Polaribacter vadi: LPB03_00415
Help
Entry
LPB03_00415 CDS
T04504
Name
(GenBank) SusC/RagA family protein
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
pob
Polaribacter vadi
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pob00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pob02000
]
LPB03_00415
Transporters [BR:
pob02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
LPB03_00415
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
EF-hand_5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AOW16012
UniProt:
A0A1B8TZX5
LinkDB
All DBs
Position
101447..104494
Genome browser
AA seq
1015 aa
AA seq
DB search
MRKKITLLLFTFITVLASAQTINVKGVVKDAISGEVLPGVSISIKGTTLGTETDFDGLYN
LPQISKGSILVFNYLGYKKKEVIVADSEMINVSLEQSTEALDEIVVIGYGTQKKKEVTGA
VAVVSSQTIDDLKPTRIEQALQGQVAGVNITQSSGSPGAASNIRIRGVSTNGDSRPLILL
DGRVIEDLSVVNPSDIESINILKDASAGIYGVRAANGVILVTTKTGRKNSDFKSILNMQI
GFQQTTREIPMLNGTEYALLANEAFAANGEALPFSNISGIGQGTNWQNQVFENAPTFNID
YTLNKGTEKSTYSFGLSVLSQDGIVGGDKANFNRSNLRFNYNTDILDNLKFTSSTIYTNT
NKKNLIENTLGSILFNAVNMPPTTPVRNPNGSFSQPPVIGTGIEVANPLAQIDNAENRTW
INKISGSYGLNYSFLDYFSVETRFQANYSVVNSNTFNPVYNYGNGSVFNNDISTFTDFQQ
SYFDYTFDAFAKYERVYNDVHDVKAMLGTSIFKSTSRFEKNLTSNASGTNINDVVLGNDV
LNGNGLEIFINNNNGSNLSFDSRLLSYFARLQYAYDGKYLFSAVIRRDGSSNFGPENKFG
FFPTASAGWVASEEDFLRDSDMISFLKLRASYGIIGNDRIPGFRFVSILNGESEYVFDNQ
LAQGLAIGPIANPEIKWEQQIPLNFGVDVELLNKVNITMDYFKKTTEDLLVSAQTSGIIG
VAAPGSLVPVVNAGTVVNKGFEFSIGYKDDISEDFRYNVNYNFTKLKNEVTFVGNQTGII
EGGSFGVGQEPPSRMEAGFPIGYFYGYQTNGLFQSQAEVNAHATQTNAAPGDLRFVDTNG
DGIIDPDDRTYIGDPIADITMGLNLSFNYKRFDFNAYAFVSLGNEIVRNYERNLPLTNRP
AYYLDRWTGAGTSDSFPRVTTGATSNNLFSDFYVEDGSFLRLQSVQLGYSVGQNLLDRLE
FDKVRFFVSATNLFTISDYKGYDPTTSNGSPIGGGIDQGFYPSPKTFLLGINVNF
NT seq
3048 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaaaaaaaatcacattactactatttacattcataactgttttggcaagcgctcaa
acaataaatgtaaaaggagttgttaaagatgccatttctggagaggttttaccaggagta
agtataagtattaaaggaactactttaggtacagaaacagactttgatggtttgtataat
cttcctcaaatatcaaaaggatcaattttagtttttaactatttaggatacaagaaaaaa
gaggttatagtagccgattctgaaatgataaatgtttctttagagcaatctacagaagct
ttagatgaaatagttgtaattggttatggtacacaaaagaaaaaagaagttactggagca
gttgcagtagtttctagtcaaaccatagacgatttaaaaccaacaagaatagagcaagcg
cttcaaggacaagttgcaggtgtaaatattacacagagttctggttctccaggtgcagct
tctaatattagaataaggggagtttctacaaatggagatagcaggccattaattttatta
gatggtagagttattgaagacttaagtgttgtgaatccatcagatattgaatctatcaat
atattaaaagatgcttctgcaggtatttatggtgttcgtgctgcaaatggtgttattcta
gtaactacaaaaacgggtagaaaaaattctgattttaaatcgatcttaaatatgcagatt
ggttttcagcaaactactagagaaattccaatgcttaatggaacagaatatgcgctttta
gcaaacgaagcttttgctgcaaatggagaagctttacctttttcaaatattagtggaatt
ggtcaaggtacaaattggcaaaatcaagtttttgaaaatgcaccaacttttaatatcgat
tataccttaaataaaggaacagaaaaatctacctattcttttggtttgtctgttttaagt
caagatggaattgtaggtggagataaagctaactttaatagaagtaatttaagattcaat
tataatacagatattttagacaacttaaagtttacatcatcaacaatatatacaaataca
aataagaaaaatcttatagagaatacactaggttctattttgtttaatgctgtaaacatg
ccaccaacaactccagttaggaatccaaatggtagtttttctcaaccaccagttattggt
acaggtattgaagtagcaaaccctttagcgcaaatagacaatgcagagaacagaacttgg
attaacaagatttctggaagttatggtttaaattatagttttttagattatttttcagta
gaaactagatttcaagcaaactactctgtagtaaattcaaacacatttaatccagtttat
aactatggaaatggaagtgtttttaataatgatatttctacgtttacagattttcaacaa
agttattttgattacacttttgatgcgttcgctaaatatgaaagagtatataatgatgtg
catgatgtaaaggcgatgcttggtacttctatatttaagagtacaagtaggttcgaaaaa
aatcttaccagcaatgcttcaggaacaaatattaacgatgtagttttaggaaatgatgtt
cttaatggaaatggtttagagatttttatcaataacaataatggtagtaatttaagtttt
gatagtcgtttactctcttattttgctagattacaatatgcttatgatggtaaatattta
ttttctgcagttataagaagagatggttcttcaaacttcggcccagaaaataaatttgga
ttttttccaacagcatctgcaggttgggtagcttcagaagaagattttttaagagattct
gatatgataagtttcttaaaattaagagcaagttatggtattattggtaatgataggatt
cctggatttagatttgtttctattttaaatggtgaatcagaatatgtctttgacaaccaa
ttagcacaaggattagctatagggccaattgcaaacccagagattaaatgggaacaacaa
attccattaaactttggagtagatgtagagcttttaaataaagtaaacattactatggat
tactttaagaaaactacagaagatttattggtttctgcacaaacatcaggaattattgga
gttgctgctcctggttctttagtgccagttgtaaatgcaggaactgtagtaaataaaggt
tttgaattttcaataggttataaagatgatatttcagaagactttaggtacaatgtaaat
tacaactttacaaaacttaaaaacgaagtaacatttgttgggaatcaaacaggaattata
gaaggaggaagttttggagttggtcaagaaccaccatcaagaatggaagctggttttcct
attggttatttctatggatatcaaacgaatggcttattccaaagtcaagcagaagttaat
gcgcatgcaacgcaaacaaatgcagctcctggagatttaagatttgtagatacgaatgga
gatggtataattgatcctgatgatagaacttatattggagacccgattgcagatataaca
atgggtttaaatttatctttcaattacaaaagattcgactttaatgcatatgcttttgta
tcattaggaaatgaaattgtaagaaattatgaaagaaacttacctttaacgaacagacca
gcttattatttagatagatggactggagcaggaacaagtgattcttttccaagagttaca
actggagcaactagcaacaatttattttcagatttttatgtagaagatggttctttctta
agattgcaaagtgtacaattggggtatagtgttggacaaaaccttttagatagattagag
ttcgataaagtaagattctttgtgtcagcaaccaacttatttaccataagtgattataaa
gggtatgacccaacaacatctaatggatctccaattggtggaggtatagatcaaggtttt
tacccaagtccaaagacatttttattaggaataaatgttaatttttaa
DBGET
integrated database retrieval system