Paenibacillus nitricinens: ACN6KS_08640
Help
Entry
ACN6KS_08640 CDS
T11296
Name
(GenBank) DUF7507 domain-containing protein
Organism
pnj Paenibacillus nitricinens
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF11
DUF7507
DUF7619
bMG10
Collagen_bind
CARDB
NPCBM_assoc
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XYY67960
LinkDB
All DBs
Position
complement(1984487..1991218)
Genome browser
AA seq
2243 aa
AA seq
DB search
MRIIPLVVRATINATGAITFTGNTLGLSRSDTVGVPGTLDSIGGFTSVNTTSIFGTYPNG
TTSLYTSNSSSAILVLPSGSTVLYAELIWGGTYINGTVNLSAAINNPVSLINPAGSTFSI
TPDAATSNTVDLGNGASAYVRSANVTSIISQGGAGTYTTGGVVGTIVIPSDSTANHAGWT
LGVIYQNTSLPFRNMSLRAGAILVQATSAPVSTTITGFATPITGALGGRALFSAQEGDAN
RSGDQALFGPTSTTLVALSGPNNFANNFFASQINNDLGVLDTTGTFGNRNQTNGNPGTNI
IGGRQGWDITNVDVSARLANNQSSAILQLTTSGDAYVLNGNAIQVDINAPKINVTKSANV
SGPIVGDTVTYTVIVSNTGTASAASVVLSDALPAGSTFVTGSVVVAGVARPTFDITAGIS
LGSLALSTSITVTYQAKVTSLPPSPQNIANTANAAFTFQSVAGGSIMTGVIPSNTVTLPV
YSPILNIVKSANTANATVGDQITYTLQITNTGNIGALTTVTDNIPTGSSYVAGSFTVNGS
PVAGNPATGIAIGTIAAGGSSTVQFRVLVNSLPSPPQLVDQASAAYTFQVPDGRIIAGSA
SSNTLSIPVGLPNVAVVKSAGFADVAVGDTLLYTSVITNNGIEAVTNVILTDTIPTGTSL
VSGSVTVAGTSQPSANPGTGITVGSIAAGSSVTVTFQVNVISLPSPAQLLNKSTASYSSG
AFIGISLSNTTTTPVYQPSIQIVKSSNTASATVGGNVLYTLNVQNSGNIGAAVTLTDNIP
SGATFVSGSVTVNGVARPTDSPLTGINLGTVALGTVVPVTFLVTVQSLPSPPVLNNLASS
SYTYQLPSGRSLSGTSQSNTVSIPVSAPNVTLSKTASVADVAVGENLTYTITVSNTSSVA
VSNIVVSDPIPTGGTFVAGSVIVGGSSVPAANPNTGISISSIAAGNSTTLSFKVNVSSLP
NPAQFANRASASFTSGAFTGSSLSNTVVTPVYQPIISMVKSANTAQASVGGSLSYSILIS
NTGNIATTLLLTDTLPPQAVFNANSVIIGGTPLPGYNPVTGIPVGPLAPGDSVSVSFLVT
ITALPPTQVLLNSASATFSYTLPDGRQLGGTVVSNTLSVPVSAPNVSVIKSVNATDAVTG
DILTFTSVLTNNSIATVSNIILSDPLPENAAFIPGTVIVGGITQPLAVPSAGIPIGSLGP
GGTATVTFEVRITMPIPSQINNQSSVSFTSGVFSGSSSSNITSTPVTQPQISLLKSAVDG
DGDALVVGDTVIYTVVVSNTGNLAANVTLTDNIPVGTVFNPNSVIVGGMPQPGAAPDTGI
AVGSVAPGTSIPVSFSVNIVTLPSPQQISNQASASFTFTPPDGRPLSGTAVSNTVTLQVS
APNIVVVKSSTSTSVAIGDTVTYNVNITNSGIEAVNSVILNDPTPTGAAFVTGSVSVNGV
PFPNLNPSSGISIGTLAPGASTLVAYSVIVTSVPPTASLINKASVTFTSGVFSGSTFSNT
VTIPVYQPNISVVKTASTNNATTGDAVSYTLTVSNTGNYPASLIITDNIPAGTTFVPNSV
LINGLPLAQADPSTGIPAGVIAPGATTAVIFTVDITSLPNPQQLVNQGTVAYSFTLPDGR
TLGSSVLSNTITIPISSPNLAVVKSTPTTSTTVGDTITYTVTITNNGIETVNNAVFTDAL
PAGTTFVSGSVLVNGVPRAGGSPATGVTLGSIAPGVTVTVAFTVNTVSLPPSGLLNNQST
VSFTSGVLSNVAFSNIVSTPIYLPILAAAKSSNTVQATVGDTITYTINVTNTGNYGALAT
LSDTIPSGTTFVPNSVLIQGAPAPGADPAAGIPLGVISAGATLSVMFSVLITTLPASQQL
INQASVAFAYTLPDGRTFNSSINSNSTSISVSSPNVIVTKSSPATDAVVGDTITYNMTVT
NSGIANINNVNISDPIPAGSTFVTGSVLVDGIPHLNANPANGISLGTIAPGVSVNISFNT
IVNVLPNPATLTDQASVSFTSGAFSGSSFSNTLVIPVYQPIIVVIKGADRTAATVGDTIT
YSLNVTNTGNLTANVVITDTIPSGAIFVPNSVLVNGVPQPGSDPSTGLNIGAVAPGSTIT
VTITLQVTVASLPSPQQLVNQASSTFSFTPPDGRLLTGTSVSNVLIIPVSSPDVSVVKST
SSVDAVVGDIITYTIVVTNLGISPVNNVIMVDPIPAGSQFVTGSITVDGTPRPNGSPASG
IAIGTIAAGASSTITFQVQVVAL
NT seq
6732 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgagaatcattccactagtcgtacgggcaacgatcaatgcgaccggtgctatcacattt
acgggcaacacacttggacttagtcgctccgatacggtcggagtgccagggacactagac
agcatcggcggtttcacctctgttaacactacatctatttttggcacctatcccaatgga
actacaagtctttatacgagcaacagttcatccgctatactggtcctgccatcaggcagc
actgtgctatatgcagagctgatatggggcggaacctatatcaatggaaccgtaaacctc
agtgcagcaataaacaaccctgtctctttgataaatcctgccgggagtacgttcagcata
actcccgatgcagcaactagtaatactgttgatttaggaaatggcgcatctgcatatgtt
cgttctgctaatgtcaccagtattatttcacaaggcggtgccggaacctacaccactggt
ggtgtagttggcacgatcgttattcctagtgattccacagctaaccatgcgggctggaca
cttggtgtaatctatcaaaatacatccttgcccttccgtaatatgtccttacgggcaggt
gcaatacttgtacaggcaacttcagcaccagtctctactacaataacaggctttgcaact
ccaattacaggtgcacttggaggtagggcactatttagcgcacaggagggtgatgcgaac
cgttcgggagaccaggcattattcgggcctacatcaacaacgctcgtagctttatcagga
cccaataactttgccaacaacttcttcgcttcacagattaacaacgatctaggtgtactg
gataccactggaacattcggaaatcgcaatcaaacaaacggaaatcccggcaccaacatc
atcggtggccgacaaggctgggacattactaatgtcgacgtatcagccagacttgcaaat
aatcagtcttcagcgattttacaattaactacctccggtgatgcttatgtacttaatgga
aatgccatacaagtagatattaatgcacctaaaataaacgttactaaaagtgccaatgtg
tccggtccgattgtcggagatacggtaacttacactgtaatcgtcagtaatactggaaca
gcaagtgcggctagcgtcgttttatcagatgcgctgccagcaggatcgacctttgtcacc
ggaagcgttgtagtggccggcgtcgcaaggcccacctttgacattacagcaggaatctct
ttggggtccttggctctgagcacttcaataacggttacatatcaagctaaagtcacttca
ttaccaccaagtccgcagaatatcgctaacaccgcaaatgctgcttttacatttcaaagt
gtagctggcggttctatcatgacgggggtcattccatccaatacggtaactttacccgta
tattcgcccatccttaacattgtaaaatcagcaaatactgcaaatgcgaccgtcggagat
caaattacctatacacttcaaatcaccaacactggtaatatcggtgcgctaacaacagtt
acggataatattcctacggggagctcttatgttgcgggtagctttaccgtcaatggatct
cctgtcgctggaaatccagctacaggaattgctattgggacgatcgctgctggaggcagc
tctactgttcaatttcgtgtcttagtcaacagccttccatctccaccgcaactggtcgac
caagcaagcgccgcttatacctttcaggttccagatgggcgaattatagctggatcagcc
tcatccaatactttgtctattccagttggactccccaatgttgccgtggtcaaaagcgca
ggatttgctgatgtcgctgttggcgatacacttctttatacctccgttatcactaacaac
gggatcgaagcagttactaatgtcatccttacagacaccatacccacagggacttcgctg
gtttcgggaagtgttacagttgcagggacgtctcaaccctctgcaaatccaggaacaggc
attactgttggttcaatcgctgcagggagttcggttaccgtcacctttcaggtcaatgtt
atctcattgcctagtccagcacagctattaaacaaatctacagcatcctacagttcaggt
gcttttattggtatttcgctttccaacacgactacgactccagtatatcaacccagcatt
caaattgttaaaagctccaacaccgctagtgcaaccgtaggtggcaatgttctttataca
ttaaatgttcagaattctggaaatattggagctgctgtaaccttaaccgacaatattccc
tcaggggctacctttgtatcgggtagtgtaactgtaaacggagtcgcacgaccaacagat
tctccacttacaggcattaatctaggtacagtggccttaggaactgttgtgcccgtaaca
tttctagtcactgtccaatctcttccttcaccacctgttctgaacaatctagccagtagc
agttacacctaccaattaccaagcggcagatccttatccggaactagccaatcaaacacc
gtcagcatccctgtctctgcccctaatgttacgctaagtaaaaccgcaagcgttgcagat
gtcgcagtcggagagaatctgacttacacaatcacagtgtccaacacaagtagcgtagct
gtgagtaacatcgtcgtctctgaccccattcctactggaggcacctttgtagcaggtagc
gttattgttggcggctcatcggtgccagccgcaaatccaaatacaggaatatctattagt
agtatcgctgcaggcaactctacaacactttcttttaaagtgaacgtttcttctttacca
aatccagcacagtttgcaaacagagccagcgcttctttcacctccggtgcctttaccggt
tcctcactctcgaatacagtagtaactcctgtttatcaaccgatcattagtatggtcaaa
agcgcgaatacagctcaggcatccgttgggggatctttgtcttactcgatcctcattagc
aatacaggaaatattgcaaccacactactattgactgatacgcttccaccccaagctgta
tttaacgctaatagtgtaatcataggtggaacacctttacccggctacaatcctgtaacc
ggcattcctgtaggcccattggcaccaggtgacagtgtgtccgtaagctttctggtcacg
ataactgcattaccacctacacaggtgttgctaaactccgcttcagcaacatttagctac
accctcccagatgggcgtcaacttggaggaactgtagtgtcgaatacgctctctgtccct
gtttctgcccctaacgtcagtgtcattaaaagcgtgaatgctactgacgccgttacaggt
gacatccttacattcacctctgtattgacgaacaacagtattgctacagttagcaacatc
attctcagcgatcccctgcctgagaatgcagcttttattcccggaaccgtaattgtaggc
ggcattacccagccgctagcagttccgtccgccggcattccaatcggtagtctgggtcca
ggcggcacagctaccgtaacattcgaggtgaggataacgatgccgataccatcacagatt
aataatcagtcatccgtcagttttacatccggtgtattctccggttcttcttcatctaac
attactagcacaccagtcactcaaccacagatttccttattaaaaagtgcagtcgatgga
gatggggatgcactggttgtaggtgatacagtcatctacacggtggttgtaagtaataca
ggtaatcttgctgcaaatgtaactttaaccgataacattcctgttggaactgtctttaat
cctaacagtgttattgtaggaggcatgccgcagccaggtgcagcgcccgataccggtata
gctgtaggcagtgtggcaccggggaccagtatccctgttagcttctcagttaatatcgtg
acgctgccatcaccacaacaaatcagcaatcaagcttctgcaagctttacctttacccct
cctgacggtagacctttaagcggaactgctgtatctaatacagtcacactacaagtctca
gctcctaatatcgtcgttgtcaaaagctccacctcaacttccgtagcgatcggagatacg
gtcacttacaacgtaaatattacaaatagcggtatagaagctgtcaatagcgtaatactt
aatgatccaacaccaaccggtgctgcttttgtaacagggagcgtatccgtgaatggagtg
ccttttccaaacctgaacccttcttcggggatatcaattggtaccctagcgcctggagct
tcgactctagttgcatacagtgttatcgtgacctctgttcctcctactgcttcacttatc
aataaggcatctgtaacctttacatcaggtgttttttccggttcgactttctccaataca
gttaccattcctgtgtaccagccgaacatctcggtcgtcaaaacagcaagtacgaataac
gctacaacaggtgacgctgttagctacaccctgaccgtgagcaacacagggaactatccg
gcaagcttaatcattacggacaatattcctgcgggtactaccttcgttccgaatagtgta
ctcattaatggactccccttagcgcaagcggatccatctacggggattccagctggagtt
attgcacccggtgccactactgcagtaatattcactgttgatatcacctcactgcccaat
cctcagcagttggtcaatcagggtaccgtagcctatagcttcactttgcctgacggccgc
acacttggtagttccgtcctatccaatacaattactatccctatctcttcaccaaatctg
gccgtagtaaaatctacacctaccacatcaacaacggtgggtgatacgattacctatacg
gttacgattaccaataacggaattgaaacggtgaataacgccgtcttcacggatgccctt
cctgcgggtactacatttgtatccggcagtgttcttgttaatggtgtgcctcgtgcgggg
ggcagccctgccacgggggtaaccttaggcagtatcgcaccaggtgtaaccgtaactgta
gccttcacggtgaacacagtctcattgccgccttcaggtctactaaataaccagtcaacc
gttagcttcacctcaggagtactctctaatgtagccttttctaacattgtatcaacgcct
atttatttaccgattctagccgcagcaaaaagctccaatacagttcaagcgaccgtcgga
gataccataacctatacaattaacgtaaccaatacagggaattacggggctttagctact
ctaagtgataccatcccttccggaacgacttttgtgcctaatagcgtacttattcaaggc
gctccagctccaggagcagatcctgcagctggcattccacttggtgtaatatccgcaggt
gcaacactgtctgtcatgttctcagtactcattacaacactgccagcaagccagcagctg
ataaaccaagcttccgtagcctttgcttacaccttgcctgatggtcggacatttaacagt
tcgatcaattccaattcgacatcgatttccgtatcttcaccaaatgtcatcgtaactaag
tcttcaccagctacagatgccgttgttggcgatactattacttacaacatgacggttacc
aatagtggaatagccaacatcaacaacgtaaatattagtgatccaataccggctggatct
acatttgtcacggggagtgtgctcgttgatggtattccacatcttaatgccaatcctgcg
aatggcatctcactcggcaccattgcaccgggcgtttcagtcaatatctcgttcaacact
atcgtcaatgtgctgcctaatcctgctacgttaaccgaccaagcttccgtaagcttcaca
tctggggcattctcaggatcttcattctctaatacgcttgttattccggtttatcagcct
atcatcgttgttatcaaaggtgcggatagaactgctgcaactgtcggagatacgattacg
tactccctgaatgtaacgaatactggtaatctcacagcaaatgtagtcataactgatacg
attcctagcggagctatctttgttccaaatagcgtacttgttaacggagtgccgcaacca
ggatccgacccgtctactggattaaatattggagcagttgctccgggaagcacaataaca
gtgaccataacccttcaggttacagtagcttctcttccgtcaccgcagcagttagtcaat
caagcttcatcaacgttctcgttcacaccaccagatggtcgtctactcaccggaacttca
gtttcgaacgtcttaattatccctgtttcttctccggatgtgagtgtcgttaagagcact
tcctctgtagatgctgtggtcggcgacatcatcacttatacaattgttgttaccaatttg
ggaatttcacctgtgaataacgtcatcatggttgaccctatcccagcaggcagccagttt
gtaacaggcagcatcactgtagacggaaccccacgacctaatggcagcccggcttccggt
attgccatcggaacgattgctgctggtgcttcctcaaccatcaccttccaggttcaggta
gtagcgttatga
DBGET
integrated database retrieval system
