Polaribacter sp. Q13: JOP69_06445
Help
Entry
JOP69_06445 CDS
T10394
Name
(GenBank) response regulator
Organism
polq Polaribacter sp. Q13
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Reg_prop
HATPase_c
Response_reg
Y_Y_Y
HTH_18
HisKA
Beta-prop_LRRK2
HTH_AraC
PDE8A_N
HATPase_c_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QVY66918
LinkDB
All DBs
Position
1541958..1546178
Genome browser
AA seq
1406 aa
AA seq
DB search
MHSNIFFIKKIILILLLGVYQTTISQNSFYFDHISTDKGLSQGDVNSIYQDPKGFMWFAT
HDGLNKYNGYEFTIYKPDANLKNSIGSNLIYAVTGDEKGNLWIGTTGSGLNYYNKSTGGF
THFIHDENNKNSITNNHVISIYKDKKDQLWVGTADGLDLVDLKQPLDSLKFKHYKLGDNK
ISNSLATNKIYSIFEDSQDQIWIGSTKGLFKRTRAKNGEFYFRSVNNRINLVNSPVNCIA
EDSKGNLFIGTGNGLHVFKANFNKNKVYKLQNGFFNGLKVDKNDNLWAGTNNGLLYFENK
KNTKDISLTKRFVYDPKDTKSISKNIVKTIYIDNTGILWIGTNGGGVNKMDPERKQFKHI
KKTLDTKSLSYDKIRSIFEDSSNNLWIGTEGGGLNILFKENDNGSYANFTNLQKIKKPFA
IAEITHRNSLFVGAEDTPGLYEIDLDNLKNIQESDIKPIPEISYSVFSILEDSNKNIWIG
TYSGGVHRWLLNKKTGAYTKDVLSYRSTNNTGLSSNIIRNIYEDSDHNIWFATSNGLCKL
KPTEIEKNNPKFEVYKNDPKDKNSISHNYILALYESKKGDLWVGTFGGGLNKMETNEKDN
TVTFKTYTERDGLPNNVIKAILEDAENNLWISTNKGLSKFNPENNTFKNYDVNDGLQDNE
FQELASLKRRDGEMLFGGINGFNAFYPEDIKDNPYKAKSVITSFSISNKPIKRGEEINGH
IILKEPINETSEINLKYDENSFSFEFAAIHYSAPNKNKFAYKLEGFDKDWVYTNATKRFA
TYTNMAPGDYTLLLKASNNDGIWENSETKLHINITPPFWKTTLAYFLYFFLILAIFFGFW
RNTVTKARKKHDLELANLEKQKEEELQHIKLEFFTNISHELRTPITLIKGPLEYLQKKGA
AVKPEVAQEQFGLMRKNANYLLSLVNQLLDFRKINQGKMRLVMRNSNISAFIKEVAEPFQ
FLSHKKHIKLSFNTTDPLLKSWFDHEALEKTINNLLSNAFKFTPKNGTIDVNITNEKVAN
GIVNKEYIIIEVKDSGIGIPSNKLEAIFERFNTKKDANKNNNPEGIGIGLSFTKSLIELH
QGTIKVSSEPGQGALFTVKIPANKEEYENLPEISCKESTDLDYVRRSSENESFAIDLDDE
TTDESISKDRSKSPVLLVVDDNKDIRTFIKQALGDDYTIFEAENGQEGFEIAKKITPNII
VTDLAMPIMDGLQLCKKIKTTKTTSHIPVLILTAKLSQESELEGVKLGADDYIRKPFDIE
LLNLKLKNILQQRKNLRVRFNQEITLQPKEVTVTSSDERFLQQAIEIVEKHMMNTDFSVE
MLVKEMGHSRSNLYLKFKEITGLSSSEFIRSIRLKRAVQLFESTDLSVKEIMYMTGFNTA
SYFAKCFKKQFGVKPSDYVRKPIKKA
NT seq
4221 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcactcaaatattttctttataaaaaaaataattctgatacttctactgggggtttat
caaactacaataagccagaattctttttatttcgatcatatttctacagacaaaggattg
tctcaaggagatgttaattctatttatcaagaccctaaaggttttatgtggtttgccaca
cacgatggtttaaataaatataatggttatgagtttaccatatacaaaccagacgccaac
ctaaaaaacagtataggtagtaatcttatttatgcagttacaggtgatgaaaaaggaaat
ttatggattggaacaactggtagtggtctaaactactataacaaatctacaggagggttt
acacattttattcatgatgaaaataataaaaacagtattactaataaccatgtaattagt
atttataaggataaaaaagaccaactttgggtaggtactgctgatggacttgatttggta
gatttaaaacaacctctagattctttaaaatttaagcactataagttaggtgataacaaa
atatcgaatagcctcgctacaaacaaaatttattccatttttgaagatagtcaagatcaa
atatggataggcagtactaaaggcttgtttaaacgaactagagctaaaaacggagaattt
tattttaggtcggtaaataatcgtattaatttagtgaattctccagtaaattgtatagca
gaagatagtaagggaaatttatttataggtactggtaatggtttgcatgtttttaaggct
aactttaataaaaataaggtttataaactacaaaatggtttttttaacggtcttaaagtt
gataaaaatgataatttatgggcaggtacaaataacggactcttatattttgagaataaa
aaaaacacgaaagatatttcactaaccaaacgttttgtttatgatcctaaagacaccaaa
agtattagcaaaaatattgtaaaaacaatttatattgataacacaggcattctttggata
ggtacaaatggtggtggtgttaacaaaatggatcctgaaagaaaacaatttaaacatatt
aaaaaaaccttagatactaaaagtcttagttatgacaaaattagatctatttttgaagac
agtagtaataatttatggataggtacagaaggcggcggtcttaatatcctttttaaggag
aatgataatggtagttatgcaaattttacaaatctacaaaaaattaaaaaaccatttgct
attgcagaaattacacatagaaacagcctttttgtaggtgcagaagatacacccggtttg
tatgaaatagacctcgataacctaaaaaacatacaagaaagcgatataaaaccgatacct
gaaataagttatagtgtattttctatacttgaagatagtaataaaaacatatggattggt
acctatagtggtggtgtacacagatggcttctaaacaaaaaaacaggagcatacaccaaa
gatgttttgtcttataggagtacaaataatactggcctttctagcaatattataagaaat
atctatgaagatagtgatcataatatctggtttgctacttcaaatggattatgtaaatta
aaacctactgaaatagaaaaaaataatccaaaatttgaagtttataaaaatgatcctaag
gataaaaatagtatttctcacaactatattttagccttatatgaaagtaaaaaaggtgat
ttatgggtaggaacttttggtggcggattaaataaaatggaaaccaatgaaaaggataat
acggttacatttaaaacatacacagaaagagatggactgccaaacaatgtaattaaagca
attttagaagacgctgaaaataatttatggatatctacaaacaaagggctttcaaaattt
aacccagaaaacaacacctttaaaaattatgatgttaatgatggtttacaagataacgaa
tttcaagaattagcaagtttaaaacgtagagatggcgaaatgctttttggcggtataaac
gggttcaatgctttttatccagaagatattaaagacaatccgtacaaagcaaaatctgta
attaccagtttttctatttcaaataaaccaattaaaaggggcgaagaaattaatgggcac
atcattttaaaagaacctattaatgaaacgtccgaaattaatttaaaatatgacgaaaat
agtttctcgtttgaatttgcagccattcactattccgctcctaataaaaataaatttgct
tacaaattagaaggttttgataaagactgggtgtatacaaacgcaactaaacgttttgca
acctatacaaatatggctcctggtgattatactttactattaaaagcatctaataatgat
ggtatttgggaaaatagcgaaaccaaattacatattaatataacacctccgttttggaaa
actacactagcctattttctatatttctttttaattctagccatattctttggcttttgg
cgcaatactgtaacgaaagccagaaaaaaacatgatttagaattagctaatttagagaaa
caaaaagaagaggaattacaacatataaaattagaattctttacaaacatatctcacgaa
ttaagaacaccaattactttaataaaaggtcctttagagtatttacagaaaaaaggtgca
gctgtaaagccagaggtagcccaagaacaatttggtcttatgagaaaaaatgccaactac
ttacttagtttggtaaaccaactattagatttcagaaaaataaatcaaggtaaaatgcga
ttggtgatgcgtaatagtaatatttctgcttttataaaagaagtggcagagccctttcaa
tttttatctcacaagaaacatattaaactaagttttaatacgacagatccgttattaaaa
tcttggtttgatcacgaagctcttgagaaaacaatcaataacctactctccaatgctttt
aagttcactcccaaaaatggaactatagatgtgaatataaccaacgaaaaagtcgccaat
ggtatcgtaaataaagagtatattattattgaagtaaaggattctggaattggaatacct
agtaacaaattagaagctatttttgaaagatttaatactaaaaaagatgctaataagaac
aataatccagaagggattggtattggattgtcttttacaaaaagtttgatagaattgcat
caaggtacaattaaagtatctagcgaacctggtcaaggagcattattcacagttaaaatc
cccgctaataaagaggaatacgaaaacctgcctgaaataagttgtaaagaaagtaccgat
ctagattatgtaagaagatcttcggaaaatgaatcttttgcaatagatttagatgatgaa
acaactgatgaaagtatttctaaagacagatctaaatctcctgtattgctagtggtagat
gacaataaggatattagaacatttataaaacaagccttaggagatgactacaccatcttt
gaagcagaaaatggtcaggaaggatttgaaatagcaaaaaaaataacgccaaatattatt
gttaccgatttagccatgcctataatggacggattacagttgtgtaaaaaaattaaaaca
accaaaacaacaagtcatattcctgttttaatattaacggctaaactatcacaagaaagt
gaattagaaggtgtaaaactaggtgcagatgattatattagaaaaccttttgatattgaa
ttattaaacttaaaattaaaaaatattcttcaacaaagaaaaaatttaagagtccgtttt
aatcaagaaataacattacagccaaaagaagttacggtaacatcatctgatgaacgtttt
ttacaacaagccatagaaattgtagaaaaacacatgatgaatactgattttagtgtagaa
atgcttgtaaaagaaatggggcatagtagaagtaatctgtatctaaaatttaaagaaatc
acaggattatcttctagtgaatttatacgaagtattcgattaaaaagggctgtacaactt
tttgaatctactgatttatctgtaaaggaaattatgtacatgactggttttaacacagct
tcttactttgctaaatgctttaagaaacagtttggtgtaaaacctagtgattatgttaga
aaaccaataaagaaagcgtaa
DBGET
integrated database retrieval system