Populus nigra (Lombardy poplar): 133702666
Help
Entry
133702666 CDS
T10372
Name
(RefSeq) transcription initiation factor TFIID subunit 15b-like
KO
K13098
RNA-binding protein FUS
Organism
pnz Populus nigra (Lombardy poplar)
Pathway
pnz03015
mRNA surveillance pathway
pnz03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pnz00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
133702666
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
133702666
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
pnz03041
]
133702666
Spliceosome [BR:
pnz03041
]
Complex A
Other components
Complex A specific factors
133702666
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
Zn_ribbon_RanBP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
133702666
NCBI-ProteinID:
XP_061982967
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(21044637..21049681)
Genome browser
AA seq
451 aa
AA seq
DB search
MSGMYGQDGDSGPPSYGGGGGYGGYGGDGGGRGGYGGRGGGGGGGRGGGGGGYGGPSQSR
GGGYQGGDRGGRGGGGRGGGRGGSGREGDWPCPKPGCGNLNFARRVACNKCGTPAPAAGQ
NDRSDGDGGYRGGSGGGFGGNRGGRGGDSYDGNRSSNYNDGSRGGGYDNRSGNRGGSYSG
NQGRDDSGYNQAPPPSLPSYGGGGGGNYPPAPNSYGGNANYGMEAVPPPTSYTGGPTSYP
PSYGGPASGYGGDATGEVRSGGRGGQPGGYEGGRGGGGSRNQGGSGYGAAPADAPAKIKQ
CDDNCGDTCDNARIYISNLPPDVTIEELRELFGGIGQVGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTD
ENGNNKGDACLAYEDPSAAHSAGGFYNNYDFRGYKINVAMAEKSAPRQPAHDHGGGRGGY
GGGGRRRDNYRDGGNSGPDRHQYGGNRSRPY
NT seq
1356 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctggtatgtatggtcaagacggtgattctggccctccgtcttatggcggcggaggt
ggatatggaggttacggaggcgatggtggcgggcgtggtggatatggtggtcgaggtggt
ggtggaggcgggggaagaggcggaggaggaggaggatatggtggtccttcgcaaagtcga
ggaggtggataccaaggaggagatcggggaggcagaggaggcggcggaagaggtggtggc
agaggtggaagcggcagggaaggtgattggccttgccctaaaccaggttgtgggaatttg
aactttgcaagaagagttgcttgtaataaatgcggtactcctgctcctgctgctggccaa
aatgatcgcagtgatggtgatggtggttatagaggaggaagtggtggaggatttggtggt
aacagaggaggaagaggtggtgatagttatgatggtaatagaagtagtaattataacgat
ggaagcagaggaggtggttatgataatagaagtgggaatagaggtgggtcttacagtggt
aatcaaggaagagatgatagtggatacaatcaagctccaccaccatctctcccttcatat
ggtggtggtggtggaggtaattatccaccggctccgaactcgtatggtgggaatgctaat
tacggaatggaagcagttcctccacctacaagctatactggtggacccacatcataccct
ccatcttatggtggtcctgctagtggttatgggggtgatgctacaggtgaggtgaggagt
ggtggacgaggtggtcaacctggtgggtatgaaggtggacgtggtggtggcggttctcga
aatcagggaggtagtggttatggggctgctcctgctgatgccccggctaaaattaagcag
tgcgatgataattgtggcgatacttgtgacaatgcaagaatatatatatctaatttgcca
cctgatgtgaccattgaagaactgagagaactttttggcggcattggacaagttggaagg
attaagcagaagcggggctataaagatcaatggccctggaatataaagatatacactgat
gagaatggaaacaacaaaggtgatgcctgtttggcatatgaagacccatctgctgctcac
tctgctggcggtttttacaacaattatgatttcaggggctataaaatcaatgttgcaatg
gcagaaaagtcagctccgaggcaacctgcacatgaccatggtggtggtagaggtggctat
ggtggtggaggtcgacgcagggataattaccgagatggtgggaattctggtccagacagg
catcaatatggtggaaatcgatcacgtccttactga
DBGET
integrated database retrieval system
