Polynucleobacter asymbioticus: Pnuc_1149
Help
Entry
Pnuc_1149 CDS
T00502
Name
(GenBank) filamentous hemagglutinin family outer membrane protein
Organism
pnu
Polynucleobacter asymbioticus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TPS
MBG_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABP34365
UniProt:
A4SY01
LinkDB
All DBs
Position
complement(1197574..1204227)
Genome browser
AA seq
2217 aa
AA seq
DB search
MNSIGRQSSFSLSCVTNSLLKRTKSVLTHSLFLIAYAGLSHAAAPVPAPTAKTLPTGGQV
VAGSATISSSSTANTAVMNINQTSQRAVVNWDSFNVGKNATVNFNQPNSSAVTLNRVTGG
NASVINGAIHANGQVVLVNENGVVFGKGAQVNAAAVTASTLNIADQEFMDGKSTYKDDGI
GVGSNAGKIINKGKIQTNNDNGEGGFIALLAPEVRNQGYLLAQKGGTVAIGSGSQITLHI
QGQTLVAIKVDESVYNGLITNKRIIEAPGGLVVLATGAANQLMAGVIKNTGRIAANSLES
NGGVIELVAKNITQSGQVSANSQTKEGGQVNLVASEITLTKNSKTTATGAAGGGQVNIGL
ASTQVSGGAQVNTPTPVAIKANANQAAQTNQLANTVAVQESATIDTSATQTGNGGSIAIW
SKVQTTVAGILKSMGGAILGNGGFIETSSQGQVVLAPTASINTSANNPTGKAGTWLLDPI
DLIINSDAANVIANALANTNVTIAVTNSTTACPIGSCTQTNVSGANSSLTIASGADILKL
GTNYTTLTLSSEGIFNLNANISGQNLDVIISSSIAYLNVGSSINASKVTVQAQTIYSAGS
IQTSNYLLGANPGSLGNAIALLAQAIYVSGRLSANAIGKVAGSITLTANTIKLYPNAVLE
ANGDEGGQITVAANDSLWSSATVQANGGNGRGGTLSLTAANDQYFDQSALQANGTTDGGA
ITITTQSGDISFANSLIQTNGSTGRGGSISLSATNITQIANSNISANGYSQGGTILIGND
ASNGSLPFSMATTIDEKTAINAAQLDPNPTNQHGGFIETSGHTLNLLATINAGRGGMWLL
DPNDISIEALPVLGGTPFAYVSGSSYTYTAGASSVVYTALITSALATADVIITTASGNIT
VNGAISGVRSLTLLASSGNIQLNAGIQLTGAGSSIVLKASGYISTAGANTYLTNGGDVIF
WSNTGNVTSTTATNANFIYLDSGTKLMTVGGAIYLAGGLPSIGTTSNGNNYPTGYAFTGS
VNSGVLLGSYAGNGIPIIIKSDGGNIVIAGQTTNTNLPGFSSQSSLLIDSGMGTISLTGT
AHNGHGIELGYGSAYSNIVITSASSSPTAIQINGTTDGGSGYKGFWAIHLAGSATPGVLI
QATGFGGGVSLTGINTPSGIGVYLSDIAILANNGPIQINSTALVTQSTSSFLGACSGTAN
PCASFAIGDNTYTPITNSSSNIAINVDARNAGGVSWNGVLTVDTTGGLTIAPYTTDGWAT
TPFTWSGSNALSGGIATFTADANSFIGVADKLMIKKITSLTIGASDSTNTVNINQDTGPF
GNLSVHAGNININAPIHWVSDEAINLISSGNISVNADLVGPSSGLTAVYGGTYSCSVCSS
YYVLLNPGSSVYGSVPNLTYGIYTSAAGTTLASSAISSLVSGTASWSGVMPDSTSSVGSY
PLSYSSGLSISSLSYSLIAGNLNNWTITPAPLGIKVTATYTSGSVFTPSNSVIAATGLMA
GQTITSLQANSSNVGPGNFVTTSGLIGAGGFLASNYAMYAGSEVGNSGVLAGGLYSGTVS
GATNSGGTNTVNINRANLAITANPSPSGNVYNGNAYNGSYITNALGSDQGLMTISGVATG
VNAGTYTSNLAVNGAVLSNYNTPVITNANLVISPKPITITDIASRTIYDGVTNYATLMAN
AGYTLSSALVGSDTIGAINQTASSVGGTSFSGIAQAGIFFSTPSAAVLSIGNANNYLFSY
ATASNTVAKASLTIAAIPNLTGNVYNGSTYNGTYVTNALGSDQGLMTISGIASGVDAGIY
TSNLAVSGSVLSNYNSPVIRNANLVITPAPLVIKANDLARVAGTAFYGGNGVTYTGLLNG
ESPSVLSGVLTYSGSAQGASNAGAYVIQPGGLTSQNYSIGFISGVLVNTPQPVVNAITPP
PPPPPPPMVFSIAPPPPPPAAAAMVSIAPPPPAAEAGSGGREVAPPPVAAAMVAAPDGGI
ALAPAPAAPPPTASAPPPAAPSGANPSNTPSSSTNTDASSNKPSEGKPNGTNSKGERIGK
YDARRLAESKEAKEGKGGSDKPGSKKAEPGVNGETPPKYAGKYANGFRAAEKAAGKDGAN
KSLASNKANPPREGKYSNRVNALNNGSASASAAMAAAAMSQHQFSSTGLPPLPGAPAEAA
TPTILRGGDSLTQSYDDVPSIRNSGVANAGRSRNTENYHESLESVNLMSTLNLFIVH
NT seq
6654 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgaatagcatcggaaggcaatcttccttttctctttcttgcgttaccaattctttgttg
aagcggacgaagagcgtactgacacattctctttttctgatagcgtatgcaggactctct
cacgcagccgctcccgtgccagcacccacagcaaaaaccctccccaccggcggtcaggta
gtcgctggcagcgccacaattagttcttcatccacagcgaatactgctgtgatgaatatc
aaccaaacctcacaaagagcagtagtgaactgggatagttttaacgttggtaaaaacgcc
acggtgaactttaatcaaccgaactcttctgcagtcactctcaatcgcgtgacgggtggt
aatgcttcagtcattaatggcgccatccacgctaatggccaagtcgtactcgttaatgaa
aacggggtggtctttggtaagggtgcgcaggttaatgcagcagcagtcactgcctctact
ctgaacatcgccgatcaagagttcatggatggtaagagtacttacaaagatgatggcatt
ggagtaggttcaaatgccggcaagatcatcaataaaggcaagatccaaaccaataatgac
aatggtgaaggtggctttattgctctattagccccagaagtgcgtaaccaaggttatctc
ttagcccaaaaaggcggcacggttgctattggctctggctctcaaatcactctgcatatc
caaggccaaactttagtagccatcaaagtcgatgagagtgtctataacggcctgatcacc
aataaacgcattatcgaagcccccggtggtttagtggttttggctactggagcagccaat
caactgatggcaggagtcattaagaacacaggccgcattgctgccaatagcttagagagc
aacggcggggtgattgagttggtagctaaaaacatcacccaatctgggcaagtgagcgca
aatagccaaaccaaagagggtggtcaagtcaatctggttgctagtgagattacgcttact
aagaactccaagaccacagccactggcgcagccggtgggggccaagtcaatattggttta
gctagcacccaagtatctggtggtgcccaagtcaacaccccaactccagtggcaatcaag
gccaatgccaaccaagcagcccaaacgaatcagctagccaatacggttgctgtgcaagag
agcgccacaattgatacttcagctacccaaacaggtaacggcggatcgattgcgatctgg
tccaaggtacaaaccacagtggctggcatccttaaatccatgggcggggcaatcttaggt
aacggcggctttatcgaaaccagctcccaaggccaagttgttctagccccaacggcaagc
atcaataccagcgcaaacaacccaactggcaaagccggcacttggctcttagatccgatt
gacctgatcatcaacagtgatgctgccaatgtaatcgccaacgccttagcaaacaccaat
gtgaccattgcagttaccaacagcaccactgcttgccccattggaagttgtactcaaact
aatgtcagtggcgccaacagcagtctgactattgctagtggcgccgatatcctcaaattg
ggcaccaactacaccacgctcactctctcatcagaaggcatctttaatctcaatgccaat
atcagtggtcagaatcttgatgtgatcatcagctcttcgattgcctatctgaacgtaggt
agctccattaatgcctccaaagtaaccgtccaagctcaaacaatctatagcgctggcagc
atccaaaccagtaattacctcctaggcgcaaacccaggatctttaggtaatgccatcgcc
ttattagcccaagccatttatgtgtcaggcagactatcagctaatgccataggcaaagta
gctggcagcattacgctcaccgccaacactatcaagctatatccaaatgcagtgttagaa
gccaatggtgatgaaggtggccaaattacggttgctgccaatgactccctctggagtagc
gctacagtgcaagccaatggtggaaacggtaggggaggaacactgtccttaaccgcagca
aacgatcaatactttgaccaatcggcattacaagcaaacggcactaccgatggtggcgcc
atcacgatcactacccaaagtggtgacatctcctttgctaactccctcatccaaaccaac
ggctcgactggtcgtggcggtagcattagcctatcggctactaacattacccaaattgct
aacagcaatatcagcgcaaacgggtactcccaaggtggcacaatattaataggcaatgac
gctagtaacggttcattgcctttttctatggcgaccaccattgatgaaaagaccgctatc
aatgcagcccagttagaccccaatcccaccaaccaacacggtggttttattgaaacctcg
ggtcacactctaaacctgctggcaactattaatgctggtagaggggggatgtggttgttg
gatccgaatgatatttcaatagaggcgctaccagttttaggtgggacaccctttgcatat
gtaagtggctcttcatacacctatacggcaggggctagtagcgtggtgtataccgccctg
attacttctgccctggctactgcggatgtcatcattactacagcgtcaggcaatattact
gttaacggtgcgattagcggagttcgctcattaacccttcttgctagctctggaaatatt
caattaaatgcaggtattcagttaaccggtgcaggatcctccattgttctaaaggcaagt
ggttatatctctactgctggtgcaaatacctatttgaccaatggtggcgatgtcattttt
tggtctaacactggaaatgtaactagtactaccgcaacaaatgccaattttatttacctt
gattcaggtacaaaacttatgactgtcgggggcgccatttatcttgcaggtggcttacct
tctataggtactacatctaatggaaacaactatccaactgggtatgcatttactggcagt
gtaaattctggagttctattggggtcttatgctggtaacggcattcccatcatcatcaag
tctgatggcggcaatatagtgattgctggacaaacaactaatactaatctgccgggcttt
agtagccaatcttctctgttgattgattcaggaatgggcacaatttcgctaacgggaact
gcacataatggccatggtattgagttgggctatggctctgcttattcaaatattgtgatt
acttccgcgtcatcgtcacccacagcaattcagatcaacgggacgacagatggcggttcg
ggctataaaggcttctgggcgatccatcttgctggctccgctacgccaggtgttttaatt
caggcaacaggatttggaggtggtgtttcacttactggaatcaatacgccaagtggtatt
ggggtgtatttaagcgatattgccattcttgcgaacaatggcccaattcaaatcaattca
accgcccttgtaactcaatcgacctcatcgtttctcggggcttgttcaggcactgcgaat
ccttgtgcttctttcgccataggtgacaatacatacacgccaattactaactcttcttct
aatattgcaattaatgtggatgctaggaatgcaggcggggtctcttggaacggggtattg
actgttgataccaccggcggtctaacaattgcaccctacacaactgacggctgggccaca
accccatttacatggtctggaagcaatgctctctcgggtggaatagctacatttactgca
gatgcaaatagtttcattggcgtagctgataagctaatgattaagaaaattactagtctt
actattggtgcatccgactccaccaatacggtgaatattaaccaagacaccggccccttt
ggaaatctctcagttcatgccggaaatatcaatattaatgcgccaatccattgggtatct
gatgaagctatcaatttgatttcatctggcaatatttccgttaatgctgatttagtcggc
ccctcaagtgggttaactgctgtctatggcggcacttattcttgctctgtttgttcctct
tactatgtacttttaaatccgggttccagcgtttacggtagcgtaccaaatctgacttac
ggaatttatactagcgccgcagggacaacattagcttcaagcgcaatttctagccttgtt
tctggtacggctagttggagtggagtcatgcccgactcaacttcttcagttggatcctat
cctttaagttactcatctggactttctatctctagtttgtcttatagtctgattgcaggt
aatctaaacaattggactattactccagcaccattgggtattaaagttactgcaacatac
acgagcggtagtgtatttactcccagcaatagcgttattgcagcaactggtttaatggca
gggcagaccattacgagtcttcaggcgaactcttctaatgtaggccctggaaattttgta
actaccagtggattgattggggcaggcggttttctagctagcaactatgcgatgtatgct
ggaagtgaggtagggaattctggggtgttggctggcggtttatacagcgggacagtatcg
ggcgctacaaattcaggcggaacaaacaccgtcaatattaatagagctaacctcgccatt
actgctaatcctagcccctctggaaatgtgtataacggcaacgcatacaacggtagttac
ataaccaatgccttgggatctgaccagggattgatgaccatctcaggcgttgctactgga
gttaatgctggaacttatacctctaacttagctgttaatggcgctgtcctctctaactac
aacacgccggtaattactaatgcgaatttagtgatctcaccaaaaccaattacgattacc
gatattgcaagtcgtaccatttacgatggtgtaacaaattacgccaccttgatggctaat
gcgggttatacactgagctcagcattggtgggtagcgatacgattggtgcaatcaatcaa
acagcttcatcagttggtggtacttcattttctggtatcgctcaggctggtattttcttt
agcactccgagcgccgctgttttatcaattggtaatgccaataactaccttttctcttat
gcaactgctagcaatactgttgccaaggctagcctcaccattgctgcaatacccaatctc
acggggaacgtttacaacggctctacttataacggtacctatgtaacaaatgctttgggc
tctgatcaaggcttgatgactatctcaggtattgcttctggagttgatgctggaatctat
acctctaatttagcagttagcggttcagtgctatctaactacaacagtccagtgattaga
aatgcgaatttagtgatcactcctgcgccgttagttatcaaagcgaatgacttagcaaga
gtggcagggactgctttttatggcggtaatggtgtgacctataccggtctcctgaatggg
gagtcaccctcagtactctcaggggtattaacgtattctggatcagctcaaggcgcaagt
aatgcgggggcttatgtaatccaacccggcggtttgactagtcaaaattattctatcgga
tttattagcggtgttttagtgaatactccacagccagtggttaatgcgattactccgcca
ccgccgcctccacctcctccaatggtttttagtattgcgcctcctccacccccaccggca
gcagctgcgatggtgtccatagccccgccaccacctgctgctgaagctgggtccggggga
cgagaagttgctcctccacctgtcgctgctgcaatggttgcagcgcctgatggtggaatt
gccttggcacctgcaccagcagctccgccaccaactgcttctgcaccaccacctgcagct
ccctcaggcgcaaatccatcaaatactcctagttcatctaccaatacggatgcatcgagt
aataagccgtcagaaggtaaaccaaatggcacgaactcaaaaggagagcgtattggaaaa
tatgacgctcgaagattggcggaatcaaaagaagccaaagagggtaagggtggatctgat
aaacctggttctaaaaaagcagaacctggagtgaatggggaaacccctcctaaatatgct
ggtaaatatgctaatggtttccgggctgctgaaaaggctgctggaaaagatggcgccaat
aagtcattggcttcaaataaggctaaccctcctagagagggaaaatacagcaaccgagta
aatgcgcttaataatggttcagcgtcagcttcagctgcaatggcagcggccgcgatgtca
caacatcaattctcctcaactggcttaccccctttaccaggggctcctgctgaggcagcc
accccaacaatattgcggggcggcgatagcttaacccagtcttatgatgatgtaccatcg
atacgtaattcaggggttgctaatgcgggacgttcacggaatacggaaaattaccatgag
agtcttgagtcggttaatttaatgtcgacactgaatttatttatagtccattag
DBGET
integrated database retrieval system