Polaribacter sp. Q13: JOP69_12185
Help
Entry
JOP69_12185 CDS
T10394
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
polq Polaribacter sp. Q13
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF4175
Collagen
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QVY64524
LinkDB
All DBs
Position
2916704..2920057
Genome browser
AA seq
1117 aa
AA seq
DB search
MSGFKKIEEKLRQFTRKYYISELIKGSILFISLGFLYFFFTVFIEYFLWLKPTARTILFW
VFLLVELFLLVRFIFIPIFKLVGLRKGISFEQSSKIIGDHFPAVQDKLLNVLQLKKNSNN
SDLLLASIDQKSEELQPIPFVKAVDFKKNKKYLKYAIIPILIFLITLFTDNNDKLSQSLQ
RVVHHNTAYNPPAPFKFLLNNTDLKVVQGKSISILVETQGKVLPMESQIHFENQKYFLQN
NGNGTFSYTFSDVQNPIDFFIEANGVQSQNYNIEVIKTPTINSISLDINYPRYLNKKNET
IKNSGNIIVPEGTTITWNVSTNQTDSVAFIYNKMRSFFRQIDEHQFKYSKTIKNTLNYNI
ASSNNNLKDFENLQFSVDVVKDEFPLISVQSNIDSVSRGTSEFAGQISDDYGIRKLQIVY
YNELQSAIKNSCNLEISNQNIQSFFYQFPIGLNLIEGVNYEFYFQVSDNDAVNGGKKTKS
KVFNFRQKTSDEVEEELLQEQKNTINNIENSIQKQKNQQKNLEKVQQDLQGKKKFNWNDK
KKIEKLVERQNNYNKMMQHQTEKLQDNLEEKKEENEDLQNKKEELKKRIEELKKLDKQQK
LLDEIQKMAEKLNKDDLLKKAKELSQQNKQQERSLERILELTKRFYVEQKTMQIADKIDK
LSKKQEELSESKEATLDAQKDIKKEFDAIKKELDDLNKDNEKLKEPMELPDVEDEKENIE
EELNMSEEELSKENKSEAKSSQKKSSKKMKEMSAKMQKAMLDMEGESMEENMDDLRKILE
NLVIFSFGQEKLMNKFEESSTSHPNFGKDLKRQNELRTYFEHIDDSLYVLSMRVPKISSK
IKDDLSTTHYNLEQSLYNFSENLFINGVSNQRYVMTSVNSLADYLSNILSSMKNSMSMKM
GKGKKGKGQGFSLPDLIKKQGELSKKMKDGMKKGKKPGEKGKPGEKGEKGKEGKGDKPGK
DGKKGEDGEGGASDDLNGEIYEIYKQQSLLRQELQKQIRLSEGDGNGGNSDAKKALKKME
DLENEILEKGFNAGTLQKMEHLNYELLKLDKAALEQGEDKKRKSNASLKESQKRNIKAIQ
FKKQFYNQTEILNRQSLPLQLNYKKKVRQYFSDIKKE
NT seq
3354 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagcggatttaaaaaaattgaggagaaattacgtcagtttacacggaagtattacata
agtgaattgataaaaggaagtatattatttatttccttaggatttttgtatttttttttc
acggtatttatagaatattttttgtggttaaagccaaccgctagaactattttattttgg
gttttcttattagtagagttgtttttgttagttcgatttatttttatcccaatttttaaa
ttagttggtttaagaaaaggaatttcttttgagcaatcttctaaaattattggagatcat
tttcctgcggttcaagataaattattgaatgttttgcaattgaaaaaaaacagtaataat
tctgatttattgttggctagtattgatcaaaaatcagaagagttacaaccaattccattt
gtaaaggctgtagattttaaaaagaataaaaagtacttaaaatatgctataattcctatt
ttaatttttttaattaccttatttacagataataacgataaattatctcaaagtttacaa
cgtgttgtacatcataatacggcatataatccgcctgctccatttaaatttttattaaat
aatacggatttaaaagtggtacaaggaaagtctatttctattttggttgagacccaagga
aaagtgttacctatggagtcacagatccattttgaaaatcagaaatattttttacaaaat
aatgggaacggaacgttttcttatacgttttctgatgttcaaaatccaattgattttttt
attgaagcaaatggggttcaatctcaaaattataatatagaagtaataaaaacacctacc
attaatagtatttctttagatattaattatccaagatatctaaataagaaaaatgaaact
attaaaaactctggtaatattatagttcccgaaggtacaaccattacttggaatgtatct
acaaaccaaacagattctgtggcttttatttacaataaaatgagatctttttttaggcaa
atagatgagcatcaatttaaatattctaaaacaattaaaaatacactgaattacaatatt
gcttcttcaaataataatttaaaagattttgagaatttacaattttctgtagatgttgta
aaagatgagtttcctttaattagtgtgcaatctaatattgatagtgtttcacgtggaaca
tcagaatttgctggtcagatttctgatgattatggtattagaaaattacagattgtttat
tataatgagttacaatcagcaattaaaaatagctgcaatttagaaatatccaatcaaaat
attcaatcttttttttatcaatttccgataggattaaatcttatagaaggtgttaattat
gaattctattttcaggtttcagataatgatgctgtaaacggaggtaaaaaaactaagagt
aaagtttttaattttcggcaaaaaacaagtgatgaagtagaggaggagttattgcaagaa
caaaaaaataccattaataatattgaaaattctatacagaaacaaaagaatcaacagaaa
aatttagaaaaggttcagcaagatttacaaggaaagaagaagtttaattggaatgataaa
aagaaaatagaaaagttagtagagcgtcagaacaattataataaaatgatgcaacatcaa
actgaaaaattacaagataatttagaggaaaagaaagaagaaaatgaggatcttcagaat
aaaaaagaagagttaaaaaagcgtattgaggaattaaagaaattagacaagcaacaaaag
cttttagatgaaattcagaaaatggcagagaaacttaacaaagatgatttgttaaaaaaa
gcgaaagaattatcacaacaaaataagcaacaagaaagaagtttagaacgtattttagaa
ttgacgaagcgtttttatgtagagcagaaaacaatgcaaattgcagataagattgataaa
ttatctaaaaaacaagaggagttatcagaaagcaaagaagctactttagatgctcagaaa
gatattaaaaaggagtttgatgctattaagaaggagttggatgacttaaataaggataat
gaaaaattaaaagaacctatggaacttccggatgtggaagatgaaaaagaaaatatagag
gaagaattaaatatgtctgaagaagaactttctaaagaaaataagagtgaagcaaaaagt
agtcaaaagaaatcatctaaaaagatgaaagaaatgagcgctaaaatgcaaaaagcgatg
ctggatatggaaggggaatctatggaagagaatatggatgacttgcgaaaaattttagaa
aacttagttattttttcttttggtcaggaaaaattaatgaataagtttgaagaaagttct
acgtcacatccaaattttggtaaggacttaaagaggcaaaatgaactaagaacttatttt
gaacatatagacgatagcttgtatgtgttgtctatgcgagtgcctaaaatttcatctaaa
attaaggatgatttatctactactcattataatttagaacagtctttatataatttttct
gaaaatctctttataaacggagtgtctaaccaacgttatgtaatgacttctgtaaatagt
ttagcagattatttaagtaacattttaagtagtatgaaaaattctatgtccatgaaaatg
ggtaaaggaaagaaaggaaaaggacaaggatttagtctgccagatttaattaagaaacag
ggagaattgtctaaaaagatgaaggatggaatgaagaaaggaaagaaacctggagaaaag
ggtaagcctggagagaaaggtgaaaaaggaaaagaaggtaaaggggataaaccaggtaaa
gatggtaagaaaggtgaagatggagaaggtggtgctagtgatgatttaaatggagaaatc
tatgaaatttataagcagcaaagtttattaaggcaagaattgcaaaaacaaattaggttg
tctgagggagatggtaatggtggtaattctgatgctaagaaagctttaaagaagatggag
gatttagaaaacgaaattttagaaaaaggttttaatgctggaacgcttcaaaaaatggag
catttaaattacgaattattaaaattagataaggcggcgttagagcaaggagaagataaa
aagagaaaatcgaatgctagtttaaaggaatctcaaaaacggaatataaaagctattcaa
tttaaaaagcagttttacaatcaaacagaaatattaaatagacaatcgttacctttgcag
ctaaattataaaaagaaagtcagacaatatttttctgacataaaaaaagagtag
DBGET
integrated database retrieval system
