Polaribacter sp. BM10: BXQ17_14000
Help
Entry
BXQ17_14000 CDS
T04746
Name
(GenBank) polysaccharide biosynthesis protein
Organism
pola
Polaribacter sp. BM10
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Polysacc_synt_2
Epimerase
GDP_Man_Dehyd
RmlD_sub_bind
3Beta_HSD
CoA_binding_3
adh_short
KR
NAD_binding_4
C2185-like_N
NAD_binding_10
NmrA
PglD_N
CoA_binding
DUF6886
Tox-HDC
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AQS95121
LinkDB
All DBs
Position
3189773..3191668
Genome browser
AA seq
631 aa
AA seq
DB search
MIRNFFLKALNKYASKWVVFAIDILLVCLSFIMAYSIRLDISFDFDIKNVIPQLTIVVII
SALSFLIIGSYKGVIRHTGTKDVFNVFIGVTILSISLSFIVVFNQLFKIYPSFTIPNSII
LIHYLVSVFVLIISRYVFKAFFEIISTELDTITNALIYGAGDSGIITYGALNRERKGSYQ
ILGFIDDDKNKVNKKIDRIRVYDISMIDQNFIDKHDITEVIISIQKIKPSRLLEITDSLI
KLNVEVKIVPPLTKWIDGDLQANQIKQVNIEDLLDREQILIDNPIVQREVEGKVILVSGA
AGSIGSEISRQLSLYNCKLIVLIDQAESPLYDLQQELIQKGVTNFVAIVSDVRDKFKISR
IFKKYKPQRIFHAAAYKHVPLMEKSPYEAIKVNVLGTKNLADLAIENKIERFVMVSTDKA
VNPTNVMGASKRIAELYVSCVSKKSKKTKFTITRFGNVLGSNGSVIPLFKRQIEAGGPLT
VTHKEITRYFMTIPEACSLVLEAGTMGKGGEIYIFDMGKSVKIFEIAKRMIYLSGLKYPE
DIDIKITGLRPGEKLYEELLANGENTIKTYHEKIMIAKTQKIDAKEIKPKIEELTTTFSD
LNNSDLVAVMKGLVPEYVSNNSEFEKLDNVS
NT seq
1896 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataagaaatttttttttaaaagcgttaaataaatatgcctcgaaatgggttgttttt
gcgatagatattcttcttgtttgtttatcctttattatggcttattctataaggcttgat
ataagtttcgattttgatataaaaaatgttattccacaactaacaattgtcgttataatt
tcagcattaagctttttaattattggttcttataaaggggttattagacatacaggaaca
aaggatgtttttaacgtttttataggtgttacgattttaagtataagtttaagttttatt
gttgtatttaatcaactctttaagatttatccatcttttacaattccgaattctatcata
ttaatacattatttagtatctgtttttgtgcttattataagtagatatgtgtttaaagcg
ttttttgaaattatttcaacagagttagatacaataactaatgctttgatttatggtgct
ggtgattccggaattataacttatggtgctttaaatagagaaagaaaaggaagttatcaa
attttaggttttattgatgatgataaaaataaagtaaataaaaaaattgataggattcgt
gtttatgatatatcaatgatcgatcaaaattttatcgataagcatgatataacagaagtt
attatttcgatacagaaaattaaacctagcaggttacttgagataacggacagtttaata
aagctaaatgtagaagttaaaattgtaccgcctttaactaaatggattgatggagattta
caagcaaatcaaattaagcaagtaaatattgaagatttattagacagagaacaaatttta
attgacaatcctatcgttcagagagaagttgaaggaaaggtaattttagtttcaggcgct
gcaggttctataggaagtgaaatttctagacaattaagcctttataattgtaaattgatt
gttttaattgatcaagctgaatcacctttgtatgatttacaacaagaattgattcagaaa
ggtgttacaaactttgttgctattgtttctgatgtaagagataaatttaaaatttcaaga
atttttaaaaaatacaaacctcaaagaatttttcatgccgctgcatataaacatgtacct
ttaatggaaaaatctccttatgaagctataaaagtgaatgttttaggaacaaaaaattta
gcagatttagctattgaaaataaaatagagcgatttgtaatggtttctaccgataaagct
gtaaacccgacaaacgtaatgggcgcatctaaaagaatagccgaattatatgtaagttgt
gtaagtaaaaagtctaaaaaaaccaaatttacaattactagattcggtaatgtattaggt
tctaacggttctgtaattcctctatttaaaaggcaaattgaagcaggaggtcctttaacg
gttactcacaaagaaattacaaggtattttatgacgattcctgaagcgtgtagtttggtt
ttagaagctggtaccatggggaaaggaggagagatttatatctttgatatggggaaatct
gtaaagatttttgaaatagcaaaaagaatgatttatttatctggattaaaatatccagaa
gatattgacataaaaattacaggtttaagaccaggtgaaaaattatatgaggagttattg
gcaaatggagaaaatacgattaagacctatcatgaaaaaattatgattgcgaagactcaa
aaaatagatgcaaaagagattaaacctaaaattgaagaattaacgactacttttagtgat
ttaaataatagcgatttagtcgctgttatgaaaggtttagtgcccgaatacgtatcaaat
aattctgaatttgaaaaattagataatgttagttag
DBGET
integrated database retrieval system
