Populus nigra (Lombardy poplar): 133679817
Help
Entry
133679817 CDS
T10372
Name
(RefSeq) transcription initiation factor TFIID subunit 15b isoform X1
KO
K13098
RNA-binding protein FUS
Organism
pnz Populus nigra (Lombardy poplar)
Pathway
pnz03015
mRNA surveillance pathway
pnz03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pnz00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
133679817
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
133679817
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
pnz03041
]
133679817
Spliceosome [BR:
pnz03041
]
Complex A
Other components
Complex A specific factors
133679817
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
Zn_ribbon_RanBP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
133679817
NCBI-ProteinID:
XP_061958504
LinkDB
All DBs
Position
19:8116058..8121397
Genome browser
AA seq
445 aa
AA seq
DB search
MSGMYGQEGDSGPPSYGGGGGYGGGGRGAGAGGYGGYGGGGRGGYGGRGGGGSVGGRGGG
YGGNSQSRGDGYQGGDRGGRGGGGGRGGGRGGSGRDGDWPCPDPSCGNLNFARRSECNKC
GTPSPSAGQNDRGGGNRGGSGGGYGGNRGGRGGGSYDGNRSSNYNDGSRGGGNRGGSYGG
NQGRGDSGYNQAPPPSLPSYGGGGGNYPPPPNSNSANANYGMEAVPPPTSYTGGPTTYPP
SYGGPASGYGGDATGEVRSGGRGGQPGGRGGGSRYPGGSGYGAAPDDAPAKIKQCDDNCD
DTCDNSRIYISNLPPDVTIEELRELFAGIGQVGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEKGNNK
GDACLAYEDPSAAHSAGGFYNNYDMRGYKINVAMAEKSAPRQPAHDHGGGRGGYGGGDRR
RDNYRDAGNSGPDRHQHGGNRSRPY
NT seq
1338 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctggtatgtatggtcaagaaggcgattctggtcctccatcttacggcggtggtggt
ggatacggtggaggcggccgcggagctggcgcaggtggatatggaggctatggcggaggt
ggccgcggtggatatggtggtcgaggtggcggtgggagcgttggcggcagaggtggggga
tatggtggtaattcgcaaagtcgaggagatggataccaaggaggagatcgtggaggcaga
ggaggcggcggcggaagaggtggtggccgaggtggaagcggcagggacggtgactggcct
tgccctgatccaagctgtgggaatttgaactttgcaagaagatccgagtgtaataaatgc
ggtactccttctccttctgctggccaaaatgatcgtggtggtggtaatagaggaggaagt
ggtggaggatatggtggtaatcgaggggggagaggtggtggtagttatgacggtaataga
agtagcaattataatgatggaagcagaggaggtggcaatagaggtggatcttatggtggt
aatcaaggaagaggtgatagtggatataatcaggcgccaccaccatctcttccttcttat
ggtggtggtggaggtaattatccacctcctcctaactcgaacagtgcaaatgctaattat
ggaatggaagcagttcctccaccaacaagctatactggtggacccacaacgtaccctccg
tcttatggtggccctgctagtggttatggtggtgatgctacgggtgaggtgaggagtggt
ggacgaggtggtcagcctggtggtcgtggtggcggttcacgatatcctggaggtagtggt
tatggggctgctcctgatgatgccccggctaaaattaagcagtgtgatgataattgtgat
gatacttgcgacaactcaagaatatacatatctaatttgccacctgatgtgaccattgaa
gaactgagagagctttttgctggaattggacaagttggaaggattaagcagaagcggggt
tataaagatcaatggccctggaatataaagatatacacagatgagaagggaaacaacaaa
ggcgatgcatgtttggcttatgaagacccatctgctgctcactctgctggcggtttttac
aacaattatgatatgaggggctataaaatcaatgttgcaatggcagagaagtcagccccg
aggcaacctgcacatgaccacggcggtggtagaggtggctatggtggtggagatcgacgt
agggataactaccgagatgctggaaattctggcccagacaggcatcaacatggtggaaac
cgatcacgtccttactga
DBGET
integrated database retrieval system
