Populus nigra (Lombardy poplar): 133668764
Help
Entry
133668764 CDS
T10372
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like isoform X1
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
pnz Populus nigra (Lombardy poplar)
Pathway
pnz03015
mRNA surveillance pathway
Brite
Messenger RNA biogenesis [BR:
pnz03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
133668764
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
133668764
NCBI-ProteinID:
XP_061944743
LinkDB
All DBs
Position
1:12442815..12446867
Genome browser
AA seq
490 aa
AA seq
DB search
MQGMESDLGKLFIGGISWDTDEERLKEYFSKYGEVVEAVIMRDRVTGRARGFGFVVFADP
IVAERVIMEKHVVDGRTVEAKKAVPRDDQHILSRNTSSIHGSPGPGRTKKIFVGGLASTV
TENDFKKYFEQFGNITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVDRVLHKTFHELNGKMVE
VKRAVPKELSPGPSRSPLMGYNYGLTRANNFLNAYAQGYNMNSIGGFGMRMDSRFNPLAT
GRSGFAPFSTTGYGMSMNLEPALSPSYGGGSNFGNTPAYGRISSPYYSGNPSRYNTPVGY
GEGNARNDSLLSPTTWNVWGNGSHNTATNPASPGPLLGSRTGNFGVSFGNSGSNWGTSPV
SAQGRGGASGYTTGSMGYGSGDNNYGLSGAGYVRNSGTGAPPTSSFSGSAGGYEGSYGDL
YRSGSVYGDSTWQSATPELDGYGSFGYGLGDVASDVTTKSSEGYIGSYGVTSRQSNRGAG
IWLNRANKGS
NT seq
1473 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaagggatggaatcagatcttggtaagctcttcattggtgggatttcatgggacact
gatgaggaacgtcttaaggaatattttagcaagtatggggaagtggttgaggctgtgatc
atgagagatcgtgttacaggccgtgcccgtggctttggttttgttgtctttgcagatcct
attgttgccgagagggtcatcatggagaagcacgtggttgatggccgcacagttgaagcc
aagaaggctgttcctagggatgaccagcacattttaagtagaaacactagtagtattcat
ggttctccaggtcctggacgcacgaaaaagatttttgttggaggccttgcgtctacggtt
acagagaatgacttcaagaagtactttgagcagtttggtaatattactgatgttgtagtg
atgtacgatcacaacactctgaggccaagaggctttggcttcatcacttatgattctgag
gaagcagtggacagagttctgcataaaacatttcatgaactcaatggtaaaatggttgag
gtcaagagggcagtcccaaaggagctatcaccaggtcctagtcggagccctctgatggga
tataactatggtttgactagggccaacaacttccttaatgcatatgctcagggatataat
atgaactctattggaggttttggaatgaggatggatagtaggtttaatccactcgccact
ggtcgaagtggatttgctccctttagcaccactggttatgggatgagtatgaatttagag
ccagccttgagtccaagctacggtggaggttccaactttggtaacactcctgcatatggg
cggatctcaagtccttattatagtgggaatccaagcaggtacaacacaccagtaggttat
ggtgaggggaatgcaagaaatgattcgctcttaagccctactacttggaatgtctgggga
aatggcagccacaatactgcgacaaatcctgccagccctggtcctttattgggctccaga
actggaaattttggagtttcatttgggaatagtggatcgaattggggcacttctcctgta
tcagctcaaggcagaggaggcgcttctggctatactactggcagcatgggttatgggagt
ggtgacaacaattatggtttgagtggggcaggatatgtaagaaacagtggcactggtgca
ccaccaacatcatcattctctgggtcagctggtggttatgaggggtcctatggggacctt
tatcgcagtggttctgtttatggtgattcaacttggcaatctgctactcctgagcttgat
ggttatggttcatttggttatgggctcggtgatgtagcttcagatgttacaactaagagt
tccgagggttatattggaagttatggtgttacaagtagacaatcaaatagaggtgcagga
atctggttaaacagagctaacaagggttcttga
DBGET
integrated database retrieval system
