KEGG   Polaribacter vadi: LPB03_10130
Entry
LPB03_10130       CDS       T04504                                 
Name
(GenBank) hypothetical protein
  KO
K01728  pectate lyase [EC:4.2.2.2]
Organism
pob  Polaribacter vadi
Pathway
pob00040  Pentose and glucuronate interconversions
pob01100  Metabolic pathways
pob02024  Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pob00001]
 09100 Metabolism
  09101 Carbohydrate metabolism
   00040 Pentose and glucuronate interconversions
    LPB03_10130
 09140 Cellular Processes
  09145 Cellular community - prokaryotes
   02024 Quorum sensing
    LPB03_10130
Enzymes [BR:pob01000]
 4. Lyases
  4.2  Carbon-oxygen lyases
   4.2.2  Acting on polysaccharides
    4.2.2.2  pectate lyase
     LPB03_10130
SSDB
Motif
Pfam: CBM77 Pectate_lyase_4 Por_Secre_tail DUF7189
Other DBs
NCBI-ProteinID: AOW17790
UniProt: A0A1B8TSP6
LinkDB
Position
2309942..2312215
AA seq 757 aa
MKKNILTLLLFIGTTASIFSQSVNITEAEGWLESGFIKWEPIANAESYNVYFTGEGKTDV
KIDTQLIRNYGTYYRADALGLKAGTYTLKVAPVIAGTEQTATISSVINVQAYDRTGFAFS
NSRVPGAYKIDGTPKDNAVVLYITQNTKNTISLDVNGANANPCIGLETILEGYKKGSDNR
PLIIRLIGQITDLAYMDKGDIVIENNNNIASYITLEGVGDDAVADGWGIRIKNASNVEVR
NIATMNCNSDEGDNIGLQQGNDYIWIHNNDFFYGDAGGDADQAKGDGALDCKKSTYVTFS
YNHFWDSGKANLLGLSEGTTEGLFITYHHNWFDHSDSRHPRVRFYSAHVYNNYYDGNSKY
GVGSTEGSSVFVEANYFRNCKFPMLTSMQGSDVFNTGTQKNDYNNYPTFSKEDGGTIKAF
NNFISGANRFIAYGDASSAAFDGTKDFDAYVASTRNETIESTIKSNFGANSYNNFDTNAS
IMYSYSPDSPENAKDNVIQYSGRIQGGDLKFTFNNASEDTSSSVNSALKALLTNYKTNLV
SVQGDGEGSGNGDDGGDSGSTPGDEVHNFTTSGTTSTFYTIAGNLSTSKGDAHYNNLTLT
QCLKMESSTSISFATTEESKMILVFNDGFNGTIKLNGEKKDIVNGVLDLIIPAGNYTLTK
DVTTNLYYMSVKSTAALNVEKLGLSALVLYPNPVKDYLRLSSPNKISKIQVYNMLGAVVK
TIEINTEKIDLSHLKKGTYLIKFYGENSAVNKIIIKE
NT seq 2274 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaaaaaaatatacttactttattgttgtttataggaacaactgcttcaatattttca
caatctgtgaatattacagaagctgaaggttggttagaatctggatttataaaatgggaa
cctattgccaacgcagaaagttataatgtgtattttactggtgaaggaaaaaccgatgtt
aaaatagatacacaacttattcgtaattatggaacctactatagagcagatgccttagga
ttaaaagctgggacttataccttaaaagtagcacccgttattgctggaactgagcaaacc
gctacaatttcaagtgtaattaacgtacaagcttatgatagaacaggttttgctttttct
aatagtagagttcctggtgcgtataaaatagatggtactccaaaagataacgctgttgtt
ttatatattacacaaaacacgaaaaatacaatttctttagatgtaaatggagcgaatgca
aatccttgtataggtttagaaactatcttagaagggtataaaaaaggctcagacaataga
cctttaattataaggttaataggtcaaataactgatttagcatatatggataaaggtgat
attgttatagaaaacaacaataatattgctagttatattactttagaaggtgttggtgat
gatgctgttgctgatggttggggaattcgtattaaaaatgcgtctaatgtagaagttaga
aacattgcaactatgaattgcaatagcgatgaaggagataatattggcctgcaacaagga
aatgattatatctggattcataacaacgatttcttttatggtgatgcaggaggagatgct
gatcaagcaaaaggcgatggtgctttagattgtaaaaaatcaacctatgttacattttct
tacaaccatttttgggattctggaaaagcaaatttattgggtttgagtgaaggaacaaca
gaaggtttattcataacatatcatcataattggtttgatcattcagattcacgtcatcca
agagtacgtttttattctgcacatgtttataataattattatgatggaaactctaaatat
ggtgttggctcaacagaaggttcctctgtatttgtagaagcaaattattttagaaactgt
aaatttccgatgttaacttctatgcaaggatctgatgtttttaatacaggaacacaaaag
aatgattacaataattacccaactttttcaaaagaagatggtggtaccatcaaagctttt
aataattttatttctggagcaaataggtttatagcttatggtgatgctagttctgctgca
tttgatggtacaaaagattttgatgcctatgttgcatcaacaagaaacgaaacgattgag
agtactataaaatctaatttcggagcaaattcttacaataactttgatacaaacgcttct
ataatgtattcatatagtccagattcaccagaaaatgcaaaagataatgtgatacagtat
tctggaagaattcagggaggtgacttaaaatttacgtttaacaatgcttctgaagataca
tcatcctctgtaaattctgctttgaaagctctattaacaaattacaaaactaatttggtt
tctgttcaaggtgatggagaaggttctggaaatggtgatgatggaggagattcaggaagc
actcctggagatgaagtacataattttacaacatctggaacaacaagtactttttataca
attgcaggaaatttatcaacttctaaaggtgatgcccattataataatcttacgttaaca
caatgtttaaaaatggagtctagcacaagtatttcatttgcaactactgaagaaagtaaa
atgattttagtttttaacgatggctttaatggtactataaaattaaatggagagaaaaaa
gacattgtaaatggagtgttagatcttataatacctgcaggtaattatacccttactaaa
gatgttactacaaatctttactatatgagtgtaaaatcaacagctgctcttaatgttgaa
aagttagggttatcagcgttagttttatatccaaatcccgttaaagattatttaagactg
tcttctccaaacaaaataagtaaaatacaagtatataatatgcttggtgcagtggttaaa
acaatcgaaataaatactgagaaaatagatttatctcatcttaaaaaaggaacttatttg
atcaaattttatggagagaatagtgctgtaaataaaataattattaaagagtaa

DBGET integrated database retrieval system