Polaribacter vadi: LPB03_09645
Help
Entry
LPB03_09645 CDS
T04504
Name
(GenBank) alginate lyase
KO
K01729
poly(beta-D-mannuronate) lyase [EC:
4.2.2.3
]
Organism
pob
Polaribacter vadi
Pathway
pob00051
Fructose and mannose metabolism
pob01100
Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pob00001
]
09100 Metabolism
09101 Carbohydrate metabolism
00051 Fructose and mannose metabolism
LPB03_09645
Enzymes [BR:
pob01000
]
4. Lyases
4.2 Carbon-oxygen lyases
4.2.2 Acting on polysaccharides
4.2.2.3 mannuronate-specific alginate lyase
LPB03_09645
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Chondroitinas_B
Beta_helix
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AOW17706
UniProt:
A0A1B8TS72
LinkDB
All DBs
Position
complement(2185843..2188152)
Genome browser
AA seq
769 aa
AA seq
DB search
MQKTFLLLSAILFFISCDKTATNTIHVSNSSELIDVAKKAKAGDHIIIKNGTYKNIALQF
IGEGTEENPINLSAETAGQVFLEGTSSLEISGNYLNVSGLFFRNGYSPKDNVIAFRTGSK
KVANNSTVSNCVILDYNSLERDQDNLWVQFYGKHNVLQNCYLAGKTNGGPTVRVDLKGNQ
SIRNYHKIVNNHFGPRPRKGGARGETIQLGSSFTSMSPSNTLIANNLFEECNGEVEIISS
KTNFNIIKNNVFYKSEGSVVTRHGNYVTIDGNYFIGDGINDQFGGIRIINTGHWVTNNLF
YKIKGKNFRSPIAIMNGIPKSPLNRYNQVTDVVVAYNTFVDSDSPFQFGVGTNITQAAVL
PKSEIRSARPLRTEVVNNVIYNSKGDANPIIEHDKADGVTFKSNIIDNNGVEIKNAHGLI
TKDLTLTDIGSNIAVPTTGFADVEVYKGFDFEVISNDLLGNSRSKSNQIGAILNVENINL
DVLDKTKYGANWFSNEVDKKEATTHKVTNADELITKLKAAESGDIIDLGLGLYQVDTSLI
IDKSITIKSSGDGKAQIVFSGMENTPLFELNPYGKLKIEKVILKGNNNNYLFATLKKKMS
NHFGLTVNYCEISNFKYALKVYKQSFAERITFEATSITNCENGLELSEETNDRGDYNTEY
LTIDGCTFNNVEQNVVDYYRGGYDESTIGGNLLITNSTFMNSGASEENSRLLNHNGIHNV
NINNNTFKNNKVEFVSILWGAKNNVESNNTIINSGKIKTEENLVQKLMY
NT seq
2310 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaaaaacgttcctacttttaagtgctattttattttttatttcttgtgataaaaca
gcaacaaatacaattcatgtaagtaattcatcagaattaatagatgttgcaaaaaaggca
aaagcaggagatcatattataattaagaacggaacatataaaaacatagcacttcaattt
attggagaaggtactgaggagaatcccataaacttaagtgcagaaactgctggacaagtt
tttttagagggcacatcgagtttagaaattagcggaaattacctaaatgtaagtggcttg
ttttttagaaatggttactcacctaaagataatgtaattgcatttagaacaggttctaaa
aaagtagcaaataacagtactgtaagtaattgtgttattttagattataatagtttagaa
agagatcaagacaatctttgggtgcaattttatggaaaacacaatgttttacaaaattgt
tatttagcaggtaaaacaaatggagggccaactgttagagtagatttaaaaggaaaccaa
agtattagaaattaccataaaattgtaaataatcattttggaccaagacccagaaaagga
ggtgcaagaggagaaacaattcagttaggaagtagttttacgtccatgagtccaagcaat
acgttaattgcgaataatttattcgaagaatgtaatggagaagtagaaattatatcgagc
aaaaccaattttaacatcataaaaaataatgtgttttacaaaagtgaaggttctgtagtt
acaagacatggaaattatgtgactatagatggcaattattttataggtgatggaattaac
gatcaatttggtggtattagaattataaacacaggtcattgggttacaaataacctgttt
tataagataaaaggtaagaattttagaagtccgattgcaataatgaatggaattccaaaa
tcgcccttaaacagatacaatcaagttacagatgttgtggttgcttataatacatttgta
gattcagattcgccttttcaatttggtgtaggtacaaatattacacaagctgctgttttg
ccaaaatcggaaattcgttctgcaaggcctttaagaactgaagttgttaataatgtaatc
tataattctaaaggtgatgcaaacccaattattgagcatgataaagctgatggagtaact
tttaaaagcaatattatagacaataatggtgttgaaattaaaaatgcacatggtttaatt
actaaagatttaacgttaacagatattggttccaatattgctgttccaacaactggtttt
gctgatgttgaagtatataaaggtttcgattttgaagtgatttcgaatgatttattaggg
aattctagaagcaaatcaaatcaaattggtgcgattttaaatgttgagaatatcaattta
gatgtattagataaaactaaatatggtgcgaattggttttctaatgaagttgataaaaaa
gaagcaacaactcataaagttacaaatgctgatgaattaattactaaattaaaagctgca
gaaagtggcgatattattgatttaggtttgggtctatatcaagtagatacatctttaatt
attgataaatcaattactataaaaagttcaggagatggaaaagctcaaatcgttttttca
ggaatggaaaacacacctttgttcgaattaaatccttatggaaaattaaaaattgaaaaa
gtaattttaaaaggaaacaataacaactatctttttgcaacattgaaaaagaaaatgtca
aatcactttggattaacagttaactattgtgaaatcagcaattttaagtatgctttaaaa
gtttataaacaatcttttgcagaaagaatcacattcgaagctacttcaattacaaactgt
gaaaatggtctagaattatctgaagaaacaaatgatagaggagattataacacagaatat
ttaacgatagatggttgtacgtttaataatgtagaacaaaacgtggttgattattataga
ggtggttatgatgagtctaccattggtggaaatcttttaattaccaactccacatttatg
aattctggagcatcagaagaaaacagcagactcttaaatcataatggaattcacaatgta
aatatcaataataatacttttaaaaataataaagttgagtttgtttctattctttggggt
gcaaaaaataatgtggaatctaacaacacaatcattaattctgggaaaattaaaaccgaa
gaaaatttagtgcaaaaattgatgtattaa
DBGET
integrated database retrieval system