Polaribacter sp. Q13: JOP69_08415
Help
Entry
JOP69_08415 CDS
T10394
Name
(GenBank) leucine-rich repeat domain-containing protein
KO
K13730
internalin A
Organism
polq Polaribacter sp. Q13
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
polq00001
]
09160 Human Diseases
09171 Infectious disease: bacterial
05100 Bacterial invasion of epithelial cells
JOP69_08415
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_4
LRR_8
COR-A
Roc
TIR_2
Arf
LRR_14
LRR_9
Ras
AAA_29
MMR_HSR1
LRR_LRWD1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QVY67278
LinkDB
All DBs
Position
complement(1995417..1998605)
Genome browser
AA seq
1062 aa
AA seq
DB search
MKTPEILKLENELGVNLKQLEVGGVFDSKNRNSYLLNDNQEIMFLNLHKNKLKDISALSS
LNSLIILDLGENQITDISPLFYLKSLFALNLSSNQLTDINPLFSLINLSNLNLSSNNLND
VNPLSNLTSLIHLDLNFNKITNINPLSTLRSLTNLSLSSNQITDISSLSYLTKLTSLSTG
YNQLIDINPLSTLIFLINLDLRKNQITDISSLSSLTNLTLLLLSENRLVSIESLSSLTNL
TRLNLGYNRLSNINEVSNLFKIKTLAIERNQLTDIESLRPLTSLESLTLSFNNLSSIEPL
SSLVELTNLSLEYNELKDVTHLSHLRNLVSLCLGNNKLTNIDSLSSLTKLSNLELDSNRI
INVKSIQNIVNNLSLLRVINIRNNLLDIPYNLLNDANGLIAYFKDIKLGVTNKRNTKLLF
LGDGCVGKSTLLAHLKTLKPPTEIPINKRTEGVQLGVWKDVLPDVKVNVWDFGGQEVLHS
THRLFLGEEAVYVLVWCKESKKKCSKEETHNLQYWLDFIADYGRKSIVLLVENVIDGEFE
SKELPDDLELATLVTNYRNKQIELIPTQYRFDCKNNTEEVESFRDVIKNKIKSLHKRYPI
KYYPESWHVFQERLEKEKETHKIISLERYEELGKESKVSEPKALLSFFDKSGVIGYYERL
ADDIIILQMDWVLDPVYKTIQLKDNTLARTQGKLNDEDLDFIWNKYQPEERRLFKEYMLK
SNLLSEPKRYPDSLNRSYKYLCPSLFDDKSIDTIQWEEKERYVIVKFNFVFLAIIQQLQV
QILNHCNFDDKEIFYKNYICFKDKEGSLVWIELYKNEKELRIFSENENTIQVVLSELNLI
YPIDRTLVRLRKKDLSEEDYLYKNTDNFFHSKNEIKDYKIMEEEMDKEKKAKKIFISYSR
KDYKFKDELKSHLSLLARYNLINAWSCDEMKPGKWNSQIQSELAAADIIVYMVSHNFLDS
NYIMDEEVKKGIELIEEDPNKKIINVLVRDCLWDQWSKIEELVKKRTKNFSEMSLDHYQF
LPYHQDDGVEKLLPLEEWNVNRGQSVNTAYKQIAKRILSEII
NT seq
3189 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaactccagaaatattaaaattagaaaatgagttaggtgttaacttaaaacaacta
gaagtaggtggggtttttgattctaaaaacagaaattcatatttattaaatgataatcaa
gaaataatgtttcttaatctgcataaaaataaattgaaagatattagtgcattatcttct
ttaaatagcctaattattttagatctaggagaaaatcaaatcacagatattagccccttg
ttttatttgaagagtttatttgctttaaatttaagttcaaatcaattaacagacattaat
cccttattttctttaattaatttaagtaatttaaatttatcaagtaataacctaaatgat
gttaatcctctatctaatttaacatctttgattcatttggatttgaatttcaataaaatt
acaaatattaatcctttatctactttaaggtctttgactaatttgagtttgagttctaat
caaattacagatattagttctttatcatatttaactaaattaacttctttatctacgggg
tataatcaattgatagatattaatcctttgtctactttaatatttttgataaatttagat
ttaaggaaaaatcaaatcacagacattagttcactatcttctttaacaaatcttactttg
ttactcttatccgaaaacagattggtaagtattgaatccttaagttcattaacaaatctc
acaagattaaatctaggatataatagattatctaatattaatgaggtgtctaatttattt
aaaataaaaacattagctatagaaagaaatcaattaacagatatagaatctttacgtcca
ctaactagtttagagagtttaactttaagttttaataatttgagtagtattgaaccattg
tcttctttagttgagttgactaatttatctttagaatacaatgaattaaaagatgttact
catttgtctcatttgagaaatttggtttctttatgtttgggtaataataaattaacaaat
attgattcactatcgtctctaacaaaattaagtaatttggaattagattctaataggatt
attaatgttaagagtattcaaaatatagttaataatctttctttgcttagagtaataaat
attagaaataatttattagatataccttacaatttattaaatgatgcaaatggtttaata
gcttattttaaagatattaaattaggagtcacaaataaaagaaatacaaaattattgttt
ttaggtgatggttgtgtaggtaaaagtactttgttagcacatttaaaaacattgaaacct
ccaactgaaattccaataaataaacgaacagaaggagtacaattgggggtttggaaagat
gtattaccagatgttaaagtgaatgtatgggattttggtggacaagaggtcttgcatagc
acacaccgtctgttcttgggagaggaggcagtatatgtactagtttggtgtaaagaaagc
aagaagaaatgttctaaagaagaaactcataatttacaatattggttagactttattgcg
gattatggtaggaaaagtattgtattattagtagagaatgtaattgacggtgagtttgaa
agtaaagagcttcctgatgatttagaattagcaacacttgtaacaaattacagaaataag
caaattgaattgatccctacacaataccgttttgattgcaaaaacaatactgaagaagta
gaaagttttcgtgatgttattaaaaataaaattaaaagtttacataagagataccctatt
aagtattatcctgaaagctggcatgtatttcaagaacgtttggaaaaagaaaaagaaaca
cataaaataatttctttagaacgttatgaagagttagggaaggaatctaaagtttctgaa
ccgaaagcattactttctttttttgataaatcaggagtgattggttattatgaaaggttg
gcagatgatattattatcttacaaatggattgggttttagatccagtgtataaaacaata
caattaaaagataatacattagcaagaactcaaggtaaattgaatgatgaagatttagat
tttatatggaataaatatcaaccagaagaaagacgactatttaaagagtatatgttaaaa
agtaatttattgtcagaaccaaagagataccctgattcattaaatagaagttataaatat
ttgtgtccatcattatttgatgataaaagtatagatacaattcaatgggaagaaaaagaa
agatacgtaattgttaaatttaattttgttttcttagccataatacaacaacttcaagtt
caaattttaaaccattgtaattttgatgataaggaaatcttttacaagaattatatttgt
tttaaagacaaagaaggttcattagtttggatagaactttacaaaaatgaaaaagaattg
cggattttcagtgaaaatgaaaataccatacaagtagttttgagtgagcttaatctaatt
tatcctatagatagaacactagtcaggttaagaaaaaaagatctaagtgaagaagattat
ttatataaaaatacagataatttttttcattctaaaaatgaaattaaagattataaaata
atggaagaagaaatggataaagaaaaaaaagccaaaaaaatatttatatcttatagtaga
aaggattataagtttaaagatgagttaaaaagtcatctatcacttttagcacgatataat
ttaattaatgcttggtcttgtgatgaaatgaaaccaggaaaatggaattcacaaatacaa
tcagaattagcagcagcagatattattgtctatatggtttctcataattttttagactcg
aattatataatggacgaagaggttaaaaaaggaattgaactaatcgaagaagatccaaat
aaaaaaattatcaatgttttggtaagagattgtctttgggatcaatggtcaaaaatagaa
gaacttgtaaaaaaaagaactaaaaatttttcagaaatgagtttagatcattatcaattt
ttaccttatcatcaagatgatggtgtagaaaaattattacctcttgaagaatggaatgta
aatagaggacaaagtgttaatacagcttataaacaaatagcaaaaagaattttatccgaa
ataatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
