Pseudoalteromonas nigrifaciens: PNIG_a2652
Help
Entry
PNIG_a2652 CDS
T05271
Symbol
dnaQ
Name
(GenBank) DNA polymerase III subunit epsilon
Organism
png
Pseudoalteromonas nigrifaciens
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RNase_T
FAN1_HTH
VRR_NUC
Sds3
RNase_H_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ASM54648
UniProt:
A0AAC9XYE8
LinkDB
All DBs
Position
I:complement(2410416..2412608)
Genome browser
AA seq
730 aa
AA seq
DB search
MLDTVFIYSHGNVMKKELPAKYYLAHFRELIEFVTSKCMHLLEPKHSEFINKINQLDEQS
QCMLARVYSRKPYLVQAQSLTYEEIISPHQAIYTLKKAGILFEPNEQHYSQLLAHLTKPA
LLELLSNYDEQISYKKSAAKGALVNSAREFFKSCPHELAPLYSQYVINNRSDYYEYFEFL
FAGKLSSGDVNHQNRFVMRDLGLTATREGHSESLSRFETKAEGQSNYLLNRYRLAFKNIT
DENDYVALAPQVLVQAAYGAIAVALKNKLLVQLFKQLKNTNSELAFSLLEGCVDDSEAHE
IQIREQYRLGNKQWVKARLEAIIENPLTDDLLYFADDFLMRKFNKQTRSRLSTMLADTQC
VLEIDELYRGEVEQGVNDYYTGQGMQVFNTENTLWQSLFGLVFWHELFIDTPYPLCNEFD
IYPQVLRLGNFYAAQPAQINERLAQCQTPQALLKLVCKNAAQYFDQPNGLFKWHNELLQP
LEALILNSPIEALIDHLTNMSKHYLQLKDGYPDLMVIHNGKVHFEEVKAPGDKLRRNQLT
TIDNLKSSGFEVHIAVVKWFIDPNRIYSVVDLETTGALKGGNKITEIGLVKVQHGKVIDT
WTTLVNPQRHIPGFITSLTGISDSMVSNAPVFADIVKPLMAKLAGSIFVAHNVNFDYGFI
KKECEMAKVPFKMPKLCTVVESRKAFAGLKSYSLGNLSKHFNLNLTSHHRALADATATAQ
LLLLIQKSQS
NT seq
2193 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctagatactgtttttatatacagccatggcaatgttatgaaaaaagaattaccagca
aaatactatttagcgcattttagagagcttattgagtttgtaacaagtaaatgtatgcac
ttacttgagcccaagcacagcgaatttattaataaaattaatcagcttgatgagcaaagc
cagtgtatgttggcgcgcgtgtattcgcgcaaaccctatttagtacaagcgcagtccctc
acttatgaagaaataatctcgccgcatcaggctatttatacgctaaaaaaagcaggtatt
ttatttgagccgaacgagcagcattattcacagcttttggcgcacttaaccaaacctgct
ttactagagttactaagtaattacgacgaacaaataagctataaaaagagcgccgctaaa
ggcgcgctggtgaatagtgcccgtgagttttttaaaagctgcccgcacgagcttgcaccg
ctttatagccagtatgtaattaataatcgcagcgattattatgagtattttgagttttta
tttgcaggtaaactaagcagtggtgatgtgaatcatcaaaaccgttttgtaatgcgagac
ttaggtttaaccgctacgcgtgaagggcatagcgagagcttatcgcgctttgaaacgaag
gccgaggggcaatcaaactatttattaaaccgttaccgattagcatttaaaaatataact
gatgagaacgattacgttgctttagcgccgcaggttctagtgcaagctgcgtatggtgca
atagctgttgcgcttaaaaataagttattagtacagctttttaaacagttaaaaaacacc
aatagcgaacttgcttttagtttacttgaagggtgtgttgatgatagcgaagcacacgaa
attcaaataagagagcaatacaggcttggtaataaacagtgggtaaaagcacgcttagaa
gccattattgaaaatccgctaacggatgatttactgtattttgctgacgactttttaatg
cgtaaatttaataagcaaacgcgttcgcgtttaagcactatgcttgctgacactcagtgc
gtactcgaaattgacgaattataccgaggtgaagtagagcaaggcgtaaacgattattac
actggccaaggtatgcaggtatttaataccgaaaacacattgtggcaaagtttgtttggt
ttagtattttggcacgaattatttattgataccccttatccgctatgcaatgagtttgat
atttatccgcaagtattaaggcttggtaatttttatgcagcgcaaccagcgcaaataaat
gagcgcttagcacagtgccaaacacctcaggcattacttaaattagtatgtaaaaatgca
gcgcaatactttgatcaacctaacggtttatttaaatggcataacgagttattacaacca
ctagaagcgctgattttaaatagcccaattgaggcgttaatcgatcacttaaccaatatg
agtaagcattatttacagctaaaagacggctaccccgacttaatggttatccataacggc
aaagtacattttgaagaagtaaaagccccaggcgacaagctaaggcgaaatcaattaacg
actatagataacttaaagagcagtggttttgaggtacatatagccgttgttaaatggttt
atagatcccaaccgcatttacagcgtagttgatttagaaacgacaggcgcattaaaaggc
ggtaacaaaataaccgaaattggcttagttaaagtacagcatggcaaagtaatcgatacc
tggactactttagttaacccacaacgacatatacccgggtttatcacgtcgctaaccggt
attagcgatagcatggtaagtaatgcgccagtatttgcagatatagtaaaacctttaatg
gctaaattagcgggaagcatttttgttgcgcacaatgttaactttgactacgggtttatt
aaaaaagagtgcgaaatggcaaaggtgccttttaaaatgcccaagttgtgcactgtggtg
gaatcgcgtaaagcctttgcgggcttaaagtcgtactcgttgggtaatttgtcaaagcac
tttaatttaaacttaaccagccatcaccgagcgcttgccgatgcaaccgccacagcgcag
ttgttactgttaattcaaaaatcacaaagctag
DBGET
integrated database retrieval system