Polaribacter vadi: LPB03_07655
Help
Entry
LPB03_07655 CDS
T04504
Name
(GenBank) tail-specific protease
KO
K03797
carboxyl-terminal processing protease [EC:
3.4.21.102
]
Organism
pob
Polaribacter vadi
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pob00001
]
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01002 Peptidases and inhibitors [BR:
pob01002
]
LPB03_07655
Enzymes [BR:
pob01000
]
3. Hydrolases
3.4 Acting on peptide bonds (peptidases)
3.4.21 Serine endopeptidases
3.4.21.102 C-terminal processing peptidase
LPB03_07655
Peptidases and inhibitors [BR:
pob01002
]
Serine peptidases
Family S41: C-terminal processing peptidase family
LPB03_07655
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TSP_NTD
Peptidase_S41
DUF3340
PDZ
PDZ_6
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AOW17342
UniProt:
A0A1B8U351
LinkDB
All DBs
Position
1709585..1711723
Genome browser
AA seq
712 aa
AA seq
DB search
MKTKFRFSIPFLAFFLLISSLSINASEVNSDVNNDPEKDKVLIYVLKNILTRGHFVVKDM
NDDFSEIVYNSFIDGLDPSKRYFTQADLKEFSKYKYKIDNQLLEDDLSFYKLVYGRFLHK
IKNAKSYYGDLLAQPFNFDENETIDLDFEKVPFAKNDNELIDYWRKQLKLQTLSRIEEQT
ALQKNKLEKDKNYKVKSFATLEKEARKEVLKNMDDLYIRIEELEHDDWFSTFLNSVVGAF
DPHTTYMDPTIKERFDQTISGKLEGIGARLQKKGIYTHVSDLVIGGPASKQGELEPDDII
LKVAQGDEEPLDIVGMRLDDAIKFIKGPKGTEVRLTVKKKLDGSIKVISIIRDVVQLDET
FVKSSIVEKNGKKYAIIDLPSFYIDFSDDNYRDSAKDMEKEIERLKAEGVVGLIVDLRNN
GGGSLKTAIEISGLFIDQGPIVQVKYRGEDPVVKKDIDPQIQWEGSVVVLVNEFSASASE
IFAAAMQDYKRAVILGGNQTYGKGTVQNILPINQFYPKYEKDLGYLKMTIQKFYRVNGGS
TQKEGVYSDIAMPSRYSYMKFGERDLDGALAWDKVPQAKYTQTNSYANFNDVVYNSKERI
ANDTNFKLVNEYAKWLKKSQDETTFSLNSKAFFTDSEAKEKDAGKFKSVFDYKSNLTFLS
PRYEQDLFKTNQDLADKRLAWHKNLAKDMYVSEALNVLSELKLRDKGEIVKN
NT seq
2139 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagacgaaatttagatttagcattccttttttagcattttttttattgataagcagt
ttatctataaatgcttctgaagtaaattctgatgtaaataatgaccctgaaaaagataag
gttttaatttacgtattaaaaaacattttaacgagaggtcattttgtagtaaaagacatg
aacgacgatttttctgaaattgtttataatagttttattgatggtttagacccaagtaaa
agatattttacgcaagcagacttaaaggaattctctaagtacaaatataaaattgacaat
cagcttttagaggatgatttatctttttataaattggtctatggccgttttttacataaa
attaaaaatgcaaaatcttattatggagatttattagcacaaccttttaattttgatgaa
aacgaaacgattgatttagattttgaaaaagttccttttgctaaaaatgataatgagtta
attgattattggagaaagcaattaaaactacaaacattaagcagaattgaagagcaaaca
gcattacaaaaaaataaacttgaaaaagataagaattacaaagtaaaatcttttgcaact
ttagagaaagaagcaagaaaagaagtcctaaaaaatatggacgatttatacataagaatt
gaagaattagaacatgatgattggttttctacttttttaaattcagttgttggtgctttt
gatcctcatacaacttatatggatcctacaattaaagagcgttttgaccaaactatttct
ggaaaattagaaggaattggagctcgtttgcagaaaaaaggaatctatacacatgtatct
gatttagtaattggtggtccagcttctaaacaaggagaattggaaccagatgatattatt
ttgaaagttgctcaaggagatgaagagcctctggatattgttggaatgcgtttagatgat
gccataaaatttattaaaggtcctaaaggaactgaagtacgattaacagttaagaaaaaa
ttagatggttctataaaagttatttctattattagagatgttgttcaactagatgaaact
tttgtaaaaagtagcattgtagagaaaaatggaaaaaaatatgcaattatagatttacca
agtttttacatagattttagcgatgataattacagagattctgcaaaagatatggaaaag
gaaattgaaagattaaaagcagaaggtgtagttggtttaattgtagatttaagaaataat
ggtggtggttctttaaaaacagccattgaaatttctggattgtttatagatcaaggacct
attgttcaagtaaaatatagaggagaagatcctgttgtaaaaaaagatatagatccacaa
attcagtgggaaggttctgttgtggttttggtaaatgaattttcggcatctgcatcagaa
atatttgcagcagctatgcaagattataaaagagcggttattttaggtggaaaccaaacc
tatggaaaaggaactgttcagaatattttacctatcaatcaattttacccaaaatacgag
aaagatttaggttacttaaaaatgaccattcaaaaattttatagagttaatggaggttct
acacaaaaagaaggtgtgtattcagatattgcaatgcctagtagatatagttatatgaag
tttggtgagcgtgatttagatggagctttggcttgggataaagtgccacaagcaaaatat
acgcaaactaattcctatgctaattttaacgatgttgtatataatagtaaagaaagaatt
gcaaacgataccaattttaaattggtaaacgaatatgcaaaatggttaaagaaaagccag
gatgaaactactttctctttaaattctaaagctttttttacagatagtgaggctaaagaa
aaagatgcaggtaaatttaaatctgttttcgattataaatcgaacctaacatttttatct
cctagatacgaacaagacttatttaaaaccaaccaagatttagctgataaaagattggct
tggcataaaaacttagcaaaagacatgtatgtttctgaagctttaaatgttttaagtgaa
ttaaagttaagagataaaggtgaaattgtaaaaaactaa
DBGET
integrated database retrieval system
