KEGG   Polaribacter vadi: LPB03_09645
Entry
LPB03_09645       CDS       T04504                                 
Name
(GenBank) alginate lyase
  KO
K01729  poly(beta-D-mannuronate) lyase [EC:4.2.2.3]
Organism
pob  Polaribacter vadi
Pathway
pob00051  Fructose and mannose metabolism
pob01100  Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pob00001]
 09100 Metabolism
  09101 Carbohydrate metabolism
   00051 Fructose and mannose metabolism
    LPB03_09645
Enzymes [BR:pob01000]
 4. Lyases
  4.2  Carbon-oxygen lyases
   4.2.2  Acting on polysaccharides
    4.2.2.3  mannuronate-specific alginate lyase
     LPB03_09645
SSDB
Motif
Pfam: Chondroitinas_B Beta_helix
Other DBs
NCBI-ProteinID: AOW17706
UniProt: A0A1B8TS72
LinkDB
Position
complement(2185843..2188152)
AA seq 769 aa
MQKTFLLLSAILFFISCDKTATNTIHVSNSSELIDVAKKAKAGDHIIIKNGTYKNIALQF
IGEGTEENPINLSAETAGQVFLEGTSSLEISGNYLNVSGLFFRNGYSPKDNVIAFRTGSK
KVANNSTVSNCVILDYNSLERDQDNLWVQFYGKHNVLQNCYLAGKTNGGPTVRVDLKGNQ
SIRNYHKIVNNHFGPRPRKGGARGETIQLGSSFTSMSPSNTLIANNLFEECNGEVEIISS
KTNFNIIKNNVFYKSEGSVVTRHGNYVTIDGNYFIGDGINDQFGGIRIINTGHWVTNNLF
YKIKGKNFRSPIAIMNGIPKSPLNRYNQVTDVVVAYNTFVDSDSPFQFGVGTNITQAAVL
PKSEIRSARPLRTEVVNNVIYNSKGDANPIIEHDKADGVTFKSNIIDNNGVEIKNAHGLI
TKDLTLTDIGSNIAVPTTGFADVEVYKGFDFEVISNDLLGNSRSKSNQIGAILNVENINL
DVLDKTKYGANWFSNEVDKKEATTHKVTNADELITKLKAAESGDIIDLGLGLYQVDTSLI
IDKSITIKSSGDGKAQIVFSGMENTPLFELNPYGKLKIEKVILKGNNNNYLFATLKKKMS
NHFGLTVNYCEISNFKYALKVYKQSFAERITFEATSITNCENGLELSEETNDRGDYNTEY
LTIDGCTFNNVEQNVVDYYRGGYDESTIGGNLLITNSTFMNSGASEENSRLLNHNGIHNV
NINNNTFKNNKVEFVSILWGAKNNVESNNTIINSGKIKTEENLVQKLMY
NT seq 2310 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgcaaaaaacgttcctacttttaagtgctattttattttttatttcttgtgataaaaca
gcaacaaatacaattcatgtaagtaattcatcagaattaatagatgttgcaaaaaaggca
aaagcaggagatcatattataattaagaacggaacatataaaaacatagcacttcaattt
attggagaaggtactgaggagaatcccataaacttaagtgcagaaactgctggacaagtt
tttttagagggcacatcgagtttagaaattagcggaaattacctaaatgtaagtggcttg
ttttttagaaatggttactcacctaaagataatgtaattgcatttagaacaggttctaaa
aaagtagcaaataacagtactgtaagtaattgtgttattttagattataatagtttagaa
agagatcaagacaatctttgggtgcaattttatggaaaacacaatgttttacaaaattgt
tatttagcaggtaaaacaaatggagggccaactgttagagtagatttaaaaggaaaccaa
agtattagaaattaccataaaattgtaaataatcattttggaccaagacccagaaaagga
ggtgcaagaggagaaacaattcagttaggaagtagttttacgtccatgagtccaagcaat
acgttaattgcgaataatttattcgaagaatgtaatggagaagtagaaattatatcgagc
aaaaccaattttaacatcataaaaaataatgtgttttacaaaagtgaaggttctgtagtt
acaagacatggaaattatgtgactatagatggcaattattttataggtgatggaattaac
gatcaatttggtggtattagaattataaacacaggtcattgggttacaaataacctgttt
tataagataaaaggtaagaattttagaagtccgattgcaataatgaatggaattccaaaa
tcgcccttaaacagatacaatcaagttacagatgttgtggttgcttataatacatttgta
gattcagattcgccttttcaatttggtgtaggtacaaatattacacaagctgctgttttg
ccaaaatcggaaattcgttctgcaaggcctttaagaactgaagttgttaataatgtaatc
tataattctaaaggtgatgcaaacccaattattgagcatgataaagctgatggagtaact
tttaaaagcaatattatagacaataatggtgttgaaattaaaaatgcacatggtttaatt
actaaagatttaacgttaacagatattggttccaatattgctgttccaacaactggtttt
gctgatgttgaagtatataaaggtttcgattttgaagtgatttcgaatgatttattaggg
aattctagaagcaaatcaaatcaaattggtgcgattttaaatgttgagaatatcaattta
gatgtattagataaaactaaatatggtgcgaattggttttctaatgaagttgataaaaaa
gaagcaacaactcataaagttacaaatgctgatgaattaattactaaattaaaagctgca
gaaagtggcgatattattgatttaggtttgggtctatatcaagtagatacatctttaatt
attgataaatcaattactataaaaagttcaggagatggaaaagctcaaatcgttttttca
ggaatggaaaacacacctttgttcgaattaaatccttatggaaaattaaaaattgaaaaa
gtaattttaaaaggaaacaataacaactatctttttgcaacattgaaaaagaaaatgtca
aatcactttggattaacagttaactattgtgaaatcagcaattttaagtatgctttaaaa
gtttataaacaatcttttgcagaaagaatcacattcgaagctacttcaattacaaactgt
gaaaatggtctagaattatctgaagaaacaaatgatagaggagattataacacagaatat
ttaacgatagatggttgtacgtttaataatgtagaacaaaacgtggttgattattataga
ggtggttatgatgagtctaccattggtggaaatcttttaattaccaactccacatttatg
aattctggagcatcagaagaaaacagcagactcttaaatcataatggaattcacaatgta
aatatcaataataatacttttaaaaataataaagttgagtttgtttctattctttggggt
gcaaaaaataatgtggaatctaacaacacaatcattaattctgggaaaattaaaaccgaa
gaaaatttagtgcaaaaattgatgtattaa

DBGET integrated database retrieval system