Paenibacillus nitricinens: ACN6KS_07355
Help
Entry
ACN6KS_07355 CDS
T11296
Name
(GenBank) S-layer homology domain-containing protein
Organism
pnj Paenibacillus nitricinens
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SLH
DUF5845
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XYY67714
LinkDB
All DBs
Position
1643179..1647495
Genome browser
AA seq
1438 aa
AA seq
DB search
MKQGKNYFILLLLFILLINSLGVGVPTASADSSPASLELELPANLTDWVLDENAGYIYAI
SSAENNLYFIRLSDLKIEKTLNVGSNPYYIAKDGQSLQIALSGATMIKTVNLSTQQISDT
IITKTVPNAVAATSTHLFYGTGDGKIYKYDKVTRTSSLLFTDFMTNNITLAVDESSNTLY
VGELSSYAGIKAINAETGALLSQDIDDNMEIGGSSISLKHIFIDDQFVYFGGHQFNKRNL
IETTGTYSRTNDDYTYLEAVILDVSDAYVLTTQGVYDKYTYTPLVLFPSNKRFALLDSNG
YAFLGGIENWYDDAKKISRIDLTIPQRITANLTTDSYSIKSDQMITDWATTDKSPYIYAI
VASTNELVVINKEDLSVVKKMFIGSNPTDIKIFNNKVYVIFKGENHINIMDLEGGIPSEA
ATAKITTKHFPFEVYPDNNNRILYNSGVFDGGISVTSSVYSNVTDAVYNEKSAGIYNSDS
YTLDLDQKILYGVDSFSLYKYNSQNFKLNERQEIQSGYYNSNILLDENNLYYGSRRIDAT
QTSILYGTYPEKIIYARGSLVFSNRAVYDRDSFTKIHDLLMYMQHAYVDTDQTIFISSNN
RLYKFHSFGEMQTVMNEARLPSNAVFVDENLTSGIIDGYLSFEPPADQDGITGYAAYYLD
QNGNKLKQVGIYKNSELSTDSFLVYEISYSSLPTGAVSIGLYPVVGINNYGSEGTLDIHI
SAPIYDAPSYLPVDLSITDTNSDINIFTGTVTWKPGTAELPGARYSLYFINEEGALGDAI
AIVNGGQKSYSLTISERNVPEEALALGVFTENDDFIPPFYSRAILEDKVTADILVSSITV
HKYQVQADNIVVNNLVAGDIVRVYNERLTRLLGYGIVDPDKTTITITIINIGYPGEKLLI
TRQSSKKIESMGTLVVVPPITNDSGGGTGGGGTGGGGTGGGGGTGDGGTGGGGTGGGGTG
GGGGTGDGGTGGGGTGGGGTGGGGTGGGGTGGGGTGGGGTGGGGTGGGGTGGGGTGGGGT
DSGGSTGAVPTDSAKVVTTIKENIDGTRSSLTEVAAEFISKAMNDPEFKKNPLIIIKADE
KTATQSSQFQIDLSLLTNINNNSKEAVLILESSSGKLQLPVNSLFSAISGYSGSEQRVVI
TIAQAASDYKAKLTTQLSNSTSITLGYPMEYQVKLIGSGQDRILSSFSDYVSHMMKFNVN
QDAKAVYTGLTYDLVTETYVPVPTTWEWKDGVLQVTMKRKGNSVYTVVQNHAQFNDLNNS
NPFKDSILALANRSIIKGYSDGSFKAESVVTRAEFAAMLNRALGIMPKLQASKSFKDVKN
GVWYSSQVNAAVDAGLINGFADGNFRPSQEITHQEMIVMLVNALKYGKTDTTVNKTSSPV
LPDKLPDWVKPYYVIAQDNEILPTNSPFQFQAGKKTERQESALLLYQLMKVLKLTNAE
NT seq
4317 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaacaggggaagaattatttcattttacttttattatttattttactgattaactca
ctgggagttggggttcccaccgccagtgcagattcctcaccggcgtcgctagaactcgag
cttcctgctaatttgacggactgggtattagatgaaaatgcaggttatatctatgccatc
tctagtgcggaaaataatctctattttattcggcttagtgatcttaagattgagaaaacg
ctgaatgtaggttcgaacccttattatattgcaaaggatgggcaatctttgcagattgcg
ctttccggagcgacgatgataaaaacggttaacctctccactcaacaaatttcggacaca
atcataacaaaaacagtacctaatgcggttgctgctacttccactcatcttttctacggg
actggtgatgggaaaatctacaaatatgataaggtaactcgaacgagcagcttattattc
actgattttatgacgaataatattactctagcagttgatgagtcttccaatacactttat
gttggtgaattatcctcatatgctgggatcaaggctataaacgctgaaaccggagcatta
ctcagtcaggacattgatgacaatatggaaattggtggctcttctatttctctcaagcat
atatttattgatgatcaattcgtatattttggtgggcatcagttcaataaaaggaatttg
atagagaccactggtacttattcaagaacgaatgacgattatacttatctcgaagctgta
attttggatgtatctgacgcctatgttcttactacacaaggagtgtacgataaatataca
tatactccgttagttctatttccttctaacaaaaggtttgctttgctcgactcgaacggc
tatgcgtttcttggaggcatagagaattggtatgatgatgcaaaaaagattagtcgaatc
gatcttacgataccacaaagaataactgcaaaccttaccacggattcttattctattaaa
agcgatcaaatgattacggattgggctactacggacaagtctccgtatatttatgccatt
gttgcaagcaccaatgaacttgttgttatcaataaggaagatttgagtgtagtaaagaag
atgtttattggttcaaacccaactgacataaaaattttcaataacaaagtttatgtcatc
tttaagggtgaaaatcatatcaatattatggatttggaaggtggtattccatcagaagca
gccactgccaaaatcaccactaagcacttcccgtttgaagtctatcctgataacaataat
cggattttgtataatagcggggtatttgatggtggcatcagcgtgacatcgtctgtctat
agcaatgttacagatgcggtgtacaatgaaaaaagtgcagggatttataattcagacagt
tacacactagacctagatcaaaagatcctctatggcgtagatagtttctccctctataaa
tataacagtcaaaatttcaagttaaatgaaagacaagagatacaaagtggttattataat
tccaatatcctcctggatgaaaacaatttatattatgggagtcgtaggatcgatgcaacc
caaacatccatattatatggaacctatccagaaaaaattatttatgctcgtggcagtctt
gtgtttagtaacagagccgtctacgacagagacagctttactaaaattcatgatttattg
atgtacatgcaacacgcatatgttgatacagatcaaactatttttatatctagtaataac
cgattatataaatttcatagctttggagagatgcagacagtcatgaatgaggctcgcctt
ccttctaatgctgtttttgtggatgaaaatttaacctccggtataattgacggatatctg
tcctttgaacctccggctgatcaggatgggattacgggttatgccgcatattatcttgat
cagaatggaaataaacttaagcaagtaggaatatataagaactcagaattatcaacggat
tcattcttagtttatgaaatatcatattcgagcctgccgactggagcagtaagtattggg
ctttatccggttgtcggtattaacaattatggcagtgaggggacacttgatattcatatt
tcggcccctatctatgatgcaccaagttatctgcctgtggacttatcaattacagatacg
aattcggacatcaatatatttacaggtacagtgacatggaaacctggaacagctgaacta
ccaggtgcccgttattccttatattttattaacgaagaaggtgcgcttggagatgccatc
gctattgttaatggtgggcaaaagagttactctcttactatttccgaaagaaatgtgccg
gaggaagctttagcactcggtgttttcacggaaaatgatgatttcattcctcctttctat
agcagggcaatacttgaagataaagtgacagcggatatcctggtatcgtccattactgta
cataaataccaggtgcaagcggataacatcgttgtgaataacctggttgctggagatatc
gttcgagtttacaatgaacgacttacccgcttactaggttacgggatcgttgatccggac
aagactactattacgattactattattaacattggatatccgggggagaaactccttata
actaggcaatcatctaagaaaattgaaagtatggggactttagtcgttgtacctcctatt
acaaatgatagcggcggcggaactggtggcggcggaactggtggcggtggaactggtggc
ggcggcggaactggtgacggaggaactggtggcggaggaactggtggcggtggaactggt
ggtggcggcggcactggtgacggaggaactggtggcggaggaactggtggcggaggaact
ggtggcggcggaactggcggcggcggaactggtggcggaggaactggtggcggaggaact
ggtggcggcggaactggtggcggcggaactggcggcggtggaactggcggcggtggaact
gatagcggtggcagcacgggtgcggtccctactgacagtgccaaggtagtaacaacaatc
aaagaaaacatagatggaacccgctcgtctttgactgaagtagcagctgaatttatttca
aaggcaatgaacgatcctgaatttaagaaaaatccgttaatcattattaaggctgatgaa
aaaacggcaactcagagcagccaattccagatagatttaagtttgttaacaaatattaat
aataactcgaaggaagctgtacttattctggaatcatcatcgggcaagcttcagcttcct
gtaaattcattgttctcggcaatttccgggtacagtggttcggagcagagggtcgtcatt
acgattgctcaagctgcaagcgactacaaagccaaattgactactcaactaagcaactct
actagtattacgttgggatatccaatggagtatcaggttaagctgattggaagcggtcag
gatcgcattctttccagtttctctgattatgtcagtcatatgatgaaattcaacgtaaac
caagatgcaaaggccgtctatacaggtctaacttatgatctggtcactgagacctacgtt
cctgttccgaccacctgggaatggaaggatggagttttgcaggtgactatgaagcgtaag
gggaattctgtatatactgttgttcaaaaccatgctcaatttaatgatttgaataacagc
aatccatttaaagacagtatcttagctttagctaaccgaagtatcattaaaggttattct
gatggaagtttcaaagcagaatcggttgtcacgcgtgctgaatttgccgccatgcttaat
cgtgccttaggtattatgccgaagcttcaggcttctaaaagctttaaggatgttaagaat
ggagtttggtattcgtcgcaggtaaatgcagccgtcgacgctggcctcataaacggcttt
gcggatgggaatttccgcccgagtcaagaaattacgcatcaagagatgattgttatgctg
gtcaacgcgctgaagtatggcaaaacggacactacagtaaataaaacctcttcacctgtg
ttgcctgataaattgccggattgggtaaagccttattatgttattgcccaagataatgaa
atattgccgacgaacagtccatttcaatttcaggcgggtaagaaaactgagcgtcaagaa
agtgcgttgctattgtaccaattgatgaaggtactgaagcttacaaatgccgaataa
DBGET
integrated database retrieval system
