Polaribacter sp. Q13: JOP69_09845
Help
Entry
JOP69_09845 CDS
T10394
Name
(GenBank) glycoside hydrolase family 43 protein
KO
K01198
xylan 1,4-beta-xylosidase [EC:
3.2.1.37
]
Organism
polq Polaribacter sp. Q13
Pathway
polq00520
Amino sugar and nucleotide sugar metabolism
polq01100
Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
polq00001
]
09100 Metabolism
09107 Glycan biosynthesis and metabolism
00520 Amino sugar and nucleotide sugar metabolism
JOP69_09845
Enzymes [BR:
polq01000
]
3. Hydrolases
3.2 Glycosylases
3.2.1 Glycosidases, i.e. enzymes that hydrolyse O- and S-glycosyl compounds
3.2.1.37 xylan 1,4-beta-xylosidase
JOP69_09845
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_hydro_43
GH43_C2
DUF1349
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QVY64080
LinkDB
All DBs
Position
complement(2350625..2352292)
Genome browser
AA seq
555 aa
AA seq
DB search
MKKCAIAMLFVIAVIGCTNKKEQIKAVKKQLNTFSNPILQGFYPDPSICKVDDSYYLINS
TFAYFPGIPVFKSDDLVNWKQIGNALNRAEQLDLEGLEVSQGVFAPAISYHNGVFYIINT
IVGGKNNFIISASDPAGPWSNPTWLPKVEGIDPSMFFDKEDKTYVVFNSNPPNNSPEYDG
HRTIKIIELDVKNLKTVGEAKIIINKGAKPEDKPIWIEGPHIYNRNGFYYVMAAEGGTAE
EHSEVVFRSKNILGPYKSYKNNPILTQRNLDVNRQNPITSTGHADIIKDINGNWWGVFLG
CRPYNKNYFNTGRETFMAPVKWKNDWPVFDLEGDVVKDRYQITLKKPLANVQSVNADFID
EFNTDTLAFDWLFLRTPKEKWYSLLNGELTIKTRPETTSGTSNPSFIGYRQKHLLGQVTT
NLSFKPVSENEKAGLIAFQNETHYYYLCKSLKDNMPVVQLLKSTENGTEEIAFTSIKESD
KISFKIQAKGTYYNFYYSINNTDWQVLNKNVDARFLSTKQAGGFVGTIYGMYTTSSGIKS
KNKAVYHWFKNKNIN
NT seq
1668 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaatgtgcaatagcaatgttatttgtaattgccgtaattggctgtacaaataaa
aaagaacaaattaaagcagttaaaaaacagctaaatacattttcaaacccaattttacag
ggtttttatccagatccaagtatttgtaaagtagatgatagttattaccttataaattca
acatttgcttattttccaggaatacctgtttttaaaagtgatgatttagtaaactggaaa
caaataggaaacgctttaaacagagcagaacaattagatttagaaggtttagaagtttct
caaggcgtttttgctcctgcaatttcttatcataatggagtgttttatattattaacacg
attgttggtggtaaaaataattttattatttccgcttcagatcctgccggaccttggtct
aacccaacttggttgccaaaagtagaaggtatagatccatctatgttttttgataaagaa
gataaaacgtatgttgtttttaatagtaatcctcctaataattcaccagaatatgatggg
cacagaactattaaaattatagaattagatgttaagaatctaaaaacagttggtgaagct
aaaataattataaataaaggagcaaaaccagaagacaaacctatttggattgaaggtccg
catatttataatagaaacgggttttactatgtaatggctgcagaaggtggtaccgcagaa
gagcattctgaagttgtgtttagaagtaaaaatattttaggtccttataaaagttataaa
aataacccgattttaacgcaacgaaatttagacgttaatagacaaaatccaataacgtca
acaggtcacgcagatattattaaagatatcaatggtaattggtggggcgtttttttagga
tgtagaccttataataaaaattattttaacactggtagagaaacttttatggcacctgta
aaatggaaaaatgattggccagtttttgatttggaaggagatgttgtaaaagatcgctat
caaataacattaaagaaacctcttgctaatgtacagtctgttaacgccgattttatcgat
gaatttaatacagatactttagcgtttgattggctttttttaagaactcctaaagaaaaa
tggtattcacttttaaacggagaattaacaataaaaactcgtccagaaactacttcaggg
acatcaaacccaagttttattgggtatagacaaaaacatctattaggtcaggtaactaca
aacctatcttttaaaccagtttcagagaatgaaaaagcaggcttaattgcttttcaaaat
gaaacgcattattattacttatgtaaaagcttaaaagataatatgcctgttgttcagtta
ttaaaatcaacagaaaacggaacagaagaaatcgcctttacatcaataaaagagagcgat
aaaatatcttttaagattcaagcaaaaggaacatattacaatttctactactcaataaat
aatacagattggcaagttttaaataaaaatgtagatgctcgttttttaagcaccaaacaa
gccggtggatttgtaggaactatttacggaatgtacacaacttcatcaggtattaaaagc
aaaaacaaagctgtttatcattggtttaaaaacaagaatataaattaa
DBGET
integrated database retrieval system