Polaribacter sp. ALD11: CW731_03015
Help
Entry
CW731_03015 CDS
T05264
Name
(GenBank) mechanosensitive ion channel protein MscS
KO
K16053
miniconductance mechanosensitive channel
Organism
poa
Polaribacter sp. ALD11
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
poa00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
poa02000
]
CW731_03015
Transporters [BR:
poa02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
CW731_03015
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MS_channel_2nd
MS_channel_3rd
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AUC84330
UniProt:
A0A2K8XNF4
LinkDB
All DBs
Position
713025..714287
Genome browser
AA seq
420 aa
AA seq
DB search
MKIAHLLYDYLVSTGISEASATYLNMFALLIAVLIISFLIDFIIKKIILQLFSQFALRSK
TNFDDLLIKNKVPRNIAHIMPLIFALECVPFVFIDYPYIENIVQKGLEVFTIVLILWIVR
SLLSSLKDYLKTVPRLKDKPIDSYIQVFMIFSWTFGILSAFAIITGIEFIKFITTIGAAS
AVIILIFKDTILGFVASIQVSINDMVRIGDWITFEKYGADGDVTEINLSTVKVQNFDKTI
TTIPTYALISDSFKNWRGMEDSDGRRIKRSLNINLDSIHYLSKEEVDNFKKIQSITTYLE
TRQANIDDYNKKNNINKELLLNGRNLTNIGVFRKYIETYIENHSGTNKEMMIMVRQLEPG
SQGIPLEIYTFSNDKRWKNYEYIMSDIFDHIIAAVPYFNLEIFELPSNSSFSIQKNNSPS
NT seq
1263 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaattgctcacctattatacgattatttagtatcaacaggaatttcagaggcatct
gccacatatctaaatatgtttgctttactaatagctgtattaataatttcatttttaatc
gattttatcattaaaaaaattattctacaattattttcgcagtttgctcttagaagtaaa
actaatttcgatgatttattaataaaaaataaagtgccacggaatatagcgcatatcatg
cctttaatttttgctttagagtgcgtacccttcgtgtttatagattatccgtatattgaa
aatatagttcaaaaaggattggaagtttttacaattgtacttatactttggattgtaaga
agcctattaagttctcttaaagattacttaaaaacagtacctcgtttaaaagacaaacct
atagatagctacattcaggtatttatgattttttcttggaccttcggaattttatctgcc
tttgcgattattacaggcatagaatttatcaaatttattaccactattggagctgcttcg
gcagtaattattttgatttttaaggataccatattaggttttgttgctagtattcaggtc
tctattaatgacatggtaagaattggagattggattacgtttgaaaaatatggtgcagat
ggtgatgttaccgaaattaatctatctaccgtaaaagttcaaaattttgataaaaccatt
actacaattcctacatacgctttaatttctgattcctttaaaaactggagaggaatggaa
gattctgatggaaggcgtattaaaagatctttaaatattaatttagatagtattcattat
ttatctaaagaggaagtagataattttaagaaaattcaatcgattaccacttacttagaa
actcgtcaggcaaatattgacgattataacaagaaaaataacatcaataaagaattactt
ttaaatggtagaaaccttaccaatattggtgtttttagaaaatatattgaaacttatata
gaaaatcattctggtacaaataaagaaatgatgattatggtacgtcaactagaaccagga
agccaaggaattcctttagagatttatacttttagtaatgataaacgttggaaaaattac
gaatacattatgtctgatatcttcgatcatatcattgcagctgttccttattttaattta
gaaatttttgaattgcctagtaattctagtttttcaattcaaaagaataattcaccttct
taa
DBGET
integrated database retrieval system
