtatagcgggtagcacactcagtttgacagggcgtcaaattgatatc
caagcaggcgaaagtcggacaaaagagcgctctagaggtcaaaatatcggagccgaagtg
ggggcatttgcgcaagttggcgcacagtctggtatgggcgcttatgcaacattgggtggt
ggaaatcaaaaagtcaatggtgatagcctgagttatcataatagtcagttagacagtgag
catgtcactctgcgtagtcgccaagatatgcatttagtgggggcaaaggtacagggcaaa
cgggttgatattgaagcaggcggtaacttgcatattgaaagccgtcaagatgaaagccgt
tttgatagtcgaagtacccaagcgggagtgaatgccgaagtgagttttggtaatgcttgg
agtgccaatggcaacgtaagtgcagaacgaggtaaaagtaactataaacaagtccgcgag
ctgtcggggataatggcagaggaaggtggctatcatgtcaccgcagaaaatgtgcattta
aaaggttcggtgatagcctcgacaaatcctgcgcagagtgagttaacgaccaatagattc
agttttgaagatattaaaaatgaatcgagttacagtgccagcagtgcatcgatttcaggt
gggtatagtaagggaagagaatattatcgtgatgcggatacacacaaggttgtgtcagca
ggcagtaagaatgccgagtttatagcgggtaagaagggagcgaactttaacgcaggctta
ccgatgcacagtgaagggagtgaggaaagccttaccaaagcgaccttaacagcagggcgg
attacgctgaataaagacagccaaccaatagaaaccaccgccgacgcattagggataaat
acggatttaagtcaggctcagcgtgaggtgagtaaaccgaaagatgttacccagctttta
gccgagcagaaagagatagcgaaggcggtgggagagataaaatcggcggtagagatttat
acgagtaatcaacaggaagaggcggagcttgcggttaagcgggcgaaaaaggcattagca
caagcggagcagagtaatgatactgttgagattgcacgccataaattagcggagttagag
gcaaaacgagaattgggcaaatggcatgatgggggaagcacaaagcaagcaatagataca
gtcactattctctttacgagtgtattggcaggtaaaggagaagtcgcaactgcggtatct
acgttatcaccgacaatgaataagctgattgcagataacactaatgataaagtgagtaat
gctttagctcatgctgtttggggggcgatagaagcacatgcagcaggtggtagtgcaatt
caaggtgcgttaatttcctctggtgctgaattggtcgcaccaaaaatagcagaaattttg
tatgggaaaacagagtcagagttaaatgcagatgaaaaagcgaatatcattagtttaata
agtttaggagggggagttgcttctgggctcctttcatcatcagggaattcggtagaaatt
ctttcccatagtgcaataggtagtgagatagcgaaaaatacagtaacgaataactatctt
tcagattggcaaaaatcattgaagcaacaagaattagtagaatgtcaaggtagacttcgt
tgtgagatacaaacacgattgtattggctggcagtagatacgggacaagatgttagtttt
ggtgctggaatggttgcttcaattcctgagggtgtattagatacctttaagggagtgata
gattttgcgcaaagtccagttgaaacattagatgcgctttatcaaatggtaaaagatgga
caattagtcgataacatgaaagagtcatatttacagcgcataaataagttaagaactgaa
tttgagaatgcaggggcagaaggttcatttaatgcgggacgtgaatttggtgcactttta
caagacacagtagggattcttatcggtggtgtgggttcggctaaagcaacgaaacagctc
atgaatatcacaaaacatcaagtagataatatgttaggtgatttgcatgttgcgatgaaa
ggtaatcggcatcatttttctactttgagttgttctttccgtggtgatatggaggtgaaa
actgcacaaggttataaagcgatttctcagataaaggtaggagataacgtttttgctaag
aatgcgttaacagggttaatcacttatcagaaagtaaaagcgcattatagtaacccatat
gactatactgtttatgtcgatgtgattgataccgaaggaagaaaatcccaaacaatcgta
tcaaataaaattcacccattttttgtgcaagtgctagaaggaaatccaccaatatcttca
gaggggcatgattatgctggtgagatagcgaaaggacagtgggtagatgcacaacattta
cagaaaggttaccgtttactgtcagaggatggaaaatggcaagaggttaagcaagttgtg
attaaaccagaacagctcatagcctataatctggccgttgagaatgaccatacttacttc
gtgaaagcaccacagggggcggatggtgtttgggtgcataatgattgttggcatgctcta
cctgataatgcaaaatcagtaggcaaaatagatggttataaggcatttgagattaaagac
aaagatgggaatgatattattgttttacaaaaagatattaatcgttttgaaacagtgaat
cataaaaaaggcgttgacccacattttaatcgtttatcacagctaattgacgcggaaaca
ggtcgatatttgtcaacggataatcctgtagatggactttataatcgttcttatcttcgt
tcagaaacgttacaaaaggtttatgctaattatgagaaattagataatggtgattattgg
gatattgtgaataggaaaataatagaaggaccaattgatattgggcatgtttatggttgg
gaacatcgtcgcttgtcattggcagcgaaagagctcaattggagccaaaaacaattgaat
gactatgttaatgcgagaccagaaaactttaaattggaaaatatgcatcgaaatcgaagt
catgtagatgaaatgcctgggaaaaatgacatagatagaattatcagagatatgaaaaaa
tatgaaaaaggggataactaa
DBGET
integrated database retrieval system
