Polaribacter vadi: LPB03_09610
Help
Entry
LPB03_09610 CDS
T04504
Name
(GenBank) heparinase
KO
K20525
oligo-alginate lyase [EC:
4.2.2.26
]
Organism
pob
Polaribacter vadi
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pob00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09191 Unclassified: metabolism
99980 Enzymes with EC numbers
LPB03_09610
Enzymes [BR:
pob01000
]
4. Lyases
4.2 Carbon-oxygen lyases
4.2.2 Acting on polysaccharides
4.2.2.26 oligo-alginate lyase
LPB03_09610
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Hepar_II_III_C
Alginate_lyase
Alg17C_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AOW17699
UniProt:
A0A1B8TS61
LinkDB
All DBs
Position
complement(2175463..2177727)
Genome browser
AA seq
754 aa
AA seq
DB search
MKKFQALLFLVLITFSCTNKKEEVLVSVDDQQHPNLILTTKSVAEIKNQLGSIPLFDETL
KVAKQEVDAAIAIGIDVPMPKDMAGGYTHTQHKLNYANMQKAGVLFQLLGDEKYAVYVRD
MLLEYAKIFPTFKTHPEQRSYATGKFFWQCLNDSNWLTYTSQAYDCIYSWLPKEQSDYLN
ENLFKPYADFLSVENPKYFNRVHNHSTWGNVAVGMIGLVMDDEELINRALYGLEKSDVDL
TEKDNDGGFIFDKDGKAGFLANVDSPFSPDGFYTEGPYYQRYAMYPFLIFAEALQNKKPD
LKIFEYKNGVLIKAVDALLNLTDANGEFFPLNDGQKGMSYYTPSLISAVDIAYYYGSQDA
RLLSVAKKQGAVQLDATGLKVALALKNGEEKPFIKQSMELSDGSKGDEGGIGILRYNNED
QTMALVYKYAAQGLSHGHYDKLSFSMYENGNEVLQDYGLSRFVNVEQKNGGGYLKENKTY
AKHTIAHNTITQNEISHFDFDFETGSKNHPEKYVFDVADKNFQIVSAKEKNAYPGTEMHR
TFIMIKEDSLAKPFIVDINKVQSNKKNQYDLPFHYFGQIISTSFTYSVPKTLSTLGDKFG
YNHIWKEGSGTANAESIQFTWLDNRRFYTLTAATNKEDELILARVGANDPEFNLRKDPSI
IIRKKNTQNTVYASIIESHGIYDPVKEVAENAYSNFKNIKVLSDDANYTALKVQFKNDNE
KTIILSNLNTDKNKTHTVTINGNTYSWEGFYYYK
NT seq
2265 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaatttcaagcacttttatttctagtattaattactttttcttgtacaaataaa
aaagaagaagttttggtttctgttgatgatcaacaacatccaaacttaatattaaccact
aaaagtgttgctgaaattaaaaatcaattagggtcaattcctttgtttgatgaaacttta
aaagttgccaaacaagaagtagatgctgcaattgcaattggtatagatgtgccaatgcct
aaagatatggctggtggttatacacatactcagcacaaattaaattatgcaaacatgcaa
aaagctggtgttttatttcagcttttaggtgacgaaaaatatgcagtttacgttagagat
atgttgttggaatatgcaaaaatattcccaacatttaaaacgcacccagaacaaagaagt
tatgcaacaggtaaatttttctggcaatgtttaaacgattctaattggttaacttataca
agtcaggcttatgattgtatttattcttggttgccaaaagaacaatcagactatttaaat
gaaaatttatttaaaccttatgctgattttttatccgtagaaaacccaaaatattttaac
agagtgcacaaccattcaacttggggaaatgttgctgttggtatgattggcttggtaatg
gatgatgaggaattaataaacagagctttatatggtttagaaaaaagcgatgtagattta
actgaaaaagataatgatggtggttttatttttgataaagatggcaaagcaggtttttta
gcaaatgtagattctcctttttctcctgacggattttacacagaaggtccttattatcaa
agatatgcaatgtatccttttttaatttttgcagaagcacttcaaaataaaaaaccagat
ttaaagatttttgaatataaaaacggcgttttaataaaagctgtggatgctctattgaat
ttaacagatgcaaatggcgaattttttccattaaatgatggtcaaaaaggaatgtcttac
tatactccttctttaatttctgcagtagatattgcttattattatggaagtcaagatgca
agattattgtctgttgccaaaaaacaaggtgctgttcaactagatgcaactggtttaaaa
gttgctttggctttaaaaaatggcgaagaaaaaccatttataaaacaatctatggaattg
tctgatggctcaaaaggcgatgaaggtggcataggaattttacgctataataatgaagac
caaacaatggctttggtttacaaatatgcagcacaaggtttaagtcatggacattatgat
aaattatctttttctatgtacgaaaatggtaatgaagttttacaagattatggtttatca
agatttgtaaatgtggaacaaaaaaatggtggaggttatttaaaagagaataaaacctac
gcaaaacatacaattgcacacaatacaattacacaaaatgaaatttctcattttgatttt
gattttgaaactggaagcaaaaatcatccagaaaaatatgtttttgatgttgctgataaa
aattttcaaattgtaagcgcgaaggaaaaaaacgcatatcctggaactgaaatgcacaga
acttttatcatgataaaagaggatagtttagcaaaaccttttattgttgatatcaataaa
gtacaatccaacaaaaaaaatcaatacgatttacctttccattattttggacaaataatt
tctacaagttttacatatagtgttccaaaaaccttatcaacgttaggagataaatttgga
tataatcatatttggaaagaaggttctggaactgcaaatgcagaaagcattcaatttaca
tggttagataatagacgcttttatactttaacagcagcaaccaataaagaggatgaacta
attttagcaagagttggtgctaatgatcctgaatttaatttaagaaaagatccttcaatt
atcatcagaaaaaagaatactcaaaatacggtatatgcatcaattatagaatctcatgga
atatatgatcctgtaaaagaagttgcagaaaatgcctacagtaattttaaaaatataaaa
gttttaagtgatgatgccaattatactgcattaaaagttcaatttaaaaatgataatgag
aaaacaataattttatcaaacttaaatacagataaaaacaaaacacacacagtaactatc
aatgggaatacttattcttgggaaggtttttactactataaataa
DBGET
integrated database retrieval system
