Polaribacter sp. BM10: BXQ17_08820
Help
Entry
BXQ17_08820 CDS
T04746
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
pola
Polaribacter sp. BM10
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_14
LRR_4
LRR_8
LRR_1
LRR_R13L1-DRL21
Por_Secre_tail
LRR_13
LRR_Zer-1
LRR_LRWD1
LRR_EndoS
Ig_2
Ig_3
ig
I-set
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AQS94157
LinkDB
All DBs
Position
complement(1971599..1979089)
Genome browser
AA seq
2496 aa
AA seq
DB search
MRGKLLLIFAFISITINAQISQTERQALIDFYNATDGANWTNNTNWNTDINITSDVSNWY
GVTVTEINGQDYVTEINLSNNNLNGSFSSLVNLSNITSVDFSENMSFSGGVNFDNYAATI
DNVKLNNTGITSLKLHKYVTLNIKDVPNLNCVEVPSSSINSYHSLSMNNFDLGIKITDNC
SGVLPLDATEKAALKAIFNTTNGTAWSYNNYGSTEIVANTNPEDLRGIVTKDFGTVRRIT
KLFFHGMGLNGGLPVEIGDFSELLELKLSQNQISSIPNEIGGLSKLNHLDVSINNTLTTI
PSTVGDLVELISLKFNTTQVDLLPTTIENLLKLEILELGSTKITLLPPQIGNLAELTRLV
AAPNNIASIPTELGQLSKLTYLDFSNCKLSNTPTAFANLTNLETLYLNNNELQVVAGLGG
FTKLKHLRLHNNRLGEDNPNFNTDLPEDLSDLVLLEELTLYSNQLTKLPSNIGALLNLTS
LKIYNNRLTFLPNSIGNLTDLKELQVQGNELTSLPATIGGLTNLEKLYLSQSSNSNKIAT
LPAEIGDLSNLKELYLENMQTYDSSTGTYTYYLTSLPSTMNQLTNLEVLEAENNEIGGLV
DLTNVIKLKRLQLNNNKIEDLKIDAPVINFSLSSNPTYHFNISNNPYLSCVEVPTAEVTN
WETRYAQRPQIADNGIAFSDSCSGFRVPQSEREALVALYIATNGGDKVDATIGVTWVGTN
WSSDATELTNVGSWQGVTTEIINGQKHVTKIELISNQLSGVVPKEIADLPELTLLNLSSG
KITSVATEIGGLSKLTHLNLSSNSLESLPVGIGDFTSLVELNLSYQRINTNTSQYTSTLT
TLPNEIGNIATLEKLDLSYNGLTSLPSGIGNFTSLKELRLNNQTTSPVRYQPTNTLSSLP
DEIGNITSLEKLYLQNNIIANIPSTINGLTSLKELQLQGNELTSLPATIGGLTNLEKLYL
SQSSNSNKIATLPAEIGDLSNLKELYLENMQTYDSSTGTYTYYLTSLPSTMNQLTNLEVL
EAENNEIGGLVDLTNVIKLKRLQLNNNKITDLKIDAPVINFSLSSNPTYHFNISNNPYLS
CVEVPTAEVTNWETRYAQRPQIADNGIAFSDSCSGFRVPQSEREALVALYIATNGGDKVD
ATTGVTWVGTNWSSDATELTNVGSWQGVTTEIINGQKHVTKIELISNQLSGVVPKEIADL
PELTLLNLSSGKITSIATEIGGLSKLTHLNLSSNSLESLPVGIGDFTSLVELNLSYQRIN
TNTSQYTSTLTTLPNEIGNIATLEKLDLSYNGLTSLPSGIGNFTSLKELRLNNQTTSPVR
YQPINTLSSLPDEIGNITSLEKLYLQNNIIANIPSTINGLTSLKELQVQGNELTSLPATI
GGLTNLEKLYLSQSSNSNKIATLPAEIGDLSNLKELYLENMQTYDSSTGTYTYYLTSLPS
TMNQLTNLEVLEAENNEIGGLVDLTNVIKLKRLQLNNNKITDLKIDAPVINFSLSSNPTY
HFNISNNPYLSCVEVPTAEVTNWETRYAQRPQIADNGIAFSDSCSGFRVPQSEREALVAL
YIATNGGDKVDATIGVTWVGTNWSSDATELTNVGSWQGVTTEIINGQKHVTKIELISNQL
SGVVPKEIADLPELTLLNLSSGKITSIATEIGGLSKLTHLNLSSNSLESLPVGIGDFTSL
VELNLSYQRINTNTSQYTSTLTTLPNEIGNIATLEKLDLSYNGLTSLPSGIGNFTSLKEL
RLNNQTTSPVRYQPTNTLNSLPDEIGNIVSLEKLYLQGNVLESLPSTMTNLILLETFNIS
NNRISGSINLGLSEVLNDFRADFNNISELKIAVAPTIFGTNTTNPRANRLRLNRNALGCV
EVPSDELVAWQLSNYKEEGGIIDNGVVYSDNCNAVTTNSIPDLEREALIALYNSTKGMNW
RNDLSSSYNGVVWETDSSLKRNVGAWFGVTTEVINGQKHVTKVELNSNELDGTIPSVIKN
LIQLKELELNSNFISEIPTEIGELANLEQLTFNNQYNSNIQEYVLNTIPVEINNISSLKR
LELSSNQLEGNLDFSNLTNLISLNVSGNEITGLKIGVAPSNFDNSYNSEEQFSNTFIFYN
QYLNCISVPENTILAWEATSFASQYSNIVWGQDCSAYNNVPENEIKALVDLYNNLEGANW
TNNTNWNGNLAKALINNPYNATKWQGITTKIVDGGKHITNISLNSNKLKGELPESIGNLT
KLTNLQIGSNEISGAIPSTFGNLASLETLYLNSNKITSLPTEMSNMLALKTVYLQNNEIK
GNLPDFTNATNLTSLYISSNKFQFGDFENEFIDYQNLQTFSYSNQAKVGVEETVDFGDGY
DKTLVAIVSGTNNMYQWYKNGSPITDATSKEYVITDATQQDAGYYFCLVSNPIITGFNIE
TQRVTLNYDETLSVNKEIVLSNYIKLYPNPVKDVLQIQNINNVNIKKIEVYNLLGKRLQL
IKNPINKINISNLSEGVYLLKIDTAKGNIMKRIMKK
NT seq
7491 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaggaaaactactattaattttcgcgtttataagtataactataaatgcgcaaatt
tcacaaacagaaagacaagcattaatagatttttacaatgctacagatggagctaattgg
acgaataataccaattggaatacagatataaatattacttctgatgtttctaattggtat
ggagttacagtaacagaaattaatggtcaagattacgttacggaaatcaatttatcgaac
aataatttaaacggaagtttttctagtttggtaaatttatcaaatataacctccgtagat
ttttcagaaaatatgagtttttcaggtggtgtaaatttcgataattacgctgcaaccatt
gataatgtaaaacttaataatactggtattacgagtttaaaacttcataaatatgtaacg
ctaaatatcaaagatgtacctaatttaaattgtgttgaagtgccatcgagctcaattaat
agttaccattctttatctatgaataattttgatttaggaattaaaataactgataattgt
agcggagtcttaccattagatgctacagaaaaagcagctttaaaagcaatatttaatact
actaatggaactgcatggtcttataataattatggcagtacagaaatagtagcaaatacg
aatccagaagatttaagaggtattgtaactaaagattttggaacagttagaagaataaca
aaattattttttcatggaatgggtttaaatggaggtttgcctgttgaaattggagatttt
tcagaattattagagttaaaattaagtcaaaatcaaatcagttcaattccaaatgaaata
ggtggtttatctaaattaaatcatttagatgtaagtatcaacaatactttaactacaata
ccaagtactgttggtgatttagtagaattaatttctttaaaatttaatactacgcaagta
gatttacttccaactacaattgaaaatttattgaaattagaaattttagaattaggctct
actaaaattactttattaccacctcaaataggtaatttagcagaattaactagattagtt
gcagcacctaataatatagcaagtataccaacagaattagggcaactatcaaaactaacc
tacttagatttttcgaattgtaaactttctaatacacctacagcatttgccaatttaacc
aatttagaaactttatacttgaataataacgaattacaagtggttgctggtttaggtggt
tttacaaaattgaaacaccttcgattacacaataatagattaggagaagacaacccaaat
tttaatactgatttacccgaagatttaagcgatttagtactactagaagaactaacattg
tatagtaatcagttaacaaaattgccttctaatattggcgctttgctaaacttaacatct
ttaaaaatttataataataggctaacgtttttaccaaatagtattggtaatctaactgac
ttaaaagagttgcaggttcagggtaacgagttaacaagtttgccagcaacaattggcggt
ttaacaaatttagagaagttgtatttgtctcagagtagtaatagtaataaaatagcaact
ttaccagcagaaattggcgacttatcaaatttgaaagagttgtatttagaaaatatgcaa
acgtatgattcgtctacaggtacttatacatattatttaacaagtttgccaagtacgatg
aatcagttaaccaatttggaggttttagaagcggagaataatgaaataggcggattggtt
gatttaacaaatgtgataaaattaaagcgtttgcaattaaataataataagattgaagat
ttaaaaatagatgcgcctgtaattaattttagcttatcgtctaatccaacctatcatttt
aatatcagtaataacccttatttaagttgtgtagaagttcctacagcagaagttacaaat
tgggaaaccagatatgcacaaagaccccagatagcagacaacggaatagcatttagcgat
agttgttcaggctttagagttccacaaagtgagcgagaagctttggttgcattgtatatt
gccacaaacggaggagacaaggtagatgcaacaataggagttacttgggttggtacaaat
tggagttcagatgctacagaattaaccaatgtaggttcttggcaaggagtaactacagag
attatcaacggacagaaacatgtaactaaaatagagttgattagtaatcaattatcagga
gttgtaccaaaagaaatagcagatttaccagagttaacgttgctaaatttatcatctgga
aaaataacttcagtagctacagaaataggaggtttaagtaaattaacgcatttaaattta
tcttctaatagtttagagagtttacctgtaggaataggagattttactagtttagtagag
ttgaatttaagctatcaaagaataaatacaaatacttctcaatacacatcaactctaaca
actttaccaaatgagattggtaacatagcaacattagaaaagttagatttaagttacaat
ggattaacaagcttaccatcgggtattggtaattttacaagtttaaaggaattaagacta
aataatcaaaccacaagtcctgttagatatcaaccaacaaatacattatctagtttacca
gatgaaatcggaaatattactagtttagaaaaattgtatttacagaataatattattgcg
aacattccgagtacaataaatggtttaactagtttaaaagagttgcagttacagggtaac
gaattaacaagtttgcctgcaacaattggcggtttaacaaatttagagaagttgtatttg
tctcagagtagtaatagtaataaaatagcaactttaccagcagaaattggcgacttatca
aatttgaaagagttgtatttagaaaatatgcaaacgtatgattcgtctacaggtacttat
acatattatttaacaagtttgccaagtacgatgaatcagttaaccaatttggaggtttta
gaagcggagaataatgaaataggcggattggttgatttaacaaatgtgataaaattaaag
cgtttgcaattaaataataataagattaccgatttaaaaatagatgcgcctgtaattaat
tttagcttatcgtctaatccaacctatcattttaatatcagtaataacccttatttaagt
tgtgtagaagttcctacagcagaagttacaaattgggaaacccgatatgcacaaagaccc
cagatagcagacaacggaatagcatttagcgatagttgttcaggctttagagttccacaa
agtgagcgagaagctttggttgcattgtatattgccacaaacggaggagacaaggtagat
gcaacaacaggagttacttgggttggtacaaattggagttctgatgctacagaattaacc
aatgtaggttcttggcaaggagtaactacagagattatcaacggacagaaacacgtaact
aaaatagagttgattagtaatcaattatcaggagttgtaccaaaagaaatagcagattta
ccagagttaacgttgctaaatttatcctctggaaaaataacttcaatagccacagaaata
ggaggtttaagtaaattaacgcatttaaatttatcttctaatagtttagagagcttacct
gtaggaataggagattttactagtttagtagagttgaatttaagctatcaaagaataaat
acaaatacttctcaatacacatcaactctaacaactttaccaaatgagattggtaacata
gcaacattagaaaagttagatttaagttacaatggattaacaagcttaccatcgggtatt
ggtaattttacaagtttaaaggaattaagactaaataatcaaaccacaagtcctgttaga
tatcaaccaataaatacattatctagtttaccagatgaaatcggaaatattactagttta
gaaaaattgtatttacagaataatattattgcgaacattccgagtacaataaatggttta
actagtttaaaagagttgcaggttcagggtaacgagttaacaagtttgccagcaacaatt
ggcggtttaacaaatttagagaagttgtatttgtctcagagtagtaatagtaataaaata
gcaactttaccagcagaaattggcgacttatcaaatttgaaagagttgtatttagaaaat
atgcaaacgtatgattcgtctacaggtacttatacatattatttaacaagtttgccaagt
acgatgaatcagttaaccaatttggaggttttagaagcggagaataatgaaataggcgga
ttggttgatttaacaaatgtgataaaattaaagcgtttgcaattaaataataataagatt
accgatttaaaaatagatgcgcctgtaattaattttagcttatcgtctaatccaacctat
cattttaatatcagtaataacccttatttaagttgtgtagaagttcctacagcagaagtt
acaaattgggaaacccgatatgcacaaagaccccagatagcagacaatggaatagcattt
agcgatagttgttcaggctttagagttccacaaagtgagcgagaagctttggttgcattg
tatattgccacaaacggaggagacaaggtagatgcaacaataggagttacttgggttggt
acaaattggagttctgatgctacagaattaaccaatgtaggttcttggcaaggagtaact
acagagattatcaacggacagaaacacgtaactaaaatagagttgattagtaatcaatta
tcaggagttgtaccaaaagaaatagcagatttaccagagttaacgttgctaaatttatcc
tctggaaaaataacttcaatagccacagaaataggaggtttaagtaaattaacgcattta
aatttatcttctaatagtttagagagtttacctgtaggaataggagattttactagttta
gtagagttgaatttaagctatcaaagaataaatacaaatacttctcaatacacatcaact
ctaacaactttaccaaatgagattggtaacatagcaacattagaaaagttagatttaagt
tacaatggattaacaagcttaccatcgggtattggtaattttacaagtttaaaggaatta
agactaaataatcaaaccacaagtcctgttagatatcaaccaacaaatacgttaaatagt
ttgccagatgaaattgggaatattgttagtttagagaaattgtatttacagggtaacgtt
ttagaaagtttaccaagtacaatgaccaatttaattttattagaaacatttaatattagt
aataatagaatatcgggttctattaatttaggtttatcagaagttttaaatgactttaga
gcagatttcaataatatttcggaattaaaaattgccgttgcaccaacaatttttggaacc
aatacaacaaatccgagagcaaatagattgagactaaatagaaatgctttgggttgtgta
gaagtgcctagtgacgagctagttgcatggcaattgtctaattacaaagaagaaggcggt
ataatagataatggagttgtttattcagataattgtaatgcggtaaccactaattccatt
ccagatctagaaagagaagcattaattgctttatacaacagtacaaaaggtatgaattgg
agaaacgatttatctagttcttataacggagttgtttgggaaacagattctagcttaaaa
agaaatgttggagcttggtttggggttacaacagaggtaattaatggacaaaagcacgta
acaaaggttgaattaaattccaatgaattagatggtaccattccatccgtaattaaaaac
ttaatacaattaaaagagttagagctaaatagcaattttatatcagaaataccaactgaa
attggagaattggctaacttagaacagttaacattcaataatcaatataattctaatatt
caagaatatgttttaaatacaataccggtagaaattaataatatttcttcattaaaaaga
ttggagttaagttctaatcaattagaaggaaatttagatttttcaaatttaactaatttg
atatctttaaatgtctctggaaatgaaattacaggtttaaaaataggtgttgctccgtct
aattttgataatagttataattcagaagaacaattttctaatacttttattttttataat
caatacttaaactgtatttcagttccagagaatactattttagcctgggaagcaacttct
tttgcaagtcaatattcaaatattgtttggggacaagattgtagtgcatataataatgta
ccagaaaatgaaattaaagctttggtagatttatataataatttagagggagcaaattgg
actaataataccaattggaatggaaatttagcaaaagcgcttattaacaatccatacaat
gctacaaaatggcaaggaataaccaccaaaattgttgatggaggtaagcatattactaat
atttctttgaatagtaataagcttaaaggagaattaccagagagtattgggaatttaact
aagttaacaaatttacagataggttctaatgaaatttcgggagcaattccatctactttt
gggaatttagcctctttagaaactttatatttgaacagcaataagattacaagtttaccg
acagaaatgagtaatatgttagccttaaaaacggtatatctacaaaataatgaaattaag
ggtaatttacctgattttacgaatgcaaccaatttaacaagtttatatattagtagcaat
aaatttcaatttggtgattttgaaaatgaatttatagattatcagaatttacaaacgttt
agttattctaatcaagcaaaagttggggtagaggaaactgtagattttggtgatggttac
gataaaactctagtagcaatagttagtggaactaataatatgtaccaatggtataaaaat
ggaagtccaattacagatgctactagtaaagaatatgttattacagatgcaacacaacaa
gatgctggatattacttttgtcttgtttctaatcctattattacaggatttaatatagaa
acacaaagggttactcttaactatgatgaaacattaagtgttaataaagagattgtatta
agtaattacataaaattatatcctaatcctgttaaagatgttttacaaattcaaaatatt
aataatgtaaatattaaaaaaattgaagtgtataatcttttaggtaaaaggttacaatta
attaaaaatcctataaataaaataaatatttctaatttatcagaaggtgtttacttatta
aaaatagatacagcaaaaggtaatattatgaaaagaattatgaaaaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system