Populus nigra (Lombardy poplar): 133705130
Help
Entry
133705130 CDS
T10372
Name
(RefSeq) pumilio homolog 1-like
KO
K17943
pumilio RNA-binding family
Organism
pnz Populus nigra (Lombardy poplar)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
NABP
PUF
PUF_NOP9
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
133705130
NCBI-ProteinID:
XP_061986226
LinkDB
All DBs
Position
10:complement(13087052..13094753)
Genome browser
AA seq
999 aa
AA seq
DB search
MITDTYSKVLPDISKRSMLKNEDLSKLIREQRLQQEATSEIEKELNIYRSGSAPPTVEGS
LSSIGGLFDGTGIPGIKNSNRGGFLSEEVLRSDPAYVNYYYSNVNLNPRLPPPSLSKEDW
RFAQRLHGSGGGSNSVVGDRRRGSRGGENEGHRSLFAVQPGFGGGMEENGNENGVEWGGD
GLIGLPGLGLGSRQKSIAEIIQNDMGHANPISRHPSRPASRNAFDDDMETSEAQFSQLHG
DLASLDALRSSSNKQGMSAVQNIGASASHTYASALGATLSRSTTPDPQLVARAPSPRIPP
IGGGRTNSMDKRDVSGSHSFNGISTSFNDSELVAALSGLKMSTNGLVDEENHSQSRSQHE
IDDRHNLFNLQGDQNYVKQQSYLNKSSASSNLKLPSTLTLSGRGGSPSNHQNADNMNSPY
ANYGFSGYPVNPSSPSMIGSALANGSLPPLFGNAAAAAMAGSGLDSQALGAIGPNLMASA
AELQNLSRFGNQTAGVPLVDPLYLQYLRSDEYAAAQLATAQLAALNEPMLDREYVGNAYD
LLQKLQLETLLSSQNSQYGVPYLGKSGSLNHNYYGNTGFGLGMSYSGSPLGGPVLPNLLA
GSGGPVRHSERNMRFSPGMRNLSGGVMGSWHSEAGSNLDESFPSSLLDEFKSNKTKCFEL
SEIAGHVVEFSADQYGSRFIQQKLETATAEENNMVFDEIMPQALSLMTDVFGNYVIQKFF
EHGSASQIRELADQLTGHVLTLSLQMYGCRVIQKAIEVVELDQQTKMVTELDGHILRCVR
DQNGNHVIQKCIECVPEDAIQFIVSTFYDQVVTLSTHPYGCRVIQRVLEHCHDTKTQRIM
MDEILQSVCMLAQDQYGNYVVQHVLEHGKPHERSAIIKKLTGQIVQMSQQKFASNVIEKC
LTFGTPAERQALVDEMLGTTDENEPLQAMMKDQFANYVVQKVLETCDDQQLGLILNRIKV
HLNALKKYTYGKHIVLRVEKLVAAGERRISFLTLNPATA
NT seq
3000 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatcactgacacatattcaaaggttctgcctgatatctcaaagcgatcaatgctgaaa
aacgaggatttgagcaagctaattagagagcaaaggttgcaacaagaggcaacaagtgaa
atagagaaagaactcaatatttatcgaagtggttcagccccgcctacagtagaaggttct
ttaagttctattggaggcttatttgatggtacagggattcctggtatcaaaaatagcaat
agaggtggttttttgagtgaagaggtcctaaggtctgacccagcttatgttaattattat
tattcgaatgtgaacttgaatccaagattgcctcctccatcattgtcgaaggaggattgg
agatttgcacagagattacatggaagtggcggtggttctaattctgtggttggggataga
aggaggggaagtagaggcggcgaaaatgaagggcataggtcactttttgcagtgcagcca
gggtttggaggaggaatggaggagaatgggaatgagaatggagtggagtggggaggagat
gggcttattgggttgccgggattggggctgggaagtaggcaaaagagcattgcagagatc
attcagaatgatatgggtcatgcaaaccccatctcaaggcacccttcacgtcctgctagc
cgcaatgcattcgatgatgatatggaaacttctgaagctcagtttagtcagctgcatggt
gatttggcatcccttgatgctctacgctccagttcaaacaaacagggcatgtctgcagtt
caaaacattggtgcatcagcttctcatacctatgcttctgctttaggtgccaccttgtct
cgaagcaccacacctgaccctcagcttgtagcgagggctcctagccctcgcattccaccc
attggaggaggtaggaccaattccatggataaaagagatgtgagtggttcacactcattt
aatggcatctcaacaagcttcaatgattctgagctcgtagctgcattgtctgggttgaag
atgtcaacaaatggtttagttgatgaagagaaccactcacagtcacgaagccaacatgaa
attgatgatcgccataacctgttcaatttgcaaggtgatcaaaactatgtcaagcaacaa
tcatatttaaacaagtcatctgctagctcaaaccttaaattaccctcaactctgactctg
agtggtcgaggaggctctccttctaatcaccagaatgcagataacatgaattccccatat
gctaactatggcttcagtgggtatcctgtgaatccttcatcgccgtccatgataggaagt
gctcttgcgaatgggagtctgccacctttgtttggaaatgctgctgctgctgcaatggct
ggaagtgggttggattctcaagcactaggtgcaatagggccgaacttaatggcttcagca
gcagaattgcaaaatcttagtagatttgggaatcaaactgcaggtgtgcctcttgtggac
ccattatatcttcagtacttgagatcagatgagtatgcagctgcccagcttgcaactgcc
cagcttgcagctctcaatgaacccatgctggacagggagtatgttggtaatgcatatgat
ctcctccaaaagcttcaattagagacattgctgtcctctcaaaattcacagtatggtgtt
ccataccttggcaaatctggtagcttgaaccataattactatggaaacacaggatttggt
cttggcatgtcctattctggaagcccattaggggggcctgttcttccaaatttgcttgct
ggatctggtggtcctgtgaggcacagtgaacggaatatgcgtttttctcctgggatgagg
aatctgtctgggggtgtcatgggatcatggcattcagaagctggtagtaacctggatgaa
agttttccttcctctttactggatgagttcaaaagcaataaaactaaatgttttgaactg
tcagaaattgctggtcatgttgttgagttcagcgctgatcagtatgggagccgattcatt
caacagaagcttgagactgccacggcagaagagaataacatggtttttgatgaaattatg
ccccaagccctttcactaatgactgacgtttttggtaattatgtgattcagaagtttttt
gagcatggatctgcatcccaaataagagaactggctgatcagctaactggccatgtgctg
acccttagccttcaaatgtatggctgtcgtgttatccaaaaggctatagaagtggttgaa
ctggaccagcagactaaaatggtcacagagcttgatggtcatatcttgcgatgtgtacgt
gatcagaatggaaaccatgtcattcagaagtgtattgaatgtgtacctgaagatgccata
cagtttattgtttctacattttatgatcaagttgtgacgctgtccactcatccatatggg
tgccgtgtgatacagagagtgctggagcactgccatgacaccaaaacccagcgtataatg
atggatgagattttgcaatctgtttgcatgttggcacaagaccaatatggaaattatgtt
gttcagcatgtcctggagcatgggaaaccacatgagcgttcagcaataataaagaaatta
actgggcagatagttcaaatgagccagcagaagtttgcctccaatgtaatagagaaatgc
ttaacttttggcactcctgcagaacgccaggccctggtggatgagatgcttggcaccact
gatgagaatgagcccctacaggccatgatgaaagatcagtttgcaaattatgttgtacag
aaagtgctggaaacttgtgatgaccagcaacttggactcatactcaatcgaataaaagtt
cacttaaatgctctgaagaagtatacttatgggaaacatatagttctgcgtgtagagaaa
cttgttgcagctggagagaggagaattagcttccttactctgaatccagccactgcatag
DBGET
integrated database retrieval system