Polaribacter sp. Q13: JOP69_18460
Help
Entry
JOP69_18460 CDS
T10394
Name
(GenBank) sodium:proline symporter
Organism
polq Polaribacter sp. Q13
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HATPase_c
HisKA
HATPase_c_2
HATPase_c_5
HATPase_c_3
LTN1_E3_ligase_6th
MtrF
Exonuc_VII_L
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QVY65688
LinkDB
All DBs
Position
4385938..4388628
Genome browser
AA seq
896 aa
AA seq
DB search
MNSFTLIVIIIIYLAVLFYIAFLAEKKRQSKWVNNPYVYTLSLAVFCSAWTYYGSVGIAA
NSGINFLPIYLGPVIAAPLWIIVLRKIIRISKQHKISSIADFISLRYGNNRFLGALVTII
CLFGTLPYISLQLKAVSETFEIMSDDTSYISTSIIDDSTFYVALLLAVFAAFFGTQNTDA
SEKHKGIVATVAFESVLKLVFFTIIGGYITFYLFDGTTDIYDKISNTENFKELTTLSGIE
DGFNWFFMIALSFMSIFLLPRQFQVMVLENNREKHLKKAIWLFPLYLLLFNIFVIFIAWA
GKLTFGSTQNAEYYSLLLPLEHGNSLLATLVFLGGFSAVISMVVVSTLALSTMVSNNLII
PYGFLDKFIKNQPERNSKYIKSIRRISIFTIIISAYFFYVSFSKELSLYSIGLISFVIIA
QLAPSFFIGLFWNRGSSKAAIIGMIIGFLIAIYTLVLPFTLQAYTGTDYFTQHGLFGIAA
LKPNALLGIDFLSPPAHAFFWSISFNLMSYLVFSLVSKGNYRERNYAEMFVDSKSFTSLQ
ENAFVWKGEAYVSDVKNVLVRFLGEERATRALKIFFTKHKLPLDTQLGDARLINFSEKLL
TGSIGSASAKILIASVVKEEQISLVEVLKILEESKENIVNNKVLLEKSNELSQLSSKLKD
ANKELISKDKQKDEFLDTVAHELKTPITGIRAATELLMDEDDDMPQEMKAQFLKNILQDS
ERLGRLIHNILDFEKLETGRLNLDLEYLDIQKTIAKAIGSISQIAAKKGVKIVVNNVHSF
KINYDEDRILQVLTNLLSNAIKFCQPQTGKIYIDYKLGNALVEISVTDNGKGIPEEDHAF
VFDKFYQSKHQNTIKPQGSGLGLAITKQIVEKHQGKIWAKKGIKNGATFVFTIPFK
NT seq
2691 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatagttttactttaatagtcattataattatttatttagcggtgttgttctacatt
gcttttcttgctgaaaaaaaacgacaaagtaagtgggtaaataatccttatgtctatact
ttgtctttagctgtattttgttctgcatggacctattatggtagtgtaggaattgcagca
aattccggaattaactttttaccaatttatttagggcctgttattgcggcgcctttatgg
attattgtgcttcgaaaaattattagaatttctaaacagcataaaatttcttccattgca
gattttatttctttgcgctacggaaacaatcgttttttaggagccttggtcacaattatt
tgcctttttggtactttgccttacatttctttacaattaaaagcagtttctgaaacattt
gaaattatgtctgatgatacgagttatatttctacatcaattattgacgattctactttt
tacgttgctttattattagctgtttttgctgctttttttggaacccaaaatacagatgca
tcagaaaaacataagggaattgttgctacagttgcttttgagtctgttttaaaattggtt
ttcttcaccattattggtgggtatattacattttacttgtttgatggtacaacagatatt
tatgataaaatttcaaatacagaaaattttaaagagctaactacactaagtggtatagaa
gatggttttaattggttttttatgattgctttatcttttatgtctatatttttattacca
cgtcagtttcaagttatggttttagaaaacaatagagaaaaacatttaaagaaagcaatt
tggttgtttccattgtacttattgctttttaatatttttgttatttttattgcttgggca
ggtaaattaacctttggttctactcaaaatgcagagtattattctttattacttccgtta
gaacacggaaattcacttttagcaacgcttgtttttttaggaggtttttctgcggttatt
tctatggtggtagtttctaccttggcattatcaaccatggttagtaataacttaattatt
ccgtatgggtttttagataaatttattaaaaatcaaccagaacgaaattcaaaatatatt
aaaagcattcgtcgtatttctatttttaccattattatttcggcgtatttcttctatgtt
tcgttttcaaaagagctttctttgtattctattggattaatctcttttgttattatagcg
caattagcaccttccttttttattggtttattctggaatcgtggttcttcaaaagcggct
attatcggaatgattattggttttcttattgctatttacactttagttttaccttttaca
ttacaagcctataccggaacagattattttacgcaacacggattatttggtattgctgca
ttaaaaccaaatgctttgttaggcatcgattttttaagtccgcctgctcatgcatttttc
tggagtatttcgtttaatttaatgagttatttagtgttttcattagtttctaaaggaaat
tatagagagcgtaattatgcagaaatgtttgtagacagtaagagttttacctcacttcaa
gaaaatgcatttgtttggaaaggagaggcttatgtttcagatgttaaaaatgttttagtt
cgttttttaggtgaagaacgcgctacacgtgctcttaaaatatttttcaccaagcataaa
ttgcctttagatacccaattgggagatgctagattaattaatttttcagaaaaattatta
acaggtagtattggttctgcatccgcaaaaatattgattgcaagtgtggtaaaagaagag
caaattagtttggttgaggtgttaaaaattttagaagaatctaaagagaacattgtaaat
aataaggttttgttagaaaaatcgaatgaattgtctcaattgtcatcaaaattaaaagat
gcaaataaagaattaataagtaaagacaagcaaaaagatgaatttttagatacggttgct
catgaattgaaaacaccaattacagggattcgtgcagctactgagctattgatggatgaa
gatgatgatatgcctcaagaaatgaaagcccagtttttaaagaatattctgcaagattct
gagcgtttagggcgtttaattcataatattttagattttgaaaaactagaaacaggaaga
ttaaatttagacttagaatatttagacattcaaaagacgattgcgaaggcaattggcagt
atttctcaaattgctgcgaaaaaaggagtgaaaatcgttgtgaataatgtgcattctttt
aaaataaattatgatgaagatagaattctacaagtattaaccaatttattgtccaatgcc
attaagttttgccaaccacaaaccgggaaaatttacatagattataaattaggaaatgcc
ttggtagaaatctctgtaaccgataatggtaaagggattccggaagaagatcatgcattt
gtttttgataagttttatcaatctaaacatcaaaacaccattaaaccacagggtagtgga
ttaggattggcaataaccaaacaaatagtagaaaaacaccaaggaaaaatttgggctaaa
aaaggtataaaaaatggtgcaacatttgtttttaccatcccttttaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
