Populus nigra (Lombardy poplar): 133682067
Help
Entry
133682067 CDS
T10372
Name
(RefSeq) piezo-type mechanosensitive ion channel homolog
KO
K22128
piezo-type mechanosensitive ion channel component 1/2
Organism
pnz Populus nigra (Lombardy poplar)
Brite
Membrane trafficking [BR:
pnz04131
]
Endoplasmic reticulum (ER) - Golgi transport
Others
Others
133682067
Ion channels [BR:
pnz04040
]
Other channels
Mechanosensitive channel (Piezo)
133682067
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
133682067
NCBI-ProteinID:
XP_061961300
LinkDB
All DBs
Position
2:39607848..39630839
Genome browser
AA seq
2482 aa
AA seq
DB search
MGNFLVGFVLPVLLLTSSLINWSLISLVDLIAFLLIQYAAPKIGFRFQRRLFLLWLIIIF
SLVVILSQAVYLVIWAILGDEWSGTDAWWAHLTGFMIIHSWKSPLVIYFLVIQLLAVFVA
LVDIYGSRFGLVPWRDSCWGHFLNLLEHLGSHLRVASCLLLPAIQLGVGISHPSWLSLPF
FIASCAGLVDWSLTSNFLGLFRWWRPLQLYASINIILLYTYQLPIEFLSTLQWIADFIGL
FKISGKSEWHEICSGLSLVLFYIMLSFIKCDLEEMDFIMSMRGSNLTEQLLPLRHSFFIR
KSRSGVRHTNVLLRGAVFRTFSINFFTYGFPVSLFALSYWSFHFASICAFGLLAYVGYIV
YAFPSVFRLHRLNGLLLVFILFWAVSTYIFNVAFPLLSWKLGKDMEIWDMVGLWHYPLPG
LFLLAQFCLGILVALGNLVNNSVFLYLSDEGNGSSNDNSTVEAQEDTKVLIVATIAWGLR
KCSRAIMLVLIFLIAMKPGIIHAVYLIFFLIYLLSHNISRKIRQPLILLCEVHFAMLYIL
EINLISHALEQKGSLTMEVLLQLGLLKHHSSWDFLKIALLACFCAIHNHGFEMLFSFSAI
VQHTPRPPIGFSILKAGLNKSVLLSVYASSTTRYGHDNSSYESRIALFLGAIGQKFLTTY
RSCGTYIAFLTILLTVYLVKPNYISFGYIFLLLVWIIGRQLVEKTKRRLWFPLKAYAVMV
FVFIYSLSCFPSFETWLSSLIDLLFYLGYNSKASSLKNIWESLAVLIVMQLYSYERRQSK
HNRLHDPDPLDSGVFGFIKRFLIWHSQKILFIALFYASLSPISAFGLVYLLGLVACSTLP
KASRIPSKSFLLYTGILVTTEYLFQMWGKQVGMFPGQKHSELSLFLGFRAYKPGFWGLES
GLRAKVLVIAACTLQYNVFRWLDKMPSICQNKGKWEEPCPLFVSDEDAFMNGSMVNDENK
PPPNHSIPSVEGEGFISNSLPSITAGLTQAPDLVSNKTGGSEGSGTSKFSFGYIWGSPKE
SHKWNKKGILSLKKERLETQKTVLKVYLKFWIENIFNLFGLEINMIALLLASFALLNAIS
MLYVALLVACILLKRRIIRKLWPVFVFVFASILILEYFAIWKSMVPSNQHIPSETDVHCH
DCWESSALYFQYCKNCWNGLVVDDPRMLISYFSVFMIACFKLRADNLSSLTGSSMYRQKM
SQSKNTFVWKDLSFETKSMWTFLDYLRLYCYCHLLDLVLCLILITGTLEYDILHLGYLAF
ALVFFRMRLVILKKKNKVFRFLRIYNFALIVLSLAYQSPFVGVFSSGNFETIEYIYEMIG
FYKYDYGFRITARSALVEIIIFMLVSLQSYMFSSNEFDYVARYLEAEQIGAIVREQEKKA
AWKTAQLLYIRESEEKKRQRNLQVEKMKSEMLNLQIQLHGMNSTTNCGSSSPDSDGLRRR
RSTSRITDRDSGSPGKGEGTLRKEEQIITDDSIFRFEVHEFPSWNAESLEIKVSPKYSAE
PPLCEITEIMQESTDSLLSDSGKKAKVQSKENPLISAVQLIGDGVSQVHSIGNQAVNNLV
SFLNISPEDLDINQPSAENMVYDEMESQKTKRMSFDRSSSLQSDMSSDATSLQIGRIFRH
VWSQMQSNNDVVCYACFILVFLWNFSLLSMVFLAALFLYALCVNTGPSYIFWVIILIYTE
VYIMVQYIYQIIIQHCKMSIDPVLLRELGVPAHKITSSFVISSWPLFLVYLFILLQSSIT
VKDGEWIPSTDIKFRRSSLHRQEVLVSYSWSDRAQDLLHLMTNMVKSKIRSFFRYWKSLI
LGAESPPYFVQVSMDVPLWPEDGIQPERIESGINQLLKMVHDERCKEKNPNLCPFASRVH
VQSIERSQENPNVALVVFEVEYASPLTSCASAEWYKSLTPAADVAKEILEAQHAGFVNEI
GFPYTIVSVIGGSKREVDLYAYIFGADLSVFFLVAIFYQSVIKNKSEFLDVYQLEDQFPK
EFVFILMIIFFLIVLDRIIYLCSFATGKLIFYIFNLILFTYSVTKYAWHLEHSQNAAGLA
LRAIFLAKVVSLALQAIQIRYGIPHKSTLYRQFLTSKVSQINYLCYRLYRALPFLYELRC
VLDWSCTTTSLTMYDWLKLEDIYASLYLVKCDAVLNRAQHKQGEKQTKWTKCCSGICLFF
ILLFVIWAPMLIYSSGNPTNIANPIKDASVQVDIKTVGGRLTLYQTTLCEKLPWDIIDSD
FDLDPHGYFDTYNKNDIQLICCQADASVLWLVPNVVQMRFIQSLDRDMDMDIIFTWVLTR
DRPKGKEVVKYEKIVSPPDLPKQSDIQKVLNGSTNSFRIYNLYAKHLRVTGSGEVRSFEQ
EVDAVSADLVLNRADFNWWSFRDINSSDIHGCGGLTGPMAVVMSEETPPQGILGDTISKF
SIWGLYITFVLAVGRFIRLQCSDLRMRIPYENLPSCDRLIAICEDIYAARAEGELGVEEV
LYWTLVKIYRSPHMLLEYTKPD
NT seq
7449 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggggaattttcttgttggatttgtcttgccagtcctgctcttaacatcttctttgatc
aattggagtttgatttctcttgttgatttaatagctttccttcttattcagtatgctgca
ccaaaaataggttttcgttttcaacggcgactttttttattgtggctcattattatcttt
tccctagtagtcattctttctcaagcagtgtatcttgtcatctgggcaattctgggagat
gaatggagtggaacagatgcttggtgggcccatttaactggttttatgataatccattcc
tggaaatcaccacttgtaatttacttcttggttatacaactattagcggtttttgttgct
ttagttgatatatatgggagcagatttggtctggttccatggcgagattcctgctggggt
catttcttaaaccttcttgaacatttaggctcacatcttagggttgcttcttgtttgctg
ttgcccgcaattcaacttggtgtggggataagccatccctcatggctttctctaccattt
tttattgccagctgtgcaggcctcgtggactggtctctaacaagcaactttcttggactt
ttcaggtggtggaggcctcttcaactgtatgcaagcattaacattatactgctttatacc
tatcagcttcctatagagttcctcagtacacttcagtggatagctgattttattggcttg
ttcaaaatatctggaaaatccgagtggcatgaaatttgttccggtctttctcttgtacta
ttttacatcatgctatccttcatcaagtgtgatttggaggaaatggatttcattatgtct
atgagaggaagtaatttgacagagcaacttcttcccttgaggcattcatttttcattcgc
aaatcaagatctggtgtcaggcatactaatgttttattaaggggagcagtttttcggact
ttcagcatcaactttttcacatatggtttcccggtctcgttgtttgccctttcctactgg
agttttcattttgccagtatatgtgcatttggattacttgcatatgttggctacattgtc
tatgccttcccttctgtatttcgtttgcatcgattaaatgggctacttcttgtcttcata
ctcttttgggcagttagcacatatattttcaatgtagcttttccactcttgagttggaaa
cttggaaaggatatggaaatatgggacatggttgggttatggcattatccccttcctgga
ttgtttttgctagcacaattttgtctaggcattttggttgctctgggtaatcttgtgaac
aactctgttttcctctacctgtctgatgagggtaatggatcttctaatgacaactcaact
gtagaagcacaagaagacaccaaggtattgattgtggccacaattgcatggggactacga
aaatgttctcgggctatcatgctggtgctgatcttcctcattgccatgaaacctggaatc
atccatgctgtatatttgatttttttcttgatatatcttctgagccacaatatcagcaga
aaaatccgccagccattgattcttctgtgcgaagttcactttgccatgctgtacattctt
gagattaatctaatctctcatgctttggagcaaaagggctccttaacaatggaagttttg
ctgcagttagggcttcttaaacatcacagttcctgggatttcttgaaaatagctctcctt
gcttgcttctgtgccattcataaccatggttttgagatgttattttctttctcagcaatt
gtacagcatacccctaggccccctatcggatttagcatcttgaaagctggcctgaacaaa
tcagtcctcttgtctgtgtatgcctcctcaaccaccagatatggacatgataattcttca
tatgagagtaggatagcattgttccttggtgcaattgggcagaagtttctcactacttat
cgatcatgtggaacctacattgcttttctgactattctcctcacagtgtaccttgtaaaa
cccaattatatatcatttgggtatattttccttcttcttgtgtggataatcggaaggcaa
cttgttgagaaaacaaaaaggcgtttgtggtttcccttaaaagcatatgcggtcatggtg
tttgtcttcatctatagtttgagctgtttccccagctttgagacatggctgtccagctta
atagatctacttttttatttgggctacaactcaaaagcttcatcattgaaaaatatttgg
gaatctttagcagtcttaatagttatgcaactttatagctatgagaggagacagagcaag
cataataggctgcatgatcctgatccattggattctggagtatttgggtttatcaaacga
tttctgatctggcatagccagaagatcttgtttattgcattattttatgcttctttatct
ccaatcagtgcttttgggttggtatatttacttggccttgttgcctgttcaactttacct
aaagcttctcggatcccatccaaatcatttctattgtacaccggaattctagtgacaact
gagtatctgtttcagatgtggggtaaacaagtcggaatgtttcctggacaaaagcactct
gagctgtcccttttcttgggtttccgtgcatacaagccaggtttttggggccttgagtct
ggcttgagggcaaaagtgctggtgattgctgcttgcacacttcagtacaatgtcttccgt
tggttagataagatgccaagtatttgtcaaaataaaggaaagtgggaagagccttgtcca
ttgtttgtctcagatgaagatgccttcatgaatggttccatggtcaatgatgaaaataaa
ccacctccaaatcatagcataccatctgtagaaggagagggattcattagcaactcgttg
ccatcaatcactgctggtctcactcaagcacctgatctggtgtccaacaaaacagggggc
tctgagggtagtggcaccagtaaattttcatttggatatatctggggaagccccaaagaa
agtcataagtggaataagaaggggattctttcattgaaaaaggaaagactcgaaacacag
aagactgtcttaaaagtatatttgaagttctggatagaaaatatctttaacctctttggc
cttgagataaacatgattgcgttgcttcttgccagttttgcattgttgaatgccatctct
atgctatatgttgcattacttgttgcttgtattctcttaaaacggcgcattatacggaaa
ctatggcctgtatttgtctttgtgtttgcttcgattctcatccttgagtattttgctatc
tggaagagcatggttccttcaaatcaacatatcccaagtgagacagatgtgcattgccat
gattgctgggaaagttctgctctgtatttccaatattgcaagaattgttggaatggactt
gttgtggatgatccacgcatgcttatcagctatttttcagtcttcatgattgcttgcttt
aaactccgtgctgataacctgtccagtttaacaggttcatcaatgtatcgtcaaaaaatg
tctcaaagtaaaaatacctttgtttggaaggatctctcatttgagactaaaagcatgtgg
acttttctagactacctgaggctttactgctattgccatctcctggatcttgtgctctgc
ttgattttgattactggaactcttgagtatgacattctgcaccttggttatcttgcgttt
gctctagttttctttcggatgagacttgtaatactgaagaagaagaacaaggttttcaga
ttcttgcgcatatataactttgctctaattgttctttctctggcctatcaatctcctttt
gtaggagtatttagttctgggaactttgagactatagaatacatatatgaaatgatcgga
ttttacaagtatgactatgggtttcgaattactgcaagatctgcgcttgtggagatcatc
atatttatgctggtttcccttcagtcatatatgttctcctccaacgagtttgattatgtt
gcacgatatcttgaagcagagcaaattggtgcaattgtgcgtgagcaagagaagaaagct
gcatggaaaacagcacagttactatacatacgtgaatctgaggagaagaaacgccagcgt
aacctgcaagtggagaagatgaaatctgagatgcttaaccttcaaatccagcttcacggc
atgaactcaaccactaattgtggcagcagttcccctgatagtgatggcctgagaaggagg
aggagtacttctcgtattacagatagagattctgggagcccaggaaaaggtgaaggaacg
ctcaggaaagaagagcagatcattacagatgattcaatatttcgttttgaagtgcatgaa
tttcctagttggaatgcagaaagtctagaaataaaagtgtctccaaagtattctgcagaa
cctcctctttgtgagatcacggagatcatgcaggaatcaactgatagcttactttctgat
tctggcaagaaagcaaaggtccagtcaaaggaaaatcccttgatatctgctgtacagctg
ataggtgatggtgtttcccaggtacattcgattggaaatcaggcagttaacaaccttgtc
agcttcttaaatatctcaccagaagatttagatatcaatcagccctctgcagaaaatatg
gtgtatgatgaaatggagagccagaagactaagcgcatgagttttgaccgttcatcttct
ctgcagtctgatatgagttctgatgctactagtttgcagataggaaggatcttccgtcat
gtatggtcccaaatgcaatcgaataatgatgttgtgtgctatgcttgttttattctcgtt
tttctatggaacttcagtttgctttctatggtgttccttgctgctctcttcttgtatgct
ctatgtgtaaacactggcccgagctatatcttctgggttatcattctaatctacactgag
gtttacattatggttcagtatatctaccaaattatcatccagcactgcaaaatgagtatt
gatccagtcctacttcgtgagttgggagttcctgcacataaaattacatcatcctttgtc
atcagttcctggcctctttttcttgtctacttattcatcctcctgcagagctcaataact
gtaaaagatggtgaatggattccatctaccgacattaagttccgtagaagttctctccat
agacaagaggttctggtgagctatagctggagtgatagggcacaggatttgctgcatcta
atgaccaatatggtaaaatcaaaaataagaagcttctttaggtactggaaatcactgatt
ctaggcgcagagtctcctccatattttgtccaggtttctatggatgttcccttgtggcca
gaggatggaattcagccagagagaatagagtctggaataaaccaattgcttaaaatggtt
catgacgaaagatgcaaggaaaagaaccccaatctttgcccttttgctagtagggttcat
gtccaaagcattgaaagaagtcaagagaatccaaatgtggccttggttgtttttgaggtg
gaatatgcctcccctttgacaagctgtgcttcagctgaatggtacaagtcactaactcca
gcagctgatgtagcaaaggagattctggaagctcaacatgctgggtttgttaatgaaatt
ggatttccatacactattgtctctgtgattggaggaagcaaacgagaagttgatctttat
gcctacatatttggtgcagatttaagtgttttcttcttagttgcaattttctaccaatct
gtgataaagaataaaagtgaatttcttgatgtttatcagcttgaagatcagtttccaaaa
gaatttgtgtttatcttgatgatcatctttttcctgatcgttctggaccgcataatttac
ctctgttcatttgccactggaaagttgatcttctatattttcaacctcattctcttcaca
tattcagttacaaagtatgcttggcacttggaacattcccaaaatgctgcaggactagcg
cttcgtgctatatttcttgcaaaagtagtatctctagcgctacaagccatacaaattcgt
tatgggattcctcataaaagcaccttgtatcggcagtttttaaccagcaaagtttcgcaa
atcaattatctttgctacagactttatcgtgctttgccatttctttatgaattgaggtgt
gtactggactggtcgtgcacaacaacatcgctaaccatgtatgattggctgaagctggag
gacatatatgcaagtctgtaccttgtcaaatgtgatgctgtcttgaatagagctcaacac
aaacaaggagagaaacaaacaaaatggaccaaatgttgcagtgggatatgcctatttttc
atattactctttgttatttgggctcctatgctgatctacagcagtggtaatccaaccaac
atcgcaaaccccatcaaagatgcaagtgttcaggttgatattaagaccgtgggtggaagg
ttgaccttgtatcaaactaccctttgtgaaaagctcccatgggatatcatcgactctgat
tttgatctggatccccatggttattttgatacatataataagaatgatatccagctcata
tgctgccaagcagatgcaagtgtgctgtggcttgttccaaatgtggttcagatgagattt
atccagtcccttgaccgggatatggatatggatattatttttacatgggtacttaccagg
gataggccgaaaggaaaggaagttgtgaaatatgagaaaattgtcagtcctccagatctt
ccaaaacaatcagacatacagaaagttcttaatggttctacaaacagctttaggatatat
aatctatatgcaaaacacttacgtgttactggttctggtgaagtcagatcctttgaacaa
gaggtggatgcagttagtgcagaccttgtcttaaatcgtgcagattttaactggtggtca
ttccgtgatattaattcgtcggatatccatggctgtggaggtttgacaggacctatggca
gttgtaatgtctgaggaaacaccaccacagggtattcttggtgacaccatcagcaagttc
agcatctggggtctctacataacctttgtgcttgccgtgggccgtttcattagactccaa
tgctcagacttaagaatgagaataccgtacgagaatctaccttcctgtgacaggttgata
gccatttgtgaggacatttatgctgcgagagcagagggtgagctgggagttgaagaggtt
ctttactggacactcgtaaagatttacaggtcgccacatatgcttctggagtacaccaaa
ccagactag
DBGET
integrated database retrieval system
