Pseudoalteromonas nigrifaciens: PNIG_a2953
Help
Entry
PNIG_a2953 CDS
T05271
Symbol
btuB
Name
(GenBank) vitamin B12 transporter
KO
K16092
vitamin B12 transporter
Organism
png
Pseudoalteromonas nigrifaciens
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
png00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
png02000
]
PNIG_a2953 (btuB)
Transporters [BR:
png02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
PNIG_a2953 (btuB)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
DyP_N
HAGH_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ASM54913
UniProt:
A0AAC9UJP2
LinkDB
All DBs
Position
I:complement(2710509..2712347)
Genome browser
AA seq
612 aa
AA seq
DB search
MLNKTALGVAISAALSFSVSATVQPIEKITVTANKFEQPISNVLASVSVIDRADIEKSNV
RDLPSLLASQAGFQINSNGGFGQNSGVSLRGSGSRHTLILIDGVRVGSATLGYKGISNIA
LNTIERIEVVKGSRAAVYGSDALAGVINIITRKADNIRLDATFGSNAYQSYQMAGGTNIN
DLSASFNAGIEKTDGFDVLQNHAPDEDAYENKNIGFNIAYNDDYLGKLTVQTQYNEGYAR
YDNQYSAADSSDESNDFENYQVSLGWNKSYENQIHHIAFAFSSDSQDNTSEGVVSMYETK
RNQIDYTGQYIVSDELNINGGLNWYKDKIETNAGNYDKDSREVFAGFLGAYYDDNTVLAN
IAVRQDHDQQFGDKTTYTAAVGYHLNKFATFRASQSTGFKSPTFNDIYFPGSGNPDLKPE
TSENKELGLLLSYQDIALEVSIFRNDFDNKIAWAPTPAGPWQPTNINEARHEGIEFSFSQ
QLMGFEHAFNFTYLSAEDLETGQELAYVSKNTFNWSLNKGWGDFDAGIDLQYRGDRKGKL
TDLSSYTLWNLVGNYQATEQLSFSLRVENLFDKQYDEVDAYGIDLDGDYINDEFYYYNTA
DRRLFIGAAYQF
NT seq
1839 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttaaataaaaccgctctaggtgtggcaatttcggctgcactttcattttcagtatct
gctacagtgcaaccaatcgaaaaaattaccgttacagctaataaattcgaacaacctatt
agtaatgtgctggccagtgttagcgtaattgaccgtgctgatattgaaaaaagtaatgtg
cgagacttacctagtttgttggcttctcaagctggttttcaaattaactcaaatggtggc
tttggccaaaattcaggtgtttcgctacgcggttcaggttcacgccatacccttatttta
attgatggtgttagagtcggctcggctactcttggctataaaggtattagtaatattgcc
cttaatactattgagcgtattgaagttgttaaaggttctcgcgctgctgtttatggctca
gatgccttagctggggtgattaatattattactcgtaaagctgataatattcgcttagat
gctacttttggcagcaatgcttatcaaagctaccaaatggcgggtggaacaaatataaat
gatttaagtgcatcatttaacgctggaattgaaaaaaccgatggttttgatgtactgcaa
aaccatgcaccagatgaagacgcttatgagaacaaaaatattggcttcaatatcgcttat
aacgatgactatttaggcaagctaaccgtacaaactcagtataatgaaggttatgctcgt
tatgataatcagtacagtgcagcagacagcagtgatgaaagtaatgattttgaaaactac
caagtatcattagggtggaataaaagctacgaaaatcaaatacaccatatagcattcgca
ttttctagcgatagccaagataacaccagtgaaggtgtggttagtatgtacgaaactaag
cgaaatcaaattgattatactgggcagtatattgtctcagatgagcttaatattaatggt
ggcttgaactggtacaaagataaaatcgaaaccaacgcaggtaattatgataaagatagc
cgtgaggtttttgctggctttttaggtgcgtattacgatgataatacggttttagctaat
atcgcagttcgccaagatcatgaccaacaatttggtgataaaaccacgtatacagcagcg
gtaggttatcatttaaataagtttgctacgtttagagcaagtcaaagcacgggctttaaa
tcgcctacctttaatgatatttattttccaggttcaggtaacccagacctaaaaccagaa
acgtctgagaataaagaattaggtttgttgttaagttatcaagatattgctttagaagtg
tctattttccgtaatgattttgacaataaaatagcgtgggcaccaacacctgcaggccct
tggcagccaacaaatataaacgaagcgcgccatgaaggcattgagtttagcttttcgcaa
caactaatgggttttgagcatgcatttaacttcacttacttatctgcagaagatttagaa
acgggccaagagttagcttatgtatcaaaaaatacctttaactggtctttaaataaaggg
tggggagattttgatgcgggtatcgatttgcagtatcgtggcgataggaaaggtaaatta
acagatttatcttcatatacattatggaacctagtcggtaactatcaagcaactgagcag
ttaagcttttctttacgggtcgaaaacctgtttgataagcagtacgatgaagttgatgcc
tatggtattgatttagatggcgattatataaatgatgaattttattactataacaccgct
gaccgacgcttatttattggtgctgcataccagttttaa
DBGET
integrated database retrieval system