Polaribacter sp. BM10: BXQ17_01930
Help
Entry
BXQ17_01930 CDS
T04746
Name
(GenBank) ABC transporter
KO
K18889
ATP-binding cassette, subfamily B, multidrug efflux pump
Organism
pola
Polaribacter sp. BM10
Pathway
pola02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pola00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
BXQ17_01930
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pola02000
]
BXQ17_01930
Transporters [BR:
pola02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCB (MDR/TAP) subfamily
ABCB-BAC subgroup
BXQ17_01930
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_membrane
ABC_tran
SMC_N
nSTAND3
DUF87
KAP_NTPase
AAA_29
DUF815
AAA_18
RsgA_GTPase
DEAD
DUF2207_C
Zeta_toxin
MMR_HSR1
AAA_5
AAA_16
AAA_22
DUF4014
AAA_23
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AQS92900
LinkDB
All DBs
Position
complement(447954..449708)
Genome browser
AA seq
584 aa
AA seq
DB search
MKALKYINKYFIKYKWRLLIGILITILSKLLALKVPQIVGDSLNIVEDYQNGTITDIELV
KHQLLINVLIIIGVAILAGFFTFLMRQTIIVTSRLIEFDLKNEIYQQYQRLSLNFYKKNR
TGDLMNRISEDVSKVRMYVGPAVMYSMNMIVLLVVGFTQMINIDVKLTMYTLIPFPVLSI
SIFVLSKVIHKRSSIVQEYLSKLTTFNQEFFSGIGVVKSYGIEKSIIKDFDEIADKSKEK
NIHLQQANALFFPLMVLLIGLSNIIVIYIGGQQYINDEIQIGTIIEFMLYVNILTWPVAV
IGWVTSMIQQAEASQVRINEFLEQVPDIENNNTKPTVLNGKVEFKDVTFTYEDTNITALK
NINFTAEPGETIAILGKTGSGKSTIIELIARLYDTKEGLILIDNKPIEQANLNDVRNQIG
FVPQDPFLFSESIGDNIKFGKEDATEEQIIQAAKDADVHKNIIDFPNKYDTVLGERGVTL
SGGQKQRVSIARAIIKNPKILIFDDCLSAVDTETEEKILTNLKRVSKNKTTFIISHRVSS
AKNADKIIVLDDGKISQQGTHNQLITEKGYYKDLYEQQLLEKEN
NT seq
1755 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgaaagctctaaaatatataaataagtactttataaagtataaatggcgtttattaatt
ggtattttaattaccattttatctaaattacttgcacttaaggttccgcaaattgttggt
gattctttaaatattgtagaagattaccaaaacggaacaattaccgatatcgaacttgta
aaacatcaacttttaattaatgtattgataattattggtgtagcaattttagctggtttt
tttacttttttaatgagacaaaccattattgtaacttctagattaatagagttcgattta
aaaaacgaaatctatcaacaataccaacgcttatctttaaatttttacaaaaaaaataga
acaggagatttaatgaatagaatttctgaagatgtttctaaagtaagaatgtacgttggt
cctgcagtaatgtatagcatgaatatgattgttttgcttgtagttggttttactcaaatg
ataaatattgatgtaaaactaaccatgtatacattaatcccttttcctgttttatcaatt
tctattttcgttttaagtaaagtaattcacaaaagaagtagtattgtacaagaatattta
tcaaaattaaccacttttaatcaagagtttttctctggaattggtgtggtaaaatcttac
ggaatagaaaaatctattatcaaagattttgatgaaattgctgataaaagcaaagagaaa
aacattcatttacaacaagcaaatgcacttttttttccgttaatggtacttcttattggt
ttaagcaatattattgttatttacattggtgggcaacaatatataaatgatgaaattcaa
attggtacaattatagaatttatgctttatgtaaatattttaacttggcctgttgcagta
ataggttgggtaacttctatgatacaacaagcagaagcttcgcaagttcgaattaacgag
tttttagaacaagtgccagatattgagaataataacacaaaaccaacagttttaaacggt
aaagtagaatttaaagacgtaacctttacctatgaagacacaaatattacggcattaaaa
aatattaattttaccgcagaaccaggtgaaacaatcgctattttaggaaaaactggttct
ggaaaatctacaattatagagcttattgcaagattatacgacacaaaagaaggtttaatt
ttaattgataataaaccaattgaacaagcaaaccttaatgatgttagaaatcaaattggt
tttgttccacaagatccgtttttgttttctgaaagtattggtgacaatattaaattcgga
aaagaagatgcaacagaagaacaaattatacaagctgcaaaagatgcggatgttcataaa
aatattatcgatttcccgaacaagtatgatactgttttaggagaaagaggtgtaacatta
tccggaggacaaaaacaaagagtttctattgcaagagcaattattaagaatcctaaaatt
ttaatttttgatgattgtttgtctgcagtagacacagagactgaagaaaaaatactaaca
aatttaaaaagagtttctaaaaacaaaaccacttttattattagtcatagagtttcttct
gctaaaaatgctgataaaataattgtattagacgatggtaaaatcagtcaacaaggtact
cataatcaattaataacagaaaaaggctattataaagatttatacgaacaacaactttta
gaaaaagaaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system