Paenibacillus nitricinens: ACN6KS_24465
Help
Entry
ACN6KS_24465 CDS
T11296
Name
(GenBank) beta strand repeat-containing protein
Organism
pnj Paenibacillus nitricinens
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
DUF596
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XYY65333
LinkDB
All DBs
Position
complement(5479276..5482863)
Genome browser
AA seq
1195 aa
AA seq
DB search
MSYLSTGPIDNTMVGGIRPTQHVTIKIDNRSDVTSSTVLVQGYYMDGTRTLYVSQLINVM
PEQVITNDYYADFDAFEFIFTTLSLVDDPIQVSVWGKNSSGQIVTAHRLVHSELLGATVG
ATGATGDTGVTGATGADGATGATGADGVAGATGAAGATGADGVTGATGADGVTGATGADG
VTGTTGADGVTGATGADGVTGATGADGATGATGADGATGATGADGVTGATGADGATGATG
ADGVTGATGADGATGATGADGVTGATGADGVTGATGADGVTGATGADGVTGATGVAGVTG
ATGVAGVTGATGADGATGATGADGATGATGADGVTGATGAAGVTGATGVAGATGATGAAG
VTGVTGADGVTGATGATGADGVTGATGATGADGVTGVTGADGVTGATGATGADGVTGATG
ATGADGVTGATGATGADGATGATGADGVTGATGADGVTGATGADGATGATGAAGATGATG
ADGVTGATGSAGATGATGAAGVTGATGADGATGATGAAGVTGATGAAGVTGATGATGTAG
VTGATGVDGVTGATGVAGVTGATGAAGVTGATGADGVTGATGADGATGATGADGVTGATG
AAGVTGATGADGATGATGADGVTGATGATGAEGATGATGATGTAGVTGATGVAGVTGATG
VTGATGADGVTGATGADGVTGATGADGATGATGATGAAGVTGATGAAGVTGATGSDGVTG
ATGADGVTGATGVAGVTGATGATGATGVAGVTGATGVAGVTGATGTAGATGATGAAGATG
ATGAEGATGATGATGADGVTGATGADGATGATGTAGVTGATGTAGVTGATGVAGATGATG
AAGVTGATGADGVTGATGADGVTGATGADGATGATGATGADGVTGATGAEGATGATGATG
TAGVTGATGVTGATGVAGVTGATGAAGVTGATGAAGATGATGIAGVTGATGVAGVTGATG
AAGVTGATGVAGVTGATGIAGVTGATGVAGVTGATGAAGVTGATGVAGVTGATGVAGVTG
ATGTTGVTGATGPNIQAEGFSAFLPTLSVSSSSQLTGWTVTSPFYSDPSFSPVTGNYTVP
TTGRYSIEATINYSTTASISISLGSGINPAFIVQRTSPTATNLVSGLFPVLDVNVALILD
LRAILGSGTVTLAGEFALTAGDVIGLFYVSNGLTVPLNLGGANTAGIVWSVHELT
NT seq
3588 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgagctatttatctaccgggccgatagataataccatggtgggtgggatacgacctact
caacatgttacgatcaaaatcgataaccgaagcgatgttacttcttctacggttctcgtc
caaggatattatatggatgggacaagaactttgtatgttagtcagcttattaacgtaatg
cctgagcaagtcataaccaatgattattatgctgattttgatgcatttgaatttatattt
acgactttaagcctggtagatgatcctattcaagtttcagtatgggggaaaaatagctca
gggcaaatcgttactgctcaccgacttgttcattcagaattactcggagcaaccgtaggg
gcaactggggctacaggtgatacaggagtgactggagcgacgggagcagacggagctact
ggtgcgacgggggctgatggagtagctggtgcaaccggagctgccggagcaacgggagcc
gatggagtgactggtgcaacgggagccgatggagtaacaggagcgaccggggctgatgga
gtgactggtacgaccggagccgatggagtaacaggagcaacgggagccgatggagtgact
ggtgcaacgggagccgatggagcgactggagcgaccggagccgacggagcaactggagca
acgggagccgacggagtgactggagcaacgggagccgatggagcgactggtgcgaccgga
gccgacggagtgactggagcaacgggagccgacggagcaactggtgcaacgggagccgat
ggagtgactggtgcaacgggagccgatggagtaacaggagcgaccggggcagatggagtg
actggtgcgaccggagccgacggagtgactggagcaacgggagtcgctggagtgactgga
gcaacgggagtcgctggagtgactggagcaacgggagccgatggagcgactggtgcgacc
ggagccgatggagcgactggggcgaccggagccgacggagtgactggagcaacgggagcc
gctggagtgaccggagcaaccggagtcgctggtgcaactggagcaacgggagccgctgga
gtgacaggagtaacgggagccgacggagtaacaggagcgacaggagcaacgggagccgac
ggagtgactggtgcaacgggagcaacgggagccgatggagtgacaggagtaacgggagcc
gacggagtaacaggagcgacaggagcaacgggagccgacggagtaacaggagcgacagga
gcaacgggagccgacggagtgactggtgcaacgggagcaacgggagccgatggagcgact
ggtgcgaccggagccgatggagtgactggtgcgaccggagccgacggagtgactggagca
acgggagccgatggagcgactggggcgaccggagccgctggagcgactggggcgaccgga
gccgacggagtgactggagcaactggatccgctggagcgactggggcgaccggagccgct
ggagtaacaggagcgaccggagccgatggtgcaacaggagcaacgggagccgctggagtg
actggtgcgaccggagccgctggagtaacaggagcaacgggagcaaccggaaccgcagga
gtgacaggagcaacgggagtcgatggagtgacaggagcaacgggagtcgctggagtgact
ggtgcgaccggagccgctggagtaacaggagcgaccggggctgatggagtgactggtgcg
accggagccgatggtgcaactggtgcaaccggggctgatggagtgactggtgcgaccgga
gccgctggagtaacaggagcgaccggggcagatggagcgactggtgcgaccggagccgac
ggagtaacaggagcgacaggagcaacgggagctgaaggagcgacaggagcaacgggagca
accggaaccgcaggagtgacaggagcaacgggagtcgctggagtgacaggagcaactgga
gtaacaggagcgaccggggctgatggagtgactggtgcgaccggagccgacggagtgact
ggggcgaccggagccgatggtgcaactggagcaactggagcaacgggagccgctggagtg
actggtgcgaccggagccgctggagtaacaggagcgaccgggtctgatggagtgactggt
gcgaccggagccgacggagtgaccggagcaacgggagtcgctggagtgacaggagcaact
ggagcaactggagcaaccggagtcgctggagtgacaggagcaaccggagtcgctggagtg
acaggagcgaccggaaccgctggagcgactggtgcgaccggagccgctggtgcaacagga
gcaacgggagctgaaggagcgacaggagcaacgggagcaacgggagccgatggagtgaca
ggagcaacgggagccgatggagcaacaggagcaaccggaaccgcaggagtgacaggagca
accggaaccgcaggagtgacaggagcaaccggagtcgctggagcgactggtgcgaccgga
gccgctggagtaacaggagcgaccggggctgatggagtgactggtgcgaccggagccgac
ggagtgaccggagcaacgggagccgatggagcgactggtgcgaccggagcaacgggagcc
gacggagtgactggtgcaacgggagctgaaggagcgacaggagcaacgggagcaaccgga
accgcaggagtgacaggagcgacaggagtgacaggagcaacgggagtcgctggagtgaca
ggagcgacaggagccgctggagtgacaggagcgaccggagccgcaggagcaacaggagca
accggaatcgcaggagtgaccggagcaaccggagtcgctggagtgacaggagcgacagga
gccgcaggagtgaccggagcaacgggagtcgcaggagtgaccggagcaaccggaatcgca
ggagtgaccggagcaaccggagtcgctggagtgacaggagcgacaggagccgcaggagtg
accggagcaacgggagtcgcaggagtgaccggagcaaccggagtcgcaggagtgaccgga
gcaaccggaacaactggtgtaactggagcaacggggccgaatattcaagctgaaggattc
tctgcattcctgccaactttgtcagtatctagttcttcccaacttacgggctggactgtg
acttctccgttctattctgatccatcctttagcccagttacgggaaattacacagttccg
acgacaggtagatattctattgaagcaactattaattattccacaaccgcttctatctca
ataagtcttggtagtggaattaatccagcatttatagttcagagaacatctcctaccgca
acaaatctggtaagtggattatttcctgtgttagatgtcaatgttgcgcttattctagat
ttgagagctattttggggagcgggactgtaacgctggctggtgagtttgctctaacagca
ggtgatgttattggcttgttctatgtgtctaatggtttgacagttcctttgaatttgggc
ggcgccaacacagcaggtatagtttggtctgttcatgaattgacttaa
DBGET
integrated database retrieval system
