KEGG   Paenibacillus odorifer: PODO_28870
Entry
PODO_28870        CDS       T03326                                 
Name
(GenBank) Swarming motility protein SwrC
Organism
pod  Paenibacillus odorifer
SSDB
Motif
Pfam: ACR_tran SecD_SecF_C DUF4824
Other DBs
NCBI-ProteinID: AIQ76907
LinkDB
Position
6417361..6420528
AA seq 1055 aa
MKSLINFSLRNKFAIWLLTIIIVFAGLYSGLTMKQETLPNISIPYLSVTTIYPGAAPEGV
VNDVSKPLEQKLRNVDGVKTITSTSLENASSIQIEFDYGTNLDNATAAVRESLNEVSLPD
NVQKPSISRFSLSSMPVVSLSLSNGDTQDLEELTRIAENDIRPALEDVEGVASIQISGQY
VKEVSLKFNQDKLSQYGLTEDTVKGIIQGSSLRVPLGLFEMDKAQKAVVVDGNITTVEDL
KNVTIPVMPTGANAAGAAGAGATGAGAANGAAGAGAGNAAPGGAASMGLPTVKLGELATI
EVVGNSESISRTNGKESIGIQIVKANDANTVDVVNGVKDKTEELKAQYKGIDLTVLLDQG
KPIEDSVNTMLSKAVFGALFAVIIILVFLRNIRSTIISIISIPLSLLIAVLCLRQMNITL
NMMTLGAMTVAIGRVVDDSIVVIENIYRRLSLSGEKLKGRELISAATREMFVPIMSSTIV
TIAVFLPLALVSGMVGELFLPFALTMVFALLASLVVAITLVPAMAHSLFRNGLKGKKTHS
EKPDKLSAGYQKILNWCLSHKLVTFGVAVLLLAGSLFLIKPIGVSFMPSQEDKTVMLTYS
PKAGQRIEEVQEQGLKAEKYILAQKHIDKMQYSIGGGSPMGMGGSSNSGLFFIVYDSDTP
DFEAVKEKLIEGLTAEVPDGVWGDMSALMSGGMGGSTLTVNVFGDELDQLKPVADEIASI
VQADTTNFKDAETSLKEAYDQYTIVADQQKLSSLGLTAGQIAMKLSPAGTRPVLTEVELD
GKNYKVYIETDKETYKSIKEMEEATLTSPLGISVPIGQVAKIENGSSPDSITRMDGKMKV
DVTAEIISSDVNSASNSVKEKVDAMELPDGVTVTFGGVTEQINDTFGQLGIAMAAAIAIV
YFVLVVTFGGGLAPFAILFSLPFTVIGVLVALLIAGETLNVSSLMGALMLIGIVVTNAIV
LIDRVIHKEKEGLTTRQALLEAGGTRLRPILMTALATIGALLPLVTGLENSAGIISKGLG
VTVIGGLVSSTLLTLVVVPVVYEFLMKFRSKKVID
NT seq 3168 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaaagcttaattaatttctcgctcaggaacaaatttgccatttggcttctgacgata
attattgtgtttgccggtttatatagcggactgacgatgaagcaagaaaccttgcctaat
attagtataccctatcttagcgtaacaaccatttatccgggggccgcaccagaaggcgtc
gttaatgatgtcagcaaaccgttggagcaaaagctccgcaatgtggatggtgtaaagacg
atcacctccacttctctggagaatgcctccagtatccaaattgaattcgattacggaaca
aatctggataatgctacagcagcagtgcgcgaatcgctaaatgaggtctcattgccagac
aatgtgcagaagccttccatttcccgttttagccttagctcaatgcctgtcgtttcgctc
agtctttccaatggagatacccaggaccttgaggaattgacacgtattgctgagaacgat
attcgcccagccctagaggatgttgagggtgtggcttctattcaaatctctggtcaatac
gtcaaagaagtatcacttaaattcaatcaagataagctcagccaatatggactgactgaa
gataccgttaaaggtatcattcaaggctcttccctccgtgttccactaggactattcgag
atggacaaggctcaaaaggcagttgtcgtggacggcaacatcactaccgttgaagatctt
aaaaatgtgaccataccggtaatgccaactggcgctaacgctgcaggtgctgcaggtgct
ggagctaccggcgctggtgctgctaacggagctgctggtgcaggtgctggaaatgctgct
cctggcggagctgcaagtatgggacttccaaccgtgaagctcggagagttggccacgatt
gaggttgtggggaattccgaatccatctcccgtacaaatggtaaagaatcgatcggtatt
cagattgtcaaagccaatgatgccaacactgttgatgttgtaaatggcgttaaagacaaa
actgaagaattaaaagcacaatataaaggcattgaccttactgttctgcttgaccaaggt
aagcccattgaggactccgtaaatacgatgttgtccaaagctgtgtttggtgccttattc
gcagtaattatcattttggtgttcctgcggaatattcgttcgacgattatttctatcatc
tctattccattatccctgctgattgcagtgctgtgtctgcggcagatgaacattacgctt
aatatgatgacacttggagcgatgacggtcgcgatcgggcgggtagtcgatgactcgatt
gtagttatagagaacatatatcgacggctctccttatctggtgagaaactgaagggcaga
gaattaatcagtgcagccacgcgtgaaatgttcgtgcctatcatgtcctctacaattgta
accatcgcggtgttcttaccacttgctttggttagtggtatggttggtgagctgttcttg
cctttcgctctaaccatggtcttcgccctgctcgcttcattagtagttgcgattacccta
gttcctgcaatggctcactcgttgttccgtaatggattgaaaggtaaaaaaactcacagc
gagaaaccagacaaactttctgctggttatcaaaagattctgaactggtgtctttctcat
aaactcgttacgtttggagttgccgttcttctccttgcgggcagcttattcttaatcaag
cctattggtgtaagcttcatgccatcccaagaggataaaactgtaatgcttacttattca
ccaaaggctggacaacggattgaggaagttcaagaacaaggtctgaaagctgaaaaatac
attttagcgcagaagcatatagacaaaatgcaatattccatcggcggtggaagcccgatg
ggtatgggtggatccagcaattcaggactatttttcatcgtttatgatagtgatactcct
gatttcgaagctgttaaagagaaacttattgaaggtttgaccgcagaagtgccagatggt
gtatggggtgacatgtccgctctgatgagtggaggtatgggtggaagcactctaaccgtg
aatgtattcggagatgaactggatcagctgaagccggtcgcggatgagattgcctcaatc
gtacaggctgacaccactaatttcaaagacgcggaaacaagtctcaaagaagcatacgat
caatatacgattgtagcggatcaacagaagcttagctcccttggacttacagccggacaa
attgcgatgaagctgagtccagcaggcacgcgtccagtgctcacagaagtagaattggac
ggcaagaactacaaagtctatatcgaaacagataaagaaacgtacaagagcattaaagaa
atggaagaggctactttgacatcgccactaggcatctccgtgccaatcgggcaagtcgct
aaaattgaaaatggctcctcccctgactcgattactcgtatggacggtaaaatgaaggta
gatgttactgccgaaattatttcgagtgacgtgaatagcgcttcgaacagcgtgaaagaa
aaagtagatgctatggaattgcctgatggtgtaactgttaccttcggcggtgtaaccgag
cagatcaatgatacgtttggtcaattaggaattgctatggcggccgctattgccatcgta
tacttcgtgcttgtggttacatttggcggtggattagcaccattcgctatcctgttctca
cttcctttcacagtgattggggtactcgttgccttgctgatcgctggggaaaccttaaac
gtgtcctcgctcatgggtgcgctgatgttgattggtatcgtagtaacgaatgcgattgtc
ctcatcgaccgcgttattcataaggaaaaagaaggactcactacgcgtcaagccttgctt
gaagcaggtggcacacgtttacgtccaatcctgatgactgcccttgcaacgattggtgca
ttgctgccattggttactggacttgaaaatagtgcaggaattatctctaaggggctcggc
gtgaccgtaatcggtggtttggtcagttccacgctgctgacacttgtagtagtgccagtc
gtgtatgaattcctgatgaaattccgcagcaaaaaggtaattgattag

DBGET integrated database retrieval system